EMU: aquisição de espectrômetro de ressonância magnética nuclear para estudos de biomoléculas

• Processo: 09/53989-4
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Programa Equipamentos Multiusuários
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Biofísica - Biofísica Molecular
• Pesquisador responsável: Raghuvir Krishnaswamy Arni
• Beneficiário: Raghuvir Krishnaswamy Arni
• Instituição Sede: Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas (IBILCE). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de São José do Rio Preto. São José do Rio Preto , SP, Brasil
• Assunto(s): Biologia estrutural Proteoma Peptídeos Proteínas Ressonância magnética nuclear Espectrometria
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Biologia Estrutural | Estrutura De Proteinas | Peptideos Bioativos | Peptidioma | Proteoma | Ressonancia Magnetica Nuclear
• Publicação FAPESP: https://media.fapesp.br/bv/uploads/publicacoes/emu_bio_55.pdf
• Página web do EMU: Página do Equipamento Multiusuário não informada
• Tipo de equipamento: Tipo de Equipamento Multiusuário não informado
• Fabricante: Fabricante não informado
• Modelo: Modelo não informado

Resumo

O equipamento solicitado neste EMU será parte de um Centro de Pesquisas em iomoléculas constituído pela agregação física de equipamentos multiusuários específicos. Este Centro terá como sede o Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas (IBILCE) do campus de São José do Rio Preto da Universidade Estadual Paulista "Julio de Mesquita Filho" (UNESP). A instalação do Centro tem o apoio Institucional da Universidade, conforme documento anexo à este projeto, garantindo infraestrutura física, material, financeira e de pessoal técnico qualificado. Para a instalação desse Centro será feita em prédio próprio a ser construído em área interna ao campus do Instituto, localizado a critério da Congregação. O prédio deverá ter área aproximada de 200 metros quadrados divididos em um laboratório central, com salas onde serão instalados os equipamentos, sala de recepção e preparo de amostras, sala para os profissionais técnicos, sala de processamento de dados com computadores disponíveis aos usuários, câmara fria e anexos, como casa de gás e outros. O Estado de São Paulo mantém liderança significativa nas pesquisas em Biologia Estrutural, sendo o grupo de pesquisa de São José do Rio Preto um dos mais produtivos do país. Possui equipamentos instalados e pesquisadores atuantes em determinação de estruturas por Cristalografia e Difração de Raios X; SAXS; Modelagem Molecular; Dinâmica Molecular; Folding; Espectroscopia de IF, visível, UVe CD; Fotoacústica. Na instituição sede existem pessoas altamente qualificadas para a operação e gerenciamento deste EMU. A incorporação de um equipamento de RMN associado à capacidade intelectual e material instalado preencherá uma lacuna importante nas técnicas de Biologia Estrutural por nós aplicadas e proporcionará um incremento significativo nas pesquisas aqui realizadas, aumentando a liderança do Estado nesta área. (AU)

Publicações científicas

(29)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

EBERLE, RAPHAEL J.; KAWAI, LIEGE A.; DE MORAES, FABIO R.; TASIC, LJUBICA; ARNI, RAGHUVIR K.; CORONADO, MONIKA A.. Biochemical and biophysical characterization of a mycoredoxin protein glutaredoxin A1 from Corynebacterium pseudotuberculosis. International Journal of Biological Macromolecules, v. 107, n. B, p. 1999-2007, FEB 2018. (16/08104-8, 15/13765-0, 15/18868-2, 09/53989-4, 16/12904-0)

LOPES, TAIRINE ZARA; DE MORAES, FABIO ROGERIO; TEDESCO, ANTONIO CLAUDIO; ARNI, RAGHUVIR KRISHNASWAMY; RAHAL, PAULA; CALMON, MARILIA FREITAS. Berberine associated photodynamic therapy promotes autophagy and apoptosis via ROS generation in renal carcinoma cells. BIOMEDICINE & PHARMACOTHERAPY, v. 123, MAR 2020. (09/53989-4)

MARQUES, BEATRIZ C.; SANTOS, MARIANA B.; ANSELMO, DAIANE B.; MONTEIRO, DIEGO A.; GOMES, ELENI; SAIKI, MARILIA F. C.; RAHAL, PAULA; ROSALEN, PEDRO L.; SARDI, JANAINA C. O.; REGASINI, LUIS O.. Methoxychalcones: Effect of Methoxyl Group on the Antifungal Antibacterial and Antiproliferative Activities. Medicinal Chemistry, v. 16, n. 7, p. 881-891, 2020. (14/18330-0, 17/09245-7, 14/18577-5, 09/53989-4, 18/15083-2, 16/08084-7, 14/50926-0)

GUIMARAES, GIOVANA C.; PIVA, HEMILY R. M.; ARAUJO, GABRIELA C.; LIMA, CAROLINE S.; REGASINI, LUIS O.; DE MELO, FERNANDO A.; FOSSEY, MARCELO A.; CARUSO, ICARO P.; SOUZA, FATIMA P.. Binding investigation between M2-1protein from hRSV and acetylated quercetin derivatives: H-1 NMR, fluorescence spectroscopy, and molecular docking. International Journal of Biological Macromolecules, v. 111, p. 33-38, MAY 2018. (13/24355-2, 09/53989-4)

EBERLE, RAPHAEL J.; KAWAI, LIEGE A.; DE MORAES, FABIO R.; OLIVIER, DANILO; DO AMARAL, MARCOS S.; TASIC, LJUBICA; AMI, RAGHUVIR K.; CORONADO, MONIKA A.. Inhibition of thioredoxin A1 from Corynebacterium pseudotuberculosis by polyanions and flavonoids. International Journal of Biological Macromolecules, v. 117, p. 1066-1073, OCT 1 2018. (09/53989-4, 15/18868-2, 16/08104-8, 15/13765-0, 16/12904-0)

MENDES, LUIS F. S.; FONTANA, NATALIA A.; OLIVEIRA, CAROLINA G.; FREIRE, MARJORIE C. L. C.; LOPES, JOSE L. S.; MELO, FERNANDO A.; COSTA-FILHO, ANTONIO J.. The GRASP domain in golgi reassembly and stacking proteins: differences and similarities between lower and higher Eukaryotes. FEBS Journal, v. 286, n. 17, p. 3340-3358, SEP 2019. (17/24669-8, 12/20367-3, 15/50366-7, 09/53989-4, 16/23863-2)

PEINADO, RAFAELA DOS S.; OLIVIER, DANILO S.; EBERLE, RAPHAEL J.; DE MORAES, FABIO R.; AMARAL, MARCOS S.; ARNI, RAGHUVIR K.; CORONADO, MONIKA A.. Binding studies of a putative C. pseudotuberculosis target protein from Vitamin B-12 Metabolism. SCIENTIFIC REPORTS, v. 9, APR 23 2019. (09/53989-4, 15/18868-2, 16/08104-8, 15/13765-0, 16/12904-0)

SANCHES, KAROLINE; RODRIGUES DIAS, RAPHAEL VINICIUS; DA SILVA, PAULO HENRIQUE; FOSSEY, MARCELO ANDRES; CARUSO, ICARO PUTINHON; DE SOUZA, FATIMA PEREIRA; DE OLIVEIRA, LEANDRO CRISTANTE; DE MELO, FERNANDO ALVES. Grb2 dimer interacts with Coumarin through SH2 domains: A combined experimental and molecular modeling study. HELIYON, v. 5, n. 11, NOV 2019. (14/17630-0, 09/53989-4, 16/08753-6)

ANSELMO, DAIANE B.; POLAQUINI, CARLOS R.; MARQUES, BEATRIZ C.; AYUSSO, GABRIELA M.; ASSIS, LETICIA R.; TORREZAN, GUILHERME S.; RAHAL, PAULA; FACHIN, ANA L.; CALMON, MARILIA F.; MARINS, MOZART A.; et al. Curcumin-cinnamaldehyde hybrids as antiproliferative agents against women's cancer cells. MEDICINAL CHEMISTRY RESEARCH, v. 30, n. 11, AUG 2021. (18/15083-2, 14/50880-0, 14/18330-0, 09/53989-4, 14/50926-0)

TEMPONE, ANDRE GUSTAVO; DOS SANTOS THEODORO, REINALDO; ROMANELLI, MAIARA MARIA; FERREIRA, DAYANA AGNES SANTOS; AMARAL, MAIARA; DE ASSIS, LETICIA RIBEIRO; CRUZ, LUCAS MONTEIRO SANTA; COSTA, ALAN ROBERTO; ZANELLA, ROSEMEIRE COBO; CHRISTODOULIDES, MYRON; et al. A new reduced chalcone-derivative affects the membrane permeability and electric potential of multidrug-resistant Enterococcus faecalis. Chemico-Biological Interactions, v. 365, p. 8-pg., 2022-08-10. (14/18330-0, 21/04464-8, 18/26655-7, 19/11979-4, 17/50333-7, 18/15083-2, 09/53989-4)

PIVA, HEMILY M. R.; SA, JESSICA M.; MIRANDA, ARTEMIZA S.; TASIC, LJUBICA; FOSSEY, MARCELO A.; SOUZA, FATIMA P.; CARUSO, ICARO P.. Insights into Interactions of Flavanones with Target Human Respiratory Syncytial Virus M2-1 Protein from STD-NMR, Fluorescence Spectroscopy, and Computational Simulations. INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES, v. 21, n. 6, MAR 2020. (09/53989-4, 10/18169-3, 17/00413-4)

TORREZAN, GUILHERME SILVA; POLAQUINI, CARLOS ROBERTO; LIMA, MARCELO FREITAS; REGASINI, LUIS OCTAVIO. Use of glycerol, waste glycerol from biodiesel production and other protic solvents in bioactive alpha, beta-unsaturated ketones synthesis. SUSTAINABLE CHEMISTRY AND PHARMACY, v. 16, JUN 2020. (18/15083-2, 09/53989-4, 14/50926-0, 14/18330-0)

DOS SANTOS, MARIANA BASTOS; MARQUES, BEATRIZ CARVALHO; AYUSSO, GABRIELA MIRANDA; ROCHA GARCIA, MAYARA APARECIDA; PARACATU, LUANA CHIQUETTO; PAULI, IVANI; BOLZANI, VANDERLAN SILVA; ANDRICOPULO, ADRIANO DEFINI; XIMENES, VALDECIR FARIAS; ZERAIK, MARIA LUIZA; et al. Chalcones and their B-aryl analogues as myeloperoxidase inhibitors: In silico, in vitro and ex vivo investigations. BIOORGANIC CHEMISTRY, v. 110, MAY 2021. (16/00580-5, 14/18330-0, 09/53989-4, 18/15083-2, 14/50926-0)

CARDOSO, MARCUS V. C.; RIVERA, JOSE D.; VITALE, PHELIPE A. M.; DEGENHARDT, MAXIMILIA F. S.; ABIKO, LAYARA A.; OLIVEIRA, CRISTIANO L. P.; SALINAS, ROBERTO K.. CALX-CBD1 Ca2+-Binding Cooperativity Studied by NMR Spectroscopy and ITC with Bayesian Statistics. BIOPHYSICAL JOURNAL, v. 119, n. 2, p. 337-348, JUL 21 2020. (09/53989-4, 18/21450-8, 17/05614-8, 16/17375-5, 16/07490-1, 17/06394-1)

EBERLE, RAPHAEL J.; KAWAI, LIEGE A.; DE MORAES, FABIO R.; TASIC, LJUBICA; ARNI, RAGHUVIR K.; CORONADO, MONIKA A.. Biochemical and biophysical characterization of a mycoredoxin protein glutaredoxin A1 from Corynebacterium pseudotuberculosis. International Journal of Biological Macromolecules, v. 107, p. 9-pg., 2018-02-01. (09/53989-4, 15/13765-0, 16/08104-8, 15/18868-2, 16/12904-0)

POLAQUINI, CARLOS R.; MORAO, LUANA G.; NAZARE, ANA C.; TORREZAN, GUILHERME S.; DILARRI, GUILHERME; CAVALCA, LUCIA B.; CAMPOS, DEBORA L.; SILVA, ISABEL C.; PEREIRA, JESSE A.; SCHEFFERS, DIRK-JAN; et al. Antibacterial activity of 3,3 `-dihydroxycurcumin (DHC) is associated with membrane perturbation. BIOORGANIC CHEMISTRY, v. 90, n. SI, SEP 2019. (18/15083-2, 09/53989-4, 17/50216-0, 15/50162-2, 15/08089-6, 13/50367-8, 14/50880-0)

CARUSO, ICARO P.; GUIMARAES, GIOVANA C.; MACHADO, VITOR B.; FOSSEY, MARCELO A.; WILLBOLD, DIETER; ALMEIDA, FABIO C. L.; SOUZA, FATIMA P.. Biophysical and Dynamic Characterization of Fine-Tuned Binding of the Human Respiratory Syncytial Virus M2-1 Core Domain to Long RNAs. Journal of Virology, v. 94, n. 23, DEC 2020. (10/18169-3, 19/08739-1, 18/08900-4, 09/53989-4)

MINARI, KARINE; DE AZEVEDO, ERIKA CHANG; RODRIGUES KIRALY, VANESSA THOMAZ; HELENO BATISTA, FERNANDA APARECIDA; DE MORAES, FABIO ROGERIO; DE MELO, FERNANDO ALVES; NASCIMENTO, ALESSANDRO SILVA; GAVA, LISANDRA MARQUES; INACIO RAMOS, CARLOS HENRIQUE; BORGES, JULIO CESAR. Thermodynamic analysis of interactions of the Hsp90 with adenosine nucleotides: A comparative perspective. International Journal of Biological Macromolecules, v. 130, p. 125-138, JUN 1 2019. (15/26722-8, 13/25646-0, 17/18173-0, 11/23110-0, 14/07206-6, 12/50161-8, 09/53989-4, 17/07335-9)

CORONADO, MONIKA APARECIDA; OLIVIER, DANILO DA SILVA; EBERLE, RAPHAEL JOSEF; DO AMARAL, MARCOS SERROU; ARNI, RAGHUVIR KRISHNASWAMY. Modeling and molecular dynamics indicate that snake venom phospholipase B-like enzymes are Ntn-hydrolases. Toxicon, v. 153, p. 106-113, OCT 2018. (16/08104-8, 16/12904-0, 15/18868-2, 09/53989-4, 15/13765-0)

SANCHES, KAROLINE; CARUSO, ICARO P.; ALMEIDA, FABIO C. L.; MELO, FERNANDO A.. NMR assignment of free H-1, N-15 and C-13-Grb2-SH2 domain. BIOMOLECULAR NMR ASSIGNMENTS, v. 13, n. 2, p. 295-298, OCT 2019. (14/17630-0, 09/53989-4)

GARCIA, MAYARA A. R.; THEODORO, REINALDO S.; SARDI, JANAINA C. O.; SANTOS, MARIANA B.; AYUSSO, GABRIELA M.; PAVAN, FERNANDO R.; COSTA, ALAN R.; SANTA CRUZ, LUCAS M.; ROSALEN, PEDRO L.; REGASINI, LUIS O.. Design, synthesis and antibacterial activity of chalcones against MSSA and MRSA planktonic cells and biofilms. BIOORGANIC CHEMISTRY, v. 116, NOV 2021. (18/15083-2, 14/50926-0, 09/53989-4, 14/18330-0)

CURY SATOKATA, ALESSANDRA AKEMI; SOUZA, JONATHAN HENRIQUE; OLIVEIRA SILVA, LUANA LUIZA; SANTIAGO, MARIANA BRENTINI; RAMOS, SALVADOR BOCCALETTI; DE ASSIS, LETICIA RIBEIRO; THEODORO, REINALDO DOS SANTOS; RODRIGUES E OLIVEIRA, LIGIA; REGASINI, LUIS OCTAVIO; GOMES MARTINS, CARLOS HENRIQUE. Chalcones with potential antibacterial and antibiofilm activities against periodontopathogenic bacteria. Anaerobe, v. 76, p. 9-pg., 2022-08-01. (14/50926-0, 14/18330-0, 14/50880-0, 09/53989-4, 18/15083-2)

BORTOLOZO OLIVEIRA, ANA BEATRIZ; DE MORAES, FABIO ROGERIO; CANDIDO, NATALIA MARIA; SAMPAIO, ISABELLA; PAULA, ALEX SILVA; DE VASCONCELLOS, ADRIAN; SILVA, THAIS CERQUEIRA; MILLER, ALEX HENRIQUE; RAHAL, PAULA; NERY, JOSE GERALDO; et al. Metabolic Effects of Cobalt Ferrite Nanoparticles on Cervical Carcinoma Cells and Nontumorigenic Keratinocytes. JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH, v. 15, n. 12, p. 4337-4348, DEC 2016. (09/53989-4, 12/22809-3)

CORONADO, MONIKA APARECIDA; EBERLE, RAPHAEL JOSEF; BLEFFERT, NICOLE; FEUERSTEIN, SOPHIE; OLIVIER, DANILO SILVA; DE MORAES, FABIO ROGERIO; WILLBOLD, DIETER; ARNI, RAGHUVIR KRISHNASWAMY. Zika virus NS2B/NS3 proteinase: A new target for an old drug - Suramin a lead compound for NS2B/NS3 proteinase inhibition. Antiviral Research, v. 160, p. 118-125, DEC 2018. (16/08104-8, 15/13765-0, 15/18868-2, 09/53989-4, 16/12904-0)

EBERLE, RAPHAEL J.; CORONADO, MONIKA A.; PEINADO, RAFAELA S.; DE MORAES, FABIO R.; OLIVIER, DANILO; DREYER, THIAGO; LOPES, DEBORA DE OLIVEIRA; ROSA DA LUZ, BRENDA SILVA; AZEVEDO, VASCO; ARNI, RAGHUVIR K.. The polyanions heparin and suramin impede binding of free adenine to a DNA glycosylase from C. pseudotuberculosis. International Journal of Biological Macromolecules, v. 125, p. 459-468, MAR 15 2019. (09/53989-4, 15/18868-2, 16/08104-8, 15/13765-0, 16/12904-0)

POLAQUINI, CARLOS R.; MARQUES, BEATRIZ C.; AYUSSO, GABRIELA M.; MORAO, LUANA G.; SARDI, JANAINA C. O.; CAMPOS, DEBORA L.; SILVA, ISABEL C.; CAVALCA, LUCIA B.; SCHEFFERS, DIRK-JAN; ROSALEN, PEDRO L.; et al. Antibacterial activity of a new monocarbonyl analog of curcumin MAC 4 is associated with divisome disruption. BIOORGANIC CHEMISTRY, v. 109, APR 2021. (18/00163-0, 14/50880-0, 14/18330-0, 17/50216-0, 15/50162-2, 09/53989-4, 18/15083-2, 14/50926-0, 13/50367-8)

SA, JESSICA M.; PILOTO, JOAO V.; CILLI, EDUARDO M.; TASIC, LJUBICA; FOSSEY, MARCELO A.; ALMEIDA, FABIO C. L.; SOUZA, FATIMA P.; CARUSO, ICARO P.. Hesperetin targets the hydrophobic pocket of the nucleoprotein/phosphoprotein binding site of human respiratory syncytial virus. JOURNAL OF BIOMOLECULAR STRUCTURE & DYNAMICS, v. 40, n. 5, p. 13-pg., 2020-10-17. (10/18169-3, 09/53989-4)

MARTINEZ JUNIOR, ANDRE MIGUEL; FELIX VIEGAS DE SOUZA, RICCHARD HALLAN; PETRONIO, MAICON SEGALLA; MARTINS, GRAZIELI OLINDA; FERNANDES, JULIO CESAR; BENDERDOUR, MOHAMED; OLIVEIRA DE TIERA, VERA APARECIDA; TIERA, MARCIO JOSE. Double-grafted chitosans as siRNA nanocarriers: effects of diisopropylethylamine substitution and labile-PEG coating. JOURNAL OF NANOSTRUCTURE IN CHEMISTRY, v. N/A, p. 20-pg., 2022-03-31. (17/10331-5, 19/27801-0, 15/05148-1, 09/53989-4)

POLAQUINI, CARLOS R.; MORAO, LUANA G.; NAZARE, ANA C.; TORREZAN, GUILHERME S.; DILARRI, GUILHERME; CAVALCA, LUCIA B.; CAMPOS, DEBORA L.; SILVA, ISABEL C.; PEREIRA, JESSE A.; SCHEFFERS, DIRK-JAN; et al. Antibacterial activity of 3,3 '-dihydroxycurcumin (DHC) is associated with membrane perturbation. BIOORGANIC CHEMISTRY, v. 90, p. 8-pg., 2019-09-01. (09/53989-4, 13/50367-8, 15/50162-2, 15/08089-6, 17/50216-0, 14/50880-0, 18/15083-2)