Identificação e caracterização de microRNAs no genoma da tilápia do Nilo Oreochromis niloticus

• Processo: 11/06465-0
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Vigência: 01 de julho de 2011 - 30 de junho de 2013
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
• Pesquisador responsável: César Martins
• Beneficiário: César Martins
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IBB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Botucatu. Botucatu , SP, Brasil
• Pesquisadores associados: Alexandre Wagner Silva Hilsdorf ; Robson Francisco Carvalho
• Assunto(s): Genética molecular Peixes Tilápia-do-Nilo Genômica Genomas MicroRNAs
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Evolução | Genética Molecular | Genômica | MicroRNAs | Peixes | tilápia | Genética Molecular

Resumo

MicroRNAs (miRNAs) são pequenas moléculas de RNA (~20 nucleotídeos) que regulam pós-transcricionalmente a expressão de genes endógenos, modelando o transcriptoma e a produção de proteínas. Em geral, os miRNAs são altamente conservados no genoma de eucariotos sendo considerados elementos vitais em diversos processos biológicos durante o desenvolvimento, tais como crescimento, diferenciação e morte celular. Além disso, a associação entre abundância e diversidade de miRNAs e complexidade do grupo taxonômico, tornaram os miRNAs elementos relevantes, tanto no processo de especiação, quanto como marcadores filogenéticos para investigações evolutivas. A grande diversidade de miRNAs identificados está restrita a poucas espécies e apenas uma parte do total de alvos de miRNAs preditos foi caracterizada funcionalmente. Nesse sentido, o uso da tecnologia de sequenciamento de nova geração atrelada à análise de expressão gênica por RT-qPCR, possibilitam a identificação do microRNoma e a validação experimental de genes alvo de miRNAs numa espécie. A tilápia do Nilo, Oreochromis niloticus, pode ser considerada um excelente modelo biológico para o estudo de miRNAs em vertebrados, devido à sua importância econômica e genoma completo sequenciado. Além disso, apresenta importância evolutiva por pertencer ao grupo dos ciclídeos africanos, os quais têm sofrido rápida e extensa irradiação adaptativa. Portanto, a presente proposta objetiva (i) identificar, mapear e determinar a organização genômica de miRNAs e (ii) avaliar o padrão de expressão temporal e espacial de miRNAs e sua importância para o crescimento da tilápia do Nilo. Espera-se também contribuir com inferências evolutivas obtidas através de análise genômica comparativa, além de esclarecer quais são os miRNAs protagonistas e o papel destes em vias reguladoras do crescimento na tilápia do Nilo, visando à melhoria da produtividade na aquicultura. (AU)

Publicações científicas

(4)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

GIUSTI, JULIANA; PINHAL, DANILLO; MOXON, SIMON; CAMPOS, CAMILA LOVAGLIO; MUNSTERBERG, ANDREA; MARTINS, CESAR. MicroRNA-10 modulates Hox genes expression during Nile tilapia embryonic development. MECHANISMS OF DEVELOPMENT, v. 140, p. 12-18, MAY 2016. (11/06465-0)

BOVOLENTA, LUIZ AUGUSTO; PINHAL, DANILLO; ACENCIO, MARCIO LUIS; DE OLIVEIRA, ARTHUR CASULLI; MOXON, SIMON; MARTINS, CESAR; LEMKE, NEY. miRTil: An Extensive Repository for Nile Tilapia microRNA Next Generation Sequencing Data. CELLS, v. 9, n. 8, AUG 2020. (10/20684-3, 12/13450-1, 12/15589-7, 14/08420-1, 15/19176-7, 11/06465-0, 13/03644-6)

PINHAL, DANILLO; BOVOLENTA, LUIZ A.; MOXON, SIMON; OLIVEIRA, ARTHUR C.; NACHTIGALL, PEDRO G.; ACENCIO, MARCIO L.; PATTON, JAMES G.; HILSDORF, ALEXANDRE W. S.; LEMKE, NEY; MARTINS, CESAR. Genome-wide microRNA screening in Nile tilapia reveals pervasive isomiRs' transcription, sex-biased arm switching and increasing complexity of expression throughout development. SCIENTIFIC REPORTS, v. 8, MAY 29 2018. (12/13450-1, 12/15589-7, 15/16661-1, 15/19176-7, 11/06465-0, 13/06864-7)

NACHTIGALL, PEDRO G.; DIAS, MARCOS C.; CARVALHO, ROBSON F.; MARTINS, CESAR; PINHAL, DANILLO. MicroRNA-499 Expression Distinctively Correlates to Target Genes sox6 and rod1 Profiles to Resolve the Skeletal Muscle Phenotype in Nile Tilapia. PLoS One, v. 10, n. 3, MAR 20 2015. (11/06465-0, 13/06864-7, 12/15589-7)