Filogeografia comparada, filogenia, modelagem paleoclimática e taxonomia de répteis e anfíbios neotropicais

• Processo: 11/50146-6
• Linha de fomento: Auxílio à Pesquisa - Programa BIOTA - Temático
• Vigência: 01 de janeiro de 2012 - 31 de dezembro de 2023
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Zoologia - Taxonomia dos Grupos Recentes
• Pesquisador responsável: Miguel Trefaut Urbano Rodrigues
• Beneficiário: Miguel Trefaut Urbano Rodrigues
• Instituição-sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Pesquisadores principais: Yatiyo Yonenaga-Yassuda
• Auxílios(s) vinculado(s): 17/14839-3 - XI Congreso Latinoamericano de Herpetología, AR.EXT
• Bolsa(s) vinculada(s): 22/03462-4 - Filogeografia comparada, filogenia, modelagem paleoclimática e taxonomia de répteis e anfíbios neotropicais, BP.TT; 19/00636-9 - Filogeografia comparada, filogenia, modelagem paleoclimática e taxonomia de répteis e anfíbios neotropicais, BP.TT; 18/17410-0 - Filogeografia comparada, filogenia, modelagem paleoclimática e taxonomia de répteis e anfíbios neotropicais, BP.TT; + mais bolsas vinculadas 18/02544-1 - Filogeografia comparada, filogenia, modelagem paleoclimática e taxonomia de répteis e anfíbios neotropicais, BP.TT; 17/15025-0 - Sistemática do gênero Phyllodytes Wagler, 1830 (Anura: Hylidae: Lophyohylinae), com base em caracteres morfológicos e moleculares, e filogeografia de p. luteolus (Wied, 1824), BP.DR; 17/20070-4 - Filogeografia comparada, filogenia, modelagem paleoclimática e taxonomia de répteis e anfíbios neotropicais, BP.TT; 16/03146-4 - Revelando relações geográficas, ecológicas e evolutivas de um complexo Neotropical de espécies de lagartos unissexuais do gênero Leposoma (Squamata: Gymnophthalmidae) por meio de Modelos de Nicho Ecológico, BP.PD; 15/26746-4 - Filogeografia comparada, filogenia, modelagem paleoclimática e taxonomia de répteis e anfíbios neotropicais, BP.TT; 15/12841-5 - Caracterização química de secreções epidérmicas, cloacais e de glândulas pré-anais e femorais das espécies brasileiras de lagartos da família Teiidae (Squamata), BP.DR; 15/01839-0 - Filogeografia de Gymnodactylus do grupo darwinii da Mata Atlântica (Squamata: Gekkota: Phyllodactylidae), BP.PD; 14/24431-3 - Filogenia e revisão sistemática das espécies de Bothrops do grupo jararacussu (Squamata, Crotalinae) e filogeografia de B. jararacussu Lacerda, 1884, com teste de hipóteses biogeográficas para a existência de contato florestal pretérito Amazônia-Mata Atlântica, BP.DR; 14/17193-9 - Filogeografia comparada, filogenia, modelagem paleoclimática e taxonomia de répteis e anfíbios neotropicais, BP.TT; 14/12010-3 - Filogeografia comparada, filogenia, modelagem paleoclimática e taxonomia de répteis e anfíbios neotropicais, BP.TT; 13/22477-3 - Hibridização e mecanismos de isolamento reprodutivo de lagartos da Mata Atlântica, BP.PD; 13/20188-4 - Filogeografia comparada, filogenia, modelagem paleoclimática e taxonomia de répteis e anfíbios neotropicais, BP.TT; 13/07239-9 - Bolsa de treinamento técnico 3 (TT3) concedida como cota de bolsa orçamentária do projeto 2011/50146-6 intitulado Filogeografia comparada, filogenia, modelagem paleoclimática e taxonomia de répteis e anfíbios neotropicais, BP.TT; 13/00218-6 - Bolsa de Treinamento Técnico 3 (TT3) concedida como cota de bolsa orçamentária do projeto 2011/50146-6 intitulado "Filogeografia comparada, filogenia, modelagem paleoclimática e taxonomia de répteis e anfíbios Neotropicais"., BP.TT; 12/21213-0 - Revisão de Bothrops bilineata (Serpentes, Viperidae) com base em caracteres morfológicos e moleculares, BP.MS; 12/15754-8 - Consequências ecogeográficas da evolução do morfotipo serpentiforme em Squamata, BP.PD; 12/01319-8 - Evolução dos mecanismos de desenvolvimento envolvidos com a redução dos membros em Squamata, BP.PD; 12/10163-1 - Filogenia e sistemática dos lagartos do gênero Leposoma gr. parietale (Squamata: Gymnophthalmidae), com base em caracteres morfológicos e moleculares, BP.DR; 12/09463-0 - Diferenciação molecular e variação morfológica em lagartos microteídeos da tribo Iphisiini (Squamata, Gymnophthalmidae), BP.DR; 12/02212-2 - Taxonomia, sistemática e filogenia do grupo de Cnemidophorus lemniscatus (Squamata: Teiidae), em base a caracteres morfológicos e moleculares, BP.PD; 12/00492-8 - Filogenia da família Gymnophthlamidae (Squamata: Teiioidea) baseada em caracteres morfológicos, BP.PD; 12/00547-7 - Sistemática e taxonomia de Erythrolamprus Boie (Serpentes, Xenodontinae) com base em caracteres morfológicos e moleculares, BP.PD; 09/54300-0 - Estudos de citogenetica comparativa e de sistematica filogenetica em roedores da tribo akodontini (cricetidae, sigmodontinae): o que pode ser revelado na era da citogenomica?, BP.PD; 08/56444-6 - Diversidade genetica em especies unissexuais e bissexuais de cnemidophorus do grupo ocellifer (teiinae) e caracterizacao estrutural da proteina mos nos squamata., BP.PD - menos bolsas vinculadas
• Assunto(s): Evolução animal Filogenia Filogeografia Anfíbios Répteis
• Publicação FAPESP: https://media.fapesp.br/bv/uploads/pdfs/Brazilian_biodiversity...future_7jBzfQW_41_42.pdf

Resumo

Análises recentes de endemismo e níveis de ameaça antrópica identificaram regiões-alvo para a conservação, os chamados "hotspots". Entretanto, nosso conhecimento acerca da distribuição da biodiversidade em cada uma dessas áreas, bem como dos fatores que a originaram são escassos. Tal deficiência limita nosso poder de conservação face às rápidas mudanças ambientais causadas pelo homem. Uma das vertentes deste projeto visa estudar o papel das flutuações climáticas do Pleistoceno sobre a riqueza da herpetofauna e os níveis de diversidade genética de anuros e lagartos de regiões elevadas e de baixada da Mata Atlântica. Utilizando técnicas de modelagem de nicho ecológico acopladas ao estudo filogeográfico o projeto irá documentar padrões de diversidade de espécies numa região particularmente pouco estudada, altamente ameaçada e megadiversa e terá importantes aplicações para a conservação do pouco que resta dessa área. Em outra vertente estudamos o papel das montanhas como áreas favorecendo a diversificação adaptativa da herpetofauna, seja atuando como refúgios para espécies de climas frios durante fases quentes, seja como cenários para especiação ecogeográfica. Sob enfoque morfológico, cariotípico, taxonômico, filogenético e filogeográfico, dá-se prosseguimento ao trabalho com táxons de répteis e anfíbios dos vários ecossistemas brasileiros, recolhendo subsídios para melhor compreender sua evolução e a história biogeográfica do continente. Em um caso procura-se estudar a filogeográfia comparada de uma linhagem de lagartos sul-americanos sua equivalente ecológica africana com base em dados moleculares, de modo a procurar estabelecer correlações intercontinentais sobre sua história e origem. As coletas realizadas em áreas pouco ou ainda não amostradas no estado e no país permitirão aprimorar o conhecimento sobre nossa biodiversidade, descrevendo espécies ainda não conhecidas e, associadas aos dados filogenéticos e filogeográficos obtidos, permitirão obter informações importantes para o delineamento de estratégias de conservação adequadas de nossa biota. (AU)

Publicações científicas

(69)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

PELOSO, PEDRO L. V.; DE OLIVEIRA, RENAN M.; STURARO, MARCELO J.; RODRIGUES, MIGUEL T.; LIMA-FILHO, GERALDO R.; BITAR, YOUSZEF O. C.; WHEELER, WARD C.; ALEIXO, ALEXANDRE. Phylogeny of Map Tree Frogs, Boana semilineata Species Group, with a New Amazonian Species (Anura: Hylidae). South American Journal of Herpetology, v. 13, n. 2, p. 150-169, AUG 2018. (03/10335-8, 11/50146-6)

STURARO, MARCELO JOSE; RODRIGUES, MIGUEL T.; COLLI, GUARINO R.; KNOWLES, L. LACEY; AVILA-PIRES, TERESA C. S.. Integrative taxonomy of the lizards Cercosaura ocellata species complex (Reptilia: Gymnophthalmidae). ZOOLOGISCHER ANZEIGER, v. 275, p. 37-65, JUL 2018. (13/50297-0, 03/10335-8, 11/50146-6)

PRATES, IVAN; MELO-SAMPAIO, PAULO ROBERTO; DRUMMOND, LEANDRO DE OLIVEIRA; TEIXEIRA, JR., MAURO; RODRIGUES, MIGUEL TREFAUT; CARNAVAL, ANA CAROLINA. Biogeographic links between southern Atlantic Forest and western South America: Rediscovery, re-description, and phylogenetic relationships of two rare montane anole lizards from Brazil. Molecular Phylogenetics and Evolution, v. 113, p. 49-58, AUG 2017. (13/50297-0, 03/10335-8, 11/50146-6)

KOK, PHILIPPE J. R.; BITTENBINDER, MATYAS A.; VAN DEN BERG, JORIS K.; MARQUES-SOUZA, SERGIO; SALES NUNES, PEDRO M.; LAKING, ALEXANDRA E.; TEIXEIRA, JR., MAURO; FOUQUET, ANTOINE; MEANS, D. BRUCE; MACCULLOCH, ROSS D.; et al. Integrative taxonomy of the gymnophthalmid lizard Neusticurus rudis Boulenger, 1900 identifies a new species in the eastern Pantepui region, north-eastern South America. Journal of Natural History, v. 52, n. 13-16, SI, p. 1029-1066, 2018. (11/50146-6, 12/10163-1, 13/50297-0)

PELOSO, PEDRO L. V.; FROST, DARREL R.; RICHARDS, STEPHEN J.; RODRIGUES, MIGUEL T.; DONNELLAN, STEPHEN; MATSUI, MASAFUMI; RAXWORTHY, CRISTOPHER J.; BIJU, S. D.; LEMMON, EMILY MORIARTY; LEMMON, ALAN R.; et al. The impact of anchored phylogenomics and taxon sampling on phylogenetic inference in narrow-mouthed frogs (Anura, Microhylidae). CLADISTICS, v. 32, n. 2, p. 113-140, APR 2016. (03/10335-8, 11/50146-6)

DAL VECHIO, FRANCISCO; TEIXEIRA, JR., MAURO; SENA, MARCELO; ARGOLO, ANTONIO; GARCIA, CAROLINE; RODRIGUES, MIGUEL TREFAUT. Taxonomic Status and the Phylogenetic Placement of Amphisbaena leucocephala Peters, 1878 (Squamata, Amphisbaenidae). South American Journal of Herpetology, v. 11, n. 3, p. 157-175, DEC 2016. (03/10335-8, 11/50146-6)

SANCHEZ-PACHECO, SANTIAGO J.; TORRES-CARVAJAL, OMAR; AGUIRRE-PENAFIEL, VANESSA; SALES NUNES, PEDRO M.; VERRASTRO, LAURA; RIVAS, GILSON A.; RODRIGUES, MIGUEL T.; GRANT, TARAN; MURPHY, ROBERT W.. Phylogeny of Riama (Squamata: Gymnophthalmidae), impact of phenotypic evidence on molecular datasets, and the origin of the Sierra Nevada de Santa Marta endemic fauna. CLADISTICS, v. 34, n. 3, p. 260-291, JUN 2018. (12/00492-8, 03/10335-8, 12/10000-5, 11/50146-6)

CAMACHO, AGUSTIN; RECODER, RENATO; TEIXEIRA, JR., MAURO; KOHLSDORF, TIANA; RODRIGUES, MIGUEL TREFAUT; LEE, MICHAEL S. Y.. Overcoming phylogenetic and geographic uncertainties to test for correlates of range size evolution in gymnophthalmid lizards. ECOGRAPHY, v. 40, n. 6, p. 764-773, JUN 2017. (11/18868-1, 11/50146-6, 13/50297-0, 12/15754-8, 03/10335-8)

PIRANI, RENATA M.; WERNECK, FERNANDA P.; THOMAZ, ANDREA T.; KENNEY, MARIAH L.; STURARO, MARCELO J.; AVILA-PIRES, TERESA C. S.; PELOSO, PEDRO L. V.; RODRIGUES, MIGUEL T.; LACEY KNOWLES, L.. Testing main Amazonian rivers as barriers across time and space within widespread taxa. Journal of Biogeography, v. 46, n. 11, p. 2444-2456, NOV 2019. (13/50297-0, 14/22444-0, 11/50146-6)

DAMASCENO, ROBERTA P.; CARNAVAL, ANA CAROLINA; SASS, CHODON; RECODER, RENATO SOUSA; MORITZ, CRAIG; RODRIGUES, MIGUEL TREFAUT. Geographic restriction, genetic divergence, and morphological disparity in the Brazilian Atlantic Forests: Insights from Leposoma lizards (Gymnophthalmidae, Squamata). Molecular Phylogenetics and Evolution, v. 154, JAN 2021. (03/10335-8, 11/50146-6, 15/11498-5, 13/50297-0, 13/22477-3)

BRUNES, TULIANA O.; LYRA, MARIANA L.; MALDONADO, JOSE A.; PELLEGRINO, KATIA C. M.; RODRIGUES, MIGUEL TREFAUT; FUJITA, MATTHEW K.. The first mitochondrial genome of a South America parthenogenetic lizard (Squamata: Gymnophthalmidae). MITOCHONDRIAL DNA PART B-RESOURCES, v. 6, n. 8, p. 2393-2395, AUG 3 2021. (16/03146-4, 13/50297-0, 11/50146-6, 18/07660-0)

FOUQUET, ANTOINE; LOEBMANN, DANIEL; CASTROVIEJO-FISHER, SANTIAGO; PADIAL, JOSE M.; ORRICO, VICTOR G. D.; LYRA, MARIANA L.; ROBERTO, IGOR JOVENTINO; KOK, PHILIPPE J. R.; HADDAD, CELIO F. B.; RODRIGUES, MIGUEL T.. From Amazonia to the Atlantic forest: Molecular phylogeny of Phyzelaphryninae frogs reveals unexpected diversity and a striking biogeographic pattern emphasizing conservation challenges. Molecular Phylogenetics and Evolution, v. 65, n. 2, p. 547-561, NOV 2012. (10/51071-7, 11/50146-6, 07/57067-9, 10/50124-0, 03/10335-8)

DI-NIZO, CAMILLA BRUNO; VENTURA, KAREN; FERGUSON-SMITH, MALCOLM ANDREW; MARY O'BRIEN, PATRICIA CAROLINE; YONENAGA-YASSUDA, YATIYO; SILVA, MARIA JOSE DE J.. Comparative Chromosome Painting in Six Species of Oligoryzomys (Rodentia, Sigmodontinae) and the Karyotype Evolution of the Genus. PLoS One, v. 10, n. 2, FEB 6 2015. (05/04557-3, 10/03432-0, 09/54300-0, 11/50146-6)

GUERRA-FUENTES, RICARDO ARTURO; ROSCITO, JULIANA G.; SALES NUNES, PEDRO M.; OLIVEIRA-BASTOS, PRISCILLA RACHEL; ANTONIAZZI, MARTA MARIA; CARLOS, JARED; RODRIGUES, MIGUEL TREFAUT. Through the Looking Glass: The Spectacle in Gymnophthalmid Lizards. Anatomical Record-Advances in Integrative Anatomy and Evolutionary Biology, v. 297, n. 3, SI, p. 496-504, MAR 2014. (12/00492-8, 11/50146-6)

OLIVEIRA, ELIANA F.; GEHARA, MARCELO; SAO-PEDRO, VINICIUS A.; CHEN, XIN; MYERS, EDWARD A.; BURBRINK, FRANK T.; MESQUITA, DANIEL O.; GARDA, ADRIAN A.; COLLI, GUARINO R.; RODRIGUES, MIGUEL T.; et al. Speciation with gene flow in whiptail lizards from a Neotropical xeric biome. Molecular Ecology, v. 24, n. 23, p. 5957-5975, DEC 2015. (12/02212-2, 11/50146-6)

TEIXEIRA, JR., MAURO; PRATES, IVAN; NISA, CAROLINA; CAMARAO SILVA-MARTINS, NATHALIA SUZAN; STRUESSMANN, CHRISTINE; RODRIGUES, MIGUEL TREFAUT. Molecular data reveal spatial and temporal patterns of diversification and a cryptic new species of lowland Stenocercus Dumeril & Bibron, 1837 (Squamata: Tropiduridae). Molecular Phylogenetics and Evolution, v. 94, n. A, p. 410-423, JAN 2016. (13/50297-0, 03/10335-8, 11/50146-6)

WERNECK, FERNANDA P.; LEITE, RAFAEL N.; GEURGAS, SILVIA R.; RODRIGUES, MIGUEL T.. Biogeographic history and cryptic diversity of saxicolous Tropiduridae lizards endemic to the semiarid Caatinga. BMC Evolutionary Biology, v. 15, MAY 23 2015. (13/50297-0, 03/10335-8, 11/50146-6)

GEHARA, MARCELO; CRAWFORD, ANDREW J.; ORRICO, VICTOR G. D.; RODRIGUEZ, ARIEL; LOETTERS, STEFAN; FOUQUET, ANTOINE; BARRIENTOS, LUCAS S.; BRUSQUETTI, FRANCISCO; DE LA RIVA, IGNACIO; ERNST, RAFFAEL; et al. High Levels of Diversity Uncovered in a Widespread Nominal Taxon: Continental Phylogeography of the Neotropical Tree Frog Dendropsophus minutus. PLoS One, v. 9, n. 9, SEP 10 2014. (12/12500-5, 10/51071-7, 08/50928-1, 11/50146-6, 03/10335-8)

PAZ, ANDREA; BROWN, JASON L.; CORDEIRO, CARLOS L. O.; AGUIRRE-SANTORO, JULIAN; ASSIS, CLAYDSON; AMARO, RENATA CECILIA; RAPOSO DO AMARAL, FABIO; BOCHORNY, THUANE; BACCI, LUCAS F.; CADDAH, MAYARA K.; et al. Environmental correlates of taxonomic and phylogenetic diversity in the Atlantic Forest. Journal of Biogeography, v. 48, n. 6, MAR 2021. (17/26162-8, 11/50225-3, 11/23155-4, 11/50146-6, 13/50297-0, 18/03428-5, 03/10335-8, 11/50143-7)

FONSECA, EMANUEL M.; GEHARA, MARCELO; WERNECK, FERNANDA P.; LANNA, FLAVIA M.; COLLI, GUARINO R.; SITES, JR., JACK W.; RODRIGUES, MIGUEL T.; GARDA, ADRIAN A.. Diversification with gene flow and niche divergence in a lizard species along the South American ``diagonal of open formations{''}. Journal of Biogeography, v. 45, n. 7, p. 1688-1700, JUL 2018. (13/50297-0, 03/10335-8, 11/50146-6)

MACHADO PELLEGRINO, KATIA CRISTINA; BRUNES, TULIANA OLIVEIRA; SOUZA, SERGIO MARQUES; LAGUNA, MARCIA MARIA; SAUER AVILA-PIRES, TERESA CRISTINA; HOOGMOED, MARINUS STEVEN; RODRIGUES, MIGUEL TREFAUT. On the distinctiveness of Amapasaurus, its relationship with Loxopholis Cope 1869, and description of a new genus for L. guianensis and L. hoogmoedi (Gymnophthalmoidea/Ecpleopodini: Squamata). Zootaxa, v. 4441, n. 2, p. 332-346, JUN 27 2018. (11/50146-6, 13/50297-0, 12/10163-1, 16/03146-4, 03/10335-8)

LANNA, FLAVIA; WERNECK, FERNANDA; GEHARA, MARCELO; FONSECA, EMANUEL; COLLI, GUARINO; SITES, JR., JACK; RODRIGUES, MIGUEL; GARDA, ADRIAN. The evolutionary history of Lygodactylus lizards in the South American open diagonal. Molecular Phylogenetics and Evolution, v. 127, p. 638-645, OCT 2018. (13/50297-0, 03/10335-8, 11/50146-6)

ZAHER, HUSSAM; YANEZ-MUNOZ, MARIO H.; RODRIGUES, MIGUEL T.; GRABOSKI, ROBERTA; MACHADO, FABIO A.; ALTAMIRANO-BENAVIDES, MARCO; BONATTO, SANDRO L.; GRAZZIOTIN, FELIPE G.. Origin and hidden diversity within the poorly known Galapagos snake radiation (Serpentes: Dipsadidae). SYSTEMATICS AND BIODIVERSITY, v. 16, n. 7, p. 614-642, 2018. (02/13602-4, 12/08661-3, 07/52144-5, 12/24755-8, 08/52285-0, 11/50146-6, 07/52781-5)

DAL VECHIO, FRANCISCO; PRATES, IVAN; GRAZZIOTIN, FELIPE G.; ZAHER, HUSSAM; RODRIGUES, MIGUEL TREFAUT. Phylogeography and historical demography of the arboreal pit viper Bothrops bilineatus (Serpentes, Crotalinae) reveal multiple connections between Amazonian and Atlantic rain forests. Journal of Biogeography, v. 45, n. 10, p. 2415-2426, OCT 2018. (11/50206-9, 03/10335-8, 11/50146-6)

PRATES, IVAN; PENNA, ANNA; RODRIGUES, MIGUEL TREFAUT; CARNAVAL, ANA CAROLINA. Local adaptation in mainland anole lizards: Integrating population history and genome-environment associations. ECOLOGY AND EVOLUTION, v. 8, n. 23, p. 11932-11944, DEC 2018. (13/50297-0, 03/10335-8, 11/50146-6)

MARTINS, LIDIA F.; CHOUERI, ERIK L.; OLIVEIRA, ALAN F. S.; DOMINGOS, FABRICIUS M. C. B.; CAETANO, GABRIEL H. O.; CAVALCANTE, VITOR H. G. L.; LEITE, RAFAEL N.; FOUQUET, ANTOINE; RODRIGUES, MIGUEL T.; CARNAVAL, ANA C.; et al. hiptail lizard lineage delimitation and population expansion as windows into the history of Amazonian open ecosystem. SYSTEMATICS AND BIODIVERSITY, v. 19, n. 8, JUL 2021. (11/50146-6)

LANNA, FLAVIA M.; GEHARA, MARCELO; WERNECK, FERNANDA P.; FONSECA, EMANUEL M.; COLLI, GUARINO R.; SITES, JR., JACK W.; RODRIGUES, MIGUEL T.; GARDA, ADRIAN A.. Dwarf geckos and giant rivers: the role of the Sao Francisco River in the evolution of Lygodactylus klugei (Squamata: Gekkonidae) in the semi-arid Caatinga of north-eastern Brazil. Biological Journal of the Linnean Society, v. 129, n. 1, p. 88-98, JAN 2020. (11/50146-6)

DIAS, IURI R.; NOVAES-E-FAGUNDES, GABRIEL; MOLLO NETO, ANTONIO; ZINA, JULIANA; GARCIA, CAROLINE; RECODER, RENATO SOUSA; DAL VECHIO, FRANCISCO; RODRIGUES, MIGUEL TREFAUT; SOLE, MIRCO. A new large canopy-dwelling species of Phyllodytes Wagler, 1930 (Anura, Hylidae) from the Atlantic Forest of the state of Bahia, Northeastern Brazil. PeerJ, v. 8, JUN 23 2020. (11/50146-6, 17/15025-0)

RIVERA, DANIELLE; PRATES, IVAN; RODRIGUES, MIGUEL TREFAUT; CARNAVAL, ANA CAROLINA. Effects of climate and geography on spatial patterns of genetic structure in tropical skinks. Molecular Phylogenetics and Evolution, v. 143, FEB 2020. (03/10335-8, 11/50146-6, 13/50297-0)

MARQUES-SOUZA, SERGIO; MACHADO PELLEGRINO, KATIA C.; BRUNES, TULIANA OLIVEIRA; CARNAVAL, ANA CAROLINA; DAMASCENO, ROBERTA PACHECO; DE OLIVEIRA BORGES, MANOELA LIMA; GALLARDO, CARLOS CANDIA; RODRIGUES, MIGUEL TREFAUT. Hidden in the DNA: How multiple historical processes and natural history traits shaped patterns of cryptic diversity in an Amazon leaf-litter lizard Loxopholis osvaldoi (Squamata: Gymnophthalmidae). Journal of Biogeography, v. 47, n. 2, DEC 2019. (17/08357-6, 11/50146-6, 12/10163-1, 13/22477-3)

RECODER, RENATO; PRATES, IVAN; MARQUES-SOUZA, SERGIO; CAMACHO, AGUSTIN; NUNES, PEDRO M. SALES; DAL VECHIO, FRANCISCO; GHELLERE, JOSE MARIO; MCDIARMID, ROY W.; RODRIGUES, MIGUEL TREFAUT. Lizards from the Lost World: two new species and evolutionary relationships of the Pantepui highland Riolama (Gymnophthalmidae). ZOOLOGICAL JOURNAL OF THE LINNEAN SOCIETY, v. 190, n. 1, p. 271-297, SEP 2020. (13/50297-0, 11/50146-6, 12/15754-8)

PIRANI, RENATA M.; PELOSO, V, PEDRO L.; PRADO, JOYCE R.; POLO, ERICO M.; KNOWLES, L. LACEY; RON, SANTIAGO R.; RODRIGUES, MIGUEL T.; STURARO, MARCELO J.; WERNECK, FERNANDA P.. Diversification history of clown tree frogs in Neotropical rainforests (Anura, Hylidae, Dendropsophus leucophyllatus group). Molecular Phylogenetics and Evolution, v. 150, SEP 2020. (03/10335-8, 11/50146-6, 13/50297-0, 14/22444-0)

CARVALHO, THIAGO R. D.; MORAES, LEANDRO J. C. L.; LIMA, ALBERTINA P.; FOUQUET, ANTOINE; PELOSO, V, PEDRO L.; PAVAN, DANTE; DRUMMOND, LEANDRO O.; RODRIGUES, MIGUEL T.; GIARETTA, ARIOVALDO A.; GORDO, MARCELO; et al. Systematics and historical biogeography of Neotropical foam-nesting frogs of the Adenomera heyeri clade (Leptodactylidae), with the description of six new Amazonian species. ZOOLOGICAL JOURNAL OF THE LINNEAN SOCIETY, v. 191, n. 2, p. 395-433, FEB 2021. (17/08489-0, 13/50741-7, 11/50146-6, 15/13404-8, 03/10335-8)

PRATES, IVAN; RODRIGUES, MIGUEL TREFAUT; MELO-SAMPAIO, PAULO ROBERTO; CARNAVAL, ANA CAROLINA. Phylogenetic relationships of Amazonian anole lizards (Dactyloa): Taxonomic implications, new insights about phenotypic evolution and the timing of diversification. Molecular Phylogenetics and Evolution, v. 82, n. A, p. 258-268, JAN 2015. (13/50297-0, 03/10335-8, 11/50146-6)

ARIAS, FEDERICO JOSE; RECODER, RENATO; BEATRIZ ALVAREZ, BLANCA; ETHCEPARE, EDUARDO; QUIPILDOR, MATIAS; LOBO, FERNANDO; RODRIGUES, MIGUEL TREFAUT. Diversity of teiid lizards from Gran Chaco and Western Cerrado (Squamata: Teiidae). ZOOLOGICA SCRIPTA, v. 47, n. 2, p. 144-158, MAR 2018. (12/02212-2, 03/10335-8, 11/50146-6)

MARQUES-SOUZA, SERGIO; PRATES, IVAN; FOUQUET, ANTOINE; CAMACHO, AGUSTIN; KOK, PHILIPPE J. R.; NUNES, PEDRO M. S.; DAL VECHIO, FRANCISCO; RECODER, RENATO SOUSA; MEJIA, NATHALIA; TEIXEIRA JUNIOR, MAURO; et al. Reconquering the water: Evolution and systematics of South and Central American aquatic lizards (Gymnophthalmidae). ZOOLOGICA SCRIPTA, v. 47, n. 3, p. 255-265, MAY 2018. (15/01300-3, 11/50146-6, 12/10163-1, 12/15754-8)

GOICOECHEA, NOEMI; FROST, DARREL R.; DE LA RIVA, IGNACIO; PELLEGRINO, KATIA C. M.; SITES, JR., JACK; RODRIGUES, MIGUEL T.; PADIAL, JOSE M.. Molecular systematics of teioid lizards (Teioidea/Gymnophthalmoidea: Squamata) based on the analysis of 48 loci under tree-alignment and similarity-alignment. CLADISTICS, v. 32, n. 6, p. 624-671, DEC 2016. (13/50297-0, 03/10335-8, 11/50146-6)

JUAN CAMILO ARREDONDO; FELIPE G. GRAZZIOTIN; GUSTAVO J. SCROCCHI; MIGUEL TREFAUT RODRIGUES; SANDRO LUÍS BONATTO; HUSSAM ZAHER. Molecular phylogeny of the tribe Philodryadini Cope, 1886 (Dipsadidae: Xenodontinae): Rediscovering the diversity of the South American Racers. Papéis Avulsos de Zoologia (São Paulo), v. 60, 2020-11-13. (16/50127-5, 03/10335-8, 16/13469-5, 11/50146-6, 11/50206-9, 12/08661-3)

PRATES, IVAN; D'ANGIOLELLA, ANNELISE B.; RODRIGUES, MIGUEL T.; MELO-SAMPAIO, PAULO R.; DE QUEIROZ, KEVIN; BELL, RAYNA C.. Evolutionary drivers of sexual signal variation in Amazon Slender Anoles. Evolution, v. 75, n. 6, p. 1361-1376, JUN 2021. (11/50146-6, 03/10335-8, 13/50297-0)

ALMEIDA-SILVA, DIEGO; SILVA-SOARES, THIAGO; RODRIGUES, MIGUEL TREFAUT; VERDADE, VANESSA KRUTH. New species of flea-toad, genus Brachycephalus (Anura: Brachycephalidae) from the Atlantic Forest of Espirito Santo, Brazil. Zootaxa, v. 5068, n. 4, p. 517-532, NOV 18 2021. (11/50146-6, 01/05470-8, 03/10335-8)

RIVERA, DANIELLE; PRATES, IVAN; FIRNENO, JR., THOMAS J.; RODRIGUES, MIGUEL TREFAUT; CALDWELL, JANALEE P.; FUJITA, MATTHEW K.. hylogenomics, introgression, and demographic history of South American true toads (Rhinella. Molecular Ecology, v. 31, n. 3, DEC 2021. (13/50297-0, 12/15754-8, 03/10335-8, 17/08357-6, 11/50206-9, 11/50146-6)

THOME, MARIA TEREZA C.; CARSTENS, BRYAN C.; RODRIGUES, MIGUEL T.; ALEXANDRINO, JOAO; HADDAD, CELIO F. B.. Genomic data from the Brazilian sibilator frog reveal contrasting pleistocene dynamics and regionalism in two South American dry biomes. Journal of Biogeography, v. 48, n. 5, FEB 2021. (13/09088-8, 12/50255-2, 11/50146-6, 11/51392-0, 18/03428-5, 13/50741-7)

PRATES, IVAN; MELO-SAMPAIO, PAULO ROBERTO; DE QUEIROZ, KEVIN; CARNAVAL, ANA CAROLINA; RODRIGUES, MIGUEL TREFAUT; DRUMMOND, LEANDRO DE OLIVEIRA. Discovery of a new species of Anolis lizards from Brazil and its implications for the historical biogeography of montane Atlantic Forest endemics. Amphibia-Reptilia, v. 41, n. 1, p. 87-103, JAN 2020. (13/50297-0, 11/50146-6)

THOME, MARIA TEREZA C.; CARSTENS, BRYAN C.; RODRIGUES, MIGUEL TREFAUT; GALETTI JR, PEDRO MANOEL JR; ALEXANDRINO, JOAO; HADDAD, CELIO F. B.. A role of asynchrony of seasons in explaining genetic differentiation in a Neotropical toad. HEREDITY, v. 127, n. 4, JUL 2021. (11/51392-0, 13/50741-7, 11/50146-6, 12/50255-2, 18/03428-5, 03/10335-8, 12/06611-9)

FOUQUET, ANTOINE; LEBLANC, KILLIAN; FABRE, ANNE-CLAIRE; RODRIGUES, MIGUEL T.; MENIN, MARCELO; COURTOIS, ELODIE A.; DEWYNTER, MAEL; HOLTING, MONIQUE; ERNST, RAFFAEL; PELOSO, PEDRO; et al. Comparative osteology of the fossorial frogs of the genus Synapturanus (Anura, Microhylidae) with the description of three new species from the Eastern Guiana Shield. ZOOLOGISCHER ANZEIGER, v. 293, p. 46-73, JUL 2021. (03/10335-8, 11/50146-6)

MORAES-DA-SILVA, A. N. T. O. N. I. O.; AMARO, RENATA CECILIA; SALES NUNES, PEDRO M.; RODRIGUES, MIGUEL TREFAUT; CURCIO, FELIPE FRANCO. Long known, brand new, and possibly threatened: a new species of watersnake of the genus Helicops Wagler, 1828 (Serpentes; Xenodontinae) from the Tocantins-Araguaia River Basin, Brazil. Zootaxa, v. 4903, n. 2, p. 217-241, JAN 7 2021. (11/50146-6)

ZORNOSA-TORRES, CAMILA; AUGUSTO-ALVES, GUILHERME; LYRA, MARIANA L.; DA SILVA JUNIOR, JOSE CASSIMIRO; GARCIA, PAULO C. A.; LEITE, FELIPE; VERDADE, VANESSA; RODRIGUES, MIGUEL T.; GASPARINI, JOAO LUIZ; HADDAD, CELIO F. B.; et al. Anurans of the Caparao National Park and surroundings, southeast Brazil. Biota Neotropica, v. 20, n. 3, 2020. (14/23388-7, 11/50146-6, 13/50741-7, 19/03170-0, 03/10335-8, 01/05470-8, 16/25358-3)

REJAUD, ALEXANDRE; RODRIGUES, MIGUEL T.; CRAWFORD, ANDREW J.; CASTROVIEJO-FISHER, SANTIAGO; JARAMILLO, ANDRES F.; CHAPARRO, JUAN C.; GLAW, FRANK; GAGLIARDI-URRUTIA, GIUSSEPE; MORAVEC, JIRI; DE LA RIVA, IGNACIO J.; et al. Historical biogeography identifies a possible role of Miocene wetlands in the diversification of the Amazonian rocket frogs (Aromobatidae:Allobates). Journal of Biogeography, v. 47, n. 11, AUG 2020. (13/50297-0, 11/50146-6)

MELO-SAMPAIO, PAULO R.; PRATES, IVAN; PELOSO, PEDRO L. V.; RECODER, RENATO; DAL VECHIO, FRANCISCO; MARQUES-SOUZA, SERGIO; RODRIGUES, MIGUEL T.. A new nurse frog from Southwestern Amazonian highlands, with notes on the phylogenetic affinities of Allobates alessandroi (Aromobatidae). Journal of Natural History, v. 54, n. 1-4, SI, MAR 2020. (13/50297-0, 11/50146-6)

YOVANOVICH, CAROLA A. M.; PIEROTTI, MICHELE E. R.; KELBER, ALMUT; JORGEWICH-COHEN, GABRIEL; IBANEZ, ROBERTO; GRANT, TARAN. Lens transmittance shapes ultraviolet sensitivity in the eyes of frogs from diverse ecological and phylogenetic backgrounds. PROCEEDINGS OF THE ROYAL SOCIETY B-BIOLOGICAL SCIENCES, v. 287, n. 1918, JAN 15 2020. (15/14857-6, 18/11502-0, 11/50146-6, 18/15425-0, 12/10000-5)

BLOTTO, BORIS L.; LYRA, MARIANA L.; CARDOSO, MONICA C. S.; RODRIGUES, MIGUEL TREFAUT; DIAS, IURI R.; MARCIANO-JR, EUVALDO; DAL VECHIO, FRANCISCO; ORRICO, VICTOR G. D.; BRANDAO, REUBER A.; DE ASSIS, CLODOALDO LOPES; et al. The phylogeny of the Casque-headed Treefrogs (Hylidae: Hylinae: Lophyohylini). CLADISTICS, v. 37, n. 1, p. 36-72, JAN 2021. (03/10335-8, 13/50741-7, 11/50146-6, 12/12500-5, 18/15425-0, 07/57067-9, 13/20423-3, 14/50342-8, 12/10000-5, 17/26162-8)

DAL VECHIO, FRANCISCO; PRATES, IVAN; GRAZZIOTIN, FELIPE G.; GRABOSKI, ROBERTA; RODRIGUES, MIGUEL TREFAUT. Molecular and phenotypic data reveal a new Amazonian species of pit vipers (Serpentes: Viperidae: Bothrops). Journal of Natural History, v. 54, n. 37-38, p. 2415-2437, OCT 1 2020. (11/50146-6, 03/10335-8, 13/50297-0)

ALMEIDA-SILVA, DIEGO; DE OLIVEIRA ROCHA-BARROS, VIVIAN CELIA; FERREIRA, RODRIGO BARBOSA; VERDADE, VANESSA KRUTH. THE TADPOLE OF ZACHAENUS CARVALHOI IZECKSOHN, 1983 (ANURA: CYCLORAMPHIDAE). Zootaxa, v. 4668, n. 1, p. 145-147, SEP 9 2019. (11/50146-6)

YOVANOVICH, CAROLA A. M.; PIEROTTI, MICHELE E. R.; RODRIGUES, MIGUEL TREFAUT; GRANT, TARAN. A dune with a view: the eyes of a neotropical fossorial lizard. Frontiers in Zoology, v. 16, JUN 10 2019. (15/14857-6, 18/11502-0, 11/50146-6, 12/10000-5)

MORAES-DA-SILVA, ANTONIO; AMARO, RENATA CECILIA; SALES NUNES, PEDRO M.; STRUSSMANN, CHRISTINE; TEIXEIRA JUNIOR, MAURO; ANDRADE JR, ALBEDI; SUDRE, VINICIUS; RECODER, RENATO; RODRIGUES, MIGUEL TREFAUT; CURCIO, FELIPE FRANCO. Chance, luck and a fortunate finding: a new species of watersnake of the genus Helicops Wagler, 1828 (Serpentes: Xenodontinae), from the Brazilian Pantanal wetlands. Zootaxa, v. 4651, n. 3, p. 445-470, AUG 6 2019. (11/50146-6)

PAZ, A.; SPANOS, Z.; BROWN, J. L.; LYRA, M.; HADDAD, C.; RODRIGUES, M.; CARNAVAL, A.. Phylogeography of Atlantic Forest glassfrogs (Vitreorana): when geography, climate dynamics and rivers matter. HEREDITY, v. 122, n. 5, p. 545-557, MAY 2019. (13/50741-7, 14/50342-8, 11/50146-6, 13/50297-0, 03/10335-8)

RECODER, RENATO SOUSA; MAGALHAES-JUNIOR, ARNALDO; RODRIGUES, JULIANA; DE ARRUDA PINTO, HUGO BONFIM; RODRIGUES, MIGUEL TREFAUT; CAMACHO, AGUSTIN. Thermal Constraints Explain the Distribution of the Climate Relict Lizard Colobosauroides carvalhoi (Gymnophthalmidae) in the Semiarid Caatinga. South American Journal of Herpetology, v. 13, n. 3, p. 249-259, DEC 2018. (11/50146-6)

PRATES, IVAN; RIVERA, DANIELLE; RODRIGUES, MIGUEL T.; CARNAVAL, ANA C.. A mid-Pleistocene rainforest corridor enabled synchronous invasions of the Atlantic Forest by Amazonian anole lizards. Molecular Ecology, v. 25, n. 20, p. 5174-5186, OCT 2016. (13/50297-0, 03/10335-8, 11/50146-6)

NETO, ANTONIO MOLLO; VERDADE, VANESSA KRUTH; SANTANA, DIEGO JOSE; VARELA RIOS, CELSO HENRIQUE; HOFFMANN DE CARVALHO, ROSE MARIE; RODRIGUES, MIGUEL TREFAUT. Reproductive biology and geographic variation of Zachaenus carvalhoi (Anura: Cycloramphidae), a Brazilian Atlantic Forest frog. Phyllomedusa, v. 15, n. 2, p. 127-135, DEC 2016. (08/08853-4, 03/10335-8, 11/50146-6, 01/05470-8, 06/01266-0)

SOUZA, SERGIO MARQUES; PELLEGRINO, KATIA C. M.; SALES NUNES, PEDRO M.; TEIXEIRA JUNIOR, MAURO; GORDO, MARCELO; DE CARVALHO, VINICIUS T.; ALMEIDA, ALEXANDRE; DE OLIVEIRA, DEYLA PAULA; FRAZAO, LUCIANA; HRBEK, TOMAS; et al. On the Discovery of Bisexual Populations of the Parthenogenetic Lizard Leposoma percarinatum (Gymnophthalmidae), with Insights into the Origin of Parthenogenesis in Leposoma. South American Journal of Herpetology, v. 10, n. 2, p. 121-131, AUG 2015. (12/00492-8, 11/50146-6, 12/10163-1)

PRATES, IVAN; XUE, ALEXANDER T.; BROWN, JASON L.; ALVARADO-SERRANO, DIEGO F.; RODRIGUES, MIGUEL T.; HICKERSON, MICHAEL J.; CARNAVAL, ANA C.. Inferring responses to climate dynamics from historical demography in neotropical forest lizards. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, v. 113, n. 29, p. 7978-7985, JUL 19 2016. (13/50297-0, 03/10335-8, 11/50146-6)

CARNAVAL, ANA CAROLINA; WALTARI, ERIC; RODRIGUES, MIGUEL T.; ROSAUER, DAN; VANDERWAL, JEREMY; DAMASCENO, ROBERTA; PRATES, IVAN; STRANGAS, MARIA; SPANOS, ZOE; RIVERA, DANIELLE; et al. Prediction of phylogeographic endemism in an environmentally complex biome. PROCEEDINGS OF THE ROYAL SOCIETY B-BIOLOGICAL SCIENCES, v. 281, n. 1792, OCT 7 2014. (13/50297-0, 13/22477-3, 03/10335-8, 11/50146-6)

RODRIGUES, MIGUEL TREFAUT; VINA BERTOLOTTO, CAROLINA ELENA; AMARO, RENATA CECILIA; YONENAGA-YASSUDA, YATIYO; XAVIER FREIRE, ELIZA MARIA; MACHADO PELLEGRINO, KATIA CRISTINA. Molecular phylogeny, species limits, and biogeography of the Brazilian endemic lizard genus Enyalius (Squamata: Leiosauridae): An example of the historical relationship between Atlantic Forests and Amazonia. Molecular Phylogenetics and Evolution, v. 81, p. 137-146, DEC 2014. (13/50297-0, 03/10335-8, 11/50146-6)

CURCIO, FELIPE FRANCO; SCALI, STEFANO; RODRIGUES, MIGUEL TREFAUT. TAXONOMIC STATUS OF ERYTHROLAMPRUS BIZONA JAN (1863) (SERPENTES, XENODONTINAE): ASSEMBLING A PUZZLE WITH MANY MISSING PIECES. HERPETOLOGICAL MONOGRAPHS, v. 29, p. 40-64, 2015. (11/50146-6, 12/00547-7)

SALES NUNES, PEDRO M.; CURCIO, FELIPE F.; ROSCITO, JULIANA G.; RODRIGUES, MIGUEL T.. Are Hemipenial Spines Related to Limb Reduction? A Spiny Discussion Focused on Gymnophthalmid Lizards (Squamata: Gymnophthalmidae). Anatomical Record-Advances in Integrative Anatomy and Evolutionary Biology, v. 297, n. 3, SI, p. 482-495, MAR 2014. (12/00492-8, 12/01319-8, 11/50146-6, 12/00547-7)

THOME, MARIA TEREZA C.; SEQUEIRA, FERNANDO; BRUSQUETTI, FRANCISCO; CARSTENS, BRYAN; HADDAD, CELIO F. B.; RODRIGUES, MIGUEL TREFAUT; ALEXANDRINO, JOAO. Recurrent connections between Amazon and Atlantic forests shaped diversity in Caatinga four-eyed frogs. Journal of Biogeography, v. 43, n. 5, p. 1045-1056, MAY 2016. (13/50741-7, 12/50255-2, 11/50146-6, 11/51392-0, 12/06611-9, 03/10335-8)

STRANGAS, MARIA L.; NAVAS, CARLOS A.; RODRIGUES, MIGUEL T.; CARNAVAL, ANA C.. Thermophysiology, microclimates, and species distributions of lizards in the mountains of the Brazilian Atlantic Forest. ECOGRAPHY, v. 42, n. 2, SI, p. 354-364, FEB 2019. (13/50297-0, 08/57687-0, 03/10335-8, 11/50146-6)

FOUQUET, ANTOINE; LEBLANC, KILLIAN; FRAMIT, MARLENE; REJAUD, ALEXANDRE; RODRIGUES, MIGUEL T.; CASTROVIEJO-FISHER, SANTIAGO; PELOSO, V, PEDRO L.; PRATES, IVAN; MANZI, SOPHIE; SUESCUN, UXUE; et al. Species diversity and biogeography of an ancient frog clade from the Guiana Shield (Anura: Microhylidae: Adelastes, Otophryne, Synapturanus) exhibiting spectacular phenotypic diversification. Biological Journal of the Linnean Society, v. 132, n. 2, p. 233-256, FEB 2021. (13/50297-0, 03/10335-8, 11/50146-6, 12/15754-8)

FOUQUET, ANTOINE; MARINHO, PEDRO; REJAUD, ALEXANDRE; CARVALHO, THIAGO R.; CAMINER, MARCEL A.; JANSEN, MARTIN; RAINHA, RAISSA N.; RODRIGUES, MIGUEL T.; WERNECK, FERNANDA P.; LIMA, ALBERTINA P.; et al. Systematics and biogeography of the Boana albopunctata species group (Anura, Hylidae), with the description of two new species from Amazonia. SYSTEMATICS AND BIODIVERSITY, v. 19, n. 4, p. 375-399, MAY 19 2021. (11/50146-6, 13/50741-7, 13/50297-0, 03/10335-8, 17/08489-0)