Perfil de expressão gênica revela candidatos a marcadores moleculares em carcinoma de células escamosas de laringe

• Processo: 08/10185-0
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Publicações científicas - Artigo
• Data de Início da vigência: 01 de dezembro de 2008
• Data de Término da vigência: 31 de maio de 2009
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Humana e Médica
• Pesquisador responsável: Paula Rahal
• Beneficiário: Paula Rahal
• Instituição Sede: Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas (IBILCE). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de São José do Rio Preto. São José do Rio Preto , SP, Brasil
• Assunto(s): Cistatina B Oncologia molecular Expressão gênica
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: carcinoma de laringe | cDNA microarray | cistatina B | expressão gênica | PCR quantitativa em tempo real | Oncologia Molecular

Resumo

O carcinoma epidermóide da laringe é muito comum em câncer de cabeça e pescoço, com altas taxas de mortalidade e de prognóstico reservado. Neste estudo, nós comparamos os perfis de expressão de 13 amostras clínicas de tumor de laringe e 10 amostras não-neoplásicas da laringe utilizando um cDNA microarray custom-built contendo 331 sondas de 284 genes previamente identificados pela análise informática de dados de EST como marcadores de tumores de cabeça e pescoço. Trinta e cinco genes mostraram diferenças estatisticamente significantes (SNR e|1,0 |, pd0.001) na expressão entre amostras tumorais e não tumorais de laringe. A anotação funcional indicava que estes genes estão envolvidos em processos celulares relevantes para o fenótipo neoplásico, tais como apoptose, ciclo celular, reparo de DNA, proteólise, inibição da protease, transdução de sinal e regulação transcricional. Seis dos transcritos identificados mapeavam em regiões intrônicas de genes codificantes de proteínas e podem compreender exons não anotados como ainda longos ncRNAs não caracterizados com um papel regulador no programa de expressão gênica em tecido de laringe. A expressão diferencial de 10 desses genes (ADCY6, AES, AL2SCR3, CRR9, CSTB, DUSP1, MAP3K5, Plat, UBL1 e ZNF706) foi confirmada independentemente por PCR em tempo real. Dentre estes, o produto do gene CSTB tem atividade inibitória de protease de cisteína que tem sido associada com uma função antimetastática. Interessantemente, CSTB mostrou uma baixa expressão nas amostras tumorais analisadas (p<0,0001). O conjunto de genes aqui identificados contribui para uma melhor compreensão da base molecular do câncer de laringe, e fornece marcadores candidatos para melhorar o diagnóstico, prognóstico e tratamento deste carcinoma. (AU)