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Genômica comparada de espécies de moscas-das-frutas do grupo fraterculus. II. A próxima geração

Processo: 10/20455-4
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Regular
Vigência: 01 de setembro de 2011 - 28 de fevereiro de 2014
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
Pesquisador responsável:Reinaldo Otávio Alvarenga Alves de Brito
Beneficiário:Reinaldo Otávio Alvarenga Alves de Brito
Instituição-sede: Centro de Ciências Biológicas e da Saúde (CCBS). Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR). São Carlos , SP, Brasil
Pesq. associados:Vanessa Regina Gonçalves
Auxílios(s) vinculado(s):13/50202-9 - Comparison of intra- and inter-specific genetic architecture of speciation in South-American fruit flies, AP.R
Bolsa(s) vinculada(s):12/07987-2 - Manutenção de moscas das frutas e treinamento em práticas laboratoriais e moleculares, BP.TT
Assunto(s):Mosca-das-frutas  Genômica  Evolução molecular 

Resumo

Embora as moscas das frutas Anastrepha fraterculus e A. obliqua sejam das maiores ameaças à fruticultura nacional, sabemos muito pouco ainda sobre a biologia e genética das mesmas. A existência de mapas genéticos e novos marcadores genéticos nestas espécies são fundamentais não apenas para o estabelecimento de marcadores que permitam-nos distingüir tais espécies, mas também para estudos de genômica evolutiva que nos permitam um melhor conhecimento sobre estas espécies. Em projeto anterior, utilizamos de dados de ESTs (Expressed Sequenced Tags) de tecidos reprodutivos para isolar 100 SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms) e estabelecer um mapa de ligação inicial para A. obliqua. A obtenção destes dados para estes tefritídeos é importante não apenas pelo aspecto teórico de um melhor entendimento dos processos de evolução genômica que ocorreram entre tais insetos, mas também por sua aplicação prática em estratégias quantitativas de identificação de genes com importância econômica. Este projeto pretende expandir a análise de ESTs já feita tanto pela maior caracterização das bibliotecas previamente estabelecidas mas também pelo uso de técnicas modernas de seqüenciamento de próxima geração. Pelo uso destas estratégias, que são mais eficientes e mais baratas buscamos identificar ao menos 5000 SNPs, um número significativamente maior do que já identificados, 500 dos quais serão utilizados para a criação de mapas de ligação de alta resolução nestas espécies. Tais mapas de ligação de alta resolução serão utilizados na genômica comparada entre estas espécies buscando a identificação de genes envolvidos na diferenciação das mesmas e também em estudos de genômica evolutiva. Utilizaremos para tanto também a análise de expressão gênica diferencial para corroborar papel de genes envolvidos com a diferenciação destas espécies. A determinação destes genes será de grande valia para entender tanto os processos envolvidos na sua especiação, mas também poderão permitir o estabelecimento de melhores condições para o controle destas grandes pragas agrícolas. (AU)

Publicações científicas (9)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
DIAZ, FERNANDO; LIMA, ANDRE LUIS A.; NAKAMURA, ALINE M.; FERNANDES, FERNANDA; SOBRINHO, JR., IDERVAL; DE BRITO, REINALDO A. Evidence for Introgression Among Three Species of the Anastrepha fraterculus Group, a Radiating Species Complex of Fruit Flies. FRONTIERS IN GENETICS, v. 9, SEP 10 2018. Citações Web of Science: 3.
CONGRAINS, CARLOS; CAMPANINI, EMELINE B.; TORRES, FELIPE R.; REZENDE, VICTOR B.; NAKAMURA, ALINE M.; DE OLIVEIRA, JANAINA L.; LIMA, ANDRE L. A.; CHAHAD-EHLERS, SAMIRA; SOBRINHO, JR., IDERVAL S.; DE BRITO, REINALDO A. Evidence of Adaptive Evolution and Relaxed Constraints in Sex-Biased Genes of South American and West Indies Fruit Flies (Diptera: Tephritidae). GENOME BIOLOGY AND EVOLUTION, v. 10, n. 1, p. 380-395, JAN 2018. Citações Web of Science: 1.
DE OLIVEIRA, JANAINA LIMA; SOBRINHO-JUNIOR, IDERVAL SILVA; CHAHAD-EHLERS, SAMIRA; DE BRITO, REINALDO ALVES. Evolutionary coincidence of adaptive changes in exuperantia and the emergence of bicoid in Cyclorrhapha (Diptera). DEVELOPMENT GENES AND EVOLUTION, v. 227, n. 5, p. 355-365, SEP 2017. Citações Web of Science: 1.
CHAHAD-EHLERS, S.; ARTHUR, L. P.; LIMA, A. L. A.; GESTO, J. S. M.; TORRES, F. R.; PEIXOTO, A. A.; DE BRITO, R. A. Expanding the view of Clock and cycle gene evolution in Diptera. Insect Molecular Biology, v. 26, n. 3, p. 317-331, JUN 2017. Citações Web of Science: 4.
CAMPANINI, EMELINE BONI; CONGRAINS, CARLOS; TORRES, FELIPE RAFAEL; DE BRITO, REINALDO ALVES. . Odorant-binding proteins expression patterns in recently diverged species of Anastrepha fruit flies. SCIENTIFIC REPORTS, v. 7, MAY 19 2017. Citações Web of Science: 3.
CAMPANINI, EMELINE BONI; DE BRITO, REINALDO ALVES. Molecular evolution of Odorant-binding proteins gene family in two closely related Anastrepha fruit flies. BMC Evolutionary Biology, v. 16, OCT 7 2016. Citações Web of Science: 4.
REZENDE, VICTOR BORGES; CONGRAINS, CARLOS; LIMA, ANDRE LUIS A.; CAMPANINI, EMELINE BONI; NAKAMURA, ALINE MINALI; DE OLIVEIRA, JANAINA LIMA; CHAHAD-EHLERS, SAMIRA; SOBRINHO JUNIOR, IDERVAL; DE BRITO, REINALDO ALVES. Head Transcriptomes of Two Closely Related Species of Fruit Flies of the Anastrepha fraterculus Group Reveals Divergent Genes in Species with Extensive Gene Flow. G3-GENES, GENOMES, GENETICS, v. 6, n. 10, p. 3283-3295, OCT 2016. Citações Web of Science: 7.
NAKAMURA, ALINE MINALI; CHAHAD-EHLERS, SAMIRA; LIMA, ANDRE LUIS A.; TANIGUTI, CRISTIANE HAYUMI; SOBRINHO, JR., IDERVAL; TORRES, FELIPE RAFAEL; DE BRITO, REINALDO ALVES. Reference genes for accessing differential expression among developmental stages and analysis of differential expression of OBP genes in Anastrepha obliqua. SCIENTIFIC REPORTS, v. 6, JAN 28 2016. Citações Web of Science: 20.
GONCALVES, V. R.; SOBRINHO, JR., I. S.; MALAGO-, JR., W.; HENRIQUE-SILVA, F.; DE BRITO, R. A. Transcriptome analysis of female reproductive tissues of Anastrepha obliqua and molecular evolution of eggshell proteins in the fraterculus group. Insect Molecular Biology, v. 22, n. 5, p. 551-561, OCT 2013. Citações Web of Science: 4.

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