Isolamento e caracterização de microRNAs e seus genes alvo em cana-de-açúcar

• Processo: 07/58289-5
• Linha de fomento: Auxílio à Pesquisa - Programa BIOEN - Apoio a Jovens Pesquisadores
• Vigência: 01 de julho de 2008 - 30 de novembro de 2012
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Vegetal
• Pesquisador responsável: Fabio Tebaldi Silveira Nogueira
• Beneficiário: Fabio Tebaldi Silveira Nogueira
• Instituição-sede: Instituto de Biociências (IBB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Botucatu. Botucatu , SP, Brasil
• Bolsa(s) vinculada(s): 11/19512-6 - Análise funcional do papel da enzima DNA metiltransferase 2 (DNMT2) no desenvolvimento e resposta à estresses e identificação e caracterização de fragmentos derivados de tRNA (tRFs) em Arabidopsis thaliana., BP.DR; 11/16475-2 - Estabelecimento de protocolo de hibridização in situ, para análise de microRNAs e seus genes-alvo em cana-de-açúcar (Saccharum spp.)., BP.TT; 11/08363-0 - Geração de banco de dados de microRNAs e identificação de seus genes-alvo em cana-de-açúcar, BP.IC; + mais bolsas vinculadas 10/10091-5 - Estabelecimento de protocolo eficiente de regeneração in vitro e transformação genética via Agrobacterium tumefaciens de Brachypodium distachyon, BP.TT; 09/12710-7 - Análise do papel da via metabólica regulada pelo microRNA156 no processo de brotação de gemas laterais, BP.MS; 08/50812-3 - Isolamento e caracterização de microRNAs e seus genes-alvo em cana-de-açúcar, BP.JP.BIOEN - menos bolsas vinculadas
• Assunto(s): Cana-de-açúcar Bioenergia
• Publicação FAPESP: https://media.fapesp.br/bv/uploads/publicacoes/pasta_bioen_jun2012_56.pdf

Resumo

RNAs não codantes de 20-27 nucleotídeos (nt) regulam transcricionalmente ou pós-transcricionalmente a expressão de genes endógenos, modelando o transcriptoma e a produção de proteínas. Dentre esses, micro-RNAs (miRNAs) desempenham papel ímpar no desenvolvimento vegetal, observação comprovada pela avaliação fenotípica e molecular de plantas transgênicas e de mutantes defectivos na produção de tais RNAs. MiRNAs são produzidos a partir de precursores longos, os quais são posteriormente processados por enzimas específicas, gerando o miRNA maduro (20-22 nt). Em plantas, o miRNA maduro preferencialmente guia a clivagem do miRNA de genes-alvo, afetando diversos aspectos do desenvolvimento. O sequenciamento de populações de RNAs regulatórios possibilitou a identificação de miRNAs conservados e específicos em diferentes espécies vegetais, embora estudos em plantas de importância econômica sejam ainda incipientes. Vários membros de famílias gênicas envolvidas em mecanismos de formação e brotamento de gemas laterais são alvos de regulação por miRNAs, sugerindo que esses RNAs estão envolvidos nesse aspecto do desenvolvimento vegetal. A brotação de gemas laterais em cana-de-açúcar é um fator importante para a germinação e arquitetura dos ramos laterais, afetando tanto a biomassa foliar quanto o número de inflorescências. A identificação e a caracterização de miRNAs e seus genes-alvo poderão contribuir não somente para o melhor entendimento dos mecanismos associados ao desenvolvimento inicial de cana-de-açúcar, mas também ter potenciais aplicações no melhoramento vegetal. (AU)

Publicações científicas

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(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

ALVES, CRISTIANE S.; VICENTINI, RENATO; DUARTE, GUSTAVO T.; PINOTI, VITOR F.; VINCENTZ, MICHEL; NOGUEIRA, FABIO T. S. Genome-wide identification and characterization of tRNA-derived RNA fragments in land plants. Plant Molecular Biology, v. 93, n. 1-2, p. 35-48, JAN 2017. Citações Web of Science: 22.

ORTIZ MOREA, EDNA GICELA; DA SILVA, EDER MARQUES; FERREIRA E SILVA, GERALDO FELIPE; VALENTE, GUILHERME TARGINO; BARRERA ROJAS, CARLOS HERNAN; VINCENTZ, MICHEL; SIVEIRA NOGUEIRA, FABIO TEBALDI. Functional and evolutionary analyses of the miR156 and miR529 families in land plants. BMC PLANT BIOLOGY, v. 16, FEB 3 2016. Citações Web of Science: 30.

ORTIZ-MOREA, FAUSTO A.; VICENTINI, RENATO; SILVA, GERALDO F. F.; SILVA, EDER M.; CARRER, HELAINE; RODRIGUES, ANA P.; NOGUEIRA, FABIO T. S. Global analysis of the sugarcane microtranscriptome reveals a unique composition of small RNAs associated with axillary bud outgrowth. Journal of Experimental Botany, v. 64, n. 8, p. 2307-2320, MAY 2013. Citações Web of Science: 26.

ZANCA, ALMIR S.; VICENTINI, RENATO; ORTIZ-MOREA, FAUSTO A.; DEL BEM, LUIZ E. V.; DA SILVA, MARCIO J.; VINCENTZ, MICHEL; NOGUEIRA, FABIO T. S. Identification and expression analysis of microRNAs and targets in the biofuel crop sugarcane. BMC PLANT BIOLOGY, v. 10, NOV 24 2010. Citações Web of Science: 47.