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Estudo da variabilidade genética do perfil de ácidos graxos da carne de bovinos da raça Nelore terminados em confinamento

Processo: 11/21241-0
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Apoio a Jovens Pesquisadores
Vigência: 01 de abril de 2012 - 31 de março de 2015
Área do conhecimento:Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
Pesquisador responsável:Fernando Sebastián Baldi Rey
Beneficiário:Fernando Sebastián Baldi Rey
Instituição-sede: Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia (FMVZ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Pesq. associados:Angélica Simone Cravo Pereira ; Arione Augusti Boligon ; Fabio Ricardo Pablos de Souza ; Francisco Palma Rennó ; Guilherme Jordão de Magalhães Rosa ; Henrique Nunes de Oliveira ; Humberto Tonhati ; Lucia Galvão de Albuquerque ; Luis Artur Loyola Chardulo ; Luis Felipe Prada e Silva ; Roberta Carrilho Canesin ; Roberto Carvalheiro ; Rusbel Raúl Aspilcueta Borquis
Bolsa(s) vinculada(s):13/11853-4 - Análise das variações no número de cópias no genoma de bovinos Nelore e suas associações com o perfil de ácidos graxos da carne, BP.DR
12/23979-0 - Associação genética entre o perfil de ácidos graxos da carne com as características da carcaça e carne de bovinos da raça Nelore, BP.MS
12/15098-3 - Estudo da expressão de genes associados ao perfil de ácidos graxos em bovinos Nelore confinados, BP.MS
Assunto(s):Bovinos de corte  Qualidade da carne  Ácidos graxos  Polimorfismo genético  Seleção genética  Parâmetros genéticos 

Resumo

Dentre os atributos da carne bovina, a composição de ácidos graxos da gordura é relevante pois afeta não somente a palatabilidade da carne, mas também a saúde humana. Os ácidos graxos da carne que contribuem de forma prejudicial para a saúde humana tem recebido considerável atenção nos últimos anos. Vários estudos, utilizando raças taurinas, mostraram a existência de variabilidade genética e, portanto, a possibilidade de melhoramento genético na composição de ácidos graxos em bovinos de corte. Além disto, os resultados destes estudos mostraram estimativas de correlações genéticas favoráveis entre os ácidos graxos. Contudo, ainda são escassos trabalhos deste tipo em raças zebuínas. O perfil de ácidos graxos da carne é uma característica de difícil e custosa mensuração pelos criadores. Para este tipo de características é indicada o uso da chamada seleção genômica, que é um tipo de seleção assistida por marcadores. Na atualidade, está disponível uma série de tecnologias que permitem obter informações genômicas em larga escala em várias espécies de animais domésticos. Apesar dos grandes avanços nas técnicas de biologia molecular que possibilitam a genotipagem dos animais em menor tempo e de forma automatizada, ainda estão sendo desenvolvidas as metodologias que permitem a incorporação de informações genômicas em programas de melhoramento genético animal. O objetivo deste projeto é estudar a variabilidade genética do perfil de ácidos graxos da carne de bovinos da raça Nelore terminados em confinamento, bem como implementar modelos e metodologias que utilizam informações genômicas visando melhorar a composição dos ácidos graxos da carne. Para alcançar este objetivo é proposto os seguintes objetivos específicos: 1) Estudar e caracterizar o perfil de ácidos graxos na carne de bovinos da raça Nelore terminados em confinamento 2) Estimar parâmetros genéticos para a composição de ácidos graxos na carne de bovinos da raça Nelore terminados em confinamento 3) Estudar a associação de polimorfismos de base única (marcadores SNPs) com a composição de ácidos graxos na carne 4) Predizer os valores genéticos a partir das informações genômicas considerando diferentes modelos de análise 5) Verificar os padrões de expressão de genes envolvidos no metabolismo lipídico e na síntese de ácidos graxos 6) Estudar a influência dos polimorfismos SNP (polimorfismos funcionais) sobre a expressão de vários genes de interesse. Serão utilizados aproximadamente, entre 900 a 1.000 animais machos da raça Nelore terminados em confinamento (mínimo 90 dias) com idade ao redor de dois anos de idade. A partir da concentração dos ácidos graxos individuais, será calculada a proporção de ácidos graxos saturados, ácidos graxos monoinsaturados, ácidos graxos poliinsaturados, relação entre ácidos graxos poliinsaturados e ácidos graxos saturados, ácidos graxos da serie n-6, ácidos graxos da serie n-3, e relação n-6/n-3. Além disto, os índices de dessaturação (ID) (adição de uma ligação dupla) e alongamento (IE) (conversão das cadeias de 16 para 18 átomos de carbono) serão calculados. As estimativas de parâmetros genéticos e componentes de (co)variâncias para estas características, serão estimados pelo método da máxima verossimilhança restrita livre de derivada. Na genotipagem dos animais será utilizado um painel com mais de 777.000 SNP do BovineSNP BeadChip. Serão realizadas análises de associação do genoma amplo, por meio de análises de regressão simples e múltipla, com o objetivo de obter uma varredura no genoma procurando regiões de interesse. Posteriormente, os SNPs com efeitos significativos obtidos na análise de regressão múltipla serão analisados aplicando um modelo animal incluindo os efeitos dos SNPs no modelo. Os valores genômicos serão obtidos considerando diferentes distribuições a priori para os efeitos e variâncias dos SNPs. As estimativa dos efeitos dos marcadores serão estimadas utilizando os modelos BLUP, BayesB e BayesLasso. (AU)

Publicações científicas (9)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
MUELLER, LENISE FREITAS; CARVALHO BALIEIRO, JULIO CESAR; FERRINHO, ADRIELLE MATIAS; MARTINS, TAIANE DA SILVA; DA SILVA CORTE, ROSANA RUEGGER PEREIRA; DE AMORIM, TAMYRES RODRIGUES; MANGINI FURLAN, JOYCE DE JESUS; BALDI, FERNANDO; CRAVO PEREIRA, ANGELICA SIMONE. Gender status effect on carcass and meat quality traits of feedlot Angus x Nellore cattle. ANIMAL SCIENCE JOURNAL, v. 90, n. 8, p. 1078-1089, AUG 2019. Citações Web of Science: 0.
JUSTINO CHIAIA, HERMENEGILDO LUCAS; PERIPOLLI, ELISA; DE OLIVEIRA SILVA, RAFAEL MEDEIROS; BRAGA FEITOSA, FABIELE LOISE; ANTUNES DE LEMOS, MARCOS VINICIUS; BERTON, MARIANA PIATTO; OLIVIERI, BIANCA FERREIRA; ESPIGOLAN, RAFAEL; TONUSSI, RAFAEL LARA; MANSAN GORDO, DANIEL GUSTAVO; DE ALBUQUERQUE, LUCIA GALVAO; DE OLIVEIRA, HENRIQUE NUNES; FERRINHO, ADRIELLE MATHIAS; MUELLER, LENISE FREITAS; KLUSKA, SABRINA; TONHATI, HUMBERTO; CRAVO PEREIRA, ANGELICA SIMONE; AGUILAR, IGNACIO; BALDI, FERNANDO. Genomic prediction ability for beef fatty acid profile in Nelore cattle using different pseudo-phenotypes. JOURNAL OF APPLIED GENETICS, v. 59, n. 4, p. 493-501, NOV 2018. Citações Web of Science: 0.
PERIPOLLI, ELISA; METZGER, JULIA; ANTUNES DE LEMOS, MARCOS VINICIUS; STAFUZZA, NEDENIA BONVINO; KLUSKA, SABRINA; OLIVIERI, BIANCA FERREIRA; BRAGA FEITOSA, FABIELI LOUISE; BERTON, MARIANA PIATTO; LOPES, FERNANDO BRITO; MUNARI, DANISIO PRADO; LOBO, RAYSILDO BARBOSA; MAGNABOSCO, CLAUDIO DE ULHOA; DI CROCE, FERNANDO; OSTERSTOCK, JASON; DENISE, SUE; CRAVO PEREIRA, ANGELICA SIMONE; BALDI, FERNANDO. Autozygosity islands and ROH patterns in Nellore lineages: evidence of selection for functionally important traits. BMC Genomics, v. 19, SEP 17 2018. Citações Web of Science: 2.
ANTUNES DE LEMOS, MARCOS VINICIUS; BERTON, MARIANA PIATTO; FERREIRA DE CAMARGO, GREGORIO MIGUEL; PERIPOLLI, ELISA; DE OLIVEIRA SILVA, RAFAEL MEDEIROS; OLIVIERI, BIANCA FERREIRA; CESAR, ALINE S. M.; CRAVO PEREIRA, ANGELICA SIMONE; DE ALBUQUERQUE, LUCIA GALVAO; DE OLIVEIRA, HENRIQUE NUNES; TONHATI, HUMBERTO; BALDI, FERNANDO. Copy number variation regions in Nellore cattle: Evidences of environment adaptation. LIVESTOCK SCIENCE, v. 207, p. 51-58, JAN 2018. Citações Web of Science: 7.
ABOUJAOUDE, CAROLYN; CRAVO PEREIRA, ANGELICA SIMONE; BRAGA FEITOSA, FABIELI LOUISE; ANTUNES DE LEMOS, MARCOS VINICIUS; JUSTINO CHIAIA, HERMENEGILDO LUCAS; BERTON, MARIANA PIATTO; PERIPOLLI, ELISA; DE OLIVEIRA SILVA, RAFAEL MEDEIROS; FERRINHO, ADRIELLE MATHIAS; MUELLER, LENISE FREITAS; OLIVIERI, BIANCA FERREIRA; DE ALBUQUERQUE, LUCIA GALVAO; DE OLIVEIRA, HENRIQUE NUNES; TONHATI, HUMBERTO; ESPIGOLAN, RAFAEL; TONUSSI, RAFAEL; GORDO, DANIEL MANSAN; BRAGA MAGALHAES, ANA FABRICIA; BALDI, FERNANDO. Genetic parameters for fatty acids in intramuscular fat from feedlot-finished Nelore carcasses. ANIMAL PRODUCTION SCIENCE, v. 58, n. 2, p. 234-243, 2018. Citações Web of Science: 2.
TONUSSI, RAFAEL LARA; DE OLIVEIRA SILVA, RAFAEL MEDEIROS; BRAGA MAGALHAES, ANA FABRICIA; ESPIGOLAN, RAFAEL; PERIPOLLI, ELISA; OLIVIERI, BIANCA FERREIRA; BRAGA FEITOSAL, FABIELI LOISE; ANTUNES LEMOS, MARCOS VINICFUS; BERTON, MARIANA PIATTO; JUSTINO CHIAIA, HERMENEGILDO LUCAS; CRAVO PEREIRA, ANGELICA SIMONE; LOBO, RAYSILDO BARBOSA; FRAMARTINO BEZERRA, LUIZ ANTONIO; MAGNABOSCO, CLAUDIO DE ULHOA; LOURENCO, DANIELA ANDRESSA LINO; AGUILAR, IGNACIO; BALDI, FERNANDO. Application of single step genomic BLUP under different uncertain paternity scenarios using simulated data. PLoS One, v. 12, n. 9 SEP 28 2017. Citações Web of Science: 5.
DIAS, M. M.; CANOVAS, A.; MANTILLA-ROJAS, C.; RILEY, D. G.; LUNA-NEVAREZ, P.; COLEMAN, S. J.; SPEIDEL, S. E.; ENNS, R. M.; ISLAS-TREJO, A.; MEDRANO, J. F.; MOORE, S. S.; FORTES, M. R. S.; NGUYEN, L. T.; VENUS, B.; DIAZ, I. S. D. P.; SOUZA, F. R. P.; FONSECA, L. F. S.; BALDI, F.; ALBUQUERQUE, L. G.; THOMAS, M. G.; OLIVEIRA, H. N. SNP detection using RNA-sequences of candidate genes associated with puberty in cattle. Genetics and Molecular Research, v. 16, n. 1 MAR 24 2017. Citações Web of Science: 6.
ABOUJAOUDE, CAROLYN; BERTON, MARIANA PIATTO; DE OLIVEIRA, HENRIQUE NUNES; ESPIGOLAN, RAFAEL; TONUSSI, RAFAEL LARA; DE OLIVEIRA SILVA, RAFAEL MEDEIROS; BALDI, FERNANDO. . JOURNAL OF APPLIED GENETICS, v. 58, n. 1, p. 123-132, FEB 2017. Citações Web of Science: 4.
LEMOS, MARCOS V. A.; JUSTINO CHIAIA, HERMENEGILDO LUCAS; BERTON, MARIANA PIATTO; FEITOSA, FABIELI L. B.; ABOUJAOUD, CAROLYN; CAMARGO, GREGORIO M. F.; PEREIRA, ANGELICA S. C.; ALBUQUERQUE, LUCIA G.; FERRINHO, ADRIELLE M.; MUELLER, LENISE F.; MAZALLI, MONICA R.; FURLAN, JOYCE J. M.; CARVALHEIRO, ROBERTO; GORDO, DANIEL M.; TONUSSI, RAFAEL; ESPIGOLAN, RAFAEL; DE OLIVEIRA SILVA, RAFAEL MEDEIROS; DE OLIVEIRA, HENRIQUE NUNES; DUCKETT, SUSAN; AGUILAR, IGNACIO; BALDI, FERNANDO. Genome-wide association between single nucleotide polymorphisms with beef fatty acid profile in Nellore cattle using the single step procedure. BMC Genomics, v. 17, MAR 9 2016. Citações Web of Science: 23.

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