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Uso da abordagem de biologia de sistemas para desenvolver um modelo de funcionamento em plantas

Resumo

O avanço de setores da ciência como as Mudanças Climáticas Globais e a Bioenergia requerem o conhecimento profundo de como as plantas respondem ao ambiente em mudança. Ainda que plantas modelo e nativas tenham sido estudadas do ponto de vista da ecofisiologia, bioquímica e biologia molecular, as abordagens têm sido feitas em um ou dois níveis de organização, sendo que uma limitação é a grande quantidade de dados produzida. A presente proposta pretende expandir estudos utilizando o sorgo como planta modelo, de maneira a integrar o funcionamento deste de forma integrada em diferentes níveis de organização. Pretendemos obter dados de fisiologia, metabolismo e expressão gênica em quadro condições: [CO2] ambiente, [CO2] elevado; [CO2] ambiente com déficit hídrico e [CO2] elevado com déficit hídrico. Dois grupos de pesquisa em biologia de plantas interagirão com um grupo de matemática e ciência da computação com a finalidade de atingir as seguintes metas: 1) testar e refinar ferramentas de análise de redes em biologia; 2) desenvolver ferramentas de integração de dados a partir de experimentos biológicos; 3) desenvolver ferramentas de visualização; 4) tentar extrapolar as análises para outras espécies vegetais. (AU)

Matéria(s) publicada(s) na Revista Pesquisa FAPESP sobre o auxílio::
Aliados inverosímiles 
Aliados improváveis 
Receita de celulose 
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Science and Technology Research News (EUA): Software Compares More Than Two Complex Networks Simultaneously (17/Out/2019)
Madrimasd (Espanha): Un software permite comparar más de dos redes complejas a la vez (27/Set/2019)
Green Area (Líbano): Un software permite comparar más de dos redes complejas a la vez (26/Set/2019)
NCYT Amazings (Espanha): Un software permite comparar más de dos redes complejas a la vez (25/Set/2019)
Catalunya Vanguardista (Espanha): Un software permite comparar más de dos redes complejas a la vez (25/Set/2019)
Jornal da USP online: Software pretende desenvolver uma forma diferente de abordar o mundo (13/Set/2019)
Brasil CT&I: Software permite comparar mais de duas redes complexas simultaneamente (10/Set/2019)

Publicações científicas (4)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
DE PINHO TAVARES, EVELINE QUEIROZ; MATTOS MARTINS, MARINA CAMARA; GRANDIS, ADRIANA; ROMIM, GRAYCE H.; PIOVEZANI, AMANDA RUSISKA; GAIARSA, JONAS WEISSMANN; BUCKERIDGE, MARCOS SILVEIRA. Newly identified miRNAs may contribute to aerenchyma formation in sugarcane roots. PLANT DIRECT, v. 4, n. 3 MAR 2020. Citações Web of Science: 0.
LOCOSSELLI, GIULIANO MASELLI; BUCKERIDGE, MARCOS SILVEIRA. Dendrobiochemistry, a missing link to further understand carbon allocation during growth and decline of trees. TREES-STRUCTURE AND FUNCTION, v. 31, n. 6, p. 1745-1758, DEC 2017. Citações Web of Science: 12.
TAVARES, EVELINE Q. P.; BUCKERIDGE, MARCOS S. Do plant cell walls have a code?. Plant Science, v. 241, p. 286-294, DEC 2015. Citações Web of Science: 9.
DE SOUZA, AMANDA P.; COCURON, JEAN-CHRISTOPHE; GARCIA, ANA CAROLINA; ALONSO, ANA PAULA; BUCKERIDGE, MARCOS S. Changes in Whole-Plant Metabolism during the Grain-Filling Stage in Sorghum Grown under Elevated CO2 and Drought. Plant Physiology, v. 169, n. 3, p. 1755-1765, NOV 2015. Citações Web of Science: 10.

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