Biologia estrutural de proteinas processadoras de acidos nucleicos em bacterias com elevada relevancia biomedica

• Processo: 11/50963-4
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de abril de 2012
• Data de Término da vigência: 30 de setembro de 2014
• Área do conhecimento: Ciências da Saúde - Farmácia
• Pesquisador responsável: Martin Rodrigo Alejandro Wurtele Alfonso
• Beneficiário: Martin Rodrigo Alejandro Wurtele Alfonso
• Instituição Sede: Instituto de Ciência e Tecnologia (ICT). Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP). Campus São José dos Campos. São José dos Campos , SP, Brasil
• Assunto(s): Biologia estrutural Bioquímica de proteínas Obesidade
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Biologia Estrutural | Bioquimica De Proteinas | Desenho Racional De Inibidores | Obesidade | Rna Inibitorio

Resumo

O fenômeno do RNA inibitório tem recebido atenção elevada na área de biomedicina nos últimos anos. Este projeto visa analisar um grupo de proteínas denominado Cas, que está envolvido em recentemente descobertos processos de regulação e processamento de RNA em procariontes. Proteínas deste grupo participam no processamento do RNA inibitório do assim denominado sistema CRISPR. Pretendemos clonar, expressar, purificar, analisar bioquimicamente e estruturalmente e também realizar primeiros ensaios para a descoberta de inibidores com diversas proteínas desta família. Como o sistema CRISPR participa na defesa de bactérias contra bacteriófagos e a aquisição de plasmídeos, este trabalho pode abrir caminho para a realização de estratégias para o tratamento de doenças causadas por estes organismos. Faz parte desta proposta, nuclear na UNIFESP, Campus São José dos Campos, um grupo de pesquisa em biologia estrutural e desenho racional de inibidores que teria como objetivo, após a análise bioquímica, realizar técnicas da bioinformática estrutural para detectar mecanismos de inibição específicos para esta classe de alvos medicinais de elevadíssima importância para a saúde humana. (AU)

Publicações científicas

(10)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

GALLO, GLORIA; AUGUSTO, GILLES; RANGEL, GIULLIANA; ZELANIS, ANDRE; MORI, MARCELO A.; CAMPOS, CLAUDIA BARBOSA; WUERTELE, MARTIN. Purification, crystallization, crystallographic analysis and phasing of the CRISPR-associated protein Csm2 from Thermotoga maritima. ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY COMMUNICATIONS, v. 71, n. 10, p. 1223-1227, OCT 2015. (11/50963-4)

COELHO, CAMILA; GALLO, GLORIA; CAMPOS, CLAUDIA B.; HARDY, LEON; WURTELE, MARTIN. Biochemical screening for SARS-CoV-2 main protease inhibitors. PLoS One, v. 15, n. 10, OCT 6 2020. (11/50963-4)

COELHO, CAMILA; GALLO, GLORIA; HARDY, LEON; BOTTAZZI, MARIA ELENA; CAMPOS, CLAUDIA; WURTELE, MARTIN. Biochemical Screening of Potent Zika Virus Protease Inhibitors. CHEMMEDCHEM, v. 17, n. 8, p. 12-pg., 2022-02-09. (11/50963-4)

MAIELLO, FERNANDO; GALLO, GLORIA; COELHO, CAMILA; SUCHARSKI, FERNANDA; HARDY, LEON; WURTELE, MARTIN. Crystal structure of Thermus thermophilus methylenetetrahydrofolate dehydrogenase and determinants of thermostability. PLoS One, v. 15, n. 5, MAY 13 2020. (11/50963-4)

GALLO, GLORIA; AUGUSTO, GILLES; RANGEL, GIULLIANA; ZELANIS, ANDRE; MORI, MARCELO A.; CAMPOS, CLAUDIA BARBOSA; WUERTELE, MARTIN. Purification, crystallization, crystallographic analysis and phasing of the CRISPR-associated protein Csm2 from Thermotoga maritima. ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY COMMUNICATIONS, v. 71, p. 5-pg., 2015-10-01. (11/50963-4)

GALLO, GLORIA; AUGUSTO, GILLES; RANGEL, GIULLIANA; ZELANIS, ANDRE; MORI, MARCELO A.; CAMPOS, CLAUDIA B.; WUERTELE, MARTIN. Structural basis for dimer formation of the CRISPR-associated protein Csm2 of Thermotoga maritima. FEBS Journal, v. 283, n. 4, p. 10-pg., 2016-02-01. (11/50963-4)

GALLO, GLORIA; AUGUSTO, GILLES; RANGEL, GIULLIANA; ZELANIS, ANDRE; MORI, MARCELO A.; CAMPOS, CLAUDIA B.; WUERTELE, MARTIN. Structural basis for dimer formation of the CRISPR-associated protein Csm2 of Thermotoga maritima. FEBS Journal, v. 283, n. 4, p. 694-703, FEB 2016. (11/50963-4)

GALLO, GLORIA; BARCICK, UILLA; COELHO, CAMILA; SALARDANI, MURILO; CAMACHO, MAURICIO F.; CAJADO-CARVALHO, DANIELA; LOURES, FLAVIO V.; SERRANO, SOLANGE M. T.; HARDY, LEON; ZELANIS, ANDRE; et al. A proteomics-MM/PBSA dual approach for the analysis of SARS-CoV-2 main protease substrate peptide specificity. Peptides, v. 154, p. 8-pg., 2022-08-01. (11/50963-4, 13/07467-1, 19/07282-8)

SUCHARSKI, FERNANDA; GALLO, GLORIA; COELHO, CAMILA; HARDY, LEON; WUERTELE, MARTIN. Modeling the role of charged residues in thermophilic proteins by rotamer and dynamic cross correlation analysis. Journal of Molecular Modeling, v. 29, n. 5, p. 10-pg., 2023-05-01. (11/50963-4)

BORGES, BRUNO; GALLO, GLORIA; COELHO, CAMILA; NEGRI, NAIANE; MAIELLO, FERNANDO; HARDY, LEON; WURTELE, MARTIN. Dynamic cross correlation analysis of Thermus thermophilus alkaline phosphatase and determinants of thermostability. BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-GENERAL SUBJECTS, v. 1865, n. 7, JUL 2021. (11/50963-4)