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Biologia de sistemas das interações microbianas na decomposição do bagaço de cana

Processo: 10/18198-3
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Pesquisador Visitante - Internacional
Vigência: 15 de janeiro de 2011 - 14 de janeiro de 2012
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
Pesquisador responsável:Fábio Márcio Squina
Beneficiário:Fábio Márcio Squina
Pesquisador visitante: Rolf Alexander Prade
Inst. do pesquisador visitante: Oklahoma State University, Estados Unidos
Instituição-sede: Laboratório Nacional de Luz Síncrotron (LNLS). Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais (CNPEM). Ministério da Ciência, Tecnologia, Inovações e Comunicações (Brasil). Campinas , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:08/58037-9 - Geração de biblioteca para conversão enzimática de biomassa a partir de metagenoma do solo, AP.BIOEN.JP
Assunto(s):Genômica  Proteômica  Bagaço de cana-de-açúcar  Bioetanol  Biodegradação  Intercâmbio de pesquisadores 

Resumo

Bagaço de cana assim como outras fontes de biomassa tais como milho e sorgo são produzidas em grandes quantidades por usinas alcooleiras e biorefinarias. A utilização da biomassa como fonte de açúcares fermentáveis (obtido pela degradação da celulose e hemicelulose) viabilizando a produção de bicombustíveis de segunda geração, é um item prioritário nos programas de bioenergia de muitas nações. Na natureza biomassa morta é inteiramente reciclada por complexas interações de sistemas microbianos. Isso significa que os polímeros recalcitrantes são decompostos em suas unidades monoméricas (açúcares e fenóis) e utilizados pelos microrganismos para promover o crescimento vegetativo, produzindo CO2 e H2O. A nossa hipótese diz que o processo natural de reciclagem integral da biomassa requer um sistema enzimático, em vez de enzimas individuais. Portanto a nossa proposta sugere entender este sistema enzimático da natureza, determinar a sua base genética e reconstruir este sistema enzimático em um sistema heterólogo apto para produção comercial destas proteínas. O projeto Biologia de Sistemas das Interações microbianas na Decomposição do Bagaço de cana é uma colaboração entre a Oklahoma State University e o CTBE e faz interface com projetos em biomassa de sorgo, milho financiados pelos Departamentos de Energia (Contrato ZDJ-7-77608-01) e Agricultura (contrato 2007-35504-18244) dos Estados Unidos e a companhia Edenspace Corp. (contrato 06103-OKL) e o projeto "Library generation for biomass-conversion enzymes from soil metagenome" (Investigator Principal: Fabio Squina), financiado pelo programa BIOEN da FAPESP (Processo: 2008/58037-9). (AU)

Publicações científicas (6)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
MANDELLI, F.; COUGER, M. B.; PAIXAO, D. A. A.; MACHADO, C. B.; CARNIELLI, C. M.; ARICETTI, J. A.; POLIKARPOV, I.; PRADE, R.; CALDANA, C.; PAES LEME, A. F.; MERCADANTE, A. Z.; RIANO-PACHON, D. M.; SQUINA, FABIO MARCIO. Thermal adaptation strategies of the extremophile bacterium Thermus filiformis based on multi-omics analysis. EXTREMOPHILES, v. 21, n. 4, p. 775-788, JUL 2017. Citações Web of Science: 6.
COTA, JUNIO; CORREA, THAMY L. R.; DAMASIO, ANDRE R. L.; DIOGO, JOSE A.; HOFFMAM, ZAIRA B.; GARCIA, WANIUS; OLIVEIRA, LEANDRO C.; PRADE, ROLF A.; SQUINA, FABIO M. Comparative analysis of three hyperthermophilic GH1 and GH3 family members with industrial potential. NEW BIOTECHNOLOGY, v. 32, n. 1, p. 13-20, JAN 25 2015. Citações Web of Science: 24.
SEGATO, FERNANDO; DAMASIO, ANDRE R. L.; DE LUCAS, ROSYMAR C.; SQUINA, FABIO M.; PRADE, ROLF A. Genomics Review of Holocellulose Deconstruction by Aspergilli. MICROBIOLOGY AND MOLECULAR BIOLOGY REVIEWS, v. 78, n. 4, p. 588-613, DEC 2014. Citações Web of Science: 34.
GONCALVES, T. A.; DAMASIO, A. R. L.; SEGATO, F.; ALVAREZ, T. M.; BRAGATTO, J.; BRENELLI, L. B.; CITADINI, A. P. S.; MURAKAMI, M. T.; RULLER, R.; PAES LEME, A. F.; PRADE, R. A.; SQUINA, F. M. Functional characterization and synergic action of fungal xylanase and arabinofuranosidase for production of xylooligosaccharides. Bioresource Technology, v. 119, p. 293-299, SEP 2012. Citações Web of Science: 44.
SEGATO, FERNANDO; DAMASIO, ANDRE R. L.; GONCALVES, THIAGO A.; DE LUCAS, ROSYMAR C.; SQUINA, FABIO M.; DECKER, STEPHEN R.; PRADE, ROLF A. High-yield secretion of multiple client proteins in Aspergillus. Enzyme and Microbial Technology, v. 51, n. 2, p. 100-106, JUL 15 2012. Citações Web of Science: 38.
SEGATO, FERNANDO; DAMASIO, ANDRE R. L.; GONCALVES, THIAGO AUGUSTO; MURAKAMI, MARIO T.; SQUINA, FABIO M.; POLIZELI, MARIA DE LOURDES T. M.; MORT, ANDREW J.; PRADE, ROLF A. Two structurally discrete GH7-cellobiohydrolases compete for the same cellulosic substrate fiber. BIOTECHNOLOGY FOR BIOFUELS, v. 5, APR 11 2012. Citações Web of Science: 12.

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