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Estudos da diversidade microbiana no Parque Zoológico do Estado de São Paulo

Processo: 11/50870-6
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Programa BIOTA - Temático
Vigência: 01 de agosto de 2012 - 31 de julho de 2018
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Microbiologia
Pesquisador responsável:João Carlos Setubal
Beneficiário:João Carlos Setubal
Instituição-sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo, SP, Brasil
Pesquisadores principais:Aline Maria da Silva
Bolsa(s) vinculada(s):17/20539-2 - Capacitação técnica para o projeto temático Estudos da Diversidade Microbiana no Zoológico de São Paulo, BP.TT
17/12645-7 - Caracterização de três novos bacteriófagos de Pseudomonas aeruginosa, BP.IC
16/23639-5 - Utilização de testes fenotípicos e moleculares para identificação de bactérias com capacidade de biodegradar hidrocarbonetos, BP.IC
+ mais bolsas vinculadas 16/09565-9 - Estudos de diversidade microbiana no zoo de São Paulo - apoio de bioinformática, BP.TT
15/08561-7 - Estudos da diversidade microbiana no Parque Zoológico de s. Paulo, BP.TT
14/16450-8 - Análise da diversidade de bacteriófagos associada à comunidade microbiana durante o processo de compostagem, BP.MS
14/15413-1 - Prospecção e caracterização de enzimas termoestáveis de interesse industrial em dados metagenômicos e metatranscritômicos da compostagem do Parque Zoológico de São Paulo, BP.PD
13/05325-5 - Análise computacional de genes codificantes de glicosil hidrolases em dados metagenômicos de compostagem, BP.MS
13/08148-7 - Estudos de metagenômica e metatranscritômica da comunidade microbiana da compostagem do Zoológico de São Paulo, BP.DD
13/00536-8 - Estudos da diversidade microbiana do Parque Zoológico do Estado de São Paulo -- projeto temático. treinamento técnico de nível 5, para a parte de bioinformática, BP.TT - menos bolsas vinculadas
Assunto(s):Biodiversidade  Biologia computacional  Compostagem  Metagenômica  Ecologia 
Publicação FAPESP:http://media.fapesp.br/bv/uploads/pdfs/Brazilian_biodiversity...future_PJNv3vk_33_34.pdf

Resumo

Este projeto tem por objetivo geral coletar, analisar e prospectar dados moleculares de três microbiomas existentes no Parque Zoológico do Estado de São Paulo: com postagem vegetal da mata atlântica, lago, e fezes de macacos bugias. A escolha destes três microbiomas contempla a diversidade de ambientes no parque e a missão de preservação de animais da Fundação PZSP. O projeto dará continuidade a outro projeto financiado pela FAPESP (processo 2009/52030-5R) o qual focaliza somente a unidade de com postagem do parque. O projeto fará uso de diversas metodologias, sendo as principais a metagenômica por pirossequenciamento, a identificação dos isolados microbianos por espectrofotometria de massa, e bioinformática. Como resultados esperados incluem-se diversos bancos de dados, dois websites, uma coleção de isolados, publicações científicas de alto nível e material de divulgação para educação em microbiologia junto aos visitantes do parque e para ensino fundamental e médio. O projeto inclui pesquisadores da USP (campi Butantan e Zona Leste), da UNIFESP (campi Vila Clementino e Diadema), e da Fundação Parque Zoológico de São Paulo. O projeto atende à chamada do programa BIOTA-microorganismos dando ênfase aos seguintes aspectos: caracterização da biodiversidade de microorganismos e de biomas específicos, com prospecção e o estabelecimento de coleções de linhagens microbianas; desenvolvimento de estratégias para a rápida identificação e transferência de linhagens com potencial de aplicação biotecnológica e industrial; e bioprospecção de produtos microbianos. (AU)

Matéria(s) publicada(s) na Agência FAPESP sobre o auxílio:
Treinamento técnico em bioinformática no IQ-USP com Bolsa da FAPESP 
Núcleo de Ciência Genômica da USP tem vagas para pesquisa com bolsas da FAPESP 
Matéria(s) publicada(s) na Revista Pesquisa FAPESP sobre o auxílio:
Aliados improváveis 
Mais bits a serviço do DNA 
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