Busca avançada
Ano de início
Entree

Desequilíbrios genômicos submicroscópicos em quadros clínicos específicos de anomalias congênitas e deficiência mental

Resumo

Hibridação comparativa de genomas em microarray ou array-CGH (aCGH) é uma técnica que permite investigar perdas e ganhos de seqüências de DNA no genoma inteiro com resolução 2 ordens de magnitude maior do que a citogenética clássica. Introduzimos a técnica de aCGH em 2004 no IBUSP e, com o apoio do CEPID Centro de Estudos do Genoma Humano (CEGH), investigamos alterações submicroscópicas em cerca de 400 famílias com indivíduos afetados por deficiência mental e/ou anomalias congênitas, detectando alterações cromossômicas crípticas entre 17% a 30% dos pacientes, dependendo do critério clínico de seleção. Além do evidente benefício para cálculos de risco de recorrência e aconselhamento genético dessas famílias, 20 artigos que contribuem para o mapeamento de doenças específicas e descrição de novas síndromes resultaram desse trabalho, vários em colaboração com grupos internacionais. Os microarrays utilizados foram produzidos pela pesquisadora C. Rosenberg quando docente na Universidade de Leiden, Holanda, e doados à Universidade de São Paulo; tinham BACs como alvo de hibridação e resolução de cerca de 1 Mb. Os BAC-arrays, entretanto, estão sendo substituídos por oligoarrays, que têm resolução muito maior e menor custo. Pretendemos, assim, continuar nossa investigação, agora em grupos com fenótipos específicos (num total de 400 pacientes e 200 controles), utilizando uma plataforma comercial de alta resolução. Os Pesquisadores Principais e Colaboradores representam centros de referência para os quadros clínicos escolhidos para o estudo, com etiologia parcial ou totalmente desconhecida, especificamente: anomalias Müllerianas, surdez, síndrome de Silver-Russel, deficiência mental de herança ligado ao X e câncer pediátrico associado a defeitos congênitos. Neste projeto, (a) temos colaboração internacional com o Dr. John Crolla, do National Genetics Reference Laboratory, Wessex, UK, que coordena um consórcio europeu de usuários de uma mesma plataforma de aCGH para diagnóstico de deficiência mental e anomalias congênitas; (b) Dr. Crolla e C. Rosenberg são parte de um consórcio internacional para padronização de aCGH em estudos clínicos, financiado pelo National Institute of Health (NIH, EUA) e coordenado pelo Dr. David Ledbetter, da Universidade de Atlanta; (c) C. Rosenberg é parte do consórcio internacional DECIPHER - Database of Chromosomal Imbalances and Phenotype in humans using Ensembl Resources (http://www.sanger.ac.uk/PostGenomics/decipher), banco de dados que compila e disponibiliza on line as alterações submicroscópicas detectadas em pacientes com fenótipos alterados. Esse projeto é uma colaboração entre o Instituto de Biociências da USP (IB-USP) e o Hospital do Câncer AC Camargo. A coordenadora do projeto, atualmente pesquisadora do Hospital do Câncer AC Camargo, foi aprovada em setembro último em concurso público para a vaga de docente do IB-USP e aguarda contratação. Quando a contratação da USP ocorrer, a pesquisadora passará a ter vínculo empregatício com a USP e continuará como colaboradora do Hospital do Câncer AC Camargo, não afetando a execução do projeto. (AU)

Matéria(s) publicada(s) na Agência FAPESP sobre o auxílio:
Matéria(s) publicada(s) em Outras Mídias (0 total):
Mais itensMenos itens
VEICULO: TITULO (DATA)
VEICULO: TITULO (DATA)

Publicações científicas (22)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
DANTAS, VITOR G. L.; FREITAS, ERIKA L.; DELLA-ROSA, VALTER A.; LEZIROVITZ, KARINA; DE MORAES, ANA MARIA S. M.; RAMOS, SILVIA B.; OITICICA, JEANNE; ALVES, LEANDRO U.; PEARSON, PETER L.; ROSENBERG, CARLA; et al. Novel partial duplication of EYA1 causes branchiootic syndrome in a large Brazilian family. INTERNATIONAL JOURNAL OF AUDIOLOGY, v. 54, n. 9, p. 593-598, . (03/04780-9, 09/05620-1, 98/14254-2, 09/00898-1)
CANTON, ANA P. M.; COSTA, SILVIA S.; RODRIGUES, TATIANE C.; BERTOLA, DEBORA R.; MALAQUIAS, ALEXSANDRA C.; CORREA, FERNANDA A.; ARNHOLD, IVO J. P.; ROSENBERG, CARLA; JORGE, ALEXANDER A. L.. Genome-wide screening of copy number variants in children born small for gestational age reveals several candidate genes involved in growth pathways. EUROPEAN JOURNAL OF ENDOCRINOLOGY, v. 171, n. 2, p. 253-262, . (09/00898-1, 13/03236-5)
VILLELA, DARINE; SCHLESINGER, DAVID; SUEMOTO, CLAUDIA K.; GRINBERG, LEA T.; ROSENBERG, CARLA. A microdeletion in Alzheimer's disease disrupts NAMPT gene. JOURNAL OF GENETICS, v. 93, n. 2, p. 535-537, . (09/00898-1, 10/15503-0)
VICTORINO KREPISCHI, ANA CRISTINA; CAPELLI, LEONARDO PIRES; SILVA, AMANDA GONCALVES; SOUZA DE ARAUJO, ERICA SARA; PEARSON, PETER LEES; HECK, BENJAMIN; LIMA DA COSTA, CECILIA MARIA; DE CAMARGO, BEATRIZ; ROSENBERG, CARLA. Large germline copy number variations as predisposing factor in childhood neoplasms. FUTURE ONCOLOGY, v. 10, n. 9, p. 1627-1633, . (09/00898-1, 09/02058-0, 08/57887-9, 13/08028-1)
CAPELLI, LEONARDO P.; KREPISCHI, C. V.; GURGEL-GIANNETTI, JULIANA; MENDES, MIRIAN FABIOLA S.; RODRIGUES, TATIANE; VARELA, MONICA C.; KOIFFMANN, CELIA P.; ROSENBERG, CARLA. Deletion of the RMGA and CHD2 genes in a child with epilepsy and mental deficiency. EUROPEAN JOURNAL OF MEDICAL GENETICS, v. 55, n. 2, p. 132-134, . (09/00898-1, 98/14254-2)
RODRIGUES, TATIANE CRISTINA; FIDALGO, FELIPE; LIMA DA COSTA, CECILIA MARIA; FERREIRA, ELISA NAPOLITANO; DA CUNHA, ISABELA WERNECK; CARRARO, DIRCE MARIA; VICTORINO KREPISCHI, ANA CRISTINA; ROSENBERG, CARLA. Upregulated genes at 2q24 gains as candidate oncogenes in hepatoblastomas. FUTURE ONCOLOGY, v. 10, n. 15, p. 2449-2457, . (09/00898-1, 11/24007-9, 13/08028-1, 06/00054-0)
SIMIONI, MILENA; VIEIRA, TARSIS PAIVA; SGARDIOLI, ILARIA CRISTINA; FREITAS, ERIKA LOPES; ROSENBERG, CARLA; MAURER-MORELLI, CLAUDIA VIANNA; LOPES-CENDES, ISCIA; FETT-CONTE, AGNES CRISTINA; GIL-DA-SILVA-LOPES, VERA LUCIA. Insertional translocation of 15q25-q26 into 11p13 and duplication at 8p23.1 characterized by high resolution arrays in a boy with congenital malformations and aniridia. AMERICAN JOURNAL OF MEDICAL GENETICS PART A, v. 158A, n. 11, p. 2905-2910, . (09/00898-1, 08/10596-0)
BONALDI, ADRIANO; KASHIWABARA, ANDRE; DE ARAUJO, ERICA S.; PEREIRA, LYGIA V.; PASCHOAL, ALEXANDRE R.; ANDOZIA, MAYRA B.; VILLELA, DARINE; RIVAS, MARIA P.; SUEMOTO, CLAUDIA K.; PASQUALUCCI, CARLOS A.; et al. Mining Novel Candidate Imprinted Genes Using Genome-Wide Methylation Screening and Literature Review. EPIGENOMES, v. 1, n. 2, . (09/00898-1, 13/07480-8, 13/08028-1)
MASCHIETTO, MARIANA; RODRIGUES, TATIANE CRISTINA; KASHIWABARA, ANDRE YOSHIAKI; SOUZA DE ARAUJO, ERICA SARA; MARQUES AGUIAR, TALITA FERREIRA; LIMA DA COSTA, CECILIA MARIA; DA CUNHA, ISABELA WERNECK; VASQUES, LUCIANA DOS REIS; CYPRIANO, MONICA; BRENTANI, HELENA; et al. DNA methylation landscape of hepatoblastomas reveals arrest at early stages of liver differentiation and cancer-related alterations. ONCOTARGET, v. 8, n. 58, p. 97871-97889, . (11/24007-9, 13/08028-1, 09/00898-1, 15/06281-7, 16/04785-0)
LINHARES, NATALIA D.; SVARTMAN, MARTA; RODRIGUES, TATIANE C.; ROSENBERG, CARLA; VALADARES, EUGENIA R.. Subtelomeric 6p25 deletion/duplication: Report of a patient with new clinical findings and genotype-phenotype correlations. EUROPEAN JOURNAL OF MEDICAL GENETICS, v. 58, n. 5, p. 310-318, . (09/00898-1)
LINHARES, NATALIA D.; VALADARES, EUGENIA R.; DA COSTA, SILVIA S.; ARANTES, RODRIGO R.; DE OLIVEIRA, LUIZ ROBERTO; ROSENBERG, CARLA; VIANNA-MORGANTE, ANGELA M.; SVARTMAN, MARTA. Inherited Xq13.2-q21.31 duplication in a boy with recurrent seizures and pubertal gynecomastia: Clinical, chromosomal and aCGH characterization. META GENE, v. 9, p. 185-190, . (09/00898-1, 98/14254-2)
FONTES, MARSHALL I. B.; SANTOS, ANA P.; MOLCK, MIRIAM C.; SIMIONI, MILENA; NASCIMENTO, DIOGO L. L.; ANDRADE, ANA K. M.; ROSENBERG, CARLA; KREPISCHI, ANA C. V.; APPENZELLER, SIMONE; MONLLEO, ISABELLA L.; et al. Genotype-Phenotype Correlation of 16p13.3 Terminal Duplication and 22q13.33 Deletion: Natural History of a Patient and Review of the Literature. AMERICAN JOURNAL OF MEDICAL GENETICS PART A, v. 170, n. 3, p. 766-772, . (09/00898-1, 12/51799-6, 12/10071-0, 13/08028-1)
SILVA, AMANDA G.; KREPISCHI, ANA C. V.; PEARSON, PETER L.; HAINAUT, PIERRE; ROSENBERG, CARLA; ACHATZ, MARIA ISABEL. The profile and contribution of rare germline copy number variants to cancer risk in Li-Fraumeni patients negative for TP53 mutations. ORPHANET JOURNAL OF RARE DISEASES, v. 9, . (09/00898-1, 08/57887-9)
SILVA, AMANDA GONCALVES; MASCHIETTO, MARIANA; VIDAL, DANIEL ONOFRE; PELICARIO, LEANDRO MOTA; PEREIRA VELLOSO, ELVIRA DEOLINDA RODRIGUES; LOPES, LUIZ FERNANDO; KREPISCHI, ANA CRISTINA; ROSENBERG, CARLA. Array-CGH as an adjuvant tool in cytogenetic diagnosis of pediatric MDS and JMML. MEDICAL ONCOLOGY, v. 30, n. 4, . (09/00898-1, 08/57887-9)
VILLELA, DARINE; SUEMOTO, CLAUDIA K.; PASQUALUCCI, CARLOS A.; GRINBERG, LEA T.; ROSENBERG, CARLA. Do Copy Number Changes in CACNA2D2, CACNA2D3, and CACNA1D Constitute a Predisposing Risk Factor for Alzheimer's Disease?. FRONTIERS IN GENETICS, v. 7, . (09/00898-1, 10/15503-0, 13/08028-1)
HOMMA, THAIS K.; KREPISCHI, ANA C. V.; FURUYA, TATIANE K.; HONJO, RACHEL S.; MALAQUIAS, ALEXSANDRA C.; BERTOLA, DEBORA R.; COSTA, SILVIA S.; CANTON, ANA P.; ROELA, ROSIMEIRE A.; FREIRE, BRUNA L.; et al. Recurrent Copy Number Variants Associated with Syndromic Short Stature of Unknown Cause. Hormone Research in Paediatrics, v. 89, n. 1, p. 13-21, . (09/00898-1, 13/03236-5, 13/08028-1, 15/26980-7)
FONSECA, A. C. S.; BONALDI, A.; COSTA, S. S.; FREITAS, M. R.; KOK, F.; VIANNA-MORGANTE, A. M.. PLP1 duplication at the breakpoint regions of an apparently balanced t(X;22) translocation causes Pelizaeus-Merzbacher disease in a girl. Clinical Genetics, v. 83, n. 2, p. 169-174, . (09/00898-1, 98/14254-2, 09/03480-8)
BONALDI, ADRIANO; MAZZEU, JULIANA F.; COSTA, SILVIA S.; HONJO, RACHEL S.; BERTOLA, DEBORA R.; ALBANO, LILIAN M. J.; FURQUIM, ISABEL M.; KIM, CHONG A.; VIANNA-MORGANTE, ANGELA M.. Microduplication of the ICR2 Domain at Chromosome 11p15 and Familial Silver-Russell Syndrome. AMERICAN JOURNAL OF MEDICAL GENETICS PART A, v. 155A, n. 10, p. 2479-2483, . (09/00898-1, 98/14254-2, 09/03341-8)
VICTORINO KREPISCHI, ANA CRISTINA; PEARSON, PETER LEES; ROSENBERG, CARLA. Germline copy number variations and cancer predisposition. FUTURE ONCOLOGY, v. 8, n. 4, p. 441-450, . (09/00898-1, 08/57887-9)
KREPISCHI‚ A.C.V.; ACHATZ‚ M.I.W.; SANTOS‚ E.M.M.; COSTA‚ S.S.; LISBOA‚ B.C.G.; BRENTANI‚ H.; SANTOS‚ T.M.; GONÇALVES‚ A.; NÓBREGA‚ A.F.; PEARSON‚ P.L.; et al. Germline DNA copy number variation in familial and early-onset breast cancer. BREAST CANCER RESEARCH, v. 14, n. 1, p. R24, . (09/00898-1, 08/57887-9)
VICTORINO KREPISCHI, ANA CRISTINA; KNIJNENBURG, JEROEN; BERTOLA, DEBORA ROMEO; KIM, CHONG AE; PEARSON, PETER LEES; BIJLSMA, EMILIA; SZUHAI, KAROLY; KOK, FERNANDO; VIANNA-MORGANTE, ANGELA MARIA; ROSENBERG, CARLA. Two distinct regions in 2q24.2-q24.3 associated with idiopathic epilepsy. Epilepsia, v. 51, n. 12, p. 2457-2460, . (09/00898-1, 98/14254-2)
VILLELA, DARINE; RAMALHO, RODRIGO F.; SILVA, ADERBAL R. T.; BRENTANI, HELENA; SUEMOTO, CLAUDIA K.; PASQUALUCCI, CARLOS AUGUSTO; GRINBERG, LEA T.; KREPISCHI, ANA C. V.; ROSENBERG, CARLA. Differential DNA Methylation of MicroRNA Genes in Temporal Cortex from Alzheimer's Disease Individuals. NEURAL PLASTICITY, . (09/00898-1, 10/15503-0, 13/08028-1)

Por favor, reporte erros na lista de publicações científicas escrevendo para: cdi@fapesp.br.