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Caracterização de mutações adaptativas no vírus da dengue sorotipo 2 (DENV2) cultivados em diferentes sistemas, através de sequenciamento em larga escala

Processo: 12/15381-7
Modalidade de apoio:Auxílio à Pesquisa - Regular
Vigência: 01 de novembro de 2012 - 30 de abril de 2015
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Microbiologia
Pesquisador responsável:Camila Malta Romano
Beneficiário:Camila Malta Romano
Instituição Sede: Instituto de Medicina Tropical de São Paulo (IMT). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Pesquisadores associados: André Luis da Costa da Silva ; Jaime Henrique Amorim Santos ; Luis Carlos de Souza Ferreira ; Margareth de Lara Capurro-Guimarães
Bolsa(s) vinculada(s):13/03311-7 - Caracterização de mutações adaptativas no vírus da dengue sorotipo 2 (DENV2) cultivados em diferentes sistemas, através de sequenciamento em larga escala, BP.TT
Assunto(s):Arbovirus  Vírus da dengue  Mutação  Sequenciamento de nucleotídeos em larga escala  Genomas  Adaptação biológica  Interações hospedeiro-patógeno 
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:adaptação | Arbovírus | Dengue | Sequenciamento em larga escala | Evolução viral

Resumo

O acúmulo de mutações em arbovírus, incluindo dengue, não ocorre tão rapidamente como nos demais vírus de RNA, como HCV e HIV. Provavelmente, a forte seleção resultante da alternância de hospedeiros, aliada a uma possível maior fidelidade da RNA polimerase viral mantenham a estabilidade genética observada nos arbovírus. Para ser efetivamente transmitido entre hospedeiros de classes tão diferentes, o fitness (capacidade replicativa) de um arbovírus deve ser semelhante em ambos, o que de certa forma acaba limitando o nível de adaptação dos vírus a apenas um tipo de hospedeiro. Portanto, a alternância de hospedeiros gera vírus generalistas, onde as substituições neutras ou favoráveis para replicação em ambos os hospedeiros seriam mais facilmente selecionadas (trade-off hypothesis). Além de seleção natural impactando no ganho de variabilidade, os vírus ainda podem perder variabilidade por deriva genética. Por outro lado, já foi demonstrado que certos arbovírus foram capazes de infectar novos hospedeiros, aumentar sua capacidade replicativa ou ainda, aumentaram sua virulência no hospedeiro vertebrado com a substituição de apenas um aminoácido. Ainda assim, pouco se sabe a respeito dos mecanismos que governam o ganho/perda desse fitness e patogenicidade em condições naturais. Para isso, modelos que mimetizem a replicação viral em diferentes condições e micro-ambientes podem auxiliar na compreensão da evolução desses vírus e na elucidação dos mecanismos imunopatogênicos da infecção por esses agentes. Assim pretende-se obter nessa proposta uma maior compreensão dos mecanismos de aquisição de substituições de caráter adaptativo em vírus crescidos em células de inseto e células de mamífero, e também em insetos vetores fêmeas Aedes aegipty. O genoma completo dos vírus presentes em diferentes tecidos do mosquito (intestino médio e glândula salivar) e em cultura celular serão obtidos através de sequenciamento em larga escala, o que permitirá uma análise profunda e detalhada da população viral. Uma vez que nosso grupo já gerou dados semelhantes aos propostos aqui, porem a partir de hospedeiro vertebrado, os resultados obtidos nesse estudo poderão ser analisados de forma abrangente e comparativa. Dessa forma, esses resultados contribuirão para o entendimento do impacto da pressão seletiva exercida por cada hospedeiro no fitness viral, e consequentemente, na evolução desses vírus a curto e a médio prazo. (AU)

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Publicações científicas (9)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
SALVADOR, FELIPE SCASSI; AMORIM, JAIME HENRIQUE; SANTOS ALVES, RUBENS PRINCE; PEREIRA, SARA A.; SOUZA FERREIRA, LUIS CARLOS; ROMANO, CAMILA MALTA. Complete Genome Sequence of an Atypical Dengue Virus Serotype 2 Lineage Isolated in Brazil. MICROBIOLOGY RESOURCE ANNOUNCEMENTS, v. 3, n. 4, . (12/51204-2, 11/51761-6, 12/15381-7)
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SANTIAGO E SOUZA, NATHALIA CAROLINE; FELIX, ALVINA CLARA; DE PAULA, ANDERSON VICENTE; LEVI, JOSE EDUARDO; PANNUTI, CLAUDIO SERGIO; ROMANO, CAMILA MALTA. Evaluation of serological cross-reactivity between yellow fever and other flaviviruses. INTERNATIONAL JOURNAL OF INFECTIOUS DISEASES, v. 81, p. 4-5, . (16/16069-8, 12/15381-7)
URBANO, PAULO ROBERTO; SOARES DE OLIVEIRA, ANA CAROLINA; ROMANO, CAMILA MALTA. ALTERNATIVE METHODS FOR SEQUENCING FULL TSPyV GENOMES USING SANGER OR NGS. Revista do Instituto de Medicina Tropical de São Paulo, v. 58, . (12/15381-7)
GOMES DE SOUSA CARDOZO, FRANCIELLE TRAMONTINI; BAIMUKANOVA, GYULNAR; LANTERI, MARION CHRISTINE; KEATING, SHEILA MARIE; FERREIRA, FREDERICO MORAES; HEITMAN, JOHN; PANNUTI, CLAUDIO SERGIO; PATI, SHIBANI; ROMANO, CAMILA MALTA; SABINO, ESTER CERDEIRA. Serum from dengue virus-infected patients with and without plasma leakage differentially affects endothelial cells barrier function in vitro. PLoS One, v. 12, n. 6, . (13/01702-9, 13/01690-0, 12/15381-7)
NALI, L. H. S.; OLIVEIRA, A. C. S.; ALVES, D. O.; CALEIRO, G. S.; NUNES, C. F.; GERHARDT, D.; SUCCI, R. C. M.; ROMANO, CAMILA M.; MACHADO, D. M.. Expression of human endogenous retrovirus K and W in babies. ARCHIVES OF VIROLOGY, v. 162, n. 3, p. 857-861, . (12/15381-7)
URBANO, PAULO R.; NALI, LUIZ H. S.; BICALHO, CAMILA S.; PIERROTTI, LIGIA C.; DAVID-NETO, ELIAS; PANNUTI, CLAUDIO S.; ROMANO, CAMILA M.. New findings about trichodysplasia spinulosa-associated polyomavirus (TSPyV)-novel qPCR detects TSPyV-DNA in blood samples. DIAGNOSTIC MICROBIOLOGY AND INFECTIOUS DISEASE, v. 84, n. 2, p. 123-124, . (12/15381-7)
SALVADOR, FELIPE SCASSI; AMORIM, JAIME HENRIQUE; SANTOS ALVES, RUBENS PRINCE; PEREIRA, SARA A.; SOUZA FERREIRA, LUIS CARLOS; ROMANO, CAMILA MALTA. Complete Genome Sequence of an Atypical Dengue Virus Serotype 2 Lineage Isolated in Brazil. GENOME ANNOUNCEMENTS, v. 3, n. 4, p. 2-pg., . (12/15381-7, 12/51204-2, 11/51761-6)
URBANO, PAULO ROBERTO P.; PANNUTI, CLAUDIO SERGIO; PIERROTTI, LIGIA C.; DAVID-NETO, ELIAS; ROMANO, CAMILA MALTA. Rapid Detection of Trichodysplasia Spinulosa-Associated Polyomavirus in Skin Biopsy Specimen. GENOME ANNOUNCEMENTS, v. 2, n. 4, p. 2-pg., . (12/15381-7)

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