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Evolução molecular de regiões regulatórias de genes HOX associados com a morfologia da nadadeira de peixes, com especial ênfase em Chondrichthyes

Processo: 12/05391-5
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Regular
Vigência: 01 de janeiro de 2013 - 30 de junho de 2015
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Zoologia
Pesquisador responsável:Marcelo Rodrigues de Carvalho
Beneficiário:Marcelo Rodrigues de Carvalho
Instituição-sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Pesq. associados:Murilo de Carvalho ; Tiana Kohlsdorf
Assunto(s):Evolução animal  Genética animal  Regulação da expressão gênica  Clonagem  Análise de sequência de DNA  Peixes 

Resumo

A evolução das regiões de regulação gênica, em especial nos genes expressos durante o desenvolvimento embrionário, parece estar diretamente relacionada com processos evolutivos que resultam na origem de novas morfologias, dado que variações em regiões regulatórias determinam mudanças nos padrões de expressão de genes durante a formação de estruturas específicas. A presente proposta de pesquisa objetiva investigar associações entre a sequência de nucleotídeos da região regulatória CsB, que controla a expressão dos genes mais próximos da extremidade 5' do cluster do HoxD (i.e. Hoxd11 e Hoxd13) durante a formação do broto dos apêndices pareados nos vertebrados. As sequências serão analisadas quanto à presença tanto de regiões conservadas quanto de regiões com altas taxas de substituição de nucleotídeos, para posterior inferência sobre presença de sítios de ligação para fatores de transcrição específicos. Serão analisadas espécies de condrictes que representem a maior parte da variação morfológica das nadadeiras dos principais clados (i.e. Squalomorphi e Galeomorphi) e comparados com representantes dos grandes grupos de Actinopterygii. Os fragmentos da referida região regulatória serão obtidos a partir de reações de PCR com posterior clonagem e sequenciamento. Para tanto, serão utilizados primers degenerados desenvolvidos no laboratório colaborador deste projeto (FFCLRP-USP) os quais foram previamente testados, com sucesso, em estudo preliminar à presente proposta. O grupo escolhido visa mostrar como (e se) a variação morfológica das nadadeiras dos peixes é resultante da evolução molecular desta região regulatória. Este estudo também contribuirá para o entendimento da evolução genotípica em espécies não-modelos nos estudos de biologia evolutiva do desenvolvimento. (AU)

Matéria(s) publicada(s) na Agência FAPESP sobre o auxílio:
Arraia cururu descoberta por Alfred Wallace há 160 anos é finalmente descrita 

Publicações científicas (19)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
PETEAN, FLAVIA DE FIGUEIREDO; DE CARVALHO, MARCELO R. Comparative morphology and systematics of the cookiecutter sharks, genus Isistius Gill (1864) (Chondrichthyes: Squaliformes: Dalatiidae). PLoS One, v. 13, n. 8 AUG 20 2018. Citações Web of Science: 0.
DA SILVA, JOAO PAULO C. B.; VAZ, DIEGO F. B.; DE CARVALHO, MARCELO R. Phylogenetic inferences on the systematics of squaliform sharks based on elasmobranch scapular morphology (Chondrichthyes: Elasmobranchii). ZOOLOGICAL JOURNAL OF THE LINNEAN SOCIETY, v. 182, n. 3, p. 614-630, MAR 2018. Citações Web of Science: 1.
JONES, CHRISTIAN M.; HOFFMAYER, ERIC R.; HENDON, JILL M.; QUATTRO, JOSEPH M.; LEWANDOWSKI, JUSTIN; ROBERTS, MARK A.; POULAKIS, GREGG R.; AJEMIAN, MATTHEW J.; DRIGGERS, III, WILLIAM B.; DE CARVALHO, MARCELO R.; REGO, MARIANA G.; HAZIN, FABIO H. V.; MARQUEZ-FARIAS, J. FERNANDO. Morphological conservation of rays in the genus Rhinoptera (Elasmobranchii, Rhinopteridae) conceals the occurrence of a large batoid, Rhinoptera brasiliensis Muller, in the northern Gulf of Mexico. Zootaxa, v. 4286, n. 4, p. 499-514, JUL 4 2017. Citações Web of Science: 1.
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VIANA, SARAH T. DE F.; DE CARVALHO, MARCELO R. Redescription of Squalus acutipinnis Regan, 1908, a Valid Species of Spiny Dogfish from Southern Africa (Chondrichthyes: Squaliformes: Squalidae). Copeia, v. 104, n. 2, p. 539-553, JUL 2016. Citações Web of Science: 7.
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EBERT, DAVID A.; HAAS, DIANE L.; DE CARVALHO, MARCELO R. Tetronarce cowleyi, sp nov., a new species of electric ray from southern Africa (Chondrichthyes: Torpediniformes: Torpedinidae). Zootaxa, v. 3936, n. 2, p. 237-250, MAR 19 2015. Citações Web of Science: 3.
WHITE, WILLIAM T.; VAZ, DIEGO F. B.; HO, HSUAN-CHING; EBERT, DAVID A.; DE CARVALHO, MARCELO R.; CORRIGAN, SHANNON; ROCHEL, ELISABETH; DE CARVALHO, MURILO; TANAKA, SHO; NAYLOR, GAVIN J. P. Redescription of Scymnodon ichiharai Yano and Tanaka 1984 (Squaliformes: Somniosidae) from the western North Pacific, with comments on the definition of somniosid genera. ICHTHYOLOGICAL RESEARCH, v. 62, n. 2, p. 213-229, JAN 2015. Citações Web of Science: 4.
FONTENELLE, JOAO PEDRO; DA SILVA, JOAO PAULO C. B.; DE CARVALHO, MARCELO R. Potamotrygon limai, sp nov., a new species of freshwater stingray from the upper Madeira River system, Amazon basin (Chondrichthyes: Potamotrygonidae). Zootaxa, v. 3765, n. 3, p. 249-268, FEB 18 2014. Citações Web of Science: 19.
CARVALHO, MURILO; BOCKMANN, FLAVIO ALICINO; DE CARVALHO, MARCELO RODRIGUES. Homology of the Fifth Epibranchial and Accessory Elements of the Ceratobranchials among Gnathostomes: Insights from the Development of Ostariophysans. PLoS One, v. 8, n. 4 APR 18 2013. Citações Web of Science: 16.

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