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Análise da expressão de genes polimórficos identificados em portadores de carcinoma de células escamosas de base de língua

Processo: 12/17182-1
Modalidade de apoio:Auxílio à Pesquisa - Regular
Vigência: 01 de fevereiro de 2013 - 31 de janeiro de 2015
Área do conhecimento:Ciências da Saúde - Medicina - Clínica Médica
Pesquisador responsável:Gustavo Jacob Lourenço
Beneficiário:Gustavo Jacob Lourenço
Instituição Sede: Faculdade de Ciências Médicas (FCM). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
Pesquisadores associados:Gustavo Jacob Lourenço ; Jörg Kobarg
Assunto(s):Oncologia  Neoplasias da língua  Carcinoma de células escamosas  Expressão gênica  Polimorfismo de um único nucleotídeo  Genótipo  Reação em cadeia da polimerase em tempo real  Análise de sequência com séries de oligonucleotídeos 
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:carcinoma de base de língua | expressão gênica | Polimorfismo gênico | Cancerologia

Resumo

Alterações genéticas herdadas, como polimorfismos gênicos de base única (SNPs), foram associadas com o risco de carcinoma de células escamosas (CEC) de cabeça e pescoço. O CEC de base de língua (BL) merece destaque entre os demais devido às altas taxas de morbidade e mortalidade, mas a associação desse tumor com SNPs não foi ainda estabelecida. Recentemente, nós identificamos 6.609 novos SNPs associados com alterações no risco de ocorrência do CEC de BL. O estudo foi conduzido por genotipagem em larga escala em amostras de sangue periférico de pacientes com CEC de BL e controles saudáveis, utilizando microarranjos de DNA (SNP array 5.0, Affytmetrix®). Vários SNPs considerados de interesse estiveram localizados na região codificadora dos genes SPTA1 (rs863931), TREML2 (rs3747742), ZAN (rs17147735), IKBKAP (rs3204145), FAM24B (rs1891110), CASP5 (rs3181320), EXOC3L4 (rs2297067), LGALS14 (rs4830) e CPT1B (rs2269383). Uma vez que as quantidades e funções das proteínas codificadas pelos alelos selvagens e variantes dos SNPs não foram ainda determinadas, não nos foi possível esclarecer as associações identificadas. Frente ao exposto, o nosso objetivo no presente estudo é o de avaliar se os diferentes genótipos (homozigoto selvagem, heterozigoto, homozigoto variante) dos referidos SNPs alteram as expressões dos respectivos genes. Para cumprir tal objetivo, optamos por analisar amostras de sangue periférico de indivíduos saudáveis. O DNA genômico das amostras será analisado para identificar os genótipos de cada polimorfismo (homozigoto selvagem, heterozigoto, homozigoto variante), por meio da reação em cadeia da polimerase em tempo real (RT-PCR), utilizando iniciadores e sondas TaqMan® (Applied Biosystems®). O RNA total das amostras será analisado para a identificar a expressão gênica em indivíduos com os distintos genótipos de cada SNP, por meio da reação em cadeia da polimerase quantitativa (qPCR), utilizando iniciadores específicos e o corante SYBR Green (Applied Biosystems®). A significância estatística das diferenças de expressão gênica (””CT) entre grupos (homozigoto selvagem, heterozigoto, homozigoto variante) será avaliada por meio dos testes t e ANOVA, considerando um valor de P< 0,05. Acreditamos que os resultados deste estudo poderão contribuir para definir os papéis dos alelos selvagem e variante de cada SNP na produção das respectivas proteínas e, consequentemente, definir seus papéis na predisposição herdada ao CEC de BL. (AU)

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Publicações científicas (4)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
CARRON, JULIANA; DALLA COSTA, ANA PAULA; RINCK-JUNIOR, JOSE AUGUSTO; MARIANO, FERNANDA VIVIANE; CARVALHO, BENILTON DE SA; PASSOS LIMA, CARMEN SILVIA; LOURENCO, GUSTAVO JACOB. Role of a genetic variation in the microRNA-4421 binding site of ERP29 regarding risk of oropharynx cancer and prognosis. SCIENTIFIC REPORTS, v. 10, n. 1, . (12/17182-1, 15/18039-6, 06/06231-0)
PEQUENO, DANIEL PAIXAO; CARRON, JULIANA; GASPAR, KARLA CRISTINA; PASSOS LIMA, CARMEN SILVIA; LOURENCO, GUSTAVO JACOB. Quality of life of family caregivers and survival of head and neck cancer patients in palliative care. EUROPEAN JOURNAL OF CANCER CARE, v. 31, n. 6, p. 12-pg., . (12/17182-1)
PEQUENO, DANIEL PAIXAO; VIARO, ELISANGELA GODOI; CARRON, JULIANA; SILVA, DIEGO RODRIGUES; GASPAR, KARLA CRISTINA; PASSOS LIMA, CARMEN SILVIA; LOURENCO, GUSTAVO JACOB. Influence of Sociodemographic Characteristics and Inflammation-Related Gene Variants on the Comfort Level of Caregivers of Patients With Head and Neck Cancer. JOURNAL OF HOLISTIC NURSING, . (12/17182-1)
CARRON, JULIANA; TORRICELLI, CAROLINE; SILVA, JANET KELLER; LIU, YICHUAN; PELLEGRINO, RENATA; PASSOS LIMA, CARMEN SILVIA; LOURENCO, GUSTAVO JACOB. Association of Inherited Copy Number Variation in ADAM3A and ADAM5 Pseudogenes with Oropharynx Cancer Risk and Outcome. GENES, v. 13, n. 12, p. 13-pg., . (06/06231-0, 12/17182-1, 06/07054-5)

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