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Avaliação da variabilidade alélica, estrutura populacional e desequilíbrio de ligação no germoplasma ex situ de seringueira (Hevea brasiliensis)

Processo: 12/50491-8
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Regular
Vigência: 01 de fevereiro de 2013 - 31 de julho de 2015
Área do conhecimento:Ciências Agrárias - Agronomia - Fitotecnia
Pesquisador responsável:Anete Pereira de Souza
Beneficiário:Anete Pereira de Souza
Instituição-sede: Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética (CBMEG). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
Assunto(s):Variação genética em plantas  Germoplasma vegetal  Seringueira  Marcador molecular  Clonagem  Polimorfismo de um único nucleotídeo  Transcriptoma  Desequilíbrio de ligação 

Resumo

O desmatamento da Amazônia ameaça os recursos genéticos de muitas espécies nativas dessa região. Entre as espécies ameaçadas está o gênero Hevea, exclusivamente oriundo da floresta Amazônica, Hevea brasiliensis é uma espécie emblemática da região Amazônica, devido ao seu papel histórico no desenvolvimento econômico dos estados que compõem a Amazônia. A seringueira é a base da indústria que utiliza borracha natural. Entretanto, devido a um efeito forte efeito de restrição na base genética, mais de 95% das áreas cultivadas com seringueiras no mundo são plantadas com clones provenientes de apenas 5 a 10 árvores. A diversidade genética da espécie ainda está presente em populações nativas na área de distribuição natural, mas é ameaçada pelo ritmo acelerado de desmatamento. O objetivo central do presente projeto é a caracterização da diversidade genética de clones de seringueira coletados em diferentes regiões da Amazônia, por meio de marcadores moleculares do tipo "polimorfismo de uma única base" (single nucleotide polymorphism - SNP). Esses marcadores serão desenvolvidos a partir da comparação de sequências de um banco de ESTs (Expressed Sequence Tags) de seringueira e, a partir de resultados do transcriptoma de seringueira (pelo sequenciamento de nova geração). Os SNPs desenvolvidos serão genotipados empregando-se um espectrômetro de massas MALDI-TOF (Sequenom). Os dados de variabilidade obtidos serão empregados na construção de um mapa, no estudo da estrutura populacional e do desequilíbrio de ligação das populações representando o germoplasma da Amazônia, atualmente presente nos bancos de germoplasma e, portanto disponível ao melhoramento genético. Todos os resultados de variabilidade genética, do desequilíbrio de ligação e da estrutura populacional gerados, bem como os recursos genômicos (SNPs) desenvolvidos no presente projeto serão úteis aos estudos de genética e aos programas de melhoramento da H. brasiliensis, visando o aumento da produção de borracha. Os resultados também serão úteis aos esforços para a conservação das espécies de Hevea na Amazônia, pois auxiliarão a tomada de medidas com o objetivo de preservar a diversidade genética da seringueira e espécies aparentadas. (AU)

Matéria(s) publicada(s) na Agência FAPESP sobre o auxílio:
Estudo possibilita conhecer e preservar diversidade genética da seringueira 

Publicações científicas (7)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
MANTELLO, CAMILA CAMPOS; BOATWRIGHT, LUCAS; DA SILVA, CARLA CRISTINA; SCALOPPI, ERIVALDO JOSE; GONCALVES, PAULO DE SOUZA; BARBAZUK, W. BRAD; DE SOUZA, ANETE PEREIRA. Deep expression analysis reveals distinct cold-response strategies in rubber tree (Hevea brasiliensis). BMC Genomics, v. 20, JUN 4 2019. Citações Web of Science: 0.
FEIJO ROSA, JOAO RICARDO BACHEGA; MANTELLO, CAMILA CAMPOS; GARCIA, DOMINIQUE; DE SOUZA, LIVIA MOURA; DA SILVA, CARLA CRISTINA; GAZAFFI, RODRIGO; DA SILVA, CICERO CASIMIRO; TOLEDO-SILVA, GUILHERME; CUBRY, PHILIPPE; FRANCO GARCIA, ANTONIO AUGUSTO; DE SOUZA, ANETE PEREIRA; LE GUEN, VINCENT. QTL detection for growth and latex production in a full-sib rubber tree population cultivated under suboptimal climate conditions. BMC PLANT BIOLOGY, v. 18, OCT 10 2018. Citações Web of Science: 1.
CONSON, ANDRE R. O.; TANIGUTI, CRISTIANE H.; AMADEU, RODRIGO R.; ANDREOTTI, ISABELA A. A.; DE SOUZA, LIVIA M.; DOS SANTOS, LUCIANO H. B.; ROSA, JOAO R. B. F.; MANTELLO, CAMILA C.; DA SILVA, CARLA C.; SCALOPPI JUNIOR, ERIVALDO JOSE; RIBEIRO, RAFAEL V.; LE GUEN, VINCENT; GARCIA, ANTONIO A. F.; GONCALVES, PAULO DE SOUZA; DE SOUZA, ANETE P. High-Resolution Genetic Map and QTL Analysis of Growth-Related Traits of Hevea brasiliensis Cultivated Under Suboptimal Temperature and Humidity Conditions. FRONTIERS IN PLANT SCIENCE, v. 9, AUG 24 2018. Citações Web of Science: 1.
DE SOUZA, LIVIA M.; DOS SANTOS, LUCIANO H. B.; ROSA, JOAO R. B. F.; DA SILVA, CARLA C.; MANTELLO, CAMILA C.; CONSON, ANDRE R. O.; SCALOPPI, JR., ERIVALDO J.; FIALHO, JOSEFINO DE F.; DE MORAES, MARIO LUIZ T.; GONCALVES, PAULO DE S.; MARGARIDO, GABRIEL R. A.; GARCIA, ANTONIO A. F.; LE GUEN, VINCENT; DE SOUZA, ANETE P. Linkage Disequilibrium and Population Structure in Wild and Cultivated Populations of Rubber Tree (Hevea brasiliensis). FRONTIERS IN PLANT SCIENCE, v. 9, JUL 3 2018. Citações Web of Science: 0.
DE SOUZA, LIVIA MOURA; LE GUEN, VINCENT; MORENO CERQUEIRA-SILVA, CARLOS BERNARDO; SILVA, CARLA CRISTINA; MANTELLO, CAMILA CAMPOS; OLIVEIRA CONSON, ANDRE RICARDO; GOMES VIANNA, JOAO PAULO; ZUCCHI, MARIA IMACULADA; SCALOPPI JUNIOR, ERIVALDO JOSE; FIALHO, JOSEFINO DE FREITAS; TEIXEIRA DE MORAES, MARIO LUIS; GONCALVES, PAULO DE SOUZA; DE SOUZA, ANETE PEREIRA. Genetic Diversity Strategy for the Management and Use of Rubber Genetic Resources: More than 1,000 Wild and Cultivated Accessions in a 100-Genotype Core Collection. PLoS One, v. 10, n. 7 JUL 30 2015. Citações Web of Science: 8.
SILVA, CARLA C.; MANTELLO, CAMILA C.; CAMPOS, TATIANA; SOUZA, LIVIA M.; GONCALVES, PAULO S.; SOUZA, ANETE P. Leaf-, panel- and latex-expressed sequenced tags from the rubber tree (Hevea brasiliensis) under cold-stressed and suboptimal growing conditions: the development of gene-targeted functional markers for stress response. MOLECULAR BREEDING, v. 34, n. 3, p. 1035-1053, OCT 2014. Citações Web of Science: 11.
MANTELLO, CAMILA CAMPOS; CARDOSO-SILVA, CLAUDIO BENICIO; DA SILVA, CARLA CRISTINA; DE SOUZA, LIVIA MOURA; SCALOPPI JUNIOR, ERIVALDO JOSE; GONCALVES, PAULO DE SOUZA; VICENTINI, RENATO; DE SOUZA, ANETE PEREIRA. De Novo Assembly and Transcriptome Analysis of the Rubber Tree (Hevea brasiliensis) and SNP Markers Development for Rubber Biosynthesis Pathways. PLoS One, v. 9, n. 7 JUL 21 2014. Citações Web of Science: 37.
Publicações acadêmicas
(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

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