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Caracterização do papel de proteínas reguladoras do splicing em eucariotos

Processo: 13/02738-7
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Regular
Vigência: 01 de junho de 2013 - 31 de maio de 2016
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
Pesquisador responsável:Patricia Pereira Coltri
Beneficiário:Patricia Pereira Coltri
Instituição-sede: Instituto de Ciências Biomédicas (ICB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo, SP, Brasil
Pesq. associados:Carla Columbano de Oliveira ; Edna Teruko Kimura
Assunto(s):Expressão gênica  Processamento de RNA  Processamento de proteína  Spliceossomos 

Resumo

Em eucariotos, o splicing é um processo essencial para o controle da expressão gênica. O processo de splicing consiste na remoção de introns e ligação de exons em sequências maduras. O splicing ocorre no spliceossomo, um grande complexo ribonucleoprotéico de cerca de 4 MDa, composto por 5 snRNAs (small nuclear RNAs) e mais de 100 proteínas. A atividade catalítica do complexo depende de uma série de rearranjos estruturais que envolvem interações entre RNAs e destes com proteínas. Até recentemente a composição de proteínas do spliceossomo era considerada idêntica em todos os transcritos precursores. No entanto, a variação observada no splicing de diferentes transcritos pode indicar que o spliceossomo apresente composições protéicas diferentes. É possível supor, desta maneira, que diferentes transcritos recrutem proteínas específicas, que poderiam regular a atividade desta maquinaria e o processo de splicing. Muitos transcritos precursores em eucariotos abrigam em seus introns seqüências não codificadoras importantes para o controle e regulação da expressão gênica e manutenção celulares. Alterações na transcrição ou processamento destas seqüências podem levar ao desenvolvimento de diversas doenças, incluindo alguns tipos de tumores. Neste projeto, pretende-se investigar como ocorre o splicing em introns que contém pequenos RNAs nucleolares e RNAs não codificadores. Para isso, proteínas especificamente recrutadas para estes transcritos durante o splicing serão identificadas e caracterizadas. Pretende-se investigar de que maneira estas proteínas atuam no complexo e na ativação do splicing. Em um contexto geral, os resultados deste trabalho contribuirão para compreender os mecanismos de regulação do splicing e ativação do spliceossomo em diferentes transcritos, estabelecendo uma nova linha de pesquisa. (AU)

Publicações científicas (4)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
GATTI DA SILVA, GUILHERME H.; JURICA, MELISSA S.; CHAGAS DA CUNHA, JULIA P.; OLIVEIRA, CARLA C.; COLTRI, PATRICIA P. Human RNF113A participates of pre-mRNA splicing in vitro. Journal of Cellular Biochemistry, v. 120, n. 5, p. 8764-8774, MAY 2019. Citações Web of Science: 0.
PAIVA, MARCELO M.; KIMURA, EDNA T.; COLTRI, PATRICIA P. miR18a and miR19a Recruit Specific Proteins for Splicing in Thyroid Cancer Cells. CANCER GENOMICS & PROTEOMICS, v. 14, n. 5, p. 373-381, SEP-OCT 2017. Citações Web of Science: 3.
CANTOR, MAURICIO; PIRES, MATHIAS M.; MARQUITTI, FLAVIA M. D.; RAIMUNDO, RAFAEL L. G.; SEBASTIAN-GONZALEZ, ESTHER; COLTRI, PATRICIA P.; PEREZ, S. IVAN; BARNECHE, DIEGO R.; BRANDT, DEBORA Y. C.; NUNES, KELLY; DAURA-JORGE, FABIO G.; FLOETER, SERGIO R.; GUIMARAES, JR., PAULO R. Nestedness across biological scales. PLoS One, v. 12, n. 2 FEB 6 2017. Citações Web of Science: 5.
PIRES, MATHIAS M.; CANTOR, MAURICIO; GUIMARAES, PAULO R.; DE AGUIAR, MARCUS A. M.; DOS REIS, SERGIO F.; COLTRI, PATRICIA P. The network organization of protein interactions in the spliceosome is reproduced by the simple rules of food-web models. SCIENTIFIC REPORTS, v. 5, OCT 7 2015. Citações Web of Science: 5.

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