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Estudo computacional da termodinâmica de associação de sistemas auto-organizados

Processo: 12/15147-4
Modalidade de apoio:Auxílio à Pesquisa - Regular
Vigência: 01 de junho de 2013 - 31 de maio de 2015
Área do conhecimento:Ciências Exatas e da Terra - Química - Físico-química
Pesquisador responsável:André Farias de Moura
Beneficiário:André Farias de Moura
Instituição Sede: Centro de Ciências Exatas e de Tecnologia (CCET). Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR). São Carlos , SP, Brasil
Assunto(s):Simulação por computador  Simulação de dinâmica molecular  Termodinâmica 
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Colóides de associação | Energia de Gibbs de Associação | Igualdade de Jarzynski | Potencial de Força Média | Simulação de Dinâmica Molecular | Sistemas Automontados e Auto-Organizados | Química Teórica Computacional

Resumo

O presente projeto de pesquisa descreve o estudo teórico computacional dos potenciais termodinâmicos responsáveis pela formação espontânea de estruturas autoassociadas e auto-organizadas em solução aquosa. A proposta prevê a realização de simulações de dinâmica molecular para o estudo de um sistema prototípico de micelas de moléculas anfifílicas. Sistemas como este apresentam tempos de relaxação proibitivamente longos, de modo que a associação espontânea não pode em geral ser observada no curso de uma simulação computacional típica de dinâmica molecular quando se utilizam potenciais realistas, pois a superfície de potencial se torna complexa demais para ser amostrada na duração total atingida na integração das equações de movimento. Esta dificuldade é particularmente real para o cálculo de propriedades entrópicas, visto que a entropia não pode ser obtida como uma média de ensemble, sendo necessário, em princípio, que se conheçam todos os estados acessíveis ao sistema em seu espaço de fase. Assim, nossa proposta de investigação foca na utilização técnicas alternativas para se estudar os potenciais termodinâmicos, inclusive os entrópicos, ao longo de coordenadas de reação que descreve a associação/dissociação de moléculas de surfactante em micelas. Especificamente, serão realizadas simulações de dinâmica molecular com potencial de umbrella sampling para mapear o potencial de força média ao se remover uma molécula dos agregados estudados. O potencial de força média descreve a variação de energia de Gibbs ao longo da coordenada de reação, podendo ser separado em suas componentes entálpica e entrópica. Também é possível se separar as contribuições da cabeça e da cauda apolar, avaliando-se de maneira quantitativa e inédita o efeito de cada porção da molécula sobre a termodinâmica do processo. (AU)

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Publicações científicas (19)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
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BERNARDINO, KALIL; SWIERGIEL, JOLANTA; JADZYN, JAN; BOUTEILLER, LAURENT; DE MOURA, ANDRE FARIAS. Bulkiness as a design element to increase the rigidity and macrodipole of supramolecular polymers. JOURNAL OF MOLECULAR LIQUIDS, v. 286, . (17/12063-8, 13/07296-2, 12/15147-4)
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XU, LIGUANG; WANG, XIUXIU; WANG, WEIWEI; SUN, MAOZHONG; CHOI, WON JIN; KIM, JI-YOUNG; HAO, CHANGLONG; LI, SI; QU, AIHUA; LU, MEIRU; et al. nantiomer-dependent immunological response to chiral nanoparticle. Nature, v. 601, n. 7893, p. 366+, . (13/07296-2, 12/15147-4)
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JIANG, WENFENG; QU, ZHI-BEI; KUMAR, PRASHANT; VECCHIO, DREW; WANG, YUEFEI; MA, YU; BAHNG, JOONG HWAN; BERNARDINO, KALIL; GOMES, WEVERSON R.; COLOMBARI, FELIPPE M.; et al. Emergence of complexity inhierarchically organized chiral particles. Science, v. 368, n. 6491, p. 80-pg., . (17/12063-8, 13/07296-2, 12/15147-4, 09/54035-4)
LU, JUN; XUE, YAO; BERNARDINO, KALIL; ZHANG, NING-NING; GOMES, WEVERSON R.; RAMESAR, NAOMI S.; LIU, SHUHAN; HU, ZHENG; SUN, TIANMENG; DE MOURA, ANDRE FARIAS; et al. Enhanced optical asymmetry in supramolecular chiroplasmonic assemblies with long-range order. Science, v. 371, n. 6536, p. 1368+, . (17/12063-8, 13/07296-2, 12/15147-4)
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CHOI, WON JIN; YANO, KEIICHI; CHA, MINJEONG; COLOMBARI, FELIPPE M.; KIM, JI-YOUNG; WANG, YICHUN; LEE, SANG HYUN; SUN, KAI; KRUGER, JOHN M.; DE MOURA, ANDRE F.; et al. Chiral phonons in microcrystals and nanofibrils of biomolecules. Nature Photonics, v. 16, n. 5, p. 9-pg., . (12/15147-4, 13/07296-2)

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