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Bases moleculares da qualidade da carne em bovinos da raça Nelore

Processo: 12/23638-8
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Temático
Vigência: 01 de junho de 2013 - 30 de novembro de 2017
Área do conhecimento:Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
Pesquisador responsável:Luciana Correia de Almeida Regitano
Beneficiário:Luciana Correia de Almeida Regitano
Instituição-sede: Pecuária Sudeste. Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (EMBRAPA). Ministério da Agricultura, Pecuária e Abastecimento (Brasil). São Carlos , SP, Brasil
Pesquisadores principais:Adhemar Zerlotini Neto ; Gerson Barreto Mourão ; Luiz Lehmann Coutinho
Pesq. associados:Ana Rita de Araujo Nogueira ; Andrea Alves Do Egito ; Carlos Alberto Labate ; Cintia Righetti Marcondes ; Danísio Prado Munari ; Fabiane Siqueira ; Felipe Rodrigues da Silva ; Fernando Flores Cardoso ; Gilberto Romeiro de Oliveira Menezes ; Juliana Petrini ; Júlio Cesar de Carvalho Balieiro ; Luiz Lehmann Coutinho ; Marcos Vinicius Gualberto Barbosa da Silva ; Mauricio de Alvarenga Mudadu ; Michel Eduardo Beleza Yamagishi ; Newton Valério Verbisck ; Patricia Tholon ; Paula Regina Kuser Falcão ; Poliana Fernanda Giachetto ; Renata Tieko Nassu ; Ricardo Vieira Ventura ; Roberto Hiroshi Higa ; Simone Cristina Méo Niciura
Auxílios(s) vinculado(s):17/50044-5 - Integration of genomic resources in beef cattle breeding program: a collaborative effort between UNL and ESALQ, AP.R
17/09312-6 - AMSA 70th reciprocal meat conference, AR.EXT
Bolsa(s) vinculada(s):17/05625-0 - Estudo dos genes sob seleção em Nelore e a sua relação com as espécies Bos indicus e Bos taurus com base em dados transcriptômicos, BP.IC
16/11775-1 - Bases moleculares da qualidade de carne em bovinos da raça Nelore, BP.TT
16/13773-6 - Identificação e caracterização de regiões de eucromatina associadas a regulação da expressão gênica e a gordura intramuscular em bovinos da raça Nelore, BP.MS
+ mais bolsas vinculadas 15/09158-1 - Identificação de redes gênicas de coexpressão e dos mecanismos regulatórios associados à composição mineral e qualidade de carne em bovinos, BP.DR
16/16556-6 - Visualização de dados genômicos, anotação integrativa e análise correlacional entre medidas fenotípicas e transcritos diferencialmente expressos em músculo de bovinos Nelore, BP.TT
14/22325-1 - Perfil de expressão de microRNAs de animais extremos para eficiência alimentar da raça Nelore, BP.PD
15/00617-3 - Identificação e avaliação da expressão de microRNAs reguladores da deposição de gordura intramuscular em bovinos da raça Nelore, BP.MS
14/12652-5 - Expressão gênica diferencial associada ao conteúdo de ferro no músculo em animais Nelore, BP.MS
14/11871-5 - Identificação de eQTLs e estudo de regiões genômicas associadas à deposição e composição da gordura intramuscular em animais da raça Nelore, BP.PD
14/00943-5 - Identificação de microRNAs envolvidos com a maciez da carne em bovinos da raça Nelore, BP.MS
13/17778-4 - Perfil transcriptômico de animais extremos para eficiência alimentar da raça Nelore, BP.PD
13/21017-9 - Estudo de proteínas associadas a fenótipos de qualidade da carne em bovinos da raça Nelore, BP.PD - menos bolsas vinculadas
Assunto(s):Bovinocultura  Gado Nelore  Bos taurus indicus  Proteoma  Transcriptoma  Carne bovina  Qualidade da carne 

Resumo

O Brasil é um dos principais produtores e exportadores mundiais de carne bovina e sua vantagem competitiva deve-se principalmente ao custo de produção do bovino brasileiro, que é um dos mais baixos do mundo. Para ampliar sua importância no mercado, é necessário adequar sua produção de carne aos padrões estabelecidos pelos importadores. Entre os quesitos de qualidade, a maciez, quantidade e tipo de gordura intramuscular podem influenciar as características sensoriais e o valor nutricional da carne bovina. A seleção para qualidade da carne não tem sido efetiva em programas de melhoramento de gado de corte no Brasil. Metodologias para sequenciamento, genotipagem e análise de expressão do genoma em larga escala têm contribuído para o conhecimento das bases genéticas da variação e para a seleção precoce de bovinos. Um projeto anterior intitulado "Estratégias genéticas para produção de carne bovina de qualidade" produziu 796 novilhos, descendentes de 34 touros selecionados para amostrar a diversidade da raça Nelore, os quais foram avaliados para eficiência alimentar e qualidade da carne, bem como submetidos à análise de associação genômica com um painel de SNPs (Illumina BovineHD chip). Esse projeto permitiu identificar regiões genômicas associadas a características de produção e qualidade de carne. O presente projeto tem por objetivo alcançar melhor compreensão dos mecanismos genéticos envolvidos na variação de caracteres quantitativos apontados pela análise de associação. Para tanto, propõe-se complementar as análises de associação genômica para incluir novos fenótipos, expandir as análises do genoma funcional (RNA, microRNA e proteínas), avaliar o significado de CNVs e capacitar recursos humanos nas áreas de bioinformática e genômica. (AU)

Matéria(s) publicada(s) na Agência FAPESP sobre o auxílio:
Carne mais macia e maior produtividade 

Publicações científicas (21)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
AFONSO, JULIANA; COUTINHO, LUIZ LEHMANN; TIZIOTO, POLYANA CRISTINE; DA SILVA DINIZ, WELLISON JARLES; DE LIMA, ANDRESSA OLIVEIRA; PEREIRA ROCHA, MARINA IBELLI; BUSS, CARLOS EDUARDO; NASCIMENTO ANDRADE, BRUNO GABRIEL; PIAYA, OTAVIO; DA SILVA, JULIANA VIRGINIO; LINS, LAURA ALBUQUERQUE; GROMBONI, CAIO FERNANDO; ARAUJO NOGUEIRA, ANA RITA; SALINAS FORTES, MARINA RUFINO; MOURAO, GERSON BARRETO; DE ALMEIDA REGITANO, LUCIANA CORREIA. Muscle transcriptome analysis reveals genes and metabolic pathways related to mineral concentration in Bos indices. SCIENTIFIC REPORTS, v. 9, SEP 3 2019. Citações Web of Science: 0.
DE OLIVEIRA, PRISCILA S. N.; COUTINHO, LUIZ L.; CESAR, ALINE S. M.; DA SILVA DINIZ, WELLISON J.; DE SOUZA, MARCELA M.; ANDRADE, BRUNO G.; KOLTES, JAMES E.; MOURAO, GERSON B.; ZERLOTINI, ADHEMAR; REECY, JAMES M.; REGITANO, LUCIANA C. A. Co-Expression Networks Reveal Potential Regulatory Roles of miRNAs in Fatty Acid Composition of Nelore Cattle. FRONTIERS IN GENETICS, v. 10, JUL 11 2019. Citações Web of Science: 0.
DINIZ, WELLISON J. S.; MAZZONI, GIANLUCA; COUTINHO, LUIZ L.; BANERJEE, PRIYANKA; GEISTLINGER, LUDWIG; CESAR, ALINE S. M.; BERTOLINI, FRANCESCA; AFONSO, JULIANA; DE OLIVEIRA, PRISCILA S. N.; TIZIOTO, POLYANA C.; KADARMIDEEN, HAJA N.; REGITANO, LUCIANA C. A. Detection of Co-expressed Pathway Modules Associated With Mineral Concentration and Meat Quality in Nelore Cattle. FRONTIERS IN GENETICS, v. 10, MAR 13 2019. Citações Web of Science: 0.
SILVA-VIGNATO, BARBARA; COUTINHO, LUIZ L.; POLETI, MIRELE D.; CESAR, ALINE S. M.; MONCAU, CRISTINA T.; REGITANO, LUCIANA C. A.; BALIEIRO, JULIO C. C. Gene co-expression networks associated with carcass traits reveal new pathways for muscle and fat deposition in Nelore cattle. BMC Genomics, v. 20, JAN 10 2019. Citações Web of Science: 0.
KAPPELER, BERNA I. G.; REGITANO, LUCIANA C. A.; POLETI, MIRELE D.; CESAR, ALINE S. M.; MOREIRA, GABRIEL C. M.; GASPARIN, GUSTAVO; COUTINHO, LUIZ L. MiRNAs differentially expressed in skeletal muscle of animals with divergent estimated breeding values for beef tenderness. BMC MOLECULAR BIOLOGY, v. 20, JAN 3 2019. Citações Web of Science: 1.
DE OLIVEIRA, PRISCILA S. N.; COUTINHO, LUIZ L.; TIZIOTO, POLYANA C.; CESAR, ALINE S. M.; DE OLIVEIRA, GABRIELLA B.; DINIZ, WELLISON J. DA S.; DE LIMA, ANDRESSA O.; REECY, JAMES M.; MOURAO, GERSON B.; ZERLOTINI, ADHEMAR; REGITANO, LUCIANA C. A. An integrative transcriptome analysis indicates regulatory mRNA-miRNA networks for residual feed intake in Nelore cattle. SCIENTIFIC REPORTS, v. 8, NOV 20 2018. Citações Web of Science: 3.
DE SOUZA, MARCELA M.; ZERLOTINI, ADHEMAR; GEISTLINGER, LUDWIG; TIZIOTO, POLYANA C.; TAYLOR, JEREMY F.; ROCHA, MARINA I. P.; DINIZ, WELLISON J. S.; COUTINHO, LUIZ L.; REGITANO, LUCIANA C. A. A comprehensive manually-curated compendium of bovine transcription factors. SCIENTIFIC REPORTS, v. 8, SEP 13 2018. Citações Web of Science: 1.
POLETI, MIRELE D.; REGITANO, LUCIANA C. A.; SOUZA, GUSTAVO H. M. F.; CESAR, ALINE S. M.; SIMAS, ROSINEIDE C.; SILVA-VIGNATO, BARBARA; OLIVEIRA, GABRIELLA B.; ANDRADE, SONIA C. S.; CAMERON, LUIZ C.; COUTINHO, LUIZ L. Data from proteomic analysis of bovine Longissimus dorsi muscle associated with intramuscular fat content. DATA IN BRIEF, v. 19, p. 1314-1317, AUG 2018. Citações Web of Science: 0.
CESAR, ALINE S. M.; REGITANO, LUCIANA C. A.; REECY, JAMES M.; POLETI, MIRELE D.; OLIVEIRA, PRISCILA S. N.; DE OLIVEIRA, GABRIELLA B.; MOREIRA, GABRIEL C. M.; MUDADU, MAURICIO A.; TIZIOTO, POLYANA C.; KOLTES, JAMES E.; FRITZ-WATERS, ELYN; KRAMER, LUKE; GARRICK, DORIAN; BEIKI, HAMID; GEISTLINGER, LUDWIG; MOURAO, GERSON B.; ZERLOTINI, ADHEMAR; COUTINHO, LUIZ L. Identification of putative regulatory regions and transcription factors associated with intramuscular fat content traits. BMC Genomics, v. 19, JUN 27 2018. Citações Web of Science: 3.
POLETI, MIRELE D.; REGITANO, LUCIANA C. A.; SOUZA, GUSTAVO H. M. F.; CESAR, ALINE S. M.; SIMAS, ROSINEIDE C.; SILVA-VIGNATO, BARBARA; OLIVEIRA, GABRIELLA B.; ANDRADE, SONIA C. S.; CAMERON, LUIZ C.; COUTINHO, LUIZ L. Longissimus dorsi muscle label-free quantitative proteomic reveals biological mechanisms associated with intramuscular fat deposition. JOURNAL OF PROTEOMICS, v. 179, p. 30-41, MAY 15 2018. Citações Web of Science: 5.
GEISTLINGER, LUDWIG; DA SILVA, VINICIUS HENRIQUE; MELLO CESAR, ALINE SILVA; TIZIOTO, POLYANA CRISTINE; WALDRON, LEVI; ZIMMER, RALF; DE ALMEIDA REGITANO, LUCIANA CORREIA; COUTINHO, LUIZ LEHMANN. Widespread modulation of gene expression by copy number variation in skeletal muscle. SCIENTIFIC REPORTS, v. 8, JAN 23 2018. Citações Web of Science: 3.
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SOMAVILLA, ADRIANA L.; REGITANO, LUCIANA C. A.; ROSA, GUILHERME J. M.; MOKRY, FABIANA B.; MUDADU, MAURICIO A.; TIZIOTO, POLYANA C.; OLIVEIRA, PRISCILA S. N.; SOUZA, MARCELA M.; COUTINHO, LUIZ L.; MUNARI, DANISIO P. Genome-Enabled Prediction of Breeding Values for Feedlot Average Daily Weight Gain in Nelore Cattle. G3-GENES, GENOMES, GENETICS, v. 7, n. 6, p. 1855-1859, JUN 2017. Citações Web of Science: 1.
BUZANSKAS, MARCOS ELI; VENTURA, RICARDO VIEIRA; SELEGUIM CHUD, TATIANE CRISTINA; BERNARDES, PRISCILA ARRIGUCCI; DE ABREU SANTOS, DANIEL JORDAN; DE ALMEIDA REGITANO, LUCIANA CORREIA; DE ALENCAR, MAURICIO MELLO; MUDADU, MAURICIO DE ALVARENGA; ZANELLA, RICARDO; GUALBERTO BARBOSA DA SILVA, MARCOS VINICIUS; LI, CHANGXI; SCHENKEL, FLAVIO SCHRAMM; MUNARI, DANISIO PRADO. Study on the introgression of beef breeds in Canchim cattle using single nucleotide polymorphism markers. PLoS One, v. 12, n. 2 FEB 9 2017. Citações Web of Science: 2.
TIZIOTO, POLYANA C.; COUTINHO, LUIZ L.; OLIVEIRA, PRISCILA S. N.; CESAR, ALINE S. M.; DINIZ, WELLISON J. S.; LIMA, ANDRESSA O.; ROCHA, MARINA I.; DECKER, JARED E.; SCHNABEL, ROBERT D.; MOURAO, GERSON B.; TULLIO, RYMER R.; ZERLOTINI, ADHEMAR; TAYLOR, JEREMY F.; REGITANO, LUCIANA C. A. Gene expression differences in Longissimus muscle of Nelore steers genetically divergent for residual feed intake. SCIENTIFIC REPORTS, v. 6, DEC 22 2016. Citações Web of Science: 14.
CESAR, ALINE S. M.; REGITANO, LUCIANA C. A.; POLETI, MIRELE D.; ANDRADE, SONIA C. S.; TIZIOTO, POLYANA C.; OLIVEIRA, PRISCILA S. N.; FELICIO, ANDREZZA M.; DO NASCIMENTO, MICHELE L.; CHAVES, AMALIA S.; LANNA, DANTE P. D.; TULLIO, RYMER R.; NASSU, RENATA T.; KOLTES, JAMES E.; FRITZ-WATERS, ERIC; MOURAO, GERSON B.; ZERLOTINI-NETO, ADHEMAR; REECY, JAMES M.; COUTINHO, LUIZ L. Differences in the skeletal muscle transcriptome profile associated with extreme values of fatty acids content. BMC Genomics, v. 17, NOV 22 2016. Citações Web of Science: 8.
DA SILVA DINIZ, WELLISON JARLES; COUTINHO, LUIZ LEHMANN; TIZIOTO, POLYANA CRISTINE; MELLO CESAR, ALINE SILVA; GROMBONI, CAIO FERNANDO; ARAUJO NOGUEIRA, ANA RITA; NEUBERN DE OLIVEIRA, PRISCILA SILVA; DE SOUZA, MARCELA MARIA; DE ALMEIDA REGITANO, LUCIANA CORREIA. Iron Content Affects Lipogenic Gene Expression in the Muscle of Nelore Beef Cattle. PLoS One, v. 11, n. 8 AUG 17 2016. Citações Web of Science: 6.
DA SILVA, VINICIUS HENRIQUE; DE ALMEIDA REGITANO, LUCIANA CORREIA; GEISTLINGER, LUDWIG; PERTILLE, FABIO; GIACHETTO, POLIANA FERNANDA; BRASSALOTI, RICARDO AUGUSTO; MOROSINI, NATALIA SILVA; ZIMMER, RALF; COUTINHO, LUIZ LEHMANN. Genome-Wide Detection of CNVs and Their Association with Meat Tenderness in Nelore Cattle. PLoS One, v. 11, n. 6 JUN 27 2016. Citações Web of Science: 14.
MUDADU, MAURICIO A.; PORTO-NETO, LAERCIO R.; MOKRY, FABIANA B.; TIZIOTO, POLYANA C.; OLIVEIRA, PRISCILA S. N.; TULLIO, RYMER R.; NASSU, RENATA T.; NICIURA, SIMONE C. M.; THOLON, PATRICIA; ALENCAR, MAURICIO M.; HIGA, ROBERTO H.; ROSA, ANTONIO N.; FEIJO, GELSON L. D.; FERRAZ, ANDRE L. J.; SILVA, LUIZ O. C.; MEDEIROS, SERGIO R.; LANNA, DANTE P.; NASCIMENTO, MICHELE L.; CHAVES, AMALIA S.; SOUZA, ANDREA R. D. L.; PACKER, IRINEU U.; TORRES, JR., ROBERTO A. A.; SIQUEIRA, FABIANE; MOURAO, GERSON B.; COUTINHO, LUIZ L.; REVERTER, ANTONIO; REGITANO, LUCIANA C. A. Genomic structure and marker-derived gene networks for growth and meat quality traits of Brazilian Nelore beef cattle. BMC Genomics, v. 17, MAR 15 2016. Citações Web of Science: 9.
DE SOUZA, M. M.; NICIURA, S. C. M.; TIZIOTO, P. C.; IBELLI, A. M. G.; GASPARIN, G.; ROCHA, M. I. P.; BRESSANI, F. A.; MALAGO-, JR., W.; DINIZ, W. J. S.; DE OLIVEIRA, P. S. N.; LIMA, A. O.; MUDADU, M. A.; BARIONI JUNIOR, W.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. A. Allele- and parent-of-origin-specific effects on expression of the KCNJ11 gene: A candidate for meat tenderness in cattle. Genetics and Molecular Research, v. 15, n. 3 2016. Citações Web of Science: 1.
CESAR, ALINE S. M.; REGITANO, LUCIANA C. A.; KOLTES, JAMES E.; FRITZ-WATERS, ERIC R.; LANNA, DANTE P. D.; GASPARIN, GUSTAVO; MOURAO, GERSON B.; OLIVEIRA, PRISCILA S. N.; REECY, JAMES M.; COUTINHO, LUIZ L. Putative Regulatory Factors Associated with Intramuscular Fat Content. PLoS One, v. 10, n. 6 JUN 4 2015. Citações Web of Science: 27.

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