Bases moleculares da qualidade da carne em bovinos da raça Nelore

• Processo: 12/23638-8
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Temático
• Vigência: 01 de junho de 2013 - 30 de novembro de 2017
• Área do conhecimento: Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
• Pesquisador responsável: Luciana Correia de Almeida Regitano
• Beneficiário: Luciana Correia de Almeida Regitano
• Instituição Sede: Embrapa Pecuária Sudeste. Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (EMBRAPA). Ministério da Agricultura, Pecuária e Abastecimento (Brasil). São Carlos , SP, Brasil
• Pesquisadores principais:( Últimos ): Adhemar Zerlotini Neto ; Gerson Barreto Mourão
• Pesquisadores principais:( Antigos ): Luiz Lehmann Coutinho
• Pesquisadores associados: Ana Rita de Araujo Nogueira ; Andrea Alves Do Egito ; Carlos Alberto Labate ; Cintia Righetti Marcondes ; Danísio Prado Munari ; Fabiane Siqueira ; Felipe Rodrigues da Silva ; Fernando Flores Cardoso ; Gilberto Romeiro de Oliveira Menezes ; Juliana Petrini ; Júlio Cesar de Carvalho Balieiro ; Luiz Lehmann Coutinho ; Marcos Vinicius Gualberto Barbosa da Silva ; Mauricio de Alvarenga Mudadu ; Michel Eduardo Beleza Yamagishi ; Newton Valério Verbisck ; Patricia Tholon ; Paula Regina Kuser Falcão ; Poliana Fernanda Giachetto ; Renata Tieko Nassu ; Ricardo Vieira Ventura ; Roberto Hiroshi Higa ; Simone Cristina Méo Niciura
• Auxílios(s) vinculado(s): 17/50044-5 - Integration of genomic resources in beef cattle breeding program: a collaborative effort between UNL and ESALQ, AP.R SPRINT; 17/09312-6 - AMSA 70th Reciprocal Meat Conference, AR.EXT
• Bolsa(s) vinculada(s): 17/05625-0 - Estudo dos genes sob seleção em Nelore e a sua relação com as espécies Bos indicus e Bos taurus com base em dados transcriptômicos, BP.IC; 16/11775-1 - Bases moleculares da qualidade de carne em bovinos da raça Nelore, BP.TT; 16/13773-6 - Identificação e caracterização de regiões de eucromatina associadas a regulação da expressão gênica e a gordura intramuscular em bovinos da raça nelore, BP.MS; + mais bolsas vinculadas 15/09158-1 - Identificação de redes gênicas de coexpressão e dos mecanismos regulatórios associados à composição mineral e qualidade de carne em bovinos, BP.DR; 16/16556-6 - Visualização de dados genômicos, anotação integrativa e análise correlacional entre medidas fenotípicas e transcritos diferencialmente expressos em músculo de bovinos Nelore, BP.TT; 15/00617-3 - Identificação e avaliação da expressão de microRNAs reguladores da deposição de gordura intramuscular em bovinos da raça Nelore, BP.MS; 14/22325-1 - Perfil de expressão de microRNAs de animais extremos para eficiência alimentar da raça Nelore, BP.PD; 14/12652-5 - Expressão gênica diferencial associada ao conteúdo de ferro no músculo em animais Nelore, BP.MS; 14/11871-5 - Identificação de eQTLs e estudo de regiões genômicas associadas à deposição e composição da gordura intramuscular em animais da raça Nelore, BP.PD; 14/00943-5 - Identificação de microRNAs envolvidos com a maciez da carne em bovinos da raça Nelore, BP.MS; 13/17778-4 - Perfil transcriptômico de animais extremos para eficiência alimentar da raça Nelore, BP.PD; 13/21017-9 - Estudo de proteínas associadas a fenótipos de qualidade da carne em bovinos da raça Nelore, BP.PD - menos bolsas vinculadas
• Assunto(s): Bovinocultura Gado Nelore Bos taurus indicus Proteoma Transcriptoma Carne bovina Qualidade da carne
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Bos indicus | Músculo | Proteoma | Transcriptoma | Genética dos processos fisiológicos

Resumo

O Brasil é um dos principais produtores e exportadores mundiais de carne bovina e sua vantagem competitiva deve-se principalmente ao custo de produção do bovino brasileiro, que é um dos mais baixos do mundo. Para ampliar sua importância no mercado, é necessário adequar sua produção de carne aos padrões estabelecidos pelos importadores. Entre os quesitos de qualidade, a maciez, quantidade e tipo de gordura intramuscular podem influenciar as características sensoriais e o valor nutricional da carne bovina. A seleção para qualidade da carne não tem sido efetiva em programas de melhoramento de gado de corte no Brasil. Metodologias para sequenciamento, genotipagem e análise de expressão do genoma em larga escala têm contribuído para o conhecimento das bases genéticas da variação e para a seleção precoce de bovinos. Um projeto anterior intitulado "Estratégias genéticas para produção de carne bovina de qualidade" produziu 796 novilhos, descendentes de 34 touros selecionados para amostrar a diversidade da raça Nelore, os quais foram avaliados para eficiência alimentar e qualidade da carne, bem como submetidos à análise de associação genômica com um painel de SNPs (Illumina BovineHD chip). Esse projeto permitiu identificar regiões genômicas associadas a características de produção e qualidade de carne. O presente projeto tem por objetivo alcançar melhor compreensão dos mecanismos genéticos envolvidos na variação de caracteres quantitativos apontados pela análise de associação. Para tanto, propõe-se complementar as análises de associação genômica para incluir novos fenótipos, expandir as análises do genoma funcional (RNA, microRNA e proteínas), avaliar o significado de CNVs e capacitar recursos humanos nas áreas de bioinformática e genômica. (AU)

Publicações científicas

(36)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

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DE OLIVEIRA, PRISCILA S. N.; COUTINHO, LUIZ L.; TIZIOTO, POLYANA C.; CESAR, ALINE S. M.; DE OLIVEIRA, GABRIELLA B.; DINIZ, WELLISON J. DA S.; DE LIMA, ANDRESSA O.; REECY, JAMES M.; MOURAO, GERSON B.; ZERLOTINI, ADHEMAR; et al. An integrative transcriptome analysis indicates regulatory mRNA-miRNA networks for residual feed intake in Nelore cattle. SCIENTIFIC REPORTS, v. 8, NOV 20 2018. (12/23638-8, 16/03291-4)

DE OLIVEIRA, PRISCILA S. N.; COUTINHO, LUIZ L.; CESAR, ALINE S. M.; DA SILVA DINIZ, WELLISON J.; DE SOUZA, MARCELA M.; ANDRADE, BRUNO G.; KOLTES, JAMES E.; MOURAO, GERSON B.; ZERLOTINI, ADHEMAR; REECY, JAMES M.; et al. Co-Expression Networks Reveal Potential Regulatory Roles of miRNAs in Fatty Acid Composition of Nelore Cattle. FRONTIERS IN GENETICS, v. 10, JUL 11 2019. (12/23638-8, 16/03291-4)

SILVA-VIGNATO, BARBARA; COUTINHO, LUIZ L.; CESAR, ALINE S. M.; POLETI, MIRELE D.; REGITANO, LUCIANA C. A.; BALIEIRO, JULIO C. C.. Comparative muscle transcriptome associated with carcass traits of Nellore cattle. BMC Genomics, v. 18, JUL 3 2017. (12/23638-8)

DA SILVA, VINICIUS HENRIQUE; DE ALMEIDA REGITANO, LUCIANA CORREIA; GEISTLINGER, LUDWIG; PERTILLE, FABIO; GIACHETTO, POLIANA FERNANDA; BRASSALOTI, RICARDO AUGUSTO; MOROSINI, NATALIA SILVA; ZIMMER, RALF; COUTINHO, LUIZ LEHMANN. Genome-Wide Detection of CNVs and Their Association with Meat Tenderness in Nelore Cattle. PLoS One, v. 11, n. 6, JUN 27 2016. (14/01438-2, 12/23717-5, 12/23638-8)

POLETI, MIRELE D.; REGITANO, LUCIANA C. A.; SOUZA, GUSTAVO H. M. F.; CESAR, ALINE S. M.; SIMAS, ROSINEIDE C.; SILVA-VIGNATO, BARBARA; OLIVEIRA, GABRIELLA B.; ANDRADE, SONIA C. S.; CAMERON, LUIZ C.; COUTINHO, LUIZ L.. Longissimus dorsi muscle label-free quantitative proteomic reveals biological mechanisms associated with intramuscular fat deposition. JOURNAL OF PROTEOMICS, v. 179, p. 30-41, MAY 15 2018. (13/21017-9, 12/23638-8)

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BERNARDES, PRISCILA ARRIGUCCI; DO NASCIMENTO, GUILHERME BATISTA; SAVEGNAGO, RODRIGO PELICIONI; BUZANSKAS, MARCOS ELI; WATANABE, RAFAEL NAKAMURA; DE ALMEIDA REGITANO, LUCIANA CORREIA; COUTINHO, LUIZ LEHMANN; GONDRO, CEDRIC; MUNARI, DANISIO PRADO. Evaluation of imputation accuracy using the combination of two high-density panels in Nelore beef cattle. SCIENTIFIC REPORTS, v. 9, NOV 29 2019. (13/20091-0, 12/23638-8, 16/22940-3, 15/25096-6, 13/19335-2)

DE SOUZA, MARCELA MARIA; ZERLOTINI, ADHEMAR; PEREIRA ROCHA, MARINA IBELLI; BRUSCADIN, JENNIFER JESSICA; DA SILVA DINIZ, WELLISON JARLES; CARDOSO, TAINA FIGUEIREDO; MELLO CESAR, ALINE SILVA; AFONSO, JULIANA; NASCIMENTO ANDRADE, BRUNO GABRIEL; MUDADU, MAURICIO DE ALVARENGA; et al. Allele-specific expression is widespread in Bos indicus muscle and affects meat quality candidate genes. SCIENTIFIC REPORTS, v. 10, n. 1, JUN 23 2020. (12/20328-8, 12/23638-8)

LIMA, ANDRESSA OLIVEIRA; MALHEIROS, JESSICA MORAES; AFONSO, JULIANA; PETRINI, JULIANA; COUTINHO, LUIZ LEHMANN; JARLES DA SILVA DINIZ, WELLISON; BRESSANI, FLAVIA ALINE; TIZIOTO, POLYANA CRISTINE; NEUBERN DE OLIVEIRA, PRISCILA SILVA; SILVA RIBEIRO, JANSSEN AYNA; et al. Prune homolog 2 with BCH domain (PRUNE2) gene expression is associated with feed efficiency-related traits in Nelore steers. Mammalian Genome, v. 33, n. 4, p. 13-pg., 2022-07-16. (19/04089-2, 12/23638-8)

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