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Caracterização do perfil epigenético global de linhagens celulares de tumor colorretal

Processo: 13/05304-8
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Regular
Vigência: 01 de julho de 2013 - 30 de junho de 2015
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
Pesquisador responsável:Raphael Bessa Parmigiani
Beneficiário:Raphael Bessa Parmigiani
Instituição-sede: Hospital Sírio-Libanês. Sociedade Beneficente de Senhoras (SBSHSL). São Paulo , SP, Brasil
Pesq. associados:Anamaria Aranha Camargo
Assunto(s):Epigênese genética  Fenótipo  MicroRNAs  Histonas  Metilação de DNA  Neoplasias colorretais  Linhagem celular tumoral  Transcriptoma 

Resumo

A recente caracterização do fenótipo metilador de ilhas CpG (CIMP, do inglês CpG island methylator phenotype), identificado em 20 a 30 % das amostras de câncer colorretal, confirma o importante papel desempenhado por mecanismos epigenéticos na patogênese deste tipo de tumor. Este fenótipo é caracterizado pela frequente hipermetilação de diferentes regiões do genoma de maneira tumor específica, e está associado a características clinicopatológicas do tumor. Considerando-se que modificações epigenéticas são moduladas coordenadamente, é razoável especular que além da metilação do DNA, os tumores que possuem este fenótipo também apresentem outras alterações epigenéticas singulares (modificações de histonas e expressão de microRNAs), as quais podem ter envolvimento com a biologia e evolução do tumor. O presente trabalho pretende caracterizar o perfil epigenético global de linhagens celulares de tumor colorretal. Para tanto, serão estudadas tanto linhagens celulares nas quais o perfil CIMP está presente quanto linhagens onde o mesmo está ausente. Com o auxílio de técnicas de análise global, baseadas no sequenciamento em larga escala, serão estudadas a metilação do DNA, modificações de histonas e expressão de microRNAs. Juntamente com dados de transcriptoma que estão sendo gerados a partir destas mesmas linhagens celulares, espera-se que esta completa caracterização epigenética melhore o entendimento sobre as alterações moleculares desta patologia e consequentemente, no futuro, possa auxiliar na escolha do tratamento mais adequado para os pacientes. (AU)

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
LOPES-RAMOS, CAMILA M.; BARROS, BRUNA P.; KOYAMA, FERNANDA C.; CARPINETTI, PAOLA A.; PEZUK, JULIA; DOIMO, NAYARA T. S.; HABR-GAMA, ANGELITA; PEREZ, RODRIGO O.; PARMIGIANI, RAPHAEL B. E2F1 somatic mutation within miRNA target site impairs gene regulation in colorectal cancer. PLoS One, v. 12, n. 7 JUL 13 2017. Citações Web of Science: 6.

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