Aspectos genéticos e epigenéticos na carcinogênese gástrica

• Processo: 09/07145-9
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Temático
• Vigência: 01 de dezembro de 2009 - 31 de agosto de 2015
• Área do conhecimento: Ciências da Saúde - Medicina - Clínica Médica
• Pesquisador responsável: Marilia de Arruda Cardoso Smith
• Beneficiário: Marilia de Arruda Cardoso Smith
• Instituição Sede: Escola Paulista de Medicina (EPM). Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP). Campus São Paulo. São Paulo , SP, Brasil
• Pesquisadores associados: Ismael Dale Cotrim Guerreiro da Silva ; Monica Vannucci Nunes Lipay ; Rommel Mario Rodríguez Burbano ; Sylvia Satomi Takeno Herrero
• Bolsa(s) vinculada(s): 13/23900-7 - Avaliação genética e epigenética no câncer gástrico, BP.PD; 12/03506-0 - Alterações moleculares associadas ao abuso na infância: um estudo MeDIP-Seq, BE.PQ; 10/11174-1 - Avaliação genética e epigenética no câncer gástrico, BP.PD; 09/11251-9 - Regulação Epigenética no Câncer Gástrico, BP.MS; 09/08046-4 - Estudo do padrão de acetilação de histonas na carcinogênese gástrica, BP.DR
• Assunto(s): Citogenética Neoplasias gástricas
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: acetilação de histonas | câncer gástrico | Citogenética | metilação de histonas | Metilação do DNA | Proteoma | clinica medica

Resumo

O câncer gástrico é o quarto tipo de câncer mais comum e a segunda maior causa de morte por câncer no mundo. Atualmente, o Brasil situa-se em quarto lugar quanto à maior prevalência na América Latina. Alterações nos padrões de metilação ou no remodelamento da cromatina têm sido observadas em processos carcinogênicos por regularem a expressão gênica. Além disso, alterações citogenéticas têm sido observadas em vários tipos tumorais, incluindo o câncer gástrico. A investigação desses mecanismos genéticos e epigenéticos poderá auxiliar na determinação mais precisa do diagnóstico, do prognóstico e no estabelecimento de uma conduta terapêutica. No presente estudo, inicialmente serão selecionados genes/proteínas diferencialmente expressos por microarray e por ferramentas de proteômica, em duas linhagens celulares gástricas após tratamento com agentes desmetilante e desacetilante para a identificação de genes controlados por metilação de DNA e/ou metilação e acetilação de histonas. Esses genes terão sua expressão avaliada em 50 amostras de tecido gástrico normal e 50 de tumoral por qRT-PCR. Serão clonadas e sequenciadas as regiões promotoras dos genes selecionados por microarray. Genes com expressão diferencial serão avaliados quanto ao padrão de metilação nos promotores gênicos por MS-HRM e/ou padrão de metilação e acetilação de histona H3K9 por ChIP. Também serão avaliados os padrões de metilação e de acetilação de histonas associadas a genes relacionados ao câncer e previamente estudados em nosso laboratório. Paralelamente, será avaliada a expressão de genes envolvidos nas maquinarias de metilação de DNA e de histonas e da acetilação de histonas. A expressão gênica e as modificações epigenéticas serão associadas a sexo, idade, localização, presença de H. pylori, e extensão do tumor, tipo histopatológico e presença de metástase em linfonodo e à distância. Outra abordagem importante utilizada no projeto será a análise de CGH nas linhagens para identificação de alterações citogenéticas. O projeto irá gerar novas e incrementais informações biológicas, como biomarcadores, que possibilitarão melhor compreensão etio e fisiopatológica dessa neoplasia, com potencial aplicação na prática médica. (AU)

Publicações científicas

(8)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

WISNIESKI, FERNANDA; GERALDIS, JAQUELINE CRUZ; SANTOS, LEONARDO CAIRES; LEAL, MARIANA FERREIRA; CALCAGNO, DANIELLE QUEIROZ; GIGEK, CAROLINA OLIVEIRA; CHEN, ELIZABETH SUCHI; ANAUATE, ANA CAROLINA; ARTIGIANI, RICARDO; DEMACHKI, SAMIA; et al. ifferential regulation of LRRC37A2 in gastric cancer by DNA methylatio. Epigenetics, v. 17, n. 1, FEB 2021. (07/02470-3, 09/07145-9, 16/19953-6, 17/06227-8, 10/11174-1)

ANAUATE, ANA CAROLINA; LEAL, MARIANA FERREIRA; WISNIESKI, FERNANDA; SANTOS, LEONARDO CAIRES; GIGEK, CAROLINA OLIVEIRA; CHEN, ELIZABETH SUCHI; GERALDIS, JAQUELINE CRUZ; CALCAGNO, DANIELLE QUEIROZ; ASSUMPCAO, PAULO PIMENTEL; DEMACHKI, SAMIA; et al. Identification of suitable reference genes for miRNA expression normalization in gastric cancer. Gene, v. 621, p. 59-68, JUL 20 2017. (13/23900-7, 12/14768-5, 09/07145-9)

CALCAGNO, DANIELLE QUEIROZ; TAKENO, SYLVIA SANTOMI; GIGEK, CAROLINA OLIVEIRA; LEAL, MARIANA FERREIRA; WISNIESKI, FERNANDA; CHEN, ELIZABETH SUCHI; THOMAZ ARAUJO, TAISSA MAIRA; LIMA, ELEONIDAS MOURA; MELARAGNO, MARIA ISABEL; DEMACHKI, SAMIA; et al. Identification of IL11RA and MELK amplification in gastric cancer by comprehensive genomic profiling of gastric cancer cell lines. WORLD JOURNAL OF GASTROENTEROLOGY, v. 22, n. 43, p. 9506-9514, NOV 21 2016. (09/07145-9)

GIGEK, CAROLINA OLIVEIRA; CHEN, ELIZABETH SUCHI; CALCAGNO, DANIELLE QUEIROZ; WISNIESKI, FERNANDA; BURBANO, ROMMEL RODRIGUEZ; CARDOSO SMITH, MARILIA ARRUDA. Epigenetic mechanisms in gastric cancer. Epigenomics, v. 4, n. 3, p. 279-294, JUN 2012. (09/07145-9)

CALCAGNO, DANIELLE QUEIROZ; GIGEK, CAROLINA OLIVEIRA; CHEN, ELIZABETH SUCHI; BURBANO, ROMMEL RODRIGUEZ; CARDOSO SMITH, MARILIA DE ARRUDA. DNA and histone methylation in gastric carcinogenesis. WORLD JOURNAL OF GASTROENTEROLOGY, v. 19, n. 8, p. 1182-1192, FEB 28 2013. (10/11174-1, 09/07145-9)

WISNIESKI, FERNANDA; LEAL, MARIANA FERREIRA; CALCAGNO, DANIELLE QUEIROZ; SANTOS, LEONARDO CAIRES; GIGEK, CAROLINA OLIVEIRA; CHEN, ELIZABETH SUCHI; ARTIGIANI, RICARDO; DEMACHKI, SAMIA; ASSUMPCAO, PAULO PIMENTEL; LOURENCO, LAERCIO GOMES; et al. BMP8B Is a Tumor Suppressor Gene Regulated by Histone Acetylation in Gastric Cancer. Journal of Cellular Biochemistry, v. 118, n. 4, p. 869-877, APR 2017. (09/07145-9)

WISNIESKI, FERNANDA; GERALDIS, JAQUELINE CRUZ; SANTOS, LEONARDO CAIRES; LEAL, MARIANA FERREIRA; CALCAGNO, DANIELLE QUEIROZ; GIGEK, CAROLINA OLIVEIRA; CHEN, ELIZABETH SUCHI; ANAUATE, ANA CAROLINA; ARTIGIANI, RICARDO; DEMACHKI, SAMIA; et al. Differential regulation of LRRC37A2 in gastric cancer by DNA methylation. Epigenetics, v. 17, n. 1, p. 7-pg., 2021-02-07. (07/02470-3, 17/06227-8, 09/07145-9, 10/11174-1, 16/19953-6)

MELLO, ADRIANO AZEVEDO; LEAL, MARIANA FERREIRA; REY, JUAN ANTONIO; PINTO, GIOVANNY REBOUCAS; LAMARAO, LETICIA MARTINS; MONTENEGRO, RAQUEL CARVALHO; NEGREIROS NUNES ALVES, ANA PAULA; ASSUMPCAO, PAULO PIMENTEL; BORGES, BARBARA DO NASCIMENTO; SMITH, MARILIA CARDOSO; et al. Deregulated Expression of SRC, LYN and CKB Kinases by DNA Methylation and Its Potential Role in Gastric Cancer Invasiveness and Metastasis. PLoS One, v. 10, n. 10, OCT 13 2015. (09/07145-9)