Estudos populacionais de atum amarelo (Thunnus albacares) e Serra (Scomberomorus brasiliensis) (Perciformes: Scombridae) empregando a técnica de bibliotecas de representação reduzida

• Processo: 13/07560-1
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Vigência: 01 de julho de 2013 - 30 de junho de 2015
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
• Pesquisador responsável: Claudio de Oliveira
• Beneficiário: Claudio de Oliveira
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IBB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Botucatu. Botucatu , SP, Brasil
• Pesquisadores associados: Fausto Foresti
• Assunto(s): Genética populacional Peixes Biodiversidade Marcador molecular Polimorfismo de um único nucleotídeo Biblioteca gênica
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Biodiversidade | Conservação | marcadores moleculares | Peixes | populações | SNPs | Genética de populações

Resumo

Os estudos dos polimorfismos de nucleotídeos simples (SNPs), empregando a tecnologia de sequenciamento de segunda geração (NGS), permitem chegar a um ótimo patamar de custo-benefício na genotipagem de até milhares de indivíduos. Dentro das novas tecnologias existem metodologias, empregando enzimas de restrição, como é o caso da técnica de bibliotecas de representação reduzida (RRL), que possibilitam uma redução notável no sequenciamento de genomas. Mediante RRL é possível sequenciar uma fração do genoma comum de diferentes populações e/ou espécies próximas em uma mesma corrida, usando nucleotídeos marcados, ligados aos adaptadores empregados para a construção das bibliotecas. Estas metodologias estão sendo aplicadas em peixes marinhos, os quais são excelentes modelos para estudos de adaptação e análises populacionais devido à sua grande distribuição geográfica e seus grandes tamanhos populacionais. Dentro dos peixes capturados para o consumo fresco e processados destacam-se os peixes da família Scombridae, conhecidos genericamente como atuns, bonitos, serras, etc, pois constituem um importante recurso pesqueiro mundial, sendo um dos grupos mais representativos dentro da indústria alimentícia, sendo capturados e comercializados ao longo de toda sua área de distribuição. Estes peixes estão sob extrema pressão antrópica e existe uma necessidade urgente do uso das ferramentas genéticas para identificar a estrutura e as fronteiras das populações para permitir uma melhor gestão dos estoques e sua conservação. Assim, pretendemos encontrar SNPs específicos, empregando a técnica de RRL, para duas populações de duas espécies: o atum amarelo e a serra, coletados em dois pontos distantes da costa brasileira (Rio Grande do Norte e Santa Catarina), com a finalidade de buscar e analisar a diversidade e a diferenciação genética das populações nestas duas áreas geográficas. Os resultados obtidos servirão para uma melhor identificação das populações existentes e a delimitação de áreas prioritárias para programas de conservação e manejo. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

RAQUEL SICCHA-RAMIREZ, ZOILA; MAROSO, FRANCESCO; PARDO, BELEN G.; FERNANDEZ, CARLOS; MARTINEZ, PAULINO; OLIVEIRA, CLAUDIO. SNP identification and validation on genomic DNA for studying genetic diversity in Thunnus albacares and Scomberomorus brasiliensis by combining RADseq and long read high throughput sequencing. Fisheries Research, v. 198, p. 189-194, FEB 2018. (11/00881-1, 13/07560-1)