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Análises proteômicas de fungos filamentosos meso e termofílicos expostos aos fatores físico e químico

Processo: 12/24703-8
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Regular
Vigência: 01 de fevereiro de 2014 - 30 de setembro de 2016
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica - Bioquímica de Microorganismos
Pesquisador responsável:Hamilton Cabral
Beneficiário:Hamilton Cabral
Instituição-sede: Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto (FCFRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
Assunto(s):Enzimologia  Enzimas hidrolíticas  Proteômica  Fungos  Estresse oxidativo  Expressão de proteínas  Bioprocessos 

Resumo

O proteoma é o conjunto de proteínas codificadas pelo genoma, permitindo entender como as células se adaptam às diferentes condições ambientais, além de oferecer informações importantes sobre as possíveis modificações pós-traducionais. Os estudos proteômicos têm se tornado uma excelente ferramenta para explorar, descobrir e identificar as proteínas expressas em resposta ao estresse ambiental, tais como, fonte de carbono, temperatura e pH, pois estes parâmetros afetam a produção de enzimas microbianas. A compreensão dos mecanismos de produção e secreção de proteínas pode ser auxiliada pela proteômica e a elucidação dessas etapas pode melhorar os resultados obtidos em bioprocessos. O presente projeto pretende dar continuidade a vários subprojetos que envolvem a linha de pesquisa em prospecção de enzimas hidrolíticas de origem microbiana. As enzimas que serão alvos desta investigação são as proteases, carboidrases e lipases. O objetivo deste projeto é a avaliação do potencial de fungos filamentosos meso e termofílicos em produzir enzimas quando expostos aos fatores físicos e químicos. O estudo do potencial bioquímico de expressão proteica de cada fungo será avaliado por diferentes fatores, tais como, fonte de carbono e nitrogênio, efeito da temperatura e pH entre outros. As análises serão realizadas por géis 1 e 2D, e os spots diferentes do meio padrão serão removidos e realizada a digestão por tripsina, em seguida submetido os fragmentos no espectrômetro de massas para obtenção das sequências, as quais serão analisadas in silico. Assim, com estes estudos sobre a expressão de proteínas em fungos filamentosos em diferentes condições de crescimentos, abre-se a perspectiva de explorar enzimas que ainda não foram identificadas e até detectadas por técnicas convencionais de purificação e detecção via ensaios enzimáticos. Assim as análises proteômicas possibilitam a detecção e identificação de diferentes proteínas expressas em diferentes condições de crescimentos microbianos nos bioprocessos submerso e sólido, contribuindo para identificação de conjuntos proteicos. (AU)

Publicações científicas (13)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
DA SILVA, RONIVALDO RODRIGUES; SOUTO, TATIANE BELTRAMINI; DA ROSA, NATHALIA GONSALES; GONCALVES DE OLIVEIRA, LILIAN CAROLINE; JULIANO, MARIA APARECIDA; JULIANO, LUIZ; ROSA, JOSE C.; CABRAL, HAMILTON. Evaluation of the milk clotting properties of an aspartic peptidase secreted by Rhizopus microsporus. PREPARATIVE BIOCHEMISTRY & BIOTECHNOLOGY, OCT 2019. Citações Web of Science: 0.
COITINHO, LUCIANA BARBOSA; FUMAGALLI, FERNANDO; DA ROSA-GARZON, NATHALIA GONSALES; EMERY, FLAVIO DA SILVA; CABRAL, HAMILTON. Lapachol biotransformation by filamentous fungi yields bioactive quinone derivatives and lapachol-stimulated secondary metabolites. PREPARATIVE BIOCHEMISTRY & BIOTECHNOLOGY, v. 49, n. 5, p. 459-463, MAY 28 2019. Citações Web of Science: 1.
DA ROSA-GARZON, NATHALIA GONSALES; LAURE, HELEN JULIE; ROSA, JOSE CESAR; CABRAL, HAMILTON. Fusarium oxysporum cultured with complex nitrogen sources can degrade agricultural residues: Evidence from analysis of secreted enzymes and intracellular proteome. RENEWABLE ENERGY, v. 133, p. 941-950, APR 2019. Citações Web of Science: 0.
DA SILVA, RONIVALDO RODRIGUES; DA ROSA, NATHALIA GONSALES; GONCALVES DE OLIVEIRA, LILIAN CAROLINE; JULIANO, MARIA APARECIDA; JULIANO, LUIZ; ROSA, JOSE C.; CABRAL, HAMILTON. Biochemical Properties and Catalytic Specificity of a Novel Neutral Serine Peptidase Secreted by Fungus Pyrenochaetopsis sp.. Applied Biochemistry and Biotechnology, v. 187, n. 4, p. 1158-1172, APR 2019. Citações Web of Science: 1.
DA SILVA, RONIVALDO RODRIGUES; GONCALVES DE OLIVEIRA, LILIAN CAROLINE; JULIANO, MARIA APARECIDA; JULIANO, LUIZ; DE OLIVEIRA, ARTHUR H. C.; ROSA, JOSE C.; CABRAL, HAMILTON. Biochemical and milk-clotting properties and mapping of catalytic subsites of an extracellular aspartic peptidase from basidiomycete fungus Phanerochaete chrysosporium. Food Chemistry, v. 225, p. 45-54, JUN 15 2017. Citações Web of Science: 19.
HAMIN NETO, YOUSSEF A. A.; DE OLIVEIRA, LILIAN C. G.; DE OLIVEIRA, JULIANA R.; JULIANO, MARIA A.; JULIANO, LUIZ; ARANTES, ELIANE C.; CABRAL, HAMILTON. Analysis of the Specificity and Biochemical Characterization of Metalloproteases Isolated from Eupenicillium javanicum Using Fluorescence Resonance Energy Transfer Peptides. FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, v. 7, JAN 9 2017. Citações Web of Science: 0.
DA SILVA, RONIVALDO RODRIGUES; GONCALVES DE OLIVEIRA, LILIAN CAROLINE; JULIANO, MARIA APARECIDA; JULIANO, LUIZ; ROSA, JOSE C.; CABRAL, HAMILTON. Activity of a peptidase secreted by Phanerochaete chrysosporium depends on lysine to subsite S `(1). International Journal of Biological Macromolecules, v. 94, n. A, p. 474-483, JAN 2017. Citações Web of Science: 10.
ABOU HAMIN NETO, YOUSSEF ALI; COITINHO, LUCIANA BARBOSA; PEDRO DE FREITAS, LUIS ALEXANDRE; CABRAL, HAMILTON. Box-Behnken analysis and storage of spray-dried collagenolytic proteases from Myceliophthora thermophila submerged bioprocess. PREPARATIVE BIOCHEMISTRY & BIOTECHNOLOGY, v. 47, n. 5, p. 473-480, 2017. Citações Web of Science: 0.
DA ROSA-GARZON, NATHALIA GONSALES; LAURE, HELEN JULIE; DE SOUZA-MOTTA, CRISTINA MARIA; ROSA, JOSE CESAR; CABRAL, HAMILTON. Medium pH in submerged cultivation modulates differences in the intracellular protein profile of Fusarium oxysporum. PREPARATIVE BIOCHEMISTRY & BIOTECHNOLOGY, v. 47, n. 7, p. 664-672, 2017. Citações Web of Science: 1.
IDA, ERIKA LIKA; DA SILVA, RONIVALDO RODRIGUES; DE OLIVEIRA, TASSIO BRITO; SOUTO, TATIANE BELTRAMINI; LEITE, JULIANA ABIGAIL; RODRIGUES, ANDRE; CABRAL, HAMILTON. Biochemical properties and evaluation of washing performance in commercial detergent compatibility of two collagenolytic serine peptidases secreted by Aspergillus fischeri and Penicillium citrinum. PREPARATIVE BIOCHEMISTRY & BIOTECHNOLOGY, v. 47, n. 3, p. 282-290, 2017. Citações Web of Science: 5.
DA SILVA, RONIVALDO RODRIGUES; SOUTO, TATIANE BELTRAMINI; DE OLIVEIRA, TASSIO BRITO; GONCALVES DE OLIVEIRA, LILIAN CAROLINE; KARCHER, DANIEL; JULIANO, MARIA APARECIDA; JULIANO, LUIZ; DE OLIVEIRA, ARTHUR H. C.; RODRIGUES, ANDRE; ROSA, JOSE C.; CABRAL, HAMILTON. Evaluation of the catalytic specificity, biochemical properties, and milk clotting abilities of an aspartic peptidase from Rhizomucor miehei. Journal of Industrial Microbiology & Biotechnology, v. 43, n. 8, p. 1059-1069, AUG 2016. Citações Web of Science: 14.
BIAGGIO, RAFAEL TAGE; DA SILVA, RONIVALDO RODRIGUES; DA ROSA, NATHALIA GONSALES; RIBEIRO LEITE, RODRIGO SIMOES; ARANTES, ELIANE CANDIANI; DE FREITAS CABRAL, TATIANA PEREIRA; JULIANO, MARIA A.; JULIANO, LUIZ; CABRAL, HAMILTON. Purification and biochemical characterization of an extracellular serine peptidase from Aspergillus terreus. PREPARATIVE BIOCHEMISTRY & BIOTECHNOLOGY, v. 46, n. 3, p. 298-304, 2016. Citações Web of Science: 8.
HAMIN NETO, YOUSSEF A. A.; DE OLIVEIRA, LILIAN C. G.; DE OLIVEIRA, ARTHUR H. C.; ROSA, JOSE C.; JULIANO, MARIA A.; JULIANO, LUIZ; RODRIGUES, ANDRE; CABRAL, HAMILTON. Determination of Specificity and Biochemical Characteristics of Neutral Protease Isolated from Myceliophthora thermophila. PROTEIN AND PEPTIDE LETTERS, v. 22, n. 11, p. 972-982, 2015. Citações Web of Science: 6.

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