Decifrando as grandes tendências de evolução molecular e morfológica nos Amoebozoa

• Processo: 13/04585-3
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Jovens Pesquisadores
• Data de Início da vigência: 01 de dezembro de 2013
• Data de Término da vigência: 30 de novembro de 2018
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Zoologia
• Pesquisador responsável: Daniel José Galafasse Lahr
• Beneficiário: Daniel José Galafasse Lahr
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Auxílio(s) vinculado(s): 15/50327-1 - Understanding microbial responses to environmental stress: integrated molecular and palaeocological approaches using testate Amoebae, AP.R SPRINT
• Bolsa(s) vinculada(s): 16/03193-2 - Auxílio na produção e gerenciamento de dados moleculares dos Amoebozoa, BP.TT; 15/02689-1 - Experimentos de exclusão competitiva em protistas, BP.IC; 14/12822-8 - Auxílio na produção e gerenciamento de dados moleculares dos Amoebozoa para o período inicial do projeto JP, BP.TT; 13/25729-3 - Variação Morfológica temporal de tecamebas (Arcella vulgaris e Arcella gibbosa) em populações naturais e linhagens clonais, BP.IC
• Assunto(s): Transcriptoma Filogenia Actinas Duplicação gênica Evolução molecular
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Amoebozoa | Evolução | Sistematica | Transcriptoma | Evolução de protozoários

Resumo

O projeto proposto pretende iniciar a caracterização a diversidade dos Amoebozoa no Brasil, integrando aspectos de protistologia tradicional de estudo morfológico com técnicas moleculares inovadoras. Organismos serão isolados de corpos d'água doce e marinho, de modo a capturar de maneira abrangente a diversidade de organismos ainda inexplorada no território nacional. Os organismos coletados serão submetidos à duas principais estratégias de estudo: 1) os organismos que não permitem cultura em laboratório serão foto-documentados e submetidos à processo de amplificação genômica a partir de uma única célula; e 2) os organismos que permitem cultura em laboratório serão cultivados de maneira monoxênica para geração de grandes quantidades de DNA e também geração de bibliotecas de cDNA para piro-sequenciamento do transcriptoma em plataforma Illumina. Muitos dos organismos assim estudados serão espécies novas ou pouco conhecidas, que serão descritas individualmente com estudos detalhados de microscopia eletrônica e análise filogenética baseada em concatenação de múltiplos genes (no mínimo 4 genes: subunidade ribossomal 18s, actina, alfa e beta tubulina). Outros organismos encontrados serão utilizados para caracterização de 8-10 genes utilizados em reconstruções filogenéticas abrangentes de eucariontes, com o objetivo de gerar filogenias com ênfase nas relações basais dos Amoebozoa. Os organismos cujos transcriptomas foram sequenciados serão utilizados para compreensão mais profunda sobre padrões de evolução por duplicação gênica nos Amoebozoa, com enfoque especial na família gênica de actina. Finalmente, os dados fotográficos, videográficos e moleculares gerados serão disseminados a partir de publicação de artigos em revistas de projeção internacional e também com a criação de websites voltados a divulgação do conhecimento para o público leigo. (AU)

Publicações científicas

(21)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

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