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Structure and dynamics of proteins by high-resolution NMR spectroscopy, SAXS, and computation

Processo: 13/50355-0
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Regular
Vigência: 01 de outubro de 2013 - 30 de setembro de 2014
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Biofísica - Biofísica Molecular
Convênio/Acordo: Ohio State University
Pesquisador responsável:Roberto Kopke Salinas
Beneficiário:Roberto Kopke Salinas
Pesq. responsável no exterior: Mark Foster
Instituição no exterior: Ohio State University, Estados Unidos
Instituição-sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:11/07777-5 - Sinalização por c-di-GMP e o sistema de secreção de macromoléculas do tipo IV em Xanthomonas citri, AP.TEM
Assunto(s):Simulação de dinâmica molecular  Proteínas  Espectroscopia de ressonância magnética nuclear  Espalhamento de raios X a baixos ângulos 

Resumo

As propriedades dinâmicas de muitas proteínas são essenciais para a função. Apesar disto, pouco compreendemos sobre dinâmica de proteínas, ou seja, sobre as flutuações temporais da estrutura molecular. Dinâmica de proteínas desempenha um papel crítico em diversos processos celulares, incluindo metabolismo, regulação gênica e transdução de sinal. O plano de pesquisa proposto tem por objetivo aumentar a nossa compreensão acerca do comportamento dinâmico de proteínas através da combinação de espectroscopia de Ressonância Magnética Nuclear (RMN), simulações computacionais de dinâmica molecular, e espalhamento de luz a baixo ângulo (SAXS). OSU e USP possuem expertise e infra-estrutura complementar para a realização destes estudos. A presente proposta pretende utilizar uma colaboração já existente como ponto de partida para estabelecer uma nova abordagem colaborativa para o estudo de dinâmica de proteínas. (AU)

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
ABIKO, LAYARA AKEMI; VITALE, PHELIPE M.; FAVARO, DENIZE C.; HAUK, PRICILA; LI, DA-WEI; YUAN, JIAQI; BRUSCHWEILER-LI, LEI; SALINAS, ROBERTO K.; BRUSCHWEILER, RAFAEL. Model for the allosteric regulation of the Na+/Ca2+ exchanger NCX. PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND BIOINFORMATICS, v. 84, n. 5, p. 580-590, MAY 2016. Citações Web of Science: 3.

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