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Aprendizado de máquina em neuroimagem: desenvolvimento de métodos e aplicações clínicas em transtornos psiquiátricos

Resumo

Métodos de neuroimagem como a ressonância magnética funcional, tractografia, morfometria baseada em voxel e análise da superfície cortical vêm avançando rapidamente permitindo a observação de aspectos distintos da estrutura e funcionamento cerebral e vem tendo uma contribuição fundamental para o entendimento de transtornos mentais (TM). Tradicionalmente vêm sendo utilizados para a comparação entre grupos de indivíduos saudáveis e grupos de pacientes com TM e a comparação de "médias" tem contribuído para o entendimento da etiologia e correlatos neurais associados às patologias. Como as alterações são sutis e a variabilidade dos dados é grande há uma grande sobreposição entre as "médias" de indivíduos saudáveis e com TM. Esta sobreposição limita sobremaneira o uso das técnicas de neuroimagem na prática clínica, uma vez que não pode ser aplicada para o diganóstico do caso individual. Desta forma, um dos principais desafios na psiquiatria é a descoberta de biomarcadores, tais como a neuroimagem, que sejam úteis tanto para diagnóstico dos TM como para predizer a eficácia dos tratamentos com medicações e/ou terapias (prognóstico). Alterações cerebrais sutis e espacialmente distribuídas são difíceis de serem detectadas a olho nu, mas podem ser detectadas com a utilização de métodos de aprendizado de máquina ('machine learning'). Em trabalhos anteriores do nosso grupo pudemos demonstrar que algumas dessas técnicas permitem a obtenção de predições de estados (e.g., patológico ou refratário) para o caso individual. Neste projeto, deseja-se dar um salto conceitual no desenvolvimento de métodos e aplicações em psiquiatria. Este salto embasa-se na utilização de grandes bases de dados (da ordem de centenas de indivíduos) inéditas de neuroimagem que serão combinadas com dados de genética (DNA e RNA) para validar as técnicas previamente desenvolvidas e realizar a mineração de dados para a descoberta de marcardores para os transtornos psiquiátricos. Esperamos encontrar potenciais biomarcadores para esquizofrenia através de medidas de conectividade e polimorfismos genéticos. Além disso, vamos estudar trajetórias de conectividade funcional para identificar potenciais marcadores precoces de risco para TM em uma amostra inédita no mundo incluindo mais de 750 crianças com desenvolvimento saudável e crianças em alto risco para TM,. Este grupo vem tendo sucesso no desenvolvimento metodologias combinando métodos avançados de reconhecimento de padrão de neuroimagem para TM. Este projeto vai aplicar a combinação da neuroimagem com métodos estatísticos/computacionais modernos em grandes bases de dados tanto de neuroimagem como de outros biomarcadores, provenientes de amostras seletas (portadores da doença, indivíduos em risco e controles saudáveis) e permitirá importantes avanços tecnológicos para diagnósticos e prognósticos em psiquiatria. (AU)

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Publicações científicas (40)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
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NOTO, CRISTIANO; OTA, VANESSA KIYOMI; SANTORO, MARCOS LEITE; GOUVEA, EDUARDO SAUERBRONN; SILVA, PATRICIA NATALIA; SPINDOLA, LETICIA MARIA; CORDEIRO, QUIRINO; BRESSAN, RODRIGO AFFONSECA; GADELHA, ARY; BRIETZKE, ELISA; et al. Depression, Cytokine, and Cytokine by Treatment Interactions Modulate Gene Expression in Antipsychotic Naive First Episode Psychosis. Molecular Neurobiology, v. 53, n. 8, p. 5701-5709, . (10/19176-3, 13/10498-6, 11/50740-5, 10/08968-6)
DE MOURA, ADRIANA MIYAZAKI; LOPEZ PINAYA, WALTER HUGO; GADELHA, ARY; ZUGMAN, ANDRE; NOTO, CRISTIANO; CORDEIRO, QUIRINO; BELANGERO, SINTIA IOLE; JACKOWSKI, ANDREA P.; BRESSAN, RODRIGO A.; SATO, JOAO RICARDO. Investigating brain structural patterns in first episode psychosis and schizophrenia using MRI and a machine learning approach. PSYCHIATRY RESEARCH-NEUROIMAGING, v. 275, p. 14-20, . (13/10498-6, 13/08531-5, 14/07280-1, 13/05168-7)
SUBIRA, MARTA; CANO, MARTA; DE WIT, STELLA J.; ALONSO, PINO; CARDONER, NARCIS; HOEXTER, MARCELO Q.; KWON, JUN SOO; NAKAMAE, TAKASHI; LOCHNER, CHRISTINE; SATO, JOAO R.; et al. Structural covariance of neostriatal and limbic regions in patients with obsessive-compulsive disorder. JOURNAL OF PSYCHIATRY & NEUROSCIENCE, v. 41, n. 2, p. 115-123, . (13/10498-6, 05/04206-6)
SATO, JOAO RICARDO; BIAZOLI, JR., CLAUDINEI EDUARDO; SALUM, GIOVANNI ABRAHAO; GADELHA, ARY; CROSSLEY, NICOLAS; VIEIRA, GILSON; ZUGMAN, ANDRE; PICON, FELIPE ALMEIDA; PAN, PEDRO MARIO; HOEXTER, MARCELO QUEIROZ; et al. Connectome hubs at resting state in children and adolescents: Reproducibility and psychopathological correlation. DEVELOPMENTAL COGNITIVE NEUROSCIENCE, v. 20, p. 2-11, . (13/08531-5, 13/10498-6, 08/57896-8, 13/00506-1)
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SATO, JOAO RICARDO; BIAZOLI, JR., CLAUDINEI EDUARDO; SALUM, GIOVANNI ABRAHAO; GADELHA, ARY; CROSSLEY, NICOLAS; VIEIRA, GILSON; ZUGMAN, ANDRE; PICON, FELIPE ALMEIDA; PAN, PEDRO MARIO; HOEXTER, MARCELO QUEIROZ; et al. Association between abnormal brain functional connectivity in children and psychopathology: A study based on graph theory and machine learning. WORLD JOURNAL OF BIOLOGICAL PSYCHIATRY, v. 19, n. 2, p. 119-129, . (13/08531-5, 08/57896-8, 13/10498-6, 13/00506-1, 13/16864-4)
NOTO, CRISTIANO; OTA, VANESSA KIYOMI; GADELHA, ARY; NOTO, MARIANE NUNES; BARBOSA, DECIO SABBATINI; BONIFACIO, KAMILA LANDUCCI; NUNES, SANDRA ODEBRECHT; CORDEIRO, QUIRINO; BELANGERO, SINTIA IOLE; BRESSAN, RODRIGO AFFONSECA; et al. Oxidative stress in drug naive first episode psychosis and antioxidant effects of risperidone. JOURNAL OF PSYCHIATRIC RESEARCH, v. 68, p. 210-216, . (10/19176-3, 13/10498-6, 11/50740-5, 10/08968-6)
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MOURA, LUCIANA MONTEIRO; KEMPTON, MATTHEW; BARKER, GARETH; SALUM, GIOVANNI; GADELHA, ARY; PAN, PEDRO MARIO; HOEXTER, MARCELO; GOMES DEL AQUILLA, MARCO ANTONIO; PICON, FELIPE ALMEIDA; ANES, MAURICIO; et al. Age-effects in white matter using associated diffusion tensor imaging and magnetization transfer ratio during late childhood and early adolescence. MAGNETIC RESONANCE IMAGING, v. 34, n. 4, p. 529-534, . (13/08531-5, 13/10498-6, 13/00506-1)
MOURA, L. M.; CROSSLEY, N. A.; ZUGMAN, A.; PAN, P. M.; GADELHA, A.; DEL AQUILLA, M. A. G.; PICON, F. A.; ANES, M.; AMARO, JR., E.; DE JESUS MARI, J.; et al. Coordinated brain development: exploring the synchrony between changes in grey and white matter during childhood maturation. BRAIN IMAGING AND BEHAVIOR, v. 11, n. 3, p. 808-817, . (13/08531-5, 13/10498-6, 08/57896-8, 13/00506-1)
DE OLIVEIRA, AILTON ANDRADE; CARTHERY-GOULART, MARIA TERESA; DE MAGALHAES OLIVEIRA JUNIOR, PEDRO PAULO; CARRETTIERO, DANIEL CARNEIRO; SATO, JOAO RICARDO; INITI, ALZHEIMER'S DIS NEUROIMAGING. Defining Multivariate Normative Rules for Healthy Aging using Neuroimaging and Machine Learning: An Application to Alzheimer's Disease. JOURNAL OF ALZHEIMER'S DISEASE, v. 43, n. 1, p. 201-212, . (13/10498-6, 13/00506-1)
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