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Identificação de uma assinatura genética preditiva / prognóstica na Doença de Chagas: abordagem de biologia de sistemas

Processo: 13/50302-3
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Regular
Vigência: 01 de outubro de 2013 - 31 de dezembro de 2017
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Imunologia - Imunologia Aplicada
Convênio/Acordo: ANR - Blanc
Pesquisador responsável:Edecio Cunha Neto
Beneficiário:Edecio Cunha Neto
Pesq. responsável no exterior: Christophe Chevillard
Instituição no exterior: Aix-Marseille Université (AMU), França
Instituição-sede: Faculdade de Medicina (FM). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Assunto(s):Doença de Chagas  Trypanosoma cruzi  Cardiomiopatia chagásica  Biologia de sistemas  Exoma  Polimorfismo genético  Proteômica  Transcriptoma 

Resumo

A doença de Chagas, causada pelo Trypanosoma cruzi, afeta 15 milhões de pessoas, e 30% desenvolvem a Cardiopatia Chagásica Crônica, (CCC), enquanto a maioria dos pacientes permanece na forma indeterminada (FI). A agregação familiar de casos e a associação de polimorfismos genéticos (SNP) com a CCC sugerem um componente genético na suscetibilidade à CCC. O desfecho final da doença de Chagas é determinado pela miocardite e a resposta miocárdica. Nossa hipótese que a expressão miocárdica de muitos genes e proteínas relevantes para a patogênese seja controlada por polimorfismos genéticos, e que uma assinatura genética neles baseada pode ter valor prognóstico. No objetivo 1, usaremos uma abordagem de biologia de sistemas para identificar genes/proteínas diferencialmente expressos no miocárdio CCC, usando análises proteômica e transcriptômica. No objetivo 2, identificaremos variantes genéticos associados à doença. Num estudo caso-controle utilizaremos grandes coortes principais e de replicação (casos CCC, controles FI). Tag SNP comuns dos genes identificados no Obj.1 serão genotipados e analisados. O sequenciamento do exoma será feito em famílias nucleares com múltiplos casos, para identificar variantes raros compartilhados apenas por pacientes CCC. Realizaremos análises funcionais dos SNP. Combinações de múltiplos SNP podem ter valor prognóstico para o paciente individual, indicando aqueles de maior risco. Além disso, este estudo trará importantes informações sobre a patogenia e progressão da doença. (AU)

Publicações científicas (7)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
CHEVILLARD, CHRISTOPHE; NUNES, JOAO PAULO SILVA; FRADE, AMANDA FARAGE; ALMEIDA, RAFAEL RIBEIRO; PANDEY, RAMENDRA PATI; NASCIMENTO, MARILDA SAVOIA; KALIL, JORGE; CUNHA-NETO, EDECIO. Disease Tolerance and Pathogen Resistance Genes May Underlie Trypanosoma cruzi Persistence and Differential Progression to Chagas Disease Cardiomyopathy. FRONTIERS IN IMMUNOLOGY, v. 9, DEC 3 2018. Citações Web of Science: 3.
PINTO FERREIRA, LUDMILA RODRIGUES; FERREIRA, FREDERICO MORAES; LAUGIER, LAURIE; CABANTOUS, SANDRINE; NAVARRO, ISABELA CUNHA; CANDIDO, DARLAN DA SILVA; RIGAUD, VAGNER CARVALHO; REAL, JULIANA MONTE; PEREIRA, GLAUCIA VILAR; PEREIRA, ISABELA RESENDE; RUIVO, LEONARDO; PANDEY, RAMENDRA PATI; SAVOIA, MARILDA; KALIL, JORGE; LANNES-VIEIRA, JOSELI; NAKAYA, HELDER; CHEVILLARD, CHRISTOPHE; CUNHA-NETO, EDECIO. Integration of miRNA and gene expression profiles suggest a role for miRNAs in the pathobiological processes of acute Trypanosoma cruzi infection. SCIENTIFIC REPORTS, v. 7, DEC 21 2017. Citações Web of Science: 4.
LAUGIER, LAURIE; FRADE, AMANDA FARAGE; FERREIRA, FREDERICO MORAES; BARON, MONIQUE ANDRADE; TEIXEIRA, PRISCILA CAMILLO; CABANTOUS, SANDRINE; PINTO FERREIRA, LUDMILA RODRIGUES; LOUIS, LAURENCE; CARVALHO RIGAUD, VAGNER OLIVEIRA; GAIOTTO, FABIO ANTONIO; BACAL, FERNANDO; POMERANTZEFF, PABLO; BOCCHI, EDIMAR; KALIL, JORGE; BARROS SANTOS, RONALDO HONORATO; CUNHA-NETO, EDECIO; CHEVILLARD, CHRISTOPHE. Whole-Genome Cardiac DNA Methylation Fingerprint and Gene Expression Analysis Provide New Insights in the Pathogenesis of Chronic Chagas Disease Cardiomyopathy. Clinical Infectious Diseases, v. 65, n. 7, p. 1103-1111, OCT 1 2017. Citações Web of Science: 4.
CUNHA-NETO, EDECIO; ROSA, DANIELA S.; HARRIS, PAUL E.; OLSON, TIM; MORROW, ALEX; CIOTLOS, SERBAN; HERST, CHARLES V.; RUBSAMEN, REID MARTIN. An Approach for a Synthetic CTL Vaccine Design against Zika Flavivrus Using Class I and Class II Epitopes Identified by Computer Modeling. FRONTIERS IN IMMUNOLOGY, v. 8, JUN 9 2017. Citações Web of Science: 5.
PINTO FERREIRA, LUDMILA RODRIGUES; FERREIRA, FREDERICO MORAES; NAKAYA, HELDER IMOTO; DENG, XUTAO; CNDIDO, DARLAN DA SILVA; DE OLIVEIRA, LEA CAMPOS; BILLAUD, JEAN-NOEL; LANTERI, MARION C.; RIGAUD, VAGNER OLIVEIRA-CARVALHO; SEIELSTAD, MARK; KALIL, JORGE; FERNANDES, FABIO; RIBEIRO, ANTONIO LUIZ P.; SABINO, ESTER CERDEIRA; CUNHA-NETO, EDECIO. Blood Gene Signatures of Chagas Cardiomyopathy With or Without Ventricular Dysfunction. Journal of Infectious Diseases, v. 215, n. 3, p. 387-395, FEB 1 2017. Citações Web of Science: 11.
NAVARRO, ISABELA CUNHA; FERREIRA, FREDERICO MORAES; NAKAYA, HELDER I.; BARON, MONIQUE ANDRADE; VILAR-PEREIRA, GLAUCIA; PEREIRA, ISABELA RESENDE; GONCALVES SILVA, ANA MARIA; REAL, JULIANA MONTE; DE BRITO, THALES; CHEVILLARD, CHRISTOPHE; LANNES-VIEIRA, JOSELI; KALIL, JORGE; CUNHA-NETO, EDECIO; PINTO FERREIRA, LUDMILA RODRIGUES. MicroRNA Transcriptome Profiling in Heart of Trypanosoma cruzi-Infected Mice: Parasitological and Cardiological Outcomes. PLoS Neglected Tropical Diseases, v. 9, n. 6 JUN 2015. Citações Web of Science: 11.
PINTO FERREIRA, LUDMILA RODRIGUES; FRADE, AMANDA FARAGE; BARROS SANTOS, RONALDO HONORATO; TEIXEIRA, PRISCILA CAMILLO; BARON, MONIQUE ANDRADE; NAVARRO, ISABELA CUNHA; BENVENUTI, LUIZ ALBERTO; FIORELLI, ALFREDO INACIO; BOCCHI, EDIMAR ALCIDES; STOLF, NOEDIR ANTONIO; CHEVILLARD, CHRISTOPHE; KALIL, JORGE; CUNHA-NETO, EDECIO. MicroRNAs miR-1, miR-133a, miR-133b, miR-208a and miR-208b are dysregulated in Chronic Chagas disease Cardiomyopathy. INTERNATIONAL JOURNAL OF CARDIOLOGY, v. 175, n. 3, p. 409-417, AUG 20 2014. Citações Web of Science: 33.

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