Identificação de uma assinatura genética preditiva / prognóstica na Doença de Chagas: abordagem de biologia de sistemas

• Processo: 13/50302-3
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de outubro de 2013
• Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2017
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Imunologia - Imunologia Aplicada
• Acordo de Cooperação: ANR - Blanc
• Pesquisador responsável: Edecio Cunha Neto
• Beneficiário: Edecio Cunha Neto
• Pesquisador Responsável no exterior: Christophe Chevillard
• Instituição Parceira no exterior: Aix-Marseille Université (AMU), França
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina (FM). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Doença de Chagas Trypanosoma cruzi Cardiomiopatia chagásica Biologia de sistemas Exoma Polimorfismo genético Proteômica Transcriptoma
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Imunologia Aplicada

Resumo

A doença de Chagas, causada pelo Trypanosoma cruzi, afeta 15 milhões de pessoas, e 30% desenvolvem a Cardiopatia Chagásica Crônica, (CCC), enquanto a maioria dos pacientes permanece na forma indeterminada (FI). A agregação familiar de casos e a associação de polimorfismos genéticos (SNP) com a CCC sugerem um componente genético na suscetibilidade à CCC. O desfecho final da doença de Chagas é determinado pela miocardite e a resposta miocárdica. Nossa hipótese que a expressão miocárdica de muitos genes e proteínas relevantes para a patogênese seja controlada por polimorfismos genéticos, e que uma assinatura genética neles baseada pode ter valor prognóstico. No objetivo 1, usaremos uma abordagem de biologia de sistemas para identificar genes/proteínas diferencialmente expressos no miocárdio CCC, usando análises proteômica e transcriptômica. No objetivo 2, identificaremos variantes genéticos associados à doença. Num estudo caso-controle utilizaremos grandes coortes principais e de replicação (casos CCC, controles FI). Tag SNP comuns dos genes identificados no Obj.1 serão genotipados e analisados. O sequenciamento do exoma será feito em famílias nucleares com múltiplos casos, para identificar variantes raros compartilhados apenas por pacientes CCC. Realizaremos análises funcionais dos SNP. Combinações de múltiplos SNP podem ter valor prognóstico para o paciente individual, indicando aqueles de maior risco. Além disso, este estudo trará importantes informações sobre a patogenia e progressão da doença. (AU)

Publicações científicas

(15)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

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