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Identificação de uma assinatura genética preditiva / prognóstica na Doença de Chagas: abordagem de biologia de sistemas

Processo: 13/50302-3
Modalidade de apoio:Auxílio à Pesquisa - Regular
Vigência: 01 de outubro de 2013 - 31 de dezembro de 2017
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Imunologia - Imunologia Aplicada
Convênio/Acordo: ANR - Blanc
Pesquisador responsável:Edecio Cunha Neto
Beneficiário:Edecio Cunha Neto
Pesq. responsável no exterior: Christophe Chevillard
Instituição no exterior: Aix-Marseille Université (AMU), França
Instituição Sede: Faculdade de Medicina (FM). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Assunto(s):Doença de Chagas  Trypanosoma cruzi  Cardiomiopatia chagásica  Biologia de sistemas  Exoma  Polimorfismo genético  Proteômica  Transcriptoma 
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Imunologia Aplicada

Resumo

A doença de Chagas, causada pelo Trypanosoma cruzi, afeta 15 milhões de pessoas, e 30% desenvolvem a Cardiopatia Chagásica Crônica, (CCC), enquanto a maioria dos pacientes permanece na forma indeterminada (FI). A agregação familiar de casos e a associação de polimorfismos genéticos (SNP) com a CCC sugerem um componente genético na suscetibilidade à CCC. O desfecho final da doença de Chagas é determinado pela miocardite e a resposta miocárdica. Nossa hipótese que a expressão miocárdica de muitos genes e proteínas relevantes para a patogênese seja controlada por polimorfismos genéticos, e que uma assinatura genética neles baseada pode ter valor prognóstico. No objetivo 1, usaremos uma abordagem de biologia de sistemas para identificar genes/proteínas diferencialmente expressos no miocárdio CCC, usando análises proteômica e transcriptômica. No objetivo 2, identificaremos variantes genéticos associados à doença. Num estudo caso-controle utilizaremos grandes coortes principais e de replicação (casos CCC, controles FI). Tag SNP comuns dos genes identificados no Obj.1 serão genotipados e analisados. O sequenciamento do exoma será feito em famílias nucleares com múltiplos casos, para identificar variantes raros compartilhados apenas por pacientes CCC. Realizaremos análises funcionais dos SNP. Combinações de múltiplos SNP podem ter valor prognóstico para o paciente individual, indicando aqueles de maior risco. Além disso, este estudo trará importantes informações sobre a patogenia e progressão da doença. (AU)

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Publicações científicas (15)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
ANDRIEUX, PAULINE; CHEVILLARD, CHRISTOPHE; CUNHA-NETO, EDECIO; NUNES, JOAO PAULO SILVA. Mitochondria as a Cellular Hub in Infection and Inflammation. INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES, v. 22, n. 21, . (14/50890-5, 13/50302-3)
NUNES, JOAO PAULO SILVA; ANDRIEUX, PAULINE; BROCHET, PAULINE; ALMEIDA, RAFAEL RIBEIRO; KITANO, EDUARDO; HONDA, ANDRE KENJI; IWAI, LEO KEI; ANDRADE-SILVA, DEBORA; GOUDENEGE, DAVID; ALCANTARA SILVA, KARLA DEYSIREE; et al. Co-Exposure of Cardiomyocytes to IFN-gamma and TNF-alpha Induces Mitochondrial Dysfunction and Nitro-Oxidative Stress: Implications for the Pathogenesis of Chronic Chagas Disease Cardiomyopathy. FRONTIERS IN IMMUNOLOGY, v. 12, . (14/50890-5, 13/50302-3)
PINTO FERREIRA, LUDMILA RODRIGUES; CORREIA, CRISTIANO JESUS; ZANONI, FERNANDO LUIZ; CARVALHO-SILVA, ANA CAROLINA; ZANIRATTO, RICARDO; CANDIDO, DARLAN DA SILVA; ALMEIDA, RAFAEL RIBEIRO; BREITHAUPT-FALOPPA, ANA CRISTINA; CUNHA-NETO, EDECIO; MOREIRA, LUIZ FELIPE P.. ardiac MicroRNA Expression Profile After Experimental Brain Death Is Associated With Myocardial Dysfunction and Can Be Modulated by Hypertonic Salin. TRANSPLANTATION, v. 106, n. 2, p. 289-298, . (13/50302-3, 12/19841-2, 14/50890-5)
RIBEIRO, SUSAN PEREIRA; DE MOURA MATTARAIA, VANIA GOMES; ALMEIDA, RAFAEL RIBEIRO; GHIURO VALENTINE, ELIZABETH JULIANA; SALES, NATIELY SILVA; FERREIRA, LUIS CARLOS S.; SA-ROCHA, LUIZ CARLOS; JACINTHO, LUCAS CAUE; SANTANA, VINICIUS CANATO; SIDNEY, JOHN; et al. promiscuous T cell epitope-based HIV vaccine providing redundant population coverage of the HLA class II elicits broad, polyfunctional T cell responses in nonhuman primate. Vaccine, v. 40, n. 2, p. 239-246, . (14/50890-5, 13/50302-3)
BROCHET, PAULINE; IANNI, BARBARA MARIA; LAUGIER, LAURIE; FRADE, AMANDA FARAGE; SILVA NUNES, JOAO PAULO; TEIXEIRA, PRISCILA CAMILLO; MADY, CHARLES; FERREIRA, LUDMILA RODRIGUES PINTO; FERRE, QUENTIN; SANTOS, RONALDO HONORATO BARROS; et al. Epigenetic regulation of transcription factor binding motifs promotes Th1 response in Chagas disease cardiomyopathy. FRONTIERS IN IMMUNOLOGY, v. 13, p. 16-pg., . (14/50890-5, 13/50302-3)
PINTO FERREIRA, LUDMILA RODRIGUES; FERREIRA, FREDERICO MORAES; LAUGIER, LAURIE; CABANTOUS, SANDRINE; NAVARRO, ISABELA CUNHA; CANDIDO, DARLAN DA SILVA; RIGAUD, VAGNER CARVALHO; REAL, JULIANA MONTE; PEREIRA, GLAUCIA VILAR; PEREIRA, ISABELA RESENDE; et al. Integration of miRNA and gene expression profiles suggest a role for miRNAs in the pathobiological processes of acute Trypanosoma cruzi infection. SCIENTIFIC REPORTS, v. 7, . (13/50302-3)
LAUGIER, LAURIE; FRADE, AMANDA FARAGE; FERREIRA, FREDERICO MORAES; BARON, MONIQUE ANDRADE; TEIXEIRA, PRISCILA CAMILLO; CABANTOUS, SANDRINE; PINTO FERREIRA, LUDMILA RODRIGUES; LOUIS, LAURENCE; CARVALHO RIGAUD, VAGNER OLIVEIRA; GAIOTTO, FABIO ANTONIO; et al. Whole-Genome Cardiac DNA Methylation Fingerprint and Gene Expression Analysis Provide New Insights in the Pathogenesis of Chronic Chagas Disease Cardiomyopathy. Clinical Infectious Diseases, v. 65, n. 7, p. 1103-1111, . (13/50302-3)
NAVARRO, ISABELA CUNHA; FERREIRA, FREDERICO MORAES; NAKAYA, HELDER I.; BARON, MONIQUE ANDRADE; VILAR-PEREIRA, GLAUCIA; PEREIRA, ISABELA RESENDE; GONCALVES SILVA, ANA MARIA; REAL, JULIANA MONTE; DE BRITO, THALES; CHEVILLARD, CHRISTOPHE; et al. MicroRNA Transcriptome Profiling in Heart of Trypanosoma cruzi-Infected Mice: Parasitological and Cardiological Outcomes. PLoS Neglected Tropical Diseases, v. 9, n. 6, . (13/50302-3, 12/08107-6)
PINTO FERREIRA, LUDMILA RODRIGUES; FRADE, AMANDA FARAGE; BARROS SANTOS, RONALDO HONORATO; TEIXEIRA, PRISCILA CAMILLO; BARON, MONIQUE ANDRADE; NAVARRO, ISABELA CUNHA; BENVENUTI, LUIZ ALBERTO; FIORELLI, ALFREDO INACIO; BOCCHI, EDIMAR ALCIDES; STOLF, NOEDIR ANTONIO; et al. MicroRNAs miR-1, miR-133a, miR-133b, miR-208a and miR-208b are dysregulated in Chronic Chagas disease Cardiomyopathy. INTERNATIONAL JOURNAL OF CARDIOLOGY, v. 175, n. 3, p. 409-417, . (08/57881-0, 13/50302-3, 12/08107-6)
CHEVILLARD, CHRISTOPHE; NUNES, JOAO PAULO SILVA; FRADE, AMANDA FARAGE; ALMEIDA, RAFAEL RIBEIRO; PANDEY, RAMENDRA PATI; NASCIMENTO, MARILDA SAVOIA; KALIL, JORGE; CUNHA-NETO, EDECIO. Disease Tolerance and Pathogen Resistance Genes May Underlie Trypanosoma cruzi Persistence and Differential Progression to Chagas Disease Cardiomyopathy. FRONTIERS IN IMMUNOLOGY, v. 9, . (16/15209-0, 13/50302-3, 14/50890-5)
PINTO FERREIRA, LUDMILA RODRIGUES; FERREIRA, FREDERICO MORAES; NAKAYA, HELDER IMOTO; DENG, XUTAO; CNDIDO, DARLAN DA SILVA; DE OLIVEIRA, LEA CAMPOS; BILLAUD, JEAN-NOEL; LANTERI, MARION C.; RIGAUD, VAGNER OLIVEIRA-CARVALHO; SEIELSTAD, MARK; et al. Blood Gene Signatures of Chagas Cardiomyopathy With or Without Ventricular Dysfunction. Journal of Infectious Diseases, v. 215, n. 3, p. 387-395, . (13/50302-3)
CUNHA-NETO, EDECIO; ROSA, DANIELA S.; HARRIS, PAUL E.; OLSON, TIM; MORROW, ALEX; CIOTLOS, SERBAN; HERST, CHARLES V.; RUBSAMEN, REID MARTIN. An Approach for a Synthetic CTL Vaccine Design against Zika Flavivrus Using Class I and Class II Epitopes Identified by Computer Modeling. FRONTIERS IN IMMUNOLOGY, v. 8, . (13/50302-3)
OUARHACHE, MARYEM; MARQUET, SANDRINE; FRADE, AMANDA FARAGE; FERREIRA, ARIELA MOTA; IANNI, BARBARA; ALMEIDA, RAFAEL RIBEIRO; SILVA NUNES, JOAO PAULO; PINTO FERREIRA, LUDMILA RODRIGUES; RIGAUD, VAGNER OLIVEIRA-CARVALHO; CANDIDO, DARLAN; et al. Rare Pathogenic Variants in Mitochondrial and Inflammation-Associated Genes May Lead to Inflammatory Cardiomyopathy in Chagas Disease. JOURNAL OF CLINICAL IMMUNOLOGY, v. 41, n. 5, p. 1048-1063, . (14/50890-5, 13/50302-3)
BROCHET, PAULINE; IANNI, BARBARA; NUNES, JOAO P. S.; FRADE, AMANDA F.; TEIXEIRA, PRISCILA C.; MADY, CHARLES; FERREIRA, LUDMILA R. P.; KURAMOTO, ANDREIA; PISSETTI, CRISTINA W.; SABA, BRUNO; et al. Blood DNA methylation marks discriminate Chagas cardiomyopathy disease clinical forms. FRONTIERS IN IMMUNOLOGY, v. 13, p. 6-pg., . (14/50890-5, 13/50302-3)
NUNES, JOAO PAULO SILVA; MORAES-VIEIRA, PEDRO M.; CHEVILLARD, CHRISTOPHE; CUNHA-NETO, EDECIO. Mitochondria at the Crossroads of Immunity and Inflammatory Tissue Damage. FRONTIERS IN IMMUNOLOGY, v. 12, p. 3-pg., . (14/50890-5, 15/15626-8, 13/50302-3, 19/25973-8, 19/19435-3)

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