Busca avançada
Ano de início
Entree

Investigação sobre fatores e mecanismos do controle de expressão gênica em Leishmania: do papel de modificações pós-traducionais, RNAs não codificadores, cis-elementos e amplificação gênica

Processo: 13/50219-9
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Temático
Vigência: 01 de fevereiro de 2014 - 31 de julho de 2019
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
Pesquisador responsável:Angela Kaysel Cruz
Beneficiário:Angela Kaysel Cruz
Instituição-sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
Pesquisadores principais:Luiz Ricardo Orsini Tosi
Bolsa(s) vinculada(s):18/07997-4 - Bioinformática na análise de expressão gênica em Leishmania, BP.TT
17/01713-1 - Análise da modulação de expressão de uma aminoacil tRNA-proteina transferase putativa de Leishmania major sob diferentes condições de estresse, BP.IC
16/16429-4 - Bioinformática na análise de expressão gênica em Leishmania, BP.TT
+ mais bolsas vinculadas 16/17992-4 - Investigação sobre fatores e mecanismos do controle de expressão gênica em Leishmania: do papel de modificações pós-traducionais, RNAs não codificadores, cis-elementos e amplificação gênica, BP.PD
16/00969-0 - Estudo do papel de arginina metiltransferases em Leishmania braziliensis, BP.DR
13/26806-1 - Caracterização da proteína LmRad1 de Leishmania major e estudo de seu papel na sinalização de danos no DNA, BP.DR
13/00570-1 - Caracterização do possível complexo 9-1-1 de Leishmania major, BP.PD
11/24086-6 - A "N-end rule" em Leishmania major: caracterização funcional e regulação da expressão gênica de uma leucil fenilalanil - tRNA-proteina transferase, BP.PD - menos bolsas vinculadas
Assunto(s):Epigênese genética  Leishmania  Genômica  Expressão gênica  Regulação da expressão gênica  RNA não traduzido  Sequenciamento de nucleotídeos em larga escala  Amplificação de genes 

Resumo

A Leishmania é um eucarioto ancestral e parasito de grande relevância médica, que desperta interesse enquanto modelo biológico, por exibir uma série notável de processos biológicos ímpares entre os eucariotos, particularmente no que se refere ao RNA. Nossos objetivos são decifrar mecanismos moleculares que suportam os diferentes modos de regulação pós-transcricional dos genes de Leishmania. Vamos estudar elementos conservados presentes nas 3'UTRs de mRNAs do parasito e investigar a presença, distribuição e possíveis papéis de RNAs não codificadores (ncRNAs), - modificações pós-traducionais e amplificação gênica em sua relação com o controle da expressão gênica em Leishmania e que podem ser críticos para a adaptação do parasito nos seus hospedeiros. Assim, essa proposta tem como objetivos centrais: (1) o estudo dos mecanismos pelos quais elementos conservados de 3'UTRs regulam o "turnover" de RNA e/ou a tradução nos dois estágios de desenvolvimento em Leishmania, e qual o papel destes cis-elementos no controle pós-transcricional e mais especificamente na manutenção de "regulons transcricionais" do parasito; (2) o estudo sobre função(ões) dos RNAs não codificadores em Leishmania pela geração e uso dos dados de sequenciamento de RNA em larga escala (high-throughput RNA sequencing) seguida da investigação de um grupo pequeno de ncRNAs quanto ao potencial papel na regulação da expressão gênica e patogênese; (3) o estudo sobre a biogênese de ODD3, um potencial RNA não codificador, identificação de mRNAs-alvo e mecanismo de ação; (4) a investigação de alguns de fatores epigenéticos que controlam a expressão de genes em Leishmania, tais como processos e maquinaria enzimática envolvida na metilação de proteínas e; (5) a caracterização do controle do fenômeno de amplificação gênica mediado pelas proteínas LmHus1 e LmRad9, que compõem uma possível, maquinaria de sinalização de danos no DNA. (AU)

Matéria(s) publicada(s) na Agência FAPESP sobre o auxílio:
Pós-Doutorado em Parasitologia na USP Ribeirão Preto 
Pós-Doutorado em Parasitologia na USP com Bolsa da FAPESP 

Publicações científicas (5)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
RUY, PATRICIA DE CASSIA; MONTEIRO-TELES, NATALIA MELQUIE; MISERANI MAGALHAES, RUBENS DANIEL; FREITAS-CASTRO, FELIPE; DIAS, LEANDRO; AQUINO DEFINA, TANIA PAULA; DE VASCONCELOS, ELTON JOSE ROSAS; MYLER, PETER J.; CRUZ, ANGELA KAYSEL. Comparative transcriptomics in Leishmania braziliensis: disclosing differential gene expression of coding and putative noncoding RNAs across developmental stages. RNA BIOLOGY, v. 16, n. 5, p. 639-660, MAY 4 2019. Citações Web of Science: 2.
SHARMA, ROHIT; TERRAO, MONICA CRISTINA; CASTRO, FELIPE FREITAS; BREITLING, REINHARD; FACA, VITOR; OLIVEIRA, EDUARDO BRANDT; CRUZ, ANGELA KAYSEL. Insights on a putative aminoacyl-tRNA-protein transferase of Leishmania major. PLoS One, v. 13, n. 9 SEP 12 2018. Citações Web of Science: 0.
TERRAO, MONICA CRISTINA; ROSAS DE VASCONCELOS, ELTON JOSE; DEFINA, TANIA AQUINO; MYLER, PETER J.; CRUZ, ANGELA KAYSEL. Disclosing 3 ` UTR cis-elements and putative partners involved in gene expression regulation in Leishmania spp.. PLoS One, v. 12, n. 8 AUG 31 2017. Citações Web of Science: 1.
CASTRO, FELIPE FREITAS; RUY, PATRICIA C.; ZEVIANI, KARMA NOGUEIRA; SANTOS, RAMON FREITAS; TOLEDO, JULIANO SIMOES; CRUZ, ANGELA KAYSEL. Evidence of putative non-coding RNAs from Leishmania untranslated regions. Molecular and Biochemical Parasitology, v. 214, p. 69-74, JUN 2017. Citações Web of Science: 1.
GARCIA, JULIANA B. F.; VIEIRA DA ROCHA, JOAO P.; COSTA-SILVA, HELLIDA M.; ALVES, CERES L.; MACHADO, CARLOS R.; CRUZ, ANGELA K. Leishmania major and Trypanosoma cruzi present distinct DNA damage responses. Molecular and Biochemical Parasitology, v. 207, n. 1, p. 23-32, MAY 2016. Citações Web of Science: 3.

Por favor, reporte erros na lista de publicações científicas escrevendo para: cdi@fapesp.br.
Mapa da distribuição dos acessos desta página
Para ver o sumário de acessos desta página, clique aqui.