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Análise de transcriptoma de híbridos de Drosophila mojavensis e D. arizonae

Processo: 13/24821-3
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Pesquisador Visitante - Internacional
Vigência: 16 de fevereiro de 2014 - 22 de fevereiro de 2014
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
Pesquisador responsável:Claudia Marcia Aparecida Carareto
Beneficiário:Claudia Marcia Aparecida Carareto
Pesquisador visitante: Cristina Vieira
Inst. do pesquisador visitante: Université Claude Bernard Lyon 1, França
Instituição-sede: Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas (IBILCE). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de São José do Rio Preto. São José do Rio Preto , SP, Brasil
Assunto(s):Transcriptoma  Regulação da expressão gênica  Drosophila 

Resumo

A solicitação visa a vinda da Dra. Cristina Vieira ao Brasil, no período de 16 a 23 de fevereiro de 2014, para realizar atividades de pesquisa junto ao laboratório de Evolução Molecular, sob minha coordenação, e atividades acadêmicas junto ao Programa de Pós-Graduação em Genética, do IBILCE/UNESP/campus de São José do Rio Preto. A vinda da Dra. Cristina Vieira está relacionada ao projeto "Análise de transcriptoma de híbridos de Drosophila mojavensis e D. arizonae". O objetivo do projeto é a investigação dos sistemas de regulação de genes e de elementos de transposição em espécies próximas, como Drosophila mojavensis e D. arizonae. A análise de dados RNAseq permitirá também o desenvolvimento de métodos para a identificação de SNPs e da expressão diferencial de alelos no híbrido. Esse projeto é uma continuidade de um auxílio à pesquisa já encerrado (FAPESP 2010/10731-4) em que se planejou analisar o mobiloma (elementos de transposição expressos em duas espécies de Drosophila e seus híbridos). Nesse projeto foi realizada uma análise de expressão de elementos de transposição em larga escala por meio de RNAseq em colaboração com a Dra. Cristina Vieira, como previsto. Contudo, é de conhecimento geral que a técnica de RNAseq permite acessar a todo o transcriptoma e, embora não constasse do projeto original, decidimos continuar a análise desses dados focando particularmente transcriptoma das sequências codificantes (genes). Nessa visita da Dra. Cristina Vieira pretendemos estabelecer as estratégias para análise completa desse grande conjunto de dados gerado no auxílio anterior. A análise do transcriptoma dos híbridos e das espécies parentais (D. mojavensis e D. arizonae) está sendo realizada em colaboração com pesquisadores e alunos do laboratório de Evolução Molecular e do Laboratoire de Biométrie et Biologie Évolutive. (AU)

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