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SNP genotyping allows an in-depth characterisation of the genome of sugarcane and other complex autopolyploids

Processo: 13/27145-9
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Publicações científicas - Artigo
Vigência: 01 de março de 2014 - 31 de agosto de 2014
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Vegetal
Pesquisador responsável:Anete Pereira de Souza
Beneficiário:Anete Pereira de Souza
Instituição-sede: Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética (CBMEG). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:08/52197-4 - Genomic-assisted breeding of sugarcane: using molecular markers for understanding the genetic architecture of quantitative traits and to implement marker assisted selection, AP.BIOEN.TEM
Assunto(s):Melhoramento genético vegetal  Cana-de-açúcar  SNP 

Resumo

Muitas espécies de plantas de grande valor econômico (por exemplo, batata, trigo, algodão e cana de açúcar) são poliplóides. Apesar das funções essenciais de plantas autopoliploides em atividades humanas, a nossa compreensão genética destas espécies ainda é muito pobre. O progresso enorme recente em instrumentação e manipulação bioquímica levou ao acúmulo de uma quantidade incrível de dados genômicos. Aqui, nós demonstramos pela primeira vez uma análise genética de sucesso em um genoma altamente poliploidia (cana de açúcar) por análise quantitativa de polimorfismo de nucleotídeo único (SNP) dosagem de alelos, e aplicação de um novo programa de análise de dados. Isto proporciona uma melhor compreensão da estrutura genômica autopoliploide e constitui uma base sólida para estudos genéticos. Os métodos propostos podem ser empregados para analisar qualquer autopoliploides e permitirá o futuro desenvolvimento de mapas genéticos de alta qualidade para auxiliar na montagem de sequências do genoma de referência para espécies poliplóides. (AU)