A evolução genética do HIV entre indivíduos sobre tratamento antirretroviral

• Processo: 14/01310-6
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2014
• Data de Término da vigência: 31 de julho de 2017
• Área do conhecimento: Ciências da Saúde - Medicina
• Pesquisador responsável: Maria Cecilia Araripe Sucupira
• Beneficiário: Maria Cecilia Araripe Sucupira
• Instituição Sede: Escola Paulista de Medicina (EPM). Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP). Campus São Paulo. São Paulo , SP, Brasil
• Pesquisadores associados: Luiz Mário Ramos Janini ; Ricardo Sobhie Diaz
• Bolsa(s) vinculada(s): 16/18965-0 - A evolução da região V3 do gene env do HIV entre indivíduos sobre tratamento antirretroviral, BP.TT
• Assunto(s): Infectologia HIV-1 Evolução molecular Diversidade genética RNA viral Antirretrovirais
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Divergência | Diversidade Genética | Hiv | Infectologia

Resumo

O HIV-1 é notório pelos altos índices de replicação e alta diversidade genética gerada. Estas características são de fato essenciais para o sucesso deste patógeno propiciando evasão do sistema imune, seleção de variantes resistentes aos antirretrovirais e dificultando sobremaneira o desenvolvimento de vacinas preventivas. O tratamento antirretroviral impede a progressão da doença, mas não elimina por completo o processo inflamatório crônico propiciado pelo vírus. O tratamento antirretroviral também não erradica a infecção pelo HIV em decorrência da latência viral e possivelmente replicação viral residual, sendo fundamental a definição do papel de cada uma destas duas variáveis. Sendo a diversidade e divergência genética do HIV-1 fruto da replicação viral, um tratamento antirretroviral plenamente supressor deveria abolir a evolução genética deste patógeno. Nós hipotetizamos que o tratamento antirretroviral convencional que culmina com a carga viral indetectável não é plenamente supressor, sendo que desta forma haveria ainda uma janela de oportunidade para uma melhora na sua potência, fator fundamental para a cura esterilizante da infecção pelo HIV-1. O presente trabalho visa verificar a diversidade e divergência genética do HIV-1 em pacientes com tratamento antirretroviral supressor utilizando de forma inédita o sequenciamento paralelo maciço. Serão avaliados 50 pacientes da coorte de tratamento do HIV da UNIFESP em dois momentos: pré-tratamento antirretroviral e após quatro anos do início de tratamento antirretroviral com carga viral indetectável. Amostras de sangue estocadas serão submetidas à extração do RNA viral e DNA proviral e as regiões do gene env codificadoras da alça C2V3 e gp41 serão amplificadas por nested-PCR. Em seguida, os produtos de PCR serão submetidos ao sequenciamento paralelo maciço e as sequências geradas analisadas filogeneticamente. Serão analisados marcadores inflamatórios, marcadores de translocação bacteriana e interleucinas antes do início e após período de tratamento vis a vis diversidade e divergência genética do HIV-1. (AU)