Caracterização molecular de linhagens de Campylobacter jejuni e Campylobacter coli de origens diversas

• Processo: 14/13029-0
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de dezembro de 2014
• Data de Término da vigência: 30 de novembro de 2016
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Microbiologia - Biologia e Fisiologia dos Microorganismos
• Pesquisador responsável: Juliana Pfrimer Falcão
• Beneficiário: Juliana Pfrimer Falcão
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto (FCFRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Assunto(s): Análise de sequência de DNA Virulência Marcador molecular Tipagem de sequências multilocus Campylobacter coli Campylobacter jejuni
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Campylobacter coli | Campylobacter jejuni | Genes marcadores de Virulência | Multilocus Sequence Typing | Pulsed field gel electrophoresis | sequenciamento do gene flaA | Tipagem molecular e potencial patogênico

Resumo

O gênero Campylobacter pertence à família Campylobacteraceae e atualmente compreende 25 espécies. As duas espécies de maior ocorrência e importância clínica são Campylobacter jejuni e Campylobacter coli. O isolamento de Campylobacter como causa de gastroenterites em humanos nos países da Europa e na América do Norte é muito frequente. Porém, o isolamento e o estudo de Campylobacter não são muito frequentes no Brasil, o que dificulta avaliar a dimensão dessas espécies como causadora de doença em humanos e animais, bem como, determinar o impacto de sua presença em alimentos e no meio-ambiente. Além disso, há poucos trabalhos que utilizaram métodos moleculares para tipar linhagens de C. jejuni e de C. coli isoladas no país. Assim, os objetivos desse projeto são avaliar a diversidade genética, o potencial patogênico e a suscetibilidade a antimicrobianos de linhagens de C. jejuni e C. coli isoladas de humanos, animais, alimentos e ambiente no Brasil. Serão estudadas 126 linhagens de C. jejuni isoladas de humanos (53), animais (40), alimentos (29) e ambiente (4), e 60 linhagens de C. coli, isoladas de humanos (10), animais (21), alimentos (10) e ambiente (19), durante 16 anos. As linhagens serão tipadas molecularmente pelas técnicas de Pulsed field gel electrophoresis (PFGE), sequenciamento da pequena região variável (short variable region, SVR) do gene flaA, análise do locus CRISPR (clustered regularly interspaced short palindromic repeats) por high resolution melting analysis (HRMA) e multilocus sequence typing (MLST). Ademais, será verificada a suscetibilidade a antimicrobianos pela técnica da concentração inibitória mínima e a presença de alguns genes marcadores de virulência por PCR. Tomados em conjunto, os resultados a serem obtidos deverão contribuir para um melhor entendimento do potencial patogênico, diversidade genotípica e epidemiologia de linhagens de C. jejuni e C. coli isoladas no Brasil. (AU)

Publicações científicas

(16)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

GAMES, CAROLINA N.; SOUZA, ROBERTO A.; PASSAGLIA, JAQUELINE; DUQUE, SHEILA S.; MEDEIROS, MARTA I. C.; FALCAO, JULIANA P.. Genotyping of Campylobacter coli strains isolated in Brazil suggests possible contamination amongst environmental, human, animal and food sources. Journal of Medical Microbiology, v. 65, n. 1, p. 80-90, JAN 2016. (14/13029-0)

FRAZAO, MILIANE RODRIGUES; CAO, GUOJIE; CAZENTINI MEDEIROS, MARTA INES; DUQUE, SHEILA DA SILVA; LEON, MARIA SANCHEZ; ALLARD, MARC WILLIAM; FALCAO, JULIANA PFRIMER. Draft Genome Sequences of 116 Campylobacter jejuni Strains Isolated from Humans, Animals, Food, and the Environment in Brazil. MICROBIOLOGY RESOURCE ANNOUNCEMENTS, v. 6, n. 16, APR 2018. (14/13029-0)

SERIBELLI, AMANDA AP.; FRAZAO, MILIANE R.; CAZENTINI MEDEIROS, MARTA I.; FALCAO, JULIANA P.. Molecular and phenotypic characterization of strains of Shigella sonnei isolated over 31 years suggests the circulation of two prevalent subtypes in Sao Paulo State, Brazil. Journal of Medical Microbiology, v. 65, n. 7, p. 666-677, JUL 2016. (14/13029-0)

VILELA, F. P.; FRAZAO, M. R.; RODRIGUES, D. P.; COSTA, R. G.; CASAS, M. R. T.; FERNANDES, S. A.; FALCAO, J. P.; CAMPIONI, F.. Genetic diversity, anti-microbial resistance, plasmid profile and frequency of the Vi antigen in Salmonella Dublin strains isolated in Brazil. ZOONOSES AND PUBLIC HEALTH, v. 65, n. 1, p. E34-E43, FEB 2018. (14/13029-0, 15/10818-6, 13/25191-3)

CAMPIONI, FABIO; CAO, GUOJIE; KASTANIS, GEORGE; JANIES, DANIEL A.; MORATO BERGAMINI, ALZIRA MARIA; RODRIGUES, DALIA DOS PRAZERES; STONES, ROBERT; BROWN, ERIC; ALLARD, MARC W.; FALCAO, JULIANA PFRIMER. Changing of the Genomic Pattern of Salmonella Enteritidis Strains Isolated in Brazil Over a 48 year-period revealed by Whole Genome SNP Analyses. SCIENTIFIC REPORTS, v. 8, JUL 11 2018. (14/13029-0, 16/05817-3, 13/25191-3)

GOMES, CAROLINA N.; FRAZAO, MILIANE R.; PASSAGLIA, JAQUELINE; DUQUE, SHEILA S.; CAZENTINI MEDEIROS, I, MARTA; FALCAO, JULIANA P.. Molecular Epidemiology and Resistance Profile of Campylobacter jejuni and Campylobacter coli Strains Isolated from Different Sources in Brazil. MICROBIAL DRUG RESISTANCE, v. 26, n. 12, DEC 2019. (14/13029-0, 16/24716-3)

FRAZAO, MILIANE RODRIGUES; DE SOUZA, ROBERTO ANTONIO; CAZENTINI MEDEIROS, MARTA INES; DUQUE, SHEILA DA SILVA; CAO, GUOJIE; ALLARD, MARC WILLIAM; FALCAO, JULIANA PFRIMER. Molecular typing of Campylobacter jejuni strains: comparison among four different techniques. Brazilian Journal of Microbiology, v. 51, n. 2, DEC 2019. (14/13029-0)

FRAZAO, MILIANE RODRIGUES; CAO, GUOJIE; CAZENTINI MEDEIROS, MARTA INES; DUQUE, SHEILA DA SILVA; LEON, MARIA SANCHEZ; ALLARD, MARC WILLIAM; FALCAO, JULIANA PFRIMER. Draft Genome Sequences of 116 Campylobacter jejuni Strains Isolated from Humans, Animals, Food, and the Environment in Brazil. GENOME ANNOUNCEMENTS, v. 6, n. 16, p. 4-pg., 2018-04-01. (14/13029-0)

VILELA, FELIPE PINHEIRO; GOMES, CAROLINA NOGUEIRA; PASSAGLIA, JAQUELINE; RODRIGUES, DALIA PRAZERES; COSTA, RENATA GARCIA; TIBA CASAS, MONIQUE RIBEIRO; FERNANDES, SUELI APARECIDA; FALCAO, JULIANA PFRIMER; CAMPIONI, FABIO. Genotypic Resistance to Quinolone and Tetracycline in Salmonella Dublin Strains Isolated from Humans and Animals in Brazil. MICROBIAL DRUG RESISTANCE, v. 25, n. 2, SEP 15 2018. (17/05756-7, 14/13029-0, 15/10818-6, 13/25191-3)

SERIBELLI, AMANDA AP.; FRAZAO, MILIANE R.; CAZENTINI MEDEIROS, MARTA I.; FALCAO, JULIANA P.. Molecular and phenotypic characterization of strains of Shigella sonnei isolated over 31 years suggests the circulation of two prevalent subtypes in Sao Paulo State, Brazil. Journal of Medical Microbiology, v. 65, p. 12-pg., 2016-07-01. (14/13029-0)

GAMES, CAROLINA N.; SOUZA, ROBERTO A.; PASSAGLIA, JAQUELINE; DUQUE, SHEILA S.; MEDEIROS, MARTA I. C.; FALCAO, JULIANA P.. Genotyping of Campylobacter coli strains isolated in Brazil suggests possible contamination amongst environmental, human, animal and food sources. Journal of Medical Microbiology, v. 65, p. 11-pg., 2016-01-01. (14/13029-0)

GONZALES, JULIA CUNHA; SERIBELLI, AMANDA APARECIDA; GOMES, CAROLINA NOGUEIRA; DOS PRAZERES RODRIGUES, DALIA; CAMPIONI, FABIO; PASSAGLIA, JAQUELINE; DA SILVA, PAULO; FALCAO, JULIANA PFRIMER. A high number of multidrug-resistant and predominant genetically related cluster ofShigella flexneristrains isolated over 34 years in Brazil. Brazilian Journal of Microbiology, v. 51, n. 4, p. 1563-1571, DEC 2020. (14/13029-0)

SERIBELLI, AMANDA APARECIDA; BALLABEN, ANELISE STELLA; FERREIRA, JOSEANE CRISTINA; CAZENTINI MEDEIROS, MARTA INES; COSTA DARINI, ANA LUCIA; FALCAO, JULIANA PFRIMER. IncU plasmid harbouring bla(CTX-M-8) in multidrug-resistant Shigella sonnei in Brazil. JOURNAL OF GLOBAL ANTIMICROBIAL RESISTANCE, v. 14, p. 99-100, SEP 2018. (15/23484-9, 14/13029-0, 14/14494-8)

SERIBELLI, AMANDA AP; FRAZAO, MILIANE R.; CAZENTINI MEDEIROS, MARTA I.; STEHLING, ELIANA G.; FALCAO, JULIANA P.. Molecular typing and occurrence of beta-lactam resistance genes of Shigella sonnei strains isolated from 1983 to 2014 in the Sao Paulo state of Brazil. MICROBIOLOGY AND IMMUNOLOGY, v. 61, n. 12, p. 547-553, DEC 2017. (14/13029-0)

FRAZAO, MILIANE RODRIGUES; CAZENTINI MEDEIROS, MARTA INES; DUQUE, SHEILA DA SILVA; FALCAO, JULIANA PFRIMER. Pathogenic potential and genotypic diversity of Campylobacter jejuni: a neglected food-borne pathogen in Brazil. Journal of Medical Microbiology, v. 66, n. 3, p. 350-359, MAR 2017. (14/13029-0)

FRAZAO, MILIANE RODRIGUES; CAO, GUOJIE; MEDEIROS, MARTA INES CAZENTINI; DUQUE, SHEILA DA SILVA; ALLARD, MARC WILLIAM; FALCAO, JULIANA PFRIMER. Antimicrobial Resistance Profiles and Phylogenetic Analysis ofCampylobacter jejuniStrains Isolated in Brazil by Whole Genome Sequencing. MICROBIAL DRUG RESISTANCE, v. 27, n. 5, p. 660-669, MAY 1 2021. (14/13029-0, 16/24716-3, 18/06904-2, 19/19338-8)