Programa Genoma Xanthomonas axonopodis pv citri - laboratório de sequenciamento
- Auxílios pontuais (curta duração)
Processo: | 14/19720-6 |
Linha de fomento: | Auxílio à Pesquisa - Regular |
Vigência: | 01 de março de 2015 - 31 de agosto de 2017 |
Área do conhecimento: | Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos |
Pesquisador responsável: | Cristina Elisa Alvarez Martinez |
Beneficiário: | Cristina Elisa Alvarez Martinez |
Instituição-sede: | Instituto de Biologia (IB). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas, SP, Brasil |
Pesq. associados: | Tie Koide |
Assunto(s): | Xanthomonas citri Cancro (doença de planta) Genomas Transcriptoma Fator sigma Virulência |
Resumo
Os sistemas de secreção do tipo VI (SSVI) de bactérias são complexos proteicos que atravessam o envelope bacteriano, promovendo a translocação de proteínas para o interior de células-alvo. Os SSVI foram descobertos recentemente e diversos estudos sobre a estrutura do complexo de proteínas e seu mecanismo de ação demonstram semelhanças com a maquinaria de injeção de DNA nas células bacterianas por bacteriófagos, especialmente o fago T4. Os SSVI exercem papel essencial na virulência em espécies de bactéria e podem atuar também na competição entre micro-organismos, secretando toxinas para bactérias vizinhas e aumentando o fitness da espécie que os possui. A infecção de citros por Xanthomonas citri pv citri (Xac) causa o cancro cítrico, doença responsável por grandes prejuízos à agricultura no Brasil. O genoma de Xac codifica um SSVI completo, dividido em dois grupamentos gênicos, separados por 10 genes. Este projeto visa a realizar um estudo funcional do SSVI de Xac, utilizando técnicas de genética bacteriana e biologia molecular. Para isso, cepas mutantes em genes essenciais do SSVI serão caracterizadas fenotipicamente e a expressão de genes que codificam seus componentes será analisada em diferentes condições. A identificação de substratos do SSVI será realizada pela análise do secretoma de cepas que apresentam atividade alterada de seus componentes. Dois fatores sigma alternativos codificados por genes localizados entre os dois grupamentos gênicos do SSVI também serão caracterizados, através de análise por transcriptoma de cepas que expressam altos níveis destas proteínas regulatórias e estudos fenotípicos de cepas mutantes. Os resultados obtidos contribuirão para a compreensão dos mecanismos de atuação dos SSVI e da fisiologia e patogenicidade de Xac. (AU)
Matéria(s) publicada(s) na Agência FAPESP sobre o auxílio: |
Bactéria causadora do cancro cítrico possui sistema de defesa contra amebas |