Estudo amplo de associação do genoma e resequenciamento de regiões alvo em equinos de corrida da raça Quarto de Milha

• Processo: 14/20207-1
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de março de 2015
• Data de Término da vigência: 28 de fevereiro de 2017
• Área do conhecimento: Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
• Pesquisador responsável: Rogério Abdallah Curi
• Beneficiário: Rogério Abdallah Curi
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia (FMVZ). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Botucatu. Botucatu , SP, Brasil
• Pesquisadores associados: Henrique Nunes de Oliveira ; Josineudson Augusto Ii de Vasconcelos Silva ; Luciana Correia de Almeida Regitano
• Assunto(s): Equinos Cavalos Linhagens animais Análise de sequência de DNA Genomas Polimorfismo genético Desempenho animal
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: cavalo | Gwas | Qtl | Sequenciamento de DNA | Snp | Melhoramento Genético de Equinos

Resumo

Dentro da raça Quarto de Milha, diferentes objetivos de seleção levaram à formação de linhagens com distintas habilidades, entre as quais a de corrida. Com menor efetivo, porém com grande representatividade econômica, este segmento apresenta melhor desempenho em corridas de curtas distâncias do que qualquer outra raça de equinos, sendo os mais velozes cavalos do mundo e um dos mais velozes dentre todos os animais, podendo alcançar velocidades de até 88 km/h e percorrer, a partir de uma posição estática, ¼ de milha (402 metros aproximadamente) em menos de 21 segundos. Embora seja provável que o desempenho atlético em equinos seja influenciado por grande número de genes, como em humanos, até o momento poucas variantes genéticas foram relacionadas à característica, restringindo-se à raça Puro-Sangue Inglês. Tendo em vista que os efeitos de polimorfismos de DNA sobre características são parâmetros intrínsecos de cada população, linhagem ou raça em determinado ambiente, e considerando a falta de informações em relação ao potencial de utilização da seleção assistida por marcadores em equinos, em especial na Quarto de Milha, raça de grande importância no mundo e também no Brasil, este trabalho terá como objetivos: 1) realizar estudo amplo de associação do genoma (GWAS) e característica de desempenho em cavalos Quarto de Milha de corrida utilizando chips equinos de genotipagem de SNPs; 2) sequenciar regiões genômicas de interesse, significativas pelo GWAS, visando a prospecção de polimorfismos gênicos responsáveis diretos (causais), ligados ou em forte desequilíbrio de ligação com desempenho em corridas. Para isso, serão utilizadas informações genotípicas e fenotípicas de 356 equinos da linhagem de corrida da raça Quarto de Milha, de ambos os sexos e registrados na associação de criadores. (AU)

Publicações científicas

(9)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

PEREIRA, G. L.; CHARDULO, L. A.; SILVA, J. A. I. I. V.; FARIA, R.; CURI, R. A.. Genomic regions associated with performance in racing line of Quarter Horses. LIVESTOCK SCIENCE, v. 211, p. 42-51, MAY 2018. (14/20207-1)

FONSECA, MAYARA GONCALVES; FERRAZ, GUILHERME DE CAMARGO; LAGE, JESSICA; PEREIRA, GUILHERME LUIS; CURI, ROGERIO ABDALLAH. A Genome-Wide Association Study Reveals Differences in the Genetic Mechanism of Control of the Two Gait Patterns of the Brazilian Mangalarga Marchador Breed. Journal of Equine Veterinary Science, v. 53, p. 64-67, JUN 2017. (14/20207-1, 15/17155-2)

MACIEL, S. V. S. A.; DE QUEIROZ, V. H. O.; DE OLIVEIRA, C. A. A.; DE GODOI, F. N.; PEREIRA, G. L.; CURI, R. A.; COSTA, R. B.; DE CAMARGO, G. M. F.. Genetic heterogeneity of white markings in Quarter Horses. LIVESTOCK SCIENCE, v. 232, FEB 2020. (14/20207-1)

CURI, R. A.; PEREIRA, G. L.; ALVAREZ, M. V. N.; BALDASSINI, W. A.; MACHADO NETO, O. R.; CHARDULO, L. A. L.. Exome analysis and functional classification of identified variants in racing Quarter Horses. ANIMAL GENETICS, v. 51, n. 5, JUL 2020. (14/20207-1)

PEREIRA, GUILHERME L.; CHUD, TATIANE C. S.; BERNARDES, PRISCILA A.; VENTURINI, GUILHERME C.; CHARDULO, LUIS A. L.; CURI, ROGERIO A.. Genotype Imputation and Accuracy Evaluation in Racing Quarter Horses Genotyped Using Different Commercial SNP Panels. Journal of Equine Veterinary Science, v. 58, p. 89-96, NOV 2017. (14/20207-1)

DE MATTEIS, RAFAEL; PEREIRA, GUILHERME L.; CASAROTTO, LETICIA T.; TAVERNARO, ANNA JULIA S.; SILVA, V, JOSINEUDSON AUGUSTO I. I.; CHARDULO, LUIS ARTUR L.; CURI, ROGERIO A.. Variants in the Chromosomal Region of the Myostatin Gene and Their Association With Lines, Performance, and Body Measurements of Quarter Horses. Journal of Equine Veterinary Science, v. 71, p. 75-83, DEC 2018. (14/20207-1)

PEREIRA, GUILHERME L.; MALHEIROS, JESSICA M.; OSPINA, ALEJANDRA M. T.; CHARDULO, LUIS ARTUR L.; CURI, ROGERIO A.. Exome sequencing in genomic regions related to racing performance of Quarter Horses. JOURNAL OF APPLIED GENETICS, v. 60, n. 1, p. 79-86, FEB 2019. (14/20207-1)

MARCHIORI, CINTIA MARIA; PEREIRA, GUILHERME L.; MAIORANO, AMANDA M.; ROGATTO, GABRIEL M.; ASSONI, AMANDA D.; SILVA, JOSINEUDSON AUGUSTO I. I. V.; CHARDULO, LUIS ARTUR L.; CURI, ROGERIO A.. Linkage disequilibrium and population structure characterization in the cutting and racing lines of Quarter Horses bred in Brazil. LIVESTOCK SCIENCE, v. 219, p. 45-51, JAN 2019. (14/20207-1)

SANTOS, WELLINGTON B.; PEREIRA, CAMILA B.; MAIORANO, AMANDA M.; ARCE, CHERLYNN D. SILVA; BALDASSINI, WELDER A.; PEREIRA, GUILHERME L.; CHARDULO, LUIS ARTUR L.; NETO, OTAVIO R. M.; OLIVEIRA, HENRIQUE N.; CURI, ROGERIO A.. Genomic inbreeding estimation, runs of homozygosity, and heterozygosity-enriched regions uncover signals of selection in the Quarter Horse racing line. JOURNAL OF ANIMAL BREEDING AND GENETICS, v. 140, n. 6, p. 13-pg., 2023-06-06. (14/20207-1)