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Genômica da biossíntese de hemicelulose em cana-de-açúcar: visando compreender a relação dos genes com a recalcitrância da parede celular

Processo: 14/17486-6
Modalidade de apoio:Auxílio à Pesquisa - Programa BIOEN - Regular
Vigência: 01 de março de 2015 - 28 de fevereiro de 2017
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Vegetal
Pesquisador responsável:Elisson Antonio da Costa Romanel
Beneficiário:Elisson Antonio da Costa Romanel
Instituição Sede: Escola de Engenharia de Lorena (EEL). Universidade de São Paulo (USP). Lorena , SP, Brasil
Pesquisadores associados:Marcos Silveira Buckeridge ; Renato Vicentini dos Santos
Assunto(s):Bioenergia  Biocombustíveis  Parede celular vegetal  Hemicelulose  Lignina  Cana-de-açúcar  Genômica  Etiquetas de sequências expressas  Análise de sequência de RNA 
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:bioenergia | Biossintese de Hemicelulose | cana-de-açúcar | Evolução e Bioinformática | Genômica Estrutural e Funcional | Recalcitrância da Parede Celular | Bioinformática e Genética Molecular Vegetal

Resumo

A cana-de-açúcar (Saccharum spp.) está entre as espécies que mais produz etanol derivado da sacarose (40%) acumulada na planta madura. Entretanto, 2/3 dos carbonos da cana-de-açúcar não são aproveitados para a produção de bioetanol. Um dos maiores desafios na atualidade no campo da bioenergia é a obtenção de biocombustível de segunda geração a partir da biomassa recalcitrante da parede celular dos vegetais presente no bagaço, folha e palha. Para superar essa dificuldade, faz-se necessário conhecer não somente os componentes da parede celular, como os genes e seus mecanismos molecular responsáveis pela biossíntese da parede celular. Novas pesquisas produzida pelo grupo do Dr. André Ferraz da EEL/USP revelam que a soma do teor hemicelulose e lignina em bagaço de cana-de-açúcar se correlaciona com a elevada recalcitrância da parede celular. Crescente volume de publicações vem relatando que a retirada da hemicelulose por pré-tratamento e/ou a sua modificação através de alterações genéticas resulta na redução da recalcitrância. Apesar dos avanços na caracterização funcional dos genes da biossíntese de hemicelulose ter iniciado em 2004 em plantas-modelo, pouco genes desta via foram catalogados em cana-de-açúcar. Por essas razões, o presente projeto propõe a identificação e a anotação dos genes da via de biossíntese da hemicelulose em cana-de-açúcar através do uso de análises filogenéticas e computacionais usando bancos de ESTs e RNA-Seq; e correlacionar o perfil de expressão destes genes em híbridos de cana-de-açúcar com teor contrastante de hemicelulose. A execução deste projeto permitirá iniciar a implementação de um laboratório de genética molecular no Departamento de Biotecnologia da EEL/USP. Este projeto será realizado em conjunto com a participação dos pesquisadores Dr. André Ferraz, Dr. Marcos Buckeridge da USP/Capital e Dr. Renato Vicentini da UNICAMP e o auxílio de dois discentes de mestrado do Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia Industrial e quatro discentes de iniciação científica. A execução de tais estratégias contribuirá com a anotação e catalogação dos genes de cana-de-açúcar envolvidos na biossíntese dos polissacarídeos hemicelulósicos os quais poderão ser usados para manipular a planta e ampliar a produção de etanol sem a necessidade de aumentar a área plantada. (AU)

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Publicações científicas (5)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
BATISTA, DIEGO SILVA; KOEHLER, ANDREA DIAS; ROMANEL, ELISSON; DE SOUZA, VINICIUS CAIRUS; SILVA, TATIANE DULCINEIA; ALMEIDA, MAIRA CAROLINA; MACIEL, TALLES ELISSON F.; BUENO FERREIRA, PERACIO RAFAEL; SOUSA FELIPE, SERGIO HEITOR; SALDANHA, CLEBER WITT; et al. De novo assembly and transcriptome of Pfaffia glomerata uncovers the role of photoautotrophy and the P450 family genes in 20-hydroxyecdysone production. PROTOPLASMA, v. 256, n. 3, p. 601-614, . (14/06923-6, 14/17486-6)
FANELLI, AMANDA; REINHARDT, LAURIE; MATSUOKA, SIZUO; FERRAZ, ANDRE; SILVA, TATIANE DA FRANCA; HATFIELD, RONALD D.; ROMANEL, ELISSON. Biomass composition of two new energy cane cultivars compared with their ancestral Saccharum spontaneum during internode development. BIOMASS & BIOENERGY, v. 141, . (14/06923-6, 14/17486-6, 16/24391-7, 16/25785-9)
FANELLI, AMANDA; RANCOUR, DAVID M.; SULLIVAN, MICHAEL; KARLEN, STEVEN D.; RALPH, JOHN; RIANO-PACHON, DIEGO MAURICIO; VICENTINI, RENATO; SILVA, TATIANE DA FRANCA; FERRAZ, ANDRE; HATFIELD, RONALD D.; et al. Overexpression of a Sugarcane BAHD Acyltransferase Alters Hydroxycinnamate Content in Maize Cell Wall. FRONTIERS IN PLANT SCIENCE, v. 12, . (21/02352-8, 14/17486-6, 16/24391-7, 16/25785-9)
MAMEDES-RODRIGUES, T. C.; BATISTA, D. S.; NAPOLEAO, T. A.; CRUZ, A. C. F.; FORTINI, E. A.; NOGUEIRA, F. T. S.; ROMANEL, E.; OTONI, W. C.. Lignin and cellulose synthesis and antioxidative defense mechanisms are affected by light quality in Brachypodium distachyon. PLANT CELL TISSUE AND ORGAN CULTURE, v. 133, n. 1, p. 1-14, . (14/06923-6, 14/17486-6, 16/24391-7)
CESARINO, IGOR; SIMOES, MARCELLA SIQUEIRA; BRITO, MICHAEL DOS SANTOS; FANELLI, AMANDA; SILVA, TATIANE DA FRANCA; ROMANEL, ELISSON. Building the wall: recent advances in understanding lignin metabolism in grasses. ACTA PHYSIOLOGIAE PLANTARUM, v. 38, n. 11, . (14/06923-6, 15/02527-1, 14/23017-9, 14/17486-6, 14/08468-4, 15/18361-5)

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