Genômica aplicada à produção de ruminantes

• Processo: 14/07566-2
• Linha de fomento: Auxílio à Pesquisa - Temático
• Vigência: 01 de março de 2015 - 30 de novembro de 2018
• Área do conhecimento: Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
• Pesquisador responsável: José Bento Sterman Ferraz
• Beneficiário: José Bento Sterman Ferraz
• Instituição-sede: Faculdade de Zootecnia e Engenharia de Alimentos (FZEA). Universidade de São Paulo (USP). Pirassununga , SP, Brasil
• Pesq. associados: Felipe Perecin ; Fernando Sebastián Baldi Rey ; Flávio Vieira Meirelles ; Heidge Fukumasu ; Joanir Pereira Eler ; Luiz Lehmann Coutinho ; Marcelo Beltrão Molento ; Rachel Santos Bueno Carvalho ; RICARDO VIEIRA VENTURA
• Bolsa(s) vinculada(s): 17/21573-0 - Avaliação genômica em bovinos compostos da raça Montana utilizando dados reais e simulados, aplicando o método do passo único genômico BLUP, BP.DR; 18/13902-6 - Estudo de Associação Genômica Ampla (GWAS) aplicada à produção de embriões in vitro em bovinos da raça Nelore, BP.IC; 18/06725-0 - Validação de CNV (variação do número de cópias de regiões genômicas) por qPCR, BP.IC; + mais bolsas vinculadas 18/06728-0 - Gerenciamento de bancos de dados genômicos, BP.IC; 18/04923-0 - Genômica aplicada à produção de ruminantes, BP.TT; 17/10493-5 - Estudo de associação genômica em resistência à parasitas gastrointestinais em ovinos Santa Inês utilizando SNPs e CNVs, BP.PD; 17/10103-2 - Efeitos da endogamia sobre a uniformidade de progênie de touros Nelore, BP.MS; 16/11585-8 - Análise de polimorfismos funcionais associados a eficiência alimentar em bovinos Nelore, BP.IC; 15/22276-3 - Abordagem de Biologia de Sistemas Para a Determinação de Mecanismos Moleculares Associados à Eficiência Alimentar de Bovinos Nelore, BP.DR; 15/01059-4 - Análise metabolômica sérica associada à eficiência alimentar em bovinos Nelore, BP.MS - menos bolsas vinculadas
• Assunto(s): Reprodução animal Bovinos Gado Nelore Bos taurus indicus Eficiência alimentar Biologia de sistemas Qualidade da carne Genômica Análise de sequência de DNA RNA mensageiro Análise de sequência de RNA

Resumo

A pecuária de corte é um dos principais destaques do agronegócio nacional, e tem grande importância no mercado mundial, pois o Brasil possui um dos maiores rebanhos de bovinos do mundo, com mais de 200 milhões de cabeças. Esse rebanho é composto, predominantemente por animais de origem Bos indicus, sendo que a raça Nelore e seus cruzamentos compõe aproximadamente 90% do total. Os dados efetivos de produção de carne bovina em 2012 indicam que 16,5% foram exportadas e a maior parte da produção (83,5%) abasteceu o mercado interno. (Foram retirados os dados informativos do rebanho de Ovinos). Devido à importância, interesse econômico e aumento da produção de alimentos, melhorias são necessárias para maior eficiência de produção, como, por exemplo, a seleção de animais geneticamente superiores e resistentes ao ambiente adverso dos trópicos. O uso de painéis contendo centenas de milhares de polimorfismos de nucleotídeo único (SNP - Single Nucleotide Polymorphisms) tem possibilitado aos programas de melhoramento genético animal traçar estratégias para identificação de genes ou regiões genômicas responsáveis pelas características de interesse, tornando mais eficiente o processo de seleção. A metodologia de Genome-wide Association Study (GWAS) compara os resultados dos painéis de alta densidade disponíveis em indivíduos não relacionados, que possuam uma condição fenotípica de interesse, para identificar marcadores associados a tal fenótipo, e pode apontar regiões de interesse no genoma que possam influenciar em características quantitativas. O objetivo deste projeto é realizar um estudo de genética de sistemas, abordando análises de associação genômica, desequilíbrio de ligação, variações do número de cópias de regiões genômicas (CNVs) e enriquecimento funcional em medidas de crescimento, reprodução, qualidade de carne e eficiência alimentar em bovinos da raça Nelore (Foram retirados os objetivos dos estudos de Ovinos). Adicionalmente, realizar um estudo de expressão gênica global (sequenciamento do RNA mensageiro total - RNA-Seq) e dos mecanismos epigenéticos de controle da expressão da eficiência alimentar em bovinos da raça Nelore. Com o expertise gerado, as metodologias poderão, ainda dentro da abrangência deste projeto temático, ser aplicadas a outras espécies animais. (AU)

Publicações científicas

(27)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

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