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Um ambiente computacional para a modelagem da distribuição de espécies

Processo: 04/11012-0
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Temático
Vigência: 01 de abril de 2005 - 30 de setembro de 2009
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Ecologia - Ecologia Aplicada
Pesquisador responsável:Vanderlei Perez Canhos
Beneficiário:Vanderlei Perez Canhos
Instituição-sede: Centro de Referência em Informação Ambiental (CRIA). Campinas , SP, Brasil
Bolsa(s) vinculada(s):09/14580-3 - Informática para biodiversidade: desenvolvimento de esquema para troca de dados de interação polinizador-planta, BE.PQ
08/08541-2 - Modelagem de distribuição de espécies: pré-análise das variáveis ambientais, técnicas para a geração de pseudo-ausência e algoritmo Busca Tabu para resolver o problema de distribuição de espécies, BP.TT
08/08550-1 - Unificação da interface desktop e plugin de modelagem do TerraView, BP.TT
+ mais bolsas vinculadas 08/08567-1 - Elaboração da base de dados de ocorrência de palmeiras no Brasil e estudo de modelagem de distribuição de espécies, BP.TT
06/05797-0 - Implantação do cluster do projeto open modeller como ambiente de paralelização de algoritmos do projeto, BP.TT
06/03946-9 - Ferramenta para análise de dados sobre distribuição de espécies utilizando processamento pararlelo, BP.IC
05/60249-6 - Um ambiente computacional para modelagem da distibuicao de espécies, BP.TT - menos bolsas vinculadas
Assunto(s):Modelagem computacional  Computação de alto desempenho  Desenvolvimento de software  Programação paralela  Web service  Código aberto  Software livre 
Publicação FAPESP:http://www.fapesp.br/tematicos/bio_canhos.pdf

Resumo

O projeto propõe desenvolver um ambiente computacional para a modelagem de espécies. Isso envolve trabalhar com dados (locais e remotos) sobre a presença (localização) e ausência de espécies, ferramentas de "data cleaning", dados ambientais, preparação dos dados, algoritmos para modelagem, pré e pós análise, desenvolvimento de software baseado em componentes, computação de alta performance, serviços web e interfaces "desktop". O sistema será desenvolvido com a utilização de software livre e de código aberto. O CRIA contribuirá com a sua experiência no desenvolvimento de sistemas online, no desenvolvimento da biblioteca "openModeller" e do protocolo DiGIR, e no desenvolvimento da rede speciesLink. O INPE contribuirá com o seu conhecimento sobre informações ambientais e no desenvolvimento do sistema TerraLib. A Escola Politécnica da USP irá contribuir com pesquisa em algoritmos, técnicas de paralelização, web services, tecnologia adaptativa, e computação paralela. (AU)

Publicações científicas (5)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
GIANNINI, TEREZA C.; SARAIVA, ANTONIO M.; ALVES-DOS-SANTOS, ISABEL. Ecological niche modeling and geographical distribution of pollinator and plants: A case study of Peponapis fervens (Smith, 1879) (Eucerini: Apidae) and Cucurbita species (Cucurbitaceae). ECOLOGICAL INFORMATICS, v. 5, n. 1, SI, p. 59-66, JAN 2010. Citações Web of Science: 9.
MOREIRA, EVALDINOLIA; COSTA, SERGIO; AGUIAR, ANA PAULA; CAMARA, GILBERTO; CARNEIRO, TIAGO. Dynamical coupling of multiscale land change models. LANDSCAPE ECOLOGY, v. 24, n. 9, SI, p. 1183-1194, NOV 2009. Citações Web of Science: 22.
KARLA DONATO FOOK; SILVANA AMARAL; ANTÔNIO MIGUEL VIEIRA MONTEIRO; GILBERTO CÂMARA; ARIMATÉA DE CARVALHO XIMENES; LUCIANA SATIKO ARASATO. Making species distribution models available on the web for reuse in biodiversity experiments: Euterpe edulis species case study. Sociedade e Natureza, v. 21, n. 1, p. 39-49, Abr. 2009.
SANTANA‚ FS; DE SIQUEIRA‚ MF; SARAIVA‚ AM; CORREA‚ PLP. A reference business process for ecological niche modelling. ECOLOGICAL INFORMATICS, v. 3, n. 1, p. 75-86, 2008.
FONSECA‚ F.; CÂMARA‚ G.; MONTEIRO‚ A.M. A framework for measuring the interoperability of geo-ontologies. Spatial Cognition and Computation, v. 6, n. 4, p. 309-331, 2006.

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