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Análise de dados de bioinfomática, finalização de manuscrito e discussão de projetos em fase inicial

Processo: 15/00412-2
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Pesquisador Visitante - Internacional
Vigência: 24 de maio de 2015 - 30 de maio de 2015
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Morfologia - Embriologia
Pesquisador responsável:Taiza Stumpp Teixeira
Beneficiário:Taiza Stumpp Teixeira
Pesquisador visitante: Ian Adams
Inst. do pesquisador visitante: University of Edinburgh, Escócia
Instituição-sede: Escola Paulista de Medicina (EPM). Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP). Campus São Paulo. São Paulo , SP, Brasil
Assunto(s):Células germinativas  Biologia computacional  Embrião  Epigênese genética  Retroelementos  Genomas 

Resumo

O grupo do Dr. Ian Adams, do (Medical Research Council - Human Genetics Unit/University of Edinburgh) e nosso grupo têm como linha de pesquisa o estudo do desenvolvimento embrionário de células germinativas primordiais (CGP) de camundongo e rato, respectivamente. As análises realizadas por ambos os grupos são muito semelhantes e incluem: análises epigenéticas das CGP (metilação de DNA e histonas), análise do controle da expressão de retrotransposons, defesa do genoma e pluripotência. As técnicas aplicadas nesses estudos incluem: ChIP-Seq, bisulfite sequencing, purificação de CGP etc. O Dr. Ian tem vasta experiência nesses temas e já vem colaborando com nosso grupo desde 2010. A partir de 2012-2013 esta colaboração se estreitou através de visita realizada por mim (2012) e de doutorado sanduíche realizado por meu aluno (2013 - Procs. FAPESP 2012/01028-8 e 2011/07078-0). O trabalho resultante desta colaboração está sendo finalizado e deu origem a outro projeto, recentemente aprovado pela FAPESP, do qual o Dr. Ian também é colaborador (Proc. No. 2014/19123-8). Outros projetos que estão em fase inicial em nosso grupo também envolvem temas e técnicas nos quais o Dr. Ian tem vasta experiência, de forma que discussões, seminários e interações com alunos envolvidos serão muito positivas e podem contribuir muito para a execução e bom andamento das pesquisas. Assim, a proposta desta visita, visa obter a contribuição do Dr. Ian Adams em pelo menos três projetos em fase inicial em nosso grupo. Esta visita é importante para manter e incrementar a colaboração já existente através de atividades diversas que envolvam pesquisadores e alunos do nosso grupo e mesmo de outros grupos de pesquisa. Propomos, na presente solicitação, a realização de workshop sobre bioinformática, epigenética e CGP; interação com outros pesquisadores e alunos, discussões de trabalhos em andamento preparação de manuscrito para publicação e planejamento de atividades futuras. Espera-se, desta forma, aumentar a participação do Dr. Ian nas pesquisas realizadas em nosso grupo e vice-versa, bem como aumentar as possibilidades de intercâmbio de alunos entre os laboratórios envolvidos. (AU)

Matéria(s) publicada(s) na Agência FAPESP sobre o auxílio:
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