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Microsatellite markers for Urochloa humidicola (Poaceae) and their transferability to other Urochloa species

Processo: 15/04220-0
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Publicações científicas - Artigo
Vigência: 01 de abril de 2015 - 31 de julho de 2015
Área do conhecimento:Ciências Agrárias - Agronomia - Fitotecnia
Pesquisador responsável:Anete Pereira de Souza
Beneficiário:Anete Pereira de Souza
Instituição-sede: Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética (CBMEG). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
Assunto(s):Melhoramento genético vegetal  Repetições de microssatélites  Banco de sementes 

Resumo

Urochloa humidicola é uma gramínea de estação quente comumente usada como forragem nos trópicos, sendo reconhecida por sua tolerância à inundação sazonal. Esta gramínea é uma importante espécies forrageiras para as regiões de Cerrado e da Amazônia do Brasil. U. humidicola é uma espécie poliplóides com ploidia variável (6X-9X) e apomixia facultativas, com alta plasticidade fenotípica. No entanto, a apomixia e ploidia, bem como o conhecimento limitado da base genética da coleção de germoplasma, restringiram atividades de melhoramento genético. Assim, os marcadores microssatélites pode permitir uma melhor compreensão da composição genética da espécie. Este estudo teve como objetivo desenvolver e caracterizar novos marcadores moleculares microssatélites polimórficos em U. humidicola e avaliar a sua transferência para outras espécies Urochloa.Resultados:Um conjunto de marcadores microssatélite para U. humidicola foi identificado a partir de duas bibliotecas de DNA genómico enriquecidos: a primeira biblioteca foi construída a partir de um único genótipo sexual e o segundo a partir de um conjunto de oito genótipos de apomixia, seleccionados com base nos resultados anteriores. Dos 114 loci desenvolvidos, 72 pares de primers apresentaram um bom produto de amplificação, e 64 foram polimórficos entre os 34 genótipos testados. O número de bandas por loco de microssatélite variou de 1 a 29, com uma média de 9,6 bandas por loco. O conteúdo de informação polimórfica médio (PIC) de todos os loci foi de 0,77, e a média do poder de discriminação (DP) foi de 0,87. A análise da estrutura genética revelou diferenças entre os acessos U. humidicola, híbridos e outras espécies de Urochloa. A transferência destes microssatélites foi avaliada em quatro espécies do gênero, U. brizantha, decumbens U., U. ruziziensis, e U. dictyoneura, e a percentagem de transferibilidade variou de 58,33% a 69,44%, dependendo da espécie.Conclusões:Este trabalho contribui com novos marcadores microssatélites polimórficos para U. humidicola que podem ser usados para programas de melhoramento desta e de outras espécies de Urochloa, incluindo o mapeamento genético e a identificação de QTL, bem como a seleção assistida por marcadores. (AU)

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