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Biomarcadores genéticos em pacientes com psicose virgens de tratamento

Processo: 14/50830-2
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Regular
Vigência: 01 de abril de 2015 - 31 de março de 2016
Área do conhecimento:Ciências da Saúde - Medicina - Psiquiatria
Convênio/Acordo: CONFAP ; Newton Fund, com FAPESP como instituição parceira no Brasil ; MRC, UKRI
Pesquisador responsável:Rodrigo Affonseca Bressan
Beneficiário:Rodrigo Affonseca Bressan
Pesq. responsável no exterior: Gerome Breen
Instituição no exterior: King's College London, Inglaterra
Instituição-sede: Escola Paulista de Medicina (EPM). Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP). Campus São Paulo. São Paulo , SP, Brasil
Assunto(s):Transtornos psicóticos  Esquizofrenia  Antipsicóticos  Progressão da doença  Expressão gênica  Metilação de DNA  Transcriptoma  Marcadores genéticos 
Publicação FAPESP:https://media.fapesp.br/bv/uploads/pdfs/fapesp_uk_0ka6xKy_116_116.pdf

Resumo

A investigação de indivíduos em seu primeiro episódio de psicose (FEP) antes da progressão da doença, em particular, antes do tratamento com medicamentos antipsicóticos, é particularmente útil para a compreensão da complexidade da esquizofrenia. Vários estudos sugerem que a expressão do gene no sangue poderia servir como uma ferramenta de diagnóstico para doenças relacionadas com o cérebro. Considerando-se que a esquizofrenia é uma condição crônica que requer um tratamento ao longo da vida, a progressão da doença e uso de medicação antipsicótica podem confundir os resultados sobre a expressão gênica e metilação do DNA. Nosso principal objetivo deste estudo é identificar marcadores genéticos utilizando abordagens genômicas, transcriptômicas e metilômicas em uma coorte longitudinal de primeiro episódio de psicose. Os pacientes serão avaliados antes (anFEP, n = 80) e após oito semanas (FEP-8W, n = 80) ou um ano (FEP-1Y, n = 30) do tratamento antipsicótico. Até o momento, foram coletados e extraídos o mRNA e o DNA de mais de 75 anFEP, 75 EP-8W e 20 FEP-1Y. Os demais pacientes serão coletados durante o primeiro semestre deste projeto. A genotipagem do DNA por array será realizada no Brasil utilizando o array "PsychChip" desenvolvido pelo "Psychiatric Genomics Consortium", sob a hipótese de que as diferenças na expressão gênica e na metilação dos indivíduos em anFEP e em sua resposta ao tratamento são determinados pela variância genética. As abordagens transcriptômica e metilômica serão realizadas no Reino Unido. Para a expressão gênica de todo o genoma, vamos usar o "HumanHT-12 v4 Expression BeadChip", que oferece cobertura em todo o genoma de transcrição de genes catalogados (aprox. 25.000 genes). Quanto a análise de metilação do DNA, os dados serão gerados usando o lnfinitum Human Methylation 450 BeadChip Kit, que interroga mais de 485 mil sites de metilação por amostra. Com estes dados esperamos encontrar biomarcadores sanguíneos para a doença e para a resposta ao tratamento (anFEP x FEP-8W e FEP-1Y). Além disso, em setembro de 2015, vamos realizar um curso avançado em Bioinformática na UNIFESP com duração de uma semana. Ele estará disponível para 30 estudantes de doutorado do Estado de São Paulo com excelente currículo sem qualquer custo. As aulas serão lecionadas pela equipe do Dr. Breen. Este projeto é uma grande oportunidade para os dois lados, o conhecimento do Dr. Breen em bioinformática será essencial para o grupo brasileiro para analisar os “grandes dados” gerados pelo transcriptoma e metiloma. Além disso, sua equipe vai ensinar para os alunos de pós-graduação sobre esta análise, para que sejamos capazes de realizá-la por nós mesmos. Por outro lado, o grupo brasileiro vai contribuir com uma coorte anFEP única, incluindo uma avaliação multimodal, além de conhecimentos e experiência em técnicas de genômica e epigenômica. Ambos os centros contribuirão igualmente para o desempenho do projeto, ajudando a descobrir marcadores genéticos para a esquizofrenia. (AU)

Publicações científicas (4)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
OTA, VANESSA KIYOMI; MORETTI, PATRICIA NATALIA; SANTORO, MARCOS LEITE; TALARICO, FERNANDA; SPINDOLA, LETICIA MARIA; XAVIER, GABRIELA; CARVALHO, CAROLINA MUNIZ; MARQUES, DIOGO FERRI; COSTA, GIOVANY OLIVEIRA; PELLEGRINO, RENATA; DE JONG, SIMONE; CORDEIRO, QUIRINO; HAKONARSON, HAKON; BREEN, GEROME; NOTO, CRISTIANO; BRESSAN, RODRIGO AFFONSECA; GADELHAZ, ARY; MARI, JAIR DE JESUS; BELANGERO, I, SINTIA. Gene expression over the course of schizophrenia: from clinical high-risk for psychosis to chronic stages. NPJ SCHIZOPHRENIA, v. 5, MAR 28 2019. Citações Web of Science: 0.
SANTORO, MARCOS LEITE; OTA, VANESSA; DE JONG, SIMONE; NOTO, CRISTIANO; SPINDOLA, LETICIA M.; TALARICO, FERNANDA; GOUYEA, EDUARDO; LEE, SANG HYUCK; MORETTI, PATRICIA; CURTIS, CHARLES; PATEL, HAMEL; NEWHOUSE, STEPHEN; CARYALHO, CAROLINA MUNIZ; GADELHA, ARY; CORDEIRE, QUIRINO; BRESSAN, RODRIGO AFFONSECA; BELANGERO, SINTIA IOLE; BREEN, GEROME. Polygenic risk score analyses of symptoms and treatment response in an antipsychotic-naive first episode of psychosis cohort. TRANSLATIONAL PSYCHIATRY, v. 8, AUG 31 2018. Citações Web of Science: 2.
DE JONG, SIMONE; ABDALLA DINIZ, MATEUS JOSE; SALOMA, ANDIARA; GADELHA, ARY; SANTORO, MARCOS L.; OTA, VANESSA K.; NOTO, CRISTIANO; CURTIS, CHARLESG; NEWHOUSE, STEPHEN J.; PATEL, HAMEL; HALL, LYNSEY S.; O'REILLY, PAUL F.; BELANGERO, I, SINTIA; BRESSAN, RODRIGO A.; BREEN, GEROME; WRAY, NAOMI R.; RIPKE, STEPHAN; MATTHEISEN, MANUEL; TRZASKOWSKI, MACIEJ; BYRNE, ENDA M.; ABDELLAOUI, ABDEL; ADAMS, MARK J.; AGERBO, ESBEN; AIR, TRACY M.; ANDLAUER, TILL F. M.; BACANU, SILVIU-ALIN; BAEKVAD-HANSEN, MARIE; BEEKMAN, AARTJAN T. F.; BIGDELI, TIM B.; BINDER, ELISABETH B.; BLACKWOOD, DOUGLAS H. R.; BRYOIS, JULIEN; BUTTENSCHON, HENRIETTE N.; BYBJERG-GRAUHOLM, JONAS; CAI, NA; CASTELAO, ENRIQUE; CHRISTENSEN, JANE HVARREGAARD; CLARKE, TONI-KIM; COLEMAN, I, JONATHAN R.; COLODRO-CONDE, LUCIA; COUVY-DUCHESNE, BAPTISTE; CRADDOCK, NICK; CRAWFORD, GREGORY E.; DAVIES, GAIL; DEARY, IAN J.; DEGENHARDT, FRANZISKA; DERKS, ESKE M.; DIREK, NESE; DOLAN, V, CONOR; DUNN, ERIN C.; ELEY, THALIA C.; ESCOTT-PRICE, VALENTINA; KIADEH, FARNUSH FARHADI HASSAN; FINUCANE, HILARY K.; FORSTNER, ANDREAS J.; FRANK, JOSEF; GASPAR, HELENA A.; GILL, MICHAEL; GOES, FERNANDO S.; GORDON, SCOTT D.; GROVE, JAKOB; HANSEN, CHRISTINE SOHOLM; HANSEN, THOMAS F.; HERMS, STEFAN; HICKIE, IAN B.; HOFFMANN, PER; HOMUTH, GEORG; HORN, CARSTEN; HOTTENGA, JOUKE-JAN; HOUGAARD, DAVID M.; ISING, MARCUS; JANSEN, RICK; JONES, IAN; JONES, LISA A.; JORGENSON, ERIC; KNOWLES, JAMES A.; KOHANE, ISAAC S.; KRAFT, JULIA; KRETZSCHMAR, WARREN W.; KROGH, JESPER; KUTALIK, ZOLTAN; LI, YIHAN; LIND, PENELOPE A.; MACINTYRE, DONALD J.; MACKINNON, DEAN F.; MAIER, ROBERT M.; MAIER, WOLFGANG; MARCHINI, JONATHAN; MBAREK, HAMDI; MCGRATH, PATRICK; MCGUFFIN, PETER; MEDLAND, SARAH E.; MEHTA, DIVYA; MIDDELDORP, CHRISTEL M.; MIHAILOV, EVELIN; MILANESCHI, YURI; MILANI, LILI; MONDIMORE, FRANCIS M.; MONTGOMERY, GRANT W.; MOSTAFAVI, SARA; MULLINS, NIAMH; NAUCK, MATTHIAS; NG, BERNARD; NIVARD, MICHEL G.; NYHOLT, DALE R.; OSKARSSON, HOGNI; OWEN, MICHAEL J.; PAINTER, JODIE N.; PEDERSEN, CARSTEN BOCKER; PEDERSEN, MARIANNE GIORTZ; PETERSON, ROSEANN E.; PETTERSSON, ERIK; PEYROT, WOUTER J.; PISTIS, GIORGIO; POSTHUMA, DANIELLE; QUIROZ, JORGE A.; QVIST, PER; RICE, JOHN P.; RILEY, BRIEN P.; RIVERA, MARGARITA; MIRZA, SAIRA SAEED; SCHOEVERS, ROBERT; SCHULTE, EVA C.; SHEN, LING; SHYN, I, STANLEY; SIGURDSSON, ENGILBERT; SINNAMON, GRANT C. B.; SMIT, JOHANNES H.; SMITH, DANIEL J.; STEFANSSON, HREINN; STEINBERG, STACY; STREIT, FABIAN; STROHMAIER, JANA; TANSEY, KATHERINE E.; TEISMANN, HENNING; TEUMER, ALEXANDER; THOMPSON, WESLEY; THOMSON, PIPPA A.; THORGEIRSSON, THORGEIR E.; TRAYLOR, MATTHEW; TREUTLEIN, JENS; TRUBETSKOY, VASSILY; UITTERLINDEN, ANDRE G.; UMBRICHT, DANIEL; VAN DER AUWERA, SANDRA; VAN HEMERT, ALBERT M.; VIKTORIN, ALEXANDER; VISSCHER, PETER M.; WANG, YUNPENG; WEBB, BRADLEY T.; WEINSHEIMER, SHANTEL MARIE; WELLMANN, JUERGEN; WILLEMSEN, GONNEKE; WITT, STEPHANIE H.; WU, YANG; XI, HUALIN S.; YANG, JIAN; ZHANG, FUTAO; AROLT, VOLKER; BAUNE, BERNHARD T.; BERGER, KLAUS; BOOMSMA, I, DORRET; CICHON, SVEN; DANNLOWSKI, UDO; DE GEUS, E. J. C.; DEPAULO, J. RAYMOND; DOMENICI, ENRICO; DOMSCHKE, KATHARINA; ESKO, TONU; GRABE, HANS J.; HAMILTON, STEVEN P.; HAYWARD, CAROLINE; HEATH, ANDREW C.; KENDLER, KENNETH S.; KLOIBER, STEFAN; LEWIS, GLYN; LI, QINGQIN S.; LUCAE, SUSANNE; MADDEN, PAMELA A. F.; MAGNUSSON, PATRIK K.; MARTIN, NICHOLAS G.; MCINTOSH, ANDREW M.; METSPALU, ANDRES; MORS, OLE; MORTENSEN, PREBEN BO; MUELLER-MYHSOK, BERTRAM; NORDENTOFT, MERETE; NOETHEN, MARKUS M.; O'DONOVAN, MICHAEL C.; PACIGA, SARA A.; PEDERSEN, NANCY L.; PENNINX, BRENDA W. J. H.; PERLIS, ROY H.; PORTEOUS, DAVID J.; POTASH, JAMES B.; PREISIG, MARTIN; RIETSCHEL, MARCELLA; SCHAEFER, CATHERINE; SCHULZE, THOMAS G.; SMOLLER, JORDAN W.; STEFANSSON, KARI; TIEMEIER, HENNING; UHER, RUDOLF; VOELZKE, HENRY; WEISSMAN, MYRNA M.; WERGE, THOMAS; LEWIS, CATHRYN M.; LEVINSON, DOUGLAS F.; BORGLUM, ANDERS D.; SULLIVAN, PATRICK F.; MEIER, SANDRA; STRAUSS, JOHN; XU, WEI; VINCENT, JOHN B.; MATTHEWS, KEITH; FERREIRA, MANUEL; O'DUSHLAINE, COLM; PURCELL, SHAUN; RAYCHAUDHURI, SOUMYA; RUDERFER, DOUGLAS M.; SKLAR, PAMELA; SCOTT, LAURA J.; FLICKINGER, MATTHEW; BURMEISTER, MARGIT; LI, JUN; GUAN, WEIHUA; ABSHER, DEVIN; THOMPSON, ROBERT C.; MENG, FAN GUO; SCHATZBERG, ALAN F.; BUNNEY, WILLIAM E.; BARCHAS, JACK D.; WATSON, STANLEY J.; MYERS, RICHARD M.; AKIL, HUDA; BOEHNKE, MICHAEL; CHAMBERT, KIMBERLY; MORAN, JENNIFER; SCOLNICK, EDWARD; DJUROVIC, SRDJAN; MELLE, INGRID; MORKEN, GUNNAR; CORVIN, AIDEN; ANJORIN, ADEBAYO; KANDASWAMY, RADHIKA; LAWRENCE, JACOB; MCLEAN, ALAN W.; PICKARD, BENJAMIN S.; BERGEN, SARAH E.; NIMGAONKAR, VISHWAJIT; LANDEN, MIKAEL; SCHALLING, MARTIN; OSBY, URBAN; BACKLUND, LENA; FRISEN, LOUISE; LANGSTROM, NIKLAS; STAHL, ELI; DOBBYN, AMANDA; JAMAIN, STEPHANE; ETAIN, BRUNO; BELLIVIER, FRANK; LEBER, MARKUS; MAASER, ANNA; FISCHER, SASCHA B.; REINBOLD, CELINE S.; KITTEL-SCHNEIDER, SARAH; FULLERTON, JANICE M.; ORUC, LILIJANA; PARA, JOSE G.; MAYORAL, FERMIN; RIVAS, FABIO; CZERSKI, PIOTR M.; KAMMERER-CIERNIOCH, JUTTA; VEDDER, HELMUT; BORRMANN-HASSENBACH, MARGITTA; PFENNIG, ANDREA; BRENNAN, PAUL; MCKAY, JAMES D.; KOGEVINAS, MANOLIS; SCHWARZ, MARKUS; SCHOFIELD, PETER R.; MUEHLEISEN, THOMAS W.; SCHUMACHER, JOHANNES; BAUER, MICHAEL; WRIGHT, ADAM; MITCHELL, PHILIP B.; HAUTZINGER, MARTIN; KELSOE, JOHN R.; GREENWOOD, TIFFANY A.; NIEVERGELT, CAROLINE M.; SHILLING, PAUL D.; SMITH, ERIN N.; BLOSS, CINNAMON S.; EDENBERG, HOWARD J.; KOLLER, DANIEL L.; GERSHON, ELLIOT S.; LIU, CHUNYU; BADNER, JUDITH A.; SCHEFTNER, WILLIAM A.; LAWSON, WILLIAM B.; NWULIA, EVARISTUS A.; HIPOLITO, MARIA; CORYELL, WILLIAM; RICE, JOHN; BYERLEY, WILLIAM; MCMAHON, FRANCIS J.; LOHOFF, FALK W.; ZANDI, PETER P.; MAHON, PAMELA B.; MCINNIS, MELVIN G.; ZOLLNER, SEBASTIAN; ZHANG, PENG; SZELINGER, SZABOLCS; ST CLAIR, DAVID; CAESAR, SIAN; GORDON-SMITH, KATHERINE; FRASER, CHRISTINE; GREEN, ELAINE K.; GROZEVA, DETELINA; HAMSHERE, MARIAN L.; KIROV, GEORGE; NIKOLOV, IVAN; COLLIER, DAVID A.; ELKIN, AMANDA; WILLIAMSON, RICHARD; YOUNG, ALLAN H.; FERRIER, I. 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COMMUNICATIONS BIOLOGY, v. 1, 2018. Citações Web of Science: 1.
GOUVEA, E. S.; OTA, V. K.; NOTO, C.; SANTORO, M. L.; SPINDOLA, L. M.; MORETTI, P. N.; CARVALHO, C. M.; XAVIER, G.; RIOS, A. C.; SATO, J. R.; HAYASHI, M. A. F.; BRIETZKE, E.; GADELHA, A.; BRESSAN, R. A.; CORDEIRO, Q.; BELANGERO, S. I. Gene expression alterations related to mania and psychosis in peripheral blood of patients with a first episode of psychosis. TRANSLATIONAL PSYCHIATRY, v. 6, OCT 4 2016. Citações Web of Science: 9.

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