Filogenia de Pilosocereus (Cactaceae) e delimitação de espécies no grupo Pilosocereus aurisetus baseado em modelos de coalescência e dados multiloco

• Processo: 15/06160-5
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Vigência: 01 de julho de 2015 - 30 de junho de 2017
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Vegetal
• Pesquisador responsável: Evandro Marsola de Moraes
• Beneficiário: Evandro Marsola de Moraes
• Instituição Sede: Centro de Ciências Humanas e Biológicas (CCHB). Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR). Sorocaba , SP, Brasil
• Pesquisadores associados: Daniela Cristina Zappi ; Isabel Aparecida da Silva Bonatelli ; Manolo Fernandez Perez
• Assunto(s): Genética populacional Diversidade genética Filogeografia Filogenia Marcador molecular Sequenciamento de nova geração Pilosocereus
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Diversidade Genética | Filogenia | Filogeografia | Genética de populações | marcadores moleculares | sequenciamento de nova geração | Filogeografia

Resumo

O recente desenvolvimento de novos métodos probabilísticos baseados no modelo coalescente de multiespécies tem possibilitado o teste de hipóteses sobre a delimitação de espécies mesmo em grupos que se originaram recentemente, com tênue distinção morfológica entre as linhagens e complexa variação geográfica entre populações. Entre os gêneros de Cactaceae mais diversos no Brasil, Pilosocereus abriga 41 espécies reconhecidas e é subdividido em cinco grupos taxonômicos informais com base em agrupamentos morfológicos e geográficos. Entre esses grupos, P. aurisetus abriga oito espécies restritas aos enclaves de campos rupestres no centro e leste do Brasil que mostram uma intrincada história filogeográfica com diversificação recente, presença de linhagens crípticas e uma taxonomia de difícil tratamento formal. A partir de uma base de dados obtidos por sequenciamento massivo de segmentos associados a sítios de restrição (Rad-Seq) em uma amostra inter e intraespecífica no grupo P. aurisetus, nós desenvolvemos e validamos in silico e in vitro uma série de locos nucleares anônimos e de microssatélites úteis para estudos filogenéticos e filogeográficos no gênero Pilosocereus. Na presente proposta nós utilizaremos esses marcadores para: 1) investigar as relações filogenéticas e a composição de espécies nos grupos taxonômicos informais do gênero Pilosocereus; 2) utilizar uma abordagem coalescente de delimitação de espécie para investigar a diversidade taxonômica na linhagem filogenética relacionada com o grupo P. aurisetus. Os resultados desse estudo serão utilizados para fazer recomendações explícitas para tratamentos taxonômicos formais que certamente serão necessários para alcançar um arranjo taxonômico que reflita acuradamente a diversidade do grupo de espécies estudado. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

ROMEIRO-BRITO, MONIQUE; KHAN, GULZAR; PEREZ, MANOLO F.; ZAPPI, DANIELA C.; TAYLOR, NIGEL P.; OLSTHOORN, GERARDUS; FRANCO, FERNANDO F.; MORAES, EVANDRO M.. Revisiting phylogeny, systematics, and biogeography of a Pleistocene radiation. AMERICAN JOURNAL OF BOTANY, v. 110, n. 3, p. 17-pg., 2023-03-07. (15/06160-5, 14/25227-0, 12/22943-1, 12/22477-0)

PEREZ, MANOLO F.; FRANCO, FERNANDO F.; BOMBONATO, JULIANA R.; BONATELLI, ISABEL A. S.; KHAN, GULZAR; ROMEIRO-BRITO, MONIQUE; FEGIES, ANA C.; RIBEIRO, PAULIANNY M.; SILVA, GISLAINE A. R.; MORAES, EVANDRO M.. Assessing population structure in the face of isolation by distance: Are we neglecting the problem?. DIVERSITY AND DISTRIBUTIONS, v. 24, n. 12, p. 1883-1889, DEC 2018. (12/22943-1, 12/22857-8, 15/06160-5)

PEREZ, MANOLO F.; BONATELLI, ISABEL A. S.; ROMEIRO-BRITO, MONIQUE; FRANCO, FERNANDO F.; TAYLOR, NIGEL P.; ZAPPI, DANIELA C.; MORAES, EVANDRO M.. oalescent-based species delimitation meets deep learning: Insights from a highly fragmented cactus syste. MOLECULAR ECOLOGY RESOURCES, v. 22, n. 3, OCT 2021. (12/22857-8, 15/06160-5, 12/22943-1)