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Ecologia genômica de insetos: adaptações ao clima e evolução de interações ecológicas

Processo: 13/25991-0
Modalidade de apoio:Auxílio à Pesquisa - Jovens Pesquisadores
Vigência: 01 de janeiro de 2016 - 30 de junho de 2022
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Ecologia
Pesquisador responsável:Rodrigo Cogni
Beneficiário:Rodrigo Cogni
Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Pesquisadores associados:Carlos Ribeiro Vilela ; Paulo Roberto Guimarães Junior
Auxílios(s) vinculado(s):21/06874-9 - Ecologia genômica de insetos fase 2: adaptações ao clima e evolução de interações ecológicas, AP.JP2
17/07007-1 - Visita científica do Prof. M. Turelli (UC-Davis): colaboração em pesquisa sobre Wolbachia-Drosophila, AV.EXT
Bolsa(s) vinculada(s):22/00863-8 - Variação clinal em Drosophila melanogaster na América do Sul, BP.TT
22/00567-0 - Treinamento técnico para o apoio das atividades de pesquisa sobre evolução de clinas em Drosophila melanogaster, BP.TT
20/15984-0 - Uma análise dos efeitos filogenéticos, virulência e carga bacteriana em troca de hospedeiros: as bactérias Providencia rettgeri e Enterococcus faecalis infectando moscas da família Drosophilidae, BP.MS
+ mais bolsas vinculadas 21/11027-3 - Treinamento técnico para o apoio das atividades de pesquisa sobre inimigos naturais de drosofilídeos, BP.TT
21/06831-8 - Levantamento de tripanossomatídeos associados a drosofilídeos coletados em um gradiente de altitude da Mata Atlântica, BP.IC
21/06834-7 - Frequência de bactérias endossimbiontes em populações de D. melanogaster coletadas em uma clina de latitude na América do Sul, BP.IC
21/06844-2 - Treinamento técnico para a continuação do apoio das atividades de pesquisa em ecologia evolutiva de insetos, BP.TT
21/06155-2 - Treinamento técnico para o apoio das atividades de pesquisa sobre evolução de clinas em Drosophila melanogaster, BP.TT
21/03571-5 - Treinamento técnico para o apoio das atividades de pesquisa sobre inimigos naturais de drosofilídeos, BP.TT
20/03023-5 - Treinamento técnico para o apoio das atividades de bioinformática e pesquisa em ecologia evolutiva de drosofilídeos, BP.TT
20/03028-7 - Treinamento técnico para a continuação do apoio das atividades de pesquisa em ecologia evolutiva de insetos, BP.TT
20/01009-5 - Treinamento técnico para o apoio das atividades de pesquisa sobre interações entre drosofilídeos e seus patógenos, BP.TT
19/03997-2 - Interação hospedeiro-simbionte-inimigo natural: do parasitismo ao mutualismo, BP.DR
19/05981-6 - Treinamento técnico para o apoio das atividades de pesquisa sobre interações entre drosofilídeos e seus patógenos, BP.TT
19/03532-0 - Treinamento técnico para o apoio das atividades de pesquisa em ecologia evolutiva de insetos, BP.TT
18/20088-3 - Levantamento da incidência do vírus sigma em drosofilídeos coletados em um gradiente de altitude da Mata Atlântica, BP.IC
18/01295-8 - Descrição quantitativa de uma comunidade de drosofilídeos e seus inimigos naturais em um gradiente de altitude da Mata Atlântica, BP.MS
18/01346-1 - Treinamento técnico para o apoio das atividades de pesquisa em ecologia evolutiva de insetos, BP.TT
18/01294-1 - Variação clinal em Drosophila melanogaster na América do Sul, BP.TT
17/02206-6 - Adaptações em clinas em Drosophila melanogaster, BE.PQ
16/09934-4 - Influência da história evolutiva do hospedeiro na aptidão do parasita e do hospedeiro: um estudo de caso de drosofilídeos e vírus a de Drosophila, BP.MS
16/18995-7 - Variação clinal em Drosophila melanogaster na América do Sul, BP.TT
16/20603-0 - Treinamento técnico para o apoio das atividades de pesquisa em ecologia evolutiva de insetos, BP.TT
16/15434-4 - Levantamento de bactérias endossimbiontes em drosofilídeos coletados em um gradiente de altitude da Mata Atlântica, BP.IC
16/01354-9 - Variação em clinas em genes do sistema imune de Drosophila melanogaster, BP.MS - menos bolsas vinculadas
Assunto(s):Mapeamento genético  Seleção natural  Drosophila  Genômica 
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:adaptação | coevolução | drosofilídeos | genômica de populações | Mapeamento genético | Seleção Natural | Ecologia e genética evolutiva

Resumo

Avanços recentes em genômica trouxeram uma oportunidade inédita de estudar a interface entre processos ecológicos, evolutivos e genéticos, assim como entender em detalhes as adaptações dos organismos. Neste projeto, estudarei as pressões ecológicas em ambientes naturais que influenciam os padrões de variação no nível genômico e resultam em mudanças adaptativas. Pretendo estudar adaptações a fatores abióticos do ambiente e adaptações às interações ecológicas. Para tanto, estudarei populações naturais de modelos genéticos (moscas do gênero Drosophila). Este auxílio dará início a uma nova linha de pesquisa em ecologia genômica de insetos na USP (onde fui recentemente contratado) e possibilitará a coleta de populações naturais no campo, a realização de experimentos em laboratório, incluindo o uso de ferramentas modernas de genética de drosofilídeos, e o uso de sequenciamento de próxima geração. Proponho quatro estudos específicos que, além de investigar questões importantes em biologia evolutiva, devem produzir uma base sólida de resultados que deverão embasar uma ampla diversidade de estudos futuros. Adicionalmente, serão gerados recursos tais como linhagens coletadas em diferentes populações, identificação de genes responsáveis por importantes características fenotípicas, sequências genômicas e informações sobre a diversidade de inimigos naturais no campo. Este projeto será desenvolvido em colaboração com os professores Douglas Futuyma e Walter Eanes (Stony Brook University), Frank Jiggins e Ben Longdon (Cambridge University), e Paulo R. Guimarães Jr e Carlos R. Vilela (USP). (AU)

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Publicações científicas (14)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
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VERCOSA, DIOMAR; COGNI, RODRIGO; ALVES, MARCOS NOPPER; TRIGO, JOSE ROBERTO. The geographical and seasonal mosaic in a plant-herbivore interaction: patterns of defences and herbivory by a specialist and a non-specialist. SCIENTIFIC REPORTS, v. 9, . (11/17708-0, 13/25991-0)
COSMO, LEANDRO G.; NASCIMENTO, ANDRE R.; COGNI, RODRIGO; FREITAS, ANDRE V. L.. Temporal distribution in a tri-trophic system associated with Piper amalago L. in a tropical seasonal forest. ARTHROPOD-PLANT INTERACTIONS, v. 13, n. 4, p. 647-652, . (11/50225-3, 13/25991-0, 14/50316-7, 16/01380-0)
COGNI, RODRIGO; QUENTAL, TIAGO B.; GUIMARAES JR, PAULO R.. Ehrlich and Raven escape and radiate coevolution hypothesis at different levels of organization: Past and future perspectives. Evolution, v. 76, n. 6, p. 16-pg., . (21/06780-4, 18/14809-0, 13/25991-0)
CAO, CHUAN; COGNI, RODRIGO; BARBIER, VINCENT; JIGGINS, FRANCIS M.. Complex Coding and Regulatory Polymorphisms in a Restriction Factor Determine the Susceptibility of Drosophila to Viral Infection. Genetics, v. 206, n. 4, p. 2159-2173, . (15/08307-3, 13/25991-0)
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COGNI, RODRIGO; KUCZYNSKI, KATE; KOURY, SPENCER; LAVINGTON, ERIK; BEHRMAN, EMILY L.; O'BRIEN, KATHERINE R.; SCHMIDT, PAUL S.; EANES, WALTER F.. On the Long-term Stability of Clines in Some Metabolic Genes in Drosophila melanogaster. SCIENTIFIC REPORTS, v. 7, . (13/25991-0)
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COSMO, LEANDRO G.; YAMAGUCHI, LYDIA F.; FELIX, GABRIEL M. F.; KATO, MASSUO J.; COGNI, RODRIGO; PAREJA, MARTIN. From the leaf to the community: Distinct dimensions of phytochemical diversity shape insect-plant interactions within and among individual plants. JOURNAL OF ECOLOGY, v. 109, n. 6, p. 2475-2487, . (13/25991-0, 14/50316-7, 19/22146-3)
ANDRÉ C. PIMENTEL; CAMILA S. BERALDO; RODRIGO COGNI. Host-shift as the cause of emerging infectious diseases: Experimental approaches using Drosophila-virus interactions. GENETICS AND MOLECULAR BIOLOGY, v. 44, n. 1, . (17/11774-8, 13/25991-0, 15/08307-3, 16/09934-4)
BROSH, OSAMA; FABIAN, DANIEL K.; COGNI, RODRIGO; TOLOSANA, IGNACIO; DAY, JONATHAN P.; OLIVIERI, FRANCESCA; MERCKX, MANON; AKILLI, NAZLI; SZKUTA, PIOTR; JIGGINS, FRANCIS M.. A novel transposable element-mediated mechanism causes antiviral resistance in Drosophila through truncating the Veneno protein. PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA, v. 119, n. 29, p. 10-pg., . (13/25991-0)
RODRIGUES, MURILLO F.; VIBRANOVSKI, MARIA D.; COGNI, RODRIGO. Clinal and seasonal changes are correlated in Drosophila melanogaster natural populations. Evolution, v. 75, n. 8, . (17/02206-6, 17/06374-0, 15/20844-4, 13/25991-0, 16/01354-9)
PIMENTEL, ANDRE C.; CESAR, CASSIA S.; MARTINS, MARCOS; COGNI, RODRIGO. The Antiviral Effects of the Symbiont Bacteria Wolbachia in Insects. FRONTIERS IN IMMUNOLOGY, v. 11, . (19/03997-2, 15/08307-3, 13/25991-0, 18/01295-8)

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