Desvendando as interações patógeno-hospedeiro e patógeno-patógeno utilizando abordagens de metagenômica viral e sequenciamento de última geração

• Processo: 15/11510-5
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de setembro de 2015
• Data de Término da vigência: 31 de agosto de 2017
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Microbiologia - Microbiologia Aplicada
• Pesquisador responsável: Helena Lage Ferreira
• Beneficiário: Helena Lage Ferreira
• Instituição Sede: Faculdade de Zootecnia e Engenharia de Alimentos (FZEA). Universidade de São Paulo (USP). Pirassununga , SP, Brasil
• Município da Instituição Sede: Pirassununga
• Pesquisadores associados: Clarice Weis Arns
• Assunto(s): Virologia Metagenômica Resposta imune Cultura de células Diversidade genética Aves
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Aves | cultura de células | Diversidade Genética | metagenômica | resposta imune | Virologia | Virologia

Resumo

A resposta imune inata é a forma mais profunda, genérica e eficiente de defesa do hospedeiro contra os patógenos incluindo os vírus. As aves silvestres atuam como reservatórios de diversos vírus, que são contínuas ameaças aos animais e aos seres humanos. Vírus pertencentes às três principais famílias virais (Ortomyxovidae, Paramyxoviridae e Coronaviridae) são freqüentemente encontradas em aves silvestres e também podem infectar homens e os animais:. As razões e mecanismos que permitem que as aves silvestres atuem como reservatórios de vírus de importância comprovada ou potencial à saúde humana e veterinária não são ainda completamente elucidados. Dessa forma, faremos uma triagem inicial em amostras coletadas a partir de aves silvestres e domésticas utilizando técnicas de RRT-PCR (RT-PCR em tempo real) e RT-PCR para detecção de famílias virais. As amostras positivas, para um ou múltiplos vírus, serão submetidas ao seqüenciamento de última geração (NGS) para amplificação e análise dos genomas virais completos. A resposta imune celular será avaliada in vitro utilizando o sistema de cultura de células aviárias imortalizadas (DF-1) e sua possível importância na cinética viral será monitorada após experimentos de infecção viral única ou múltiplas. Portanto, o resultado desta proposta ajudará o reconhecimento dos vírus que têm um impacto econômico significativo sobre as aves, especialmente para as aves domésticas do Brasil (terceiro maior produtor de carne de frango). Além disso, a determinação dos fatores, variações genômicas e alternância das respostas imunes contra o um ou vários patógenos ajudará não apenas a elucidar a natureza e a amplitude das respostas imunes, mas também poderá ajudar a estabelecer estratégias que permitirão o controle da disseminação e transmissão dos vírus em espécies aviárias, especialmente aqueles são extinções ou ameaçadas. (AU)

Publicações científicas

(7)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

AYALA, ANDREA J.; DIMITROV, KIRIL M.; BECKER, CASSIDY R.; GORAICHUK, IRYNA V.; ARNS, CLARICE W.; BOLOTIN, VITALY I.; FERREIRA, HELENA L.; GERILOVYCH, ANTON P.; GOUJGOULOVA, GABRIELA V.; MARTINI, MATHEUS C.; et al. Presence of Vaccine-Derived Newcastle Disease Viruses in Wild Birds. PLoS One, v. 11, n. 9, SEP 14 2016. (15/11510-5, 13/02059-2)

RIZOTTO, LAIS S.; SIMAO, RAPHAEL M.; SCAGION, GUILHERME P.; SIMASAKI, ALESSANDRA A.; CASERTAT, LEONARDO C.; BENASSI, JULIA C.; ARNS, CLARICE W.; FERREIRA, HELENA L.. Detecção de metapneumovirus aviário subtipo A em aves silvestres no estado de São Paulo, Brasil. Pesquisa Veterinária Brasileira, v. 39, n. 3, p. 209-213, MAR 2019. (15/11510-5)

VAN BORM, STEVEN; RIZOTTO, LAIS S.; ULLMANN, LEILA S.; SCAGION, GUILHERME P.; MALOSSI, CAMILA D.; SIMAO, RAPHAEL M.; ARAUJO, JOAO P., JR.; CORDEIRO, IZABELLE M.; KEID, LARA B.; SOUSA OLIVEIRA, TRICIA MARIA F.; et al. Complete Genome Sequence of a Vaccinal Newcastle Disease Virus Strain Isolated from an Owl (Rhinoptynx clamator). GENOME ANNOUNCEMENTS, v. 4, n. 6, p. 2-pg., 2016-11-01. (15/11510-5, 11/09019-0)

RIZOTTO, LAIS S.; SCAGION, GUILHERME P.; CARDOSO, TEREZA C.; SIMAO, RAPHAEL M.; CASERTA, LEONARDO C.; BENASSI, JULIA C.; KEID, LARA B.; OLIVEIRA, TRICIA M. F. DE S.; SOARES, RODRIGO M.; ARNS, CLARICE W.; et al. Complete Genome Sequence of an Avian Metapneumovirus Subtype A Strain Isolated from Chicken (Gallus gallus) in Brazil. MICROBIOLOGY RESOURCE ANNOUNCEMENTS, v. 5, n. 29, JUL 2017. (14/50696-4, 15/11510-5)

VAN BORM, STEVEN; RIZOTTO, LAIS S.; ULLMANN, LEILA S.; SCAGION, GUILHERME P.; MALOSSI, CAMILA D.; SIMAO, RAPHAEL M.; ARAUJO, JR., JOAO P.; CORDEIRO, IZABELLE M.; KEID, LARA B.; SOUSA OLIVEIRA, TRICIA MARIA F.; et al. Complete Genome Sequence of a Vaccinal Newcastle Disease Virus Strain Isolated from an Owl (Rhinoptynx clamator). MICROBIOLOGY RESOURCE ANNOUNCEMENTS, v. 4, n. 6, NOV-DEC 2016. (15/11510-5, 11/09019-0)

MARTINI, MATHEUS C.; CASERTA, LEONARDO C.; DOS SANTOS, MARCIA M. A. B.; BARNABE, ANA C. S.; DURAES-CARVALHO, RICARDO; PADILLA, MARINA A.; SIMAO, RAPHAEL M.; RIZOTTO, LAIS S.; SIMAS, PAULO V. M.; BASTOS, JULIANA C. S.; et al. Avian coronavirus isolated from a pigeon sample induced clinical disease, tracheal ciliostasis, and a high humoral response in day-old chicks. AVIAN PATHOLOGY, v. 47, n. 3, p. 286-293, 2018. (11/50919-5, 14/50696-4, 15/11510-5)

RIZOTTO, LAIS S.; SCAGION, GUILHERME P.; CARDOSO, TEREZA C.; SIMAO, RAPHAEL M.; CASERTA, LEONARDO C.; BENASSI, JULIA C.; KEID, LARA B.; OLIVEIRA, TRICIA M. F. DE S.; SOARES, RODRIGO M.; ARNS, CLARICE W.; et al. Complete Genome Sequence of an Avian Metapneumovirus Subtype A Strain Isolated from Chicken (Gallus gallus) in Brazil. GENOME ANNOUNCEMENTS, v. 5, n. 29, p. 2-pg., 2017-07-01. (15/11510-5, 14/50696-4)