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Desvendando as interações patógeno-hospedeiro e patógeno-patógeno utilizando abordagens de metagenômica viral e sequenciamento de última geração

Processo: 15/11510-5
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Regular
Vigência: 01 de setembro de 2015 - 31 de agosto de 2017
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Microbiologia - Microbiologia Aplicada
Pesquisador responsável:Helena Lage Ferreira
Beneficiário:Helena Lage Ferreira
Instituição-sede: Faculdade de Zootecnia e Engenharia de Alimentos (FZEA). Universidade de São Paulo (USP). Pirassununga , SP, Brasil
Pesq. associados:Clarice Weis Arns
Assunto(s):Virologia  Metagenômica  Resposta imune  Cultura de células  Diversidade genética  Aves 

Resumo

A resposta imune inata é a forma mais profunda, genérica e eficiente de defesa do hospedeiro contra os patógenos incluindo os vírus. As aves silvestres atuam como reservatórios de diversos vírus, que são contínuas ameaças aos animais e aos seres humanos. Vírus pertencentes às três principais famílias virais (Ortomyxovidae, Paramyxoviridae e Coronaviridae) são freqüentemente encontradas em aves silvestres e também podem infectar homens e os animais:. As razões e mecanismos que permitem que as aves silvestres atuem como reservatórios de vírus de importância comprovada ou potencial à saúde humana e veterinária não são ainda completamente elucidados. Dessa forma, faremos uma triagem inicial em amostras coletadas a partir de aves silvestres e domésticas utilizando técnicas de RRT-PCR (RT-PCR em tempo real) e RT-PCR para detecção de famílias virais. As amostras positivas, para um ou múltiplos vírus, serão submetidas ao seqüenciamento de última geração (NGS) para amplificação e análise dos genomas virais completos. A resposta imune celular será avaliada in vitro utilizando o sistema de cultura de células aviárias imortalizadas (DF-1) e sua possível importância na cinética viral será monitorada após experimentos de infecção viral única ou múltiplas. Portanto, o resultado desta proposta ajudará o reconhecimento dos vírus que têm um impacto econômico significativo sobre as aves, especialmente para as aves domésticas do Brasil (terceiro maior produtor de carne de frango). Além disso, a determinação dos fatores, variações genômicas e alternância das respostas imunes contra o um ou vários patógenos ajudará não apenas a elucidar a natureza e a amplitude das respostas imunes, mas também poderá ajudar a estabelecer estratégias que permitirão o controle da disseminação e transmissão dos vírus em espécies aviárias, especialmente aqueles são extinções ou ameaçadas. (AU)

Publicações científicas (5)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
RIZOTTO, LAIS S.; SIMAO, RAPHAEL M.; SCAGION, GUILHERME P.; SIMASAKI, ALESSANDRA A.; CASERTAT, LEONARDO C.; BENASSI, JULIA C.; ARNS, CLARICE W.; FERREIRA, HELENA L. Detection of avian metapneumovirus subtype A from wild birds in the State of Sao Paulo, Brazil. Pesquisa Veterinária Brasileira, v. 39, n. 3, p. 209-213, MAR 2019. Citações Web of Science: 1.
MARTINI, MATHEUS C.; CASERTA, LEONARDO C.; DOS SANTOS, MARCIA M. A. B.; BARNABE, ANA C. S.; DURAES-CARVALHO, RICARDO; PADILLA, MARINA A.; SIMAO, RAPHAEL M.; RIZOTTO, LAIS S.; SIMAS, PAULO V. M.; BASTOS, JULIANA C. S.; CARDOSO, TEREZA C.; FELIPPE, PAULO A. N.; FERREIRA, HELENA L.; ARNS, CLARICE W. Avian coronavirus isolated from a pigeon sample induced clinical disease, tracheal ciliostasis, and a high humoral response in day-old chicks. AVIAN PATHOLOGY, v. 47, n. 3, p. 286-293, 2018. Citações Web of Science: 0.
RIZOTTO, LAIS S.; SCAGION, GUILHERME P.; CARDOSO, TEREZA C.; SIMAO, RAPHAEL M.; CASERTA, LEONARDO C.; BENASSI, JULIA C.; KEID, LARA B.; OLIVEIRA, TRICIA M. F. DE S.; SOARES, RODRIGO M.; ARNS, CLARICE W.; VAN BORM, STEVEN; FERREIRA, HELENA L. Complete Genome Sequence of an Avian Metapneumovirus Subtype A Strain Isolated from Chicken (Gallus gallus) in Brazil. MICROBIOLOGY RESOURCE ANNOUNCEMENTS, v. 5, n. 29 JUL 2017. Citações Web of Science: 0.
VAN BORM, STEVEN; RIZOTTO, LAIS S.; ULLMANN, LEILA S.; SCAGION, GUILHERME P.; MALOSSI, CAMILA D.; SIMAO, RAPHAEL M.; ARAUJO, JR., JOAO P.; CORDEIRO, IZABELLE M.; KEID, LARA B.; SOUSA OLIVEIRA, TRICIA MARIA F.; SOARES, RODRIGO M.; MARTINI, MATHEUS C.; ORSI, MARIA A.; ARNS, CLARICE W.; FERREIRA, HELENA L. Complete Genome Sequence of a Vaccinal Newcastle Disease Virus Strain Isolated from an Owl (Rhinoptynx clamator). MICROBIOLOGY RESOURCE ANNOUNCEMENTS, v. 4, n. 6 NOV-DEC 2016. Citações Web of Science: 1.
AYALA, ANDREA J.; DIMITROV, KIRIL M.; BECKER, CASSIDY R.; GORAICHUK, IRYNA V.; ARNS, CLARICE W.; BOLOTIN, VITALY I.; FERREIRA, HELENA L.; GERILOVYCH, ANTON P.; GOUJGOULOVA, GABRIELA V.; MARTINI, MATHEUS C.; MUZYKA, DENYS V.; ORSI, MARIA A.; SCAGION, GUILHERME P.; SILVA, RENATA K.; SOLODIANKIN, OLEXII S.; STEGNIY, BORIS T.; MILLER, PATTI J.; AFONSO, CLAUDIO L. Presence of Vaccine-Derived Newcastle Disease Viruses in Wild Birds. PLoS One, v. 11, n. 9 SEP 14 2016. Citações Web of Science: 20.

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