Sequenciamento completo do exoma, Paired-end RNA e genoma: novos insights sobre a natureza genética do câncer de tiróide na idade adulta e na faixa etária pediátrica e aplicações na prática clínica

• Processo: 14/06570-6
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Temático
• Vigência: 01 de outubro de 2015 - 28 de fevereiro de 2021
• Área do conhecimento: Ciências da Saúde - Medicina - Clínica Médica
• Pesquisador responsável: Janete Maria Cerutti
• Beneficiário: Janete Maria Cerutti
• Instituição Sede: Escola Paulista de Medicina (EPM). Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP). Campus São Paulo. São Paulo , SP, Brasil
• Pesquisadores principais: Magnus Régios Dias da Silva ; Rui Monteiro de Barros Maciel
• Pesquisadores associados: Adriano Namo Cury ; Gianna Maria Griz Carvalheira ; Gilles Landman ; Nilson Ivo Tonin Zanchin ; Pedro Alexandre Favoretto Galante ; Victor Piana de Andrade
• Bolsa(s) vinculada(s): 20/06594-3 - Biópsia líquida como possível ferramenta não-invasiva de diagnóstico e prognóstico dos tumores da tiroide, BP.DD; 18/13203-0 - Novos insights no prognóstico de microcarcinoma papilífero de tiroide: análise do status mutacional de BRAF V600E e sequenciamento de exoma completo, BP.DD; 18/09911-0 - AGK-BRAF no Carcinoma Papilífero da Tiroide Pediátrico: Investigação do mecanismo associado alta taxa de recorrência e análise funcional, BP.DR; + mais bolsas vinculadas 17/12107-5 - Investigação de marcadores moleculares para diagnóstico da NEM 2 através do perfil metabólico de células HEK293 com expressão RET e pacientes NEM 2/RET, BP.DR; 17/14948-7 - Estudo do papel de LIMD2 na transição epitélio-mesênquima no câncer de tiroide, BP.PD; 15/13413-7 - Investigação de rearranjos cromossômicos no gene BRAF em carcinomas diferenciados da tiroide na infância, BP.MS; 12/17545-7 - Caracterização Molecular das Neoplasias da Tiroide através da Técnica de Sequenciamento do Exoma Completo: Busca por Marcadores Moleculares no Diagnóstico Diferencial, BP.PD - menos bolsas vinculadas
• Assunto(s): Endocrinologia Neoplasias da glândula tireoide Genomas Exoma Carcinoma Biomarcadores Análise de sequência de RNA Sequenciamento de nova geração
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: carcinoma medular da tiróide | Carcinoma Papilífero da Tiróide | exoma | Marcadores de Diagnóstico | Marcadores de prognóstico | Endocrinologia

Resumo

A prevalência das lesões nodulares identificadas na tiroide depende de vários fatores como a idade, população estudada, sexo e do método de avaliação utilizado. Devido ao uso da ultrassonografia de alta resolução, capaz de detectar nódulos a partir de 2 mm, a prevalência dos nódulos da tiroide tem aumentado, podendo chegar a 67%. Como consequência do aumento no diagnóstico do nódulo, também observamos um aumento na incidência do câncer da tiroide. Atualmente é o tumor cuja incidência mais cresceu no mundo. Segundo o Instituto Nacional de Câncer (Inca), as neoplasias da tiroide representam 5,6% dos casos de câncer nas mulheres, sendo, atualmente, o quarto tipo de câncer mais frequente na população adulta feminina Brasileira. Sugere-se que esta tendência está diretamente relacionada ao aumento da frequência do carcinoma papilífero da tiroide e suas variantes. De fato, aproximadamente 50% do aumento foi às custas do diagnóstico dos microcarcinomas papilíferos (tumores d1 cm). Semelhante ao de adulto, as taxas de incidência do câncer de tiroide pediátrico também têm aumentado, sendo o tipo histológico papilífero o mais prevalente. Assim, este projeto abordará problemas clínicos relacionados ao diagnóstico e prognóstico dos nódulos da tiroide. Prevê inicialmente identificar novos eventos genéticos associados a gênese de diferentes subtipos de carcinoma da tiroide e que possam ser utilizados como marcadores capazes de auxiliar na distinção pré-cirúrgica dos nódulos comumente classificados como indeterminado que ocorrem na idade adulta ou na faixa etária pediátrica. Acreditamos que a identificação destes novos marcadores possibilitará o desenvolvimento de um teste de diagnóstico com sensibilidade e especificidade superior aos testes atualmente disponíveis. Ainda, almeja identificar marcadores capazes de predizer o prognóstico dos nódulos da tiroide, sobretudo dos microcarcinomas papilíferos. Pretende também contribuir na determinação dos eventos genéticos associados a gênese e progressão do carcinoma medular da tiroide que ocorrem na forma esporádica e hereditária. Como estratégia na identificação de novas mutações somáticas recorrentes e/ou eventos de fusão gênica, utilizaremos sequenciamento completo do exoma e/ou do RNA (paired-end RNA Sequencing) ou Target Ressenquencing, uma vez que 85% das alterações associadas a doenças estão localizadas nas regiões codificadoras dos genes. Estas estratégias têm obtido altos índices de sucesso na identificação de genes associados a doenças, principalmente no câncer. Além da identificação de novos eventos, este projeto também visa a caracterização das vias de sinalização associadas a novos genes e novas mutações previamente identificadas pelo grupo no câncer de tiroide. Trata-se de uma proposta inovadora cujos resultados podem ter aplicação clínica imediata, bem como, auxiliar na identificação de novas vias de sinalização associadas a gênese e progressão dos tumores da tiroide e, consequentemente, abrir novas perspectivas para terapia alvo. (AU)

Publicações científicas

(31)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

DE JESUS PANIZA, ANA CAROLINA; MENDES, THAIS BIUDE; BORGES VIANNA, MATHEUS DUARTE; DIAS THOMAZ, DEBORA MOTA; CHIAPPINI, PAULA B. O.; COLAZZA-GAMA, GABRIEL A.; LINDSEY, SUSAN CHOW; DE CARVALHO, MARCOS BRASILINO; FERREIRA ALVES, VENANCIO AVANCINI; CURIONI, OTAVIO; et al. Revised criteria for diagnosis of NIFTP reveals a better correlation with tumor biological behavior. ENDOCRINE CONNECTIONS, v. 8, n. 11, p. 1529-1538, NOV 2019. (17/06487-0, 14/06570-6, 16/25784-2, 17/16315-1)

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ARAUJO, ALINE NEVES; CAMACHO, CLEBER PINTO; MENDES, THAIS BIUDE; LINDSEY, SUSAN CHOW; MORAES, LAIS; MIYAZAWA, MARTA; DELCELO, ROSANA; PELLEGRINO, RENATA; MAZZOTTI, DIEGO ROBLES; MACIEL, RUI MONTEIRO DE BARROS; et al. Comprehensive Assessment of Copy Number Alterations Uncovers Recurrent AIFM3 and DLK1 Copy Gain in Medullary Thyroid Carcinoma. CANCERS, v. 13, n. 2, JAN 2021. (10/13833-2, 14/06570-6, 17/06487-0, 12/02248-7)

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