Sequenciamento completo do exoma, Paired-end RNA e genoma: novos insights sobre a natureza genética do câncer de tiróide na idade adulta e na faixa etária pediátrica e aplicações na prática clínica

• Processo: 14/06570-6
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Temático
• Vigência: 01 de outubro de 2015 - 28 de fevereiro de 2021
• Área do conhecimento: Ciências da Saúde - Medicina - Clínica Médica
• Pesquisador responsável: Janete Maria Cerutti
• Beneficiário: Janete Maria Cerutti
• Instituição Sede: Escola Paulista de Medicina (EPM). Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP). Campus São Paulo. São Paulo , SP, Brasil
• Pesquisadores principais: Magnus Régios Dias da Silva ; Rui Monteiro de Barros Maciel
• Pesquisadores associados: Adriano Namo Cury ; Gianna Maria Griz Carvalheira ; Gilles Landman ; Nilson Ivo Tonin Zanchin ; Pedro Alexandre Favoretto Galante ; Victor Piana de Andrade
• Bolsa(s) vinculada(s): 20/06594-3 - Biópsia líquida como possível ferramenta não-invasiva de diagnóstico e prognóstico dos tumores da tiroide, BP.DD; 18/13203-0 - Novos insights no prognóstico de microcarcinoma papilífero de tiroide: análise do status mutacional de BRAF V600E e sequenciamento de exoma completo, BP.DD; 18/09911-0 - AGK-BRAF no Carcinoma Papilífero da Tiroide Pediátrico: Investigação do mecanismo associado alta taxa de recorrência e análise funcional, BP.DR; + mais bolsas vinculadas 17/12107-5 - Investigação de marcadores moleculares para diagnóstico da NEM 2 através do perfil metabólico de células HEK293 com expressão RET e pacientes NEM 2/RET, BP.DR; 17/14948-7 - Estudo do papel de LIMD2 na transição epitélio-mesênquima no câncer de tiroide, BP.PD; 15/13413-7 - Investigação de rearranjos cromossômicos no gene BRAF em carcinomas diferenciados da tiroide na infância, BP.MS; 12/17545-7 - Caracterização Molecular das Neoplasias da Tiroide através da Técnica de Sequenciamento do Exoma Completo: Busca por Marcadores Moleculares no Diagnóstico Diferencial, BP.PD - menos bolsas vinculadas
• Assunto(s): Endocrinologia Neoplasias da glândula tireoide Genomas Exoma Carcinoma Biomarcadores Análise de sequência de RNA Sequenciamento de nova geração
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: carcinoma medular da tiróide | Carcinoma Papilífero da Tiróide | exoma | Marcadores de Diagnóstico | Marcadores de prognóstico | Endocrinologia

Resumo

A prevalência das lesões nodulares identificadas na tiroide depende de vários fatores como a idade, população estudada, sexo e do método de avaliação utilizado. Devido ao uso da ultrassonografia de alta resolução, capaz de detectar nódulos a partir de 2 mm, a prevalência dos nódulos da tiroide tem aumentado, podendo chegar a 67%. Como consequência do aumento no diagnóstico do nódulo, também observamos um aumento na incidência do câncer da tiroide. Atualmente é o tumor cuja incidência mais cresceu no mundo. Segundo o Instituto Nacional de Câncer (Inca), as neoplasias da tiroide representam 5,6% dos casos de câncer nas mulheres, sendo, atualmente, o quarto tipo de câncer mais frequente na população adulta feminina Brasileira. Sugere-se que esta tendência está diretamente relacionada ao aumento da frequência do carcinoma papilífero da tiroide e suas variantes. De fato, aproximadamente 50% do aumento foi às custas do diagnóstico dos microcarcinomas papilíferos (tumores d1 cm). Semelhante ao de adulto, as taxas de incidência do câncer de tiroide pediátrico também têm aumentado, sendo o tipo histológico papilífero o mais prevalente. Assim, este projeto abordará problemas clínicos relacionados ao diagnóstico e prognóstico dos nódulos da tiroide. Prevê inicialmente identificar novos eventos genéticos associados a gênese de diferentes subtipos de carcinoma da tiroide e que possam ser utilizados como marcadores capazes de auxiliar na distinção pré-cirúrgica dos nódulos comumente classificados como indeterminado que ocorrem na idade adulta ou na faixa etária pediátrica. Acreditamos que a identificação destes novos marcadores possibilitará o desenvolvimento de um teste de diagnóstico com sensibilidade e especificidade superior aos testes atualmente disponíveis. Ainda, almeja identificar marcadores capazes de predizer o prognóstico dos nódulos da tiroide, sobretudo dos microcarcinomas papilíferos. Pretende também contribuir na determinação dos eventos genéticos associados a gênese e progressão do carcinoma medular da tiroide que ocorrem na forma esporádica e hereditária. Como estratégia na identificação de novas mutações somáticas recorrentes e/ou eventos de fusão gênica, utilizaremos sequenciamento completo do exoma e/ou do RNA (paired-end RNA Sequencing) ou Target Ressenquencing, uma vez que 85% das alterações associadas a doenças estão localizadas nas regiões codificadoras dos genes. Estas estratégias têm obtido altos índices de sucesso na identificação de genes associados a doenças, principalmente no câncer. Além da identificação de novos eventos, este projeto também visa a caracterização das vias de sinalização associadas a novos genes e novas mutações previamente identificadas pelo grupo no câncer de tiroide. Trata-se de uma proposta inovadora cujos resultados podem ter aplicação clínica imediata, bem como, auxiliar na identificação de novas vias de sinalização associadas a gênese e progressão dos tumores da tiroide e, consequentemente, abrir novas perspectivas para terapia alvo. (AU)

Publicações científicas

(31)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

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BIM, LARISSA VALDEMARIN; RIBEIRO CARNEIRO, THAISE NAYANE; BUZATTO, VANESSA CANDIOTTI; COLOZZA-GAMA, GABRIEL AVELAR; KOYAMA, FERNANDA C.; DIAS THOMAZ, DEBORA MOTA; DE JESUS PANIZA, ANA CAROLINA; LEE, EUNJUNG ALICE; FAVORETTO GALANTE, PEDRO ALEXANDRE; CERUTTI, JANETE MARIA. Molecular Signature Expands the Landscape of Driver Negative Thyroid Cancers. CANCERS, v. 13, n. 20, OCT 2021. (18/23497-1, 14/06570-6)

RADONSKY, VANESSA; KIZYS, MARINA MALTA LETRO; DOTTO, RENATA PIRES; ESPER, PRISCILA LIGEIRO GONCALVES; HEILBERG, ITA PFEFERMAN; DIAS-DA-SILVA, MAGNUS REGIOS; LAZARETTI-CASTRO, MARISE. Hypomagnesemia with Hypercalciuria Leading to Nephrocalcinosis, Amelogenesis Imperfecta, and Short Stature in a Child Carrying a Homozygous Deletion in the CLDN16 Gene. CALCIFIED TISSUE INTERNATIONAL, v. 107, n. 4, p. 6-pg., 2020-07-24. (14/06570-6, 12/01628-0, 14/15948-2)

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MACIEL, RUI M. B.; CAMACHO, CLEBER P.; ASSUMPCAO, LIGIA V. M.; BUFALO, NATASSIA E.; CARVALHO, ANDRE L.; DE CARVALHO, GISAH A.; CASTRONEVES, LUCIANA A.; DE CASTRO JR, FRANCISCO M.; CEOLIN, LUCIELI; CERUTTI, JANETE M.; et al. Genotype and phenotype landscape of MEN2 in 554 medullary thyroid cancer patients: the BrasMEN study. ENDOCRINE CONNECTIONS, v. 8, n. 3, p. 10-pg., 2019-03-01. (09/50575-4, 13/01476-9, 14/06570-6, 12/21942-1, 10/51546-5, 06/60402-1, 10/51547-1)