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Estudos estruturais e caracterização de proteínas por Cristalografia de Raios-X e ressonância magnética nuclear. investigações estruturais e biofísicas dos mecanismos moleculares de proteínas funcionais

Processo: 15/13765-0
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Regular
Vigência: 01 de novembro de 2015 - 31 de maio de 2018
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Biofísica - Biofísica Molecular
Pesquisador responsável:Raghuvir Krishnaswamy Arni
Beneficiário:Raghuvir Krishnaswamy Arni
Instituição-sede: Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas (IBILCE). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de São José do Rio Preto. São José do Rio Preto , SP, Brasil
Assunto(s):Biologia estrutural  Cristalografia de proteínas  Cristalografia 

Resumo

Este projeto de pesquisa colaborativa tem como tema central primário a expressão, caracterização e a determinação das estruturas cristalográficas de enzimas selecionadas.A cristalografia fornece imagens precisas das estruturas tridimensionais das macromoléculas biológicas em nível atômico, que é insuperável por qualquer outra técnica em seu grau de detalhe e precisão. Os modelos estruturais ajudam a elucidar mecanismos enzimáticos e a compreender os processos bioquímicos complexos inerentes à vida e à biotecnologia e sugerir modificações estruturais para inibir o funcionamento de moléculas que desencadeiam ou atenuam doenças e enfermidades ou para melhorar o desempenho das enzimas. As técnicas de Ressonância MagnéticaNuclear fornecem dados estruturais complementares e serão empregadas para determinar os modos de ligação e inibição destas enzimas. (AU)

Publicações científicas (9)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
MARIUTTI, RICARDO B.; HERNANDEZ-GONZALEZ, JORGE E.; NASCIMENTO, ANDREY F. Z.; DE MORAIS, MARIANA A. B.; MURAKAMI, MARIO T.; CARARETO, CLAUDIA M. A.; ARNI, RAGHUVIR K. A single P115Q mutation modulates specificity in the Corynebacterium pseudotuberculosis arginine repressor. BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-GENERAL SUBJECTS, v. 1864, n. 7 JUL 2020. Citações Web of Science: 0.
GREMSKI, LUIZA HELENA; DA JUSTA, HANNA CAMARA; DA SILVA, THAIS PEREIRA; POLLI, NAYANNE LOUISE COSTACURTA; ANTUNES, BRUNO CESAR; MINOZZO, JOAO CARLOS; WILLE, ANA CAROLINA MARTINS; SENFF-RIBEIRO, ANDREA; ARNI, RAGHUVIR KRISHNASWAMY; VEIGA, SILVIO SANCHES. Forty Years of the Description of Brown Spider Venom Phospholipases-D. TOXINS, v. 12, n. 3 MAR 2020. Citações Web of Science: 1.
PEINADO, RAFAELA DOS S.; OLIVIER, DANILO S.; EBERLE, RAPHAEL J.; DE MORAES, FABIO R.; AMARAL, MARCOS S.; ARNI, RAGHUVIR K.; CORONADO, MONIKA A. Binding studies of a putative C. pseudotuberculosis target protein from Vitamin B-12 Metabolism. SCIENTIFIC REPORTS, v. 9, APR 23 2019. Citações Web of Science: 0.
EBERLE, RAPHAEL J.; CORONADO, MONIKA A.; PEINADO, RAFAELA S.; DE MORAES, FABIO R.; OLIVIER, DANILO; DREYER, THIAGO; LOPES, DEBORA DE OLIVEIRA; ROSA DA LUZ, BRENDA SILVA; AZEVEDO, VASCO; ARNI, RAGHUVIR K. The polyanions heparin and suramin impede binding of free adenine to a DNA glycosylase from C. pseudotuberculosis. International Journal of Biological Macromolecules, v. 125, p. 459-468, MAR 15 2019. Citações Web of Science: 0.
CORONADO, MONIKA APARECIDA; EBERLE, RAPHAEL JOSEF; BLEFFERT, NICOLE; FEUERSTEIN, SOPHIE; OLIVIER, DANILO SILVA; DE MORAES, FABIO ROGERIO; WILLBOLD, DIETER; ARNI, RAGHUVIR KRISHNASWAMY. Zika virus NS2B/NS3 proteinase: A new target for an old drug - Suramin a lead compound for NS2B/NS3 proteinase inhibition. Antiviral Research, v. 160, p. 118-125, DEC 2018. Citações Web of Science: 6.
EBERLE, RAPHAEL J.; KAWAI, LIEGE A.; DE MORAES, FABIO R.; OLIVIER, DANILO; DO AMARAL, MARCOS S.; TASIC, LJUBICA; AMI, RAGHUVIR K.; CORONADO, MONIKA A. Inhibition of thioredoxin A1 from Corynebacterium pseudotuberculosis by polyanions and flavonoids. International Journal of Biological Macromolecules, v. 117, p. 1066-1073, OCT 1 2018. Citações Web of Science: 0.
CORONADO, MONIKA APARECIDA; OLIVIER, DANILO DA SILVA; EBERLE, RAPHAEL JOSEF; DO AMARAL, MARCOS SERROU; ARNI, RAGHUVIR KRISHNASWAMY. Modeling and molecular dynamics indicate that snake venom phospholipase B-like enzymes are Ntn-hydrolases. Toxicon, v. 153, p. 106-113, OCT 2018. Citações Web of Science: 1.
EBERLE, RAPHAEL J.; KAWAI, LIEGE A.; DE MORAES, FABIO R.; TASIC, LJUBICA; ARNI, RAGHUVIR K.; CORONADO, MONIKA A. Biochemical and biophysical characterization of a mycoredoxin protein glutaredoxin A1 from Corynebacterium pseudotuberculosis. International Journal of Biological Macromolecules, v. 107, n. B, p. 1999-2007, FEB 2018. Citações Web of Science: 1.
BHAT, SHREESHA K.; JOSHI, MANJUNATH B.; ULLAH, ANWAR; MASOOD, REHANA; BILIGIRI, SETLUR G.; ARNI, RAGHUVIR K.; SATYAMOORTHY, KAPAETTU. Serine proteinases from Bothrops snake venom activates PI3K/Akt mediated angiogenesis. Toxicon, v. 124, p. 63-72, DEC 15 2016. Citações Web of Science: 5.

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