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Estudo da interação entre fármacos e a albumina do soro humano (HSA) baseado em simulação computacional, DFT e TDDFT, experimentos de dicroísmo circular eletrônico, ECD, e determinação da constante de ligação

Resumo

No presente projeto de pesquisa pretendemos estudar a interação entre fármacos e a proteína Albumina do Soro Humano (HSA) nos sítios de ligação I e II. Os fármacos que iremos estudar são: Azapropazone, 3-Indoxyl sulfate, 3,5,-Diiodosalicyclic acid, Diflunisal, Indomethacin, Diazepan, Oxyphenbutazone, Phenylbutazone, Warfarin, Ibuprofen, ácido 3-carboxi-4-metil-5-propil-2-furanopropionico (CMPF), Dansyl-Sarcosine, Dansyl-Norvaline, Dansyl-Phenylalanine, Dansyl-Asparagine, Dansyl-Arginine e Dansyl-L-Glutamate. Iremos explorar tanto a abordagem de simulação computacional como a experimental. No aspecto de simulação computacional iremos determinar os aspectos energéticos e estruturais das moléculas de fármacos quando em solução, para isto usaremos o modelo PCM, em comparação com as propriedades determinadas experimentalmente. As propriedades estruturais experimentais serão obtidas através dos arquivos de proteínas do Protein Data Bank (PDB), enquanto que as propriedades de estabilidade energética dos complexos entre fármacos e HSA serão determinadas através da supressão de fluorescência do fármaco quando no interior da proteína. Pretende-se também propor a estereoquímica dos fármacos quando ligados no sitio de ligação da HSA através da comparação entre os resultados de dicroísmo circular induzido, obtido experimentalmente, com os resultados obtidos através de cálculos baseados na Teoria do Funcional da Densidade Dependente do Tempo (TDDFT). Serão utilizados os funcionais de troca e correlação CAM-B3LYP e PBe0 e def2-TZVPP'D. Os valores para as forças rotacionais R, na forma de velocidade dipolar (Rvel) e os comprimentos de onda de excitação serão determinados para um conjunto de estados excitados dos fármacos. (AU)

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Publicações científicas (11)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
MORGON, NELSON H.; GRANDINI, GIULIA S.; YOGUIM, MAURICIO I.; PORTO, CAIO M.; SANTANA, LUCAS C.; BISWAS, SRIJIT; DE SOUZA, AGUINALDO R.. Potential activity of Linezolid against SARS-CoV-2 using electronic and molecular docking study. Journal of Molecular Modeling, v. 27, n. 8, . (13/08293-7, 15/22338-9)
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AGUINALDO ROBINSON DE SOUZA; IZABELLE AMORIM FERREIRA BOZA; VALDECIR FARIAS XIMENES; MAURÍCIO IKEDA YOGUIN; MARÍA-JOSÉ DÁVILA-RODRIGUEZ; NELSON HENRIQUE MORGON; IGNEZ CARACELLI. ELUCIDAÇÃO DA QUIRALIDADE INDUZIDA NA MOLÉCULA DANSILGLICINA NA COMPLEXAÇÃO COM A PROTEÍNA ALBUMINA DO SORO HUMANO (HSA). Química Nova, v. 42, n. 2, p. 135-142, . (14/50926-0, 15/22338-9, 16/20549-5)
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HOLANDA, BRUNO B. C.; ALARCON, RAFAEL T.; GAGLIERI, CAROLINE; DE SOUZA, AGUINALDO R.; CASTRO, RICARDO A. E.; ROSA, PAULO C. P.; TANGERINO, DEBORA J. A.; BANNACH, GILBERT. Thermal studies, degradation kinetic, equilibrium solubility, DFT, MIR, and XRPD analyses of a new cocrystal of gemfibrozil and isonicotinamide. JOURNAL OF THERMAL ANALYSIS AND CALORIMETRY, v. 136, n. 5, p. 2049-2062, . (13/09022-7, 18/03460-6, 13/07296-2, 15/22338-9)
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ALARCON, RAFAEL T.; GAGLIERI, CAROLINE; DOS SANTOS, GIOVANNY C.; MORALLES, ANA C.; MORGON, NELSON H.; DE SOUZA, AGUINALDO R.; BANNACH, GILBERT. AIE Effect by Oxygen Clustering in Vegetable Oil-Based Polymers. CHEMISTRYSELECT, v. 6, n. 31, p. 7838-7844, . (18/03460-6, 13/08293-7, 17/08820-8, 15/22338-9)
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VENTURINI, DIEGO; DE SOUZA, AGUINALDO ROBINSON; CARACELLI, IGNEZ; MORGON, NELSON HENRIQUE; DA SILVA-FILHO, LUIZ CARLOS; XIMENES, VALDECIR FARIAS. Induction of axial chirality in divanillin by interaction with bovine serum albumin. PLoS One, v. 12, n. 6, . (14/50926-0, 15/22338-9)

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