Estudo da interação entre fármacos e a albumina do soro humano (HSA) baseado em simulação computacional, DFT e TDDFT, experimentos de dicroísmo circular eletrônico, ECD, e determinação da constante de ligação

• Processo: 15/22338-9
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de fevereiro de 2016
• Data de Término da vigência: 31 de janeiro de 2018
• Área do conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Química - Físico-química
• Pesquisador responsável: Aguinaldo Robinson de Souza
• Beneficiário: Aguinaldo Robinson de Souza
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências (FC). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Bauru. Bauru , SP, Brasil
• Pesquisadores associados: Nelson Henrique Morgon ; Valdecir Farias Ximenes
• Assunto(s): Fármacos Química computacional Dicroísmo circular Simulação por computador
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: albumina do soro humano | Constante de Estabilidade | dicroismo circular | fármacos | Simulação Computacional | tddft | Química Computacional

Resumo

No presente projeto de pesquisa pretendemos estudar a interação entre fármacos e a proteína Albumina do Soro Humano (HSA) nos sítios de ligação I e II. Os fármacos que iremos estudar são: Azapropazone, 3-Indoxyl sulfate, 3,5,-Diiodosalicyclic acid, Diflunisal, Indomethacin, Diazepan, Oxyphenbutazone, Phenylbutazone, Warfarin, Ibuprofen, ácido 3-carboxi-4-metil-5-propil-2-furanopropionico (CMPF), Dansyl-Sarcosine, Dansyl-Norvaline, Dansyl-Phenylalanine, Dansyl-Asparagine, Dansyl-Arginine e Dansyl-L-Glutamate. Iremos explorar tanto a abordagem de simulação computacional como a experimental. No aspecto de simulação computacional iremos determinar os aspectos energéticos e estruturais das moléculas de fármacos quando em solução, para isto usaremos o modelo PCM, em comparação com as propriedades determinadas experimentalmente. As propriedades estruturais experimentais serão obtidas através dos arquivos de proteínas do Protein Data Bank (PDB), enquanto que as propriedades de estabilidade energética dos complexos entre fármacos e HSA serão determinadas através da supressão de fluorescência do fármaco quando no interior da proteína. Pretende-se também propor a estereoquímica dos fármacos quando ligados no sitio de ligação da HSA através da comparação entre os resultados de dicroísmo circular induzido, obtido experimentalmente, com os resultados obtidos através de cálculos baseados na Teoria do Funcional da Densidade Dependente do Tempo (TDDFT). Serão utilizados os funcionais de troca e correlação CAM-B3LYP e PBe0 e def2-TZVPP'D. Os valores para as forças rotacionais R, na forma de velocidade dipolar (Rvel) e os comprimentos de onda de excitação serão determinados para um conjunto de estados excitados dos fármacos. (AU)

Publicações científicas

(14)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

VENTURINI, DIEGO; DE SOUZA, AGUINALDO ROBINSON; CARACELLI, IGNEZ; MORGON, NELSON HENRIQUE; DA SILVA-FILHO, LUIZ CARLOS; XIMENES, VALDECIR FARIAS. Induction of axial chirality in divanillin by interaction with bovine serum albumin. PLoS One, v. 12, n. 6, JUN 2 2017. (15/22338-9, 14/50926-0)

PASTRELLO, BRUNA; DOS SANTOS, GIOVANNY CARVALHO; DA SILVA-FILHO, LUIZ CARLOS; DE SOUZA, AGUINALDO ROBINSON; MORGON, NELSON HENRIQUE; XIMENES, VALDECIR FARIAS. Novel aminoquinoline-based solvatochromic fluorescence probe: Interaction with albumin, lysozyme and characterization of amyloid fibrils. DYES AND PIGMENTS, v. 173, FEB 2020. (15/00615-0, 15/22338-9, 16/20549-5, 18/14506-7, 14/50926-0)

MORGON, NELSON H.; BISWAS, SRIJIT; DUARI, SURAJIT; DE SOUZA, AGUINALDO R.. Solvent Effects in the Regioselective N-Functionalization of Tautomerizable Heterocycles Catalyzed by Methyl Trifluoromethanesulfonate: A Density Functional Theory Study with Implicit Solvent Model. COMPUTATION, v. 10, n. 10, p. 9-pg., 2022-10-01. (15/22338-9, 19/12294-5)

ALARCON, RAFAEL T.; GAGLIERI, CAROLINE; DOS SANTOS, GIOVANNY C.; MORALLES, ANA C.; MORGON, NELSON H.; DE SOUZA, AGUINALDO R.; BANNACH, GILBERT. AIE Effect by Oxygen Clustering in Vegetable Oil-Based Polymers. CHEMISTRYSELECT, v. 6, n. 31, p. 7838-7844, AUG 20 2021. (13/08293-7, 18/03460-6, 17/08820-8, 15/22338-9)

DE SOUSA, IRAN DA LUZ; XIMENES, VALDECIR FARIAS; DE SOUZA, AGUINALDO ROBINSON; MORGON, NELSON HENRIQUE. Solvent-induced Stokes' shift in DCJTB: Experimental and theoretical results. Journal of Molecular Structure, v. 1192, p. 186-191, SEP 15 2019. (15/22338-9, 16/20549-5, 14/50926-0, 16/04963-6)

ORENHA, RENATO PEREIRA; SILVA, GRAZIELE CAPPATO GUERRA; MORGON, NELSON HENRIQUE; CARAMORI, GIOVANNI FINOTO; PARREIRA, RENATO LUIS TAME. Can the relative positions (cis-trans) of ligands really modulate the coordination of NO in ruthenium nitrosyl complexes?. NEW JOURNAL OF CHEMISTRY, v. 45, n. 3, p. 1658-1666, JAN 21 2021. (13/08293-7, 19/00543-0, 11/07623-8, 15/22338-9, 17/24856-2)

ORENHA, RENATO PEREIRA; MORGON, NELSON HENRIQUE; SILVA, GRAZIELE CAPPATO GUERRA; CARAMORI, GIOVANNI FINOTO; PARREIRA, RENATO LUIS TAME. The pi-donor/acceptor trans effect on NO release in ruthenium nitrosyl complexes: a computational insight. NEW JOURNAL OF CHEMISTRY, v. 45, n. 20, APR 2021. (11/07623-8, 17/24856-2, 19/00543-0, 13/08293-7, 15/22338-9)

XIMENES, VALDECIR FARIAS; MORGON, NELSON HENRIQUE; DE SOUZA, AGUINALDO ROBINSON. Solvent-dependent inversion of circular dichroism signal in naproxen: An unusual effect!. CHIRALITY, v. 30, n. 9, p. 1049-1053, SEP 2018. (14/50926-0, 15/22338-9, 16/20549-5)

AGUINALDO ROBINSON DE SOUZA; IZABELLE AMORIM FERREIRA BOZA; VALDECIR FARIAS XIMENES; MAURÍCIO IKEDA YOGUIN; MARÍA-JOSÉ DÁVILA-RODRIGUEZ; NELSON HENRIQUE MORGON; IGNEZ CARACELLI. ELUCIDAÇÃO DA QUIRALIDADE INDUZIDA NA MOLÉCULA DANSILGLICINA NA COMPLEXAÇÃO COM A PROTEÍNA ALBUMINA DO SORO HUMANO (HSA). Química Nova, v. 42, n. 2, p. 135-142, 2019-02-00. (16/20549-5, 15/22338-9, 14/50926-0)

SOUSA, IRAN DA L.; HEERDT, GABRIEL; XIMENES, VALDECIR F.; DE SOUZA, AGUINALDO R.; MORGON, NELSON H.. TD-DFT Analysis of the Dissymmetry Factor in Camphor. Journal of the Brazilian Chemical Society, v. 31, n. 3, p. 613-618, MAR 2020. (14/50926-0, 16/20549-5, 15/22338-9, 16/04963-6, 19/12294-5)

FERNANDES, ANA JULIA FOGANHOLI CARVALHO; BERTOZO, LUIZA DE CARVALHO; POVINELLI, ANA PAULA RIBEIRO; ZAZERI, GABRIEL; DE SOUZA, AGUINALDO ROBINSON; MORGON, NELSON HENRIQUE; XIMENES, VALDECIR FARIAS. 4-Dimethylamino-beta-nitrostyrene, a fluorescent solvatochromic probe to estimate the apparent dielectric constant in serum albumin: Experimental and molecular dynamics studies. JOURNAL OF PHOTOCHEMISTRY AND PHOTOBIOLOGY A-CHEMISTRY, v. 433, p. 12-pg., 2022-08-11. (13/08293-7, 15/22338-9, 19/18445-5)

HOLANDA, BRUNO B. C.; ALARCON, RAFAEL T.; GAGLIERI, CAROLINE; DE SOUZA, AGUINALDO R.; CASTRO, RICARDO A. E.; ROSA, PAULO C. P.; TANGERINO, DEBORA J. A.; BANNACH, GILBERT. Thermal studies, degradation kinetic, equilibrium solubility, DFT, MIR, and XRPD analyses of a new cocrystal of gemfibrozil and isonicotinamide. JOURNAL OF THERMAL ANALYSIS AND CALORIMETRY, v. 136, n. 5, p. 2049-2062, JUN 2019. (13/09022-7, 18/03460-6, 13/07296-2, 15/22338-9)

MORGON, NELSON H.; GRANDINI, GIULIA S.; YOGUIM, MAURICIO I.; PORTO, CAIO M.; SANTANA, LUCAS C.; BISWAS, SRIJIT; DE SOUZA, AGUINALDO R.. Potential activity of Linezolid against SARS-CoV-2 using electronic and molecular docking study. Journal of Molecular Modeling, v. 27, n. 8, AUG 2021. (13/08293-7, 15/22338-9)

DE SOUZA, AGUINALDO ROBINSON; XIMENES, VALDECIR FARIAS; MORGON, NELSON HENRIQUE; CHENG, HN; MARYANOFF, CA; MILLER, BD; SCHMIDT, DG. Solvent Effects on Electronic Circular Dichroism Spectra. STEREOCHEMISTRY AND GLOBAL CONNECTIVITY: THE LEGACY OF ERNEST L ELIEL, VOL 2, v. 1258, p. 11-pg., 2017-01-01. (15/22338-9, 16/20549-5)