Investigando a evolução de cepas animais de rotavírus infectando humanos

• Processo: 15/12944-9
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Vigência: 01 de março de 2016 - 28 de fevereiro de 2018
• Área do conhecimento: Ciências da Saúde - Medicina
• Pesquisador responsável: Adriana Luchs
• Beneficiário: Adriana Luchs
• Instituição Sede: Instituto Adolfo Lutz (IAL). Coordenadoria de Controle de Doenças (CCD). Secretaria da Saúde (São Paulo - Estado). São Paulo , SP, Brasil
• Pesquisadores associados: Maria Do Carmo Sampaio Tavares Timenetsky
• Assunto(s): Rotavirus Genótipo Análise de sequência de DNA Zoonoses Epidemiologia molecular
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Evolução viral | Genótipo | Rotavirus | Sequenciamento genomico | Transmissão interepécie | Zoonose | Epidemiologia Molecular

Resumo

Rotavírus do grupo A (RVA) são a principal causa de gastroenterite viral aguda em humanos e animais. Recentemente, a vigilância continuada das cepas de RVA que infectam a população humana mundial evidenciou um aumento na frequência de detecção de genótipos incomuns, comumente isolados em animais domésticos e de estimação, inclusive no Brasil. Estudos filogenéticos sugerem que essas detecções na população humana sejam decorrências direta e/ou indireta de transmissões zoonóticas (ou interespécie). O conhecimeto sobre a distribuição genotípica e a evolução de cepas humanas de RVA é de vital importância para a avaliação da eficácia das vacinas vigentes e para o desenvolvimento de novas vacinas. Em 2006, a vacina monovalente contra o RVA foi incluída no Programa Nacional de Imunizações, a qual induziu uma redução significativa na frequência de detecção de RVA e na prevenção da gastroenterite aguda. Em países com alta cobertura vacinal, como o Brasil, a pressão seletiva exercida pela vacina pode levar a uma substituição de cepas comuns (semelhantes àquelas incluídas nas vacinas) por cepas incomuns, algumas das quais poderão ser geradas pelo rearranjo entre RVA humano e animal. O Núcleo de Doenças Entéricas (NDE) do Centro de Virologia, Instituto Adolfo Lutz é centro de referência macrorregional para a vigilância das gastroenterites virais, vinculado ao Ministério da Saúde no Brasil. As amostras fecais enviadas ao NDE são triadas com a uso de kits de ELISA comercias para o diagnóstico de RVA. As amostras positivas são genotipadas por RT-PCR, tendo como alvo as duas proteínas do capsídeo externo: VP4 (genótipo P) e VP7 (genótipo G). A identificação de cepas de RVA com combinações átipicas dos genótipos G e P (considerados incomuns ou raros) em humanos é um forte indicativo de transmissão interespécie. Desde 2008, a caracterização molecular dos 11 segmentos (constelação genômica) dos RVA é empregada no estudo da evolução viral e revelou ser uma excelente plataforma para compreender os eventos de transmissão zoonótica e, a subsequente adaptação de cepas animais à população humana. Desvendar a evolução viral e compreender o papel que as cepas animais exercem sobre epidemiologia dos RVA que infectam os humanos poderá contribuir para o aprimoramento das estratégias de vigilância dos genótipos circulantes, assim como das vacinais empregadas. O objetivo do presente estudo é compreender a dinâmica evolutiva entre cepas de RVA de origem humana e animal. Para tal será conduzido o sequenciamento do genoma completo de cepas de RVA exibindo combinação de genótipos G (VP7) e P (VP4) incomuns/raros detectadas em humanos, seguindo-se de análise filogenética. (AU)

Publicações científicas

(22)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

DA COSTA, ANTONIO CHARLYS; LUCHS, ADRIANA; DE PADUA MILAGRES, FLAVIO AUGUSTO; KOMNINAKIS, SHIRLEY VASCONCELOS; GILL, DANIELLE ELISE; BRITO SAYAO LOBATO, MARCIA CRISTINA ALVES; BRUSTULIN, RAFAEL; DAS CHAGAS, ROGERIO TOGISAKI; NEVES DOS SANTOS ABRAO, MARIA DE FATIMA; DE DEUS ALVES SOARES, CASSIA VITORIA; et al. Recombination Located over 2A-2B Junction Ribosome Frameshifting Region of Saffold Cardiovirus. Viruses-Basel, v. 10, n. 10, OCT 2018. (15/12944-9, 16/01735-2, 17/00021-9)

CUNHA, LIA; LUCHS, ADRIANA; AZEVEDO, LAIS S. S.; SILVA, VANESSA C. M.; LEMOS, MARCILIO F. F.; COSTA, ANTONIO C. C.; COMPRI, ADRIANA P. P.; FRANCA, YASMIN; VIANA, ELLEN; MALTA, FERNANDA; et al. Detection of Hepatitis E Virus Genotype 3 in Feces of Capybaras (Hydrochoeris hydrochaeris) in Brazil. Viruses-Basel, v. 15, n. 2, p. 13-pg., 2023-02-01. (20/02469-0, 15/12944-9, 20/14786-0, 20/11182-6)

DE AZEVEDO, LAIS SAMPAIO; FRANCA, YASMIN; VIANA, ELLEN; MEDEIROS, ROBERTA SALZONE; MORILLO, SIMONE GUADAGNUCCI; GUIDUCCI, RAQUEL; RIBEIRO, CIBELE DANIEL; VIEIRA, HELOISA ROSA; BARRIO-NUEVO, KAROLINA MORALES; CUNHA, MARIANA SEQUETIN; et al. Lack of molecular evidence of fecal-borne viruses in capybaras from Sao Paulo state, Brazil, 2018-2020: a minor public health issue. Brazilian Journal of Microbiology, v. N/A, p. 9-pg., 2022-11-07. (20/14786-0, 20/02469-0, 15/12944-9, 20/11182-6, 19/21706-5)

LUCHS, ADRIANA; TARDY, KAELAN; TAHMASEBI, ROOZBEH; MORILLO, SIMONE GUADAGNUCCI; MILAGRES, FLAVIO AUGUSTO DE PADUA; MORAIS, VANESSA DOS SANTOS; BRUSTULIN, RAFAEL; TELES, MARIA DA APARECIDA RODRIGUES; DE AZEVEDO, LAIS SAMPAIO; DE SOUZA, ELLEN VIANA; et al. Human astrovirus types 1, 4 and 5 circulating among children with acute gastroenteritis in a rural Brazilian state, 2010-2016. ARCHIVES OF VIROLOGY, v. 166, n. 11, AUG 2021. (19/21706-5, 15/12944-9, 17/00021-9, 20/11182-6, 20/02469-0, 16/01735-2)

MARCELLE SILVA-SALES; ELCIO LEAL; FLAVIO AUGUSTO DE PÁDUA MILAGRES; RAFAEL BRUSTULIN; VANESSA DOS SANTOS MORAIS; ROBERTA MARCATTI; EMERSON LUIZ LIMA ARAÚJO; STEVEN S. WITKIN; XUTAO DENG; ESTER CERDEIRA SABINO; et al. Genomic constellation of human Rotavirus A strains identified in Northern Brazil: a 6-year follow-up (2010-2016). Revista do Instituto de Medicina Tropical de São Paulo, v. 62, 2020-12-18. (17/00021-9, 19/21706-5, 15/12944-9)

RIBEIRO, GEOVANI DE OLIVEIRA; LUCHS, ADRIANA; DE PADUA MILAGRES, FLAVIO AUGUSTO; KOMNINAKIS, SHIRLEY VASCONCELOS; GILL, DANIELLE ELISE; BRITO SAYAO LOBATO, MARCIA CRISTINA ALVES; BRUSTULIN, RAFAEL; DAS CHAGAS, ROGERIO TOGISAKI; NEVES DOS SANTOS ABRAO, MARIA DE FATIMA; DE DEUS ALVES SOARES, CASSIA VITORIA; et al. Detection and Characterization of Enterovirus B73 from a Child in Brazil. Viruses-Basel, v. 11, n. 1, JAN 2019. (15/12944-9, 17/00021-9, 16/01735-2)

AZEVEDO, LAIS SAMPAIO; COSTA, FERNANDA FARIA; GHANI, MONIQUE BEERENS ABDUL; VIANA, ELLEN; FRANCA, YASMIN; MEDEIROS, ROBERTA SALZONE; GUIDUCCI, RAQUEL; MORILLO, SIMONE GUADAGNUCCI; PRIMO, DIELI; LOPES, RICARDO DUARTE; et al. Full genotype characterization of Brazilian canine G3P[3] strains during a 10-year survey (2012-2021) of rotavirus infection in domestic dogs and cats. ARCHIVES OF VIROLOGY, v. 168, n. 7, p. 15-pg., 2023-07-01. (20/02469-0, 15/12944-9, 20/14786-0, 20/11182-6)

ARANHA WATANABE, ARIPUANA SAKURADA; LUCHS, ADRIANA; LEAL, ELCIO; DE PADUA MILAGRES, FLAVIO AUGUSTO; KOMNINAKIS, SHIRLEY VASCONCELOS; GILL, DANIELLE ELISE; BRITO SAYAO LOBATO, MARCIA CRISTINA ALVES; BRUSTULIN, RAFAEL; DAS CHAGAS, ROGERIO TOGISAKI; NEVES DOS SANTOS ABRAO, MARIA DE FATIMA; et al. Complete Genome Sequences of Six Human Bocavirus Strains from Patients with Acute Gastroenteritis in the North Region of Brazil. GENOME ANNOUNCEMENTS, v. 6, n. 17, p. 2-pg., 2018-04-01. (16/01735-2, 17/00021-9, 15/12944-9)

ARANHA WATANABE, ARIPUANA SAKURADA; LUCHS, ADRIANA; LEAL, ELCIO; DE PADUA MILAGRES, FLAVIO AUGUSTO; KOMNINAKIS, SHIRLEY VASCONCELOS; GILL, DANIELLE ELISE; BRITO SAYAO LOBATO, MARCIA CRISTINA ALVES; BRUSTULIN, RAFAEL; DAS CHAGAS, ROGERIO TOGISAKI; NEVES DOS SANTOS ABRAO, MARIA DE FATIMA; et al. Complete Genome Sequences of Six Human Bocavirus Strains from Patients with Acute Gastroenteritis in the North Region of Brazil. MICROBIOLOGY RESOURCE ANNOUNCEMENTS, v. 6, n. 17, APR 2018. (15/12944-9, 16/01735-2, 17/00021-9)

LUCHS, ADRIANA; DA COSTA, ANTONIO CHARLYS; CILLI, AUDREY; VASCONCELOS KOMNINAKIS, SHIRLEY CAVALCANTE; COMPAGNOLI CARMONA, RITA DE CASSIA; BOEN, LAIS; MORILLO, SIMONE GUADAGNUCCI; SABINO, ESTER CERDEIRA; SAMPAIO TAVARES TIMENETSKY, MARIA DO CARMO. Spread of the emerging equine-like G3P[8] DS-1-like genetic backbone rotavirus strain in Brazil and identification of potential genetic variants. JOURNAL OF GENERAL VIROLOGY, v. 100, n. 1, p. 7-25, JAN 2019. (15/12944-9, 17/00021-9, 16/01735-2)

LUCHS, ADRIANA; LEAL, ELCIO; KOMNINAKIS, SHIRLEY VASCONCELOS; DE PADUA MILAGRES, FLAVIO AUGUSTO; BRUSTULIN, RAFAEL; RODRIGUES TELES, MARIA DA APARECIDA; GILL, DANIELLE ELISE; DENG, XUTAO; DELWART, ERIC; SABINO, ESTER CERDEIRA; et al. Wuhan large pig roundworm virus identified in human feces in Brazil. VIRUS GENES, v. 54, n. 3, p. 470-473, JUN 2018. (15/12944-9, 17/00021-9, 16/01735-2)

DA COSTA, ANTONIO CHARLYS; LEAL, ELCIO; GILL, DANIELLE; DE PADUA MILAGRES, FLAVIO AUGUSTO; KOMNINAKIS, SHIRLEY VASCONCELOS; BRUSTULIN, RAFAEL; RODRIGUES TELES, MARIA DA APARECIDA; BRITO SAYAO LOBATO, MARCIA CRISTINA ALVES; DAS CHAGAS, ROGERIO TOGISAKI; NEVES DOS SANTOS ABRAO, MARIA DE FATIMA; et al. Discovery of Cucumis melo endornavirus by deep sequencing of human stool samples in Brazil. VIRUS GENES, v. 55, n. 3, p. 332-338, JUN 2019. (15/12944-9, 17/00021-9, 16/01735-2)

LEAL, ELCIO; LUCHS, ADRIANA; DE PADUA MILAGRES, FLAVIO AUGUSTO; KOMNINAKIS, SHIRLEY VASCONCELOS; GILL, DANIELLE ELISE; BRITO SAYAO LOBATO, MARCIA CRISTINA ALVES; BRUSTULIN, RAFAEL; DAS CHAGAS, ROGERIO TOGISAKI; NEVES DOS SANTOS ABRAO, MARIA DE FATIMA; DE DEUS ALVES SOARES, CASSIA VITORIA; et al. Recombinant Strains of Human Parechovirus in Rural Areas in the North of Brazil. Viruses-Basel, v. 11, n. 6, JUN 2019. (15/12944-9, 17/00021-9, 16/01735-2)

DA COSTA, ANTONIO CHARLYS; LUCHS, ADRIANA; DE PADUA MILAGRES, FLAVIO AUGUSTO; KOMNINAKIS, SHIRLEY VASCONCELOS; GILL, DANIELLE ELISE; BRITO SAYAO LOBATO, MARCIA CRISTINA ALVES; BRUSTULIN, RAFAEL; DAS CHAGAS, ROGERIO TOGISAKI; NEVES DOS SANTOS ABRAO, MARIA DE FATIMA; DE DEUS ALVES SOARES, CASSIA VITORIA; et al. Near full length genome of a recombinant (E/D) cosavirus strain from a rural area in the central region of Brazil. SCIENTIFIC REPORTS, v. 8, AUG 17 2018. (15/12944-9, 17/00021-9, 16/01735-2)

FORO RAMOS, ENDRYA DO SOCORRO; ROSA, ULISSES ALVES; RIBEIRO, GEOVANI DE OLIVEIRA; VILLANOVA, FABIOLA; DE PADUA MILAGRES, FLAVIO AUGUSTO; BRUSTULIN, RAFAEL; MORAIS, VANESSA DOS SANTOS; BERTANHE, MAYARA; MARCATTI, ROBERTA; ARAUJO, EMERSON LUIZ LIMA; et al. High Heterogeneity of Echoviruses in Brazilian Children with Acute Gastroenteritis. Viruses-Basel, v. 13, n. 4, APR 2021. (19/21706-5, 17/00021-9, 15/12944-9)

ROSA, ULISSES ALVES; RIBEIRO, GEOVANI DE OLIVEIRA; VILLANOVA, FABIOLA; LUCHS, ADRIANA; DE PADUA MILAGRES, FLAVIO AUGUSTO; KOMNINAKIS, SHIRLEY VASCONCELOS; TAHMASEBI, ROOZBEH; BRITO SAYAO LOBATO, MARCIA CRISTINA ALVES; BRUSTULIN, RAFAEL; DAS CHAGAS, ROGERIO TOGISAKI; et al. First identification of mammalian orthoreovirus type 3 by gut virome analysis in diarrheic child in Brazil. SCIENTIFIC REPORTS, v. 9, DEC 9 2019. (15/12944-9, 17/00021-9, 16/01735-2)

FORO RAMOS, ENDRYA DO SOCORRO; ROSA, ULISSES ALVES; RIBEIRO, GEOVANI DE OLIVEIRA; VILLANOVA, FABIOLA; DE PADUA MILAGRES, FLAVIO AUGUSTO; BRUSTULIN, RAFAEL; MORAIS, VANESSA DOS SANTOS; LIMA ARAUJO, EMERSON LUIZ; PANDEY, RAMENDRA PATI; RAJ, V. SAMUEL; et al. Multiple clades of Husavirus in South America revealed by next generation sequencing. PLoS One, v. 16, n. 3, MAR 23 2021. (17/00021-9, 15/12944-9)

RAMOS, ENDRYA DO SOCORRO FORO; RIBEIRO, GEOVANI DE OLIVEIRA; VILLANOVA, FABIOLA; MILAGRES, FLAVIO AUGUSTO DE PADUA; BRUSTULIN, RAFAEL; ARAUJO, EMERSON LUIZ LIMA; PANDEY, RAMENDRA PATI; RAJ, V. SAMUEL; DENG, XUTAO; DELWART, ERIC; et al. Composition of Eukaryotic Viruses and Bacteriophages in Individuals with Acute Gastroenteritis. Viruses-Basel, v. 13, n. 12, DEC 2021. (20/14786-0, 15/12944-9, 17/00021-9)

TINKER, RORY J.; DA COSTA, ANTONIO CHARLYS; TAHMASEBI, ROOZBEH; MILAGRES, FLAVIO AUGUSTO DE PADUA; DOS SANTOS MORAIS, VANESSA; PANDEY, RAMENDRA PATI; JOSE-ABREGO, ALEXIS; BRUSTULIN, RAFAEL; RODRIGUES TELES, MARIA DA APARECIDA; CUNHA, MARIANA SEQUETIN; et al. Norovirus strains in patients with acute gastroenteritis in rural and low-income urban areas in northern Brazil. ARCHIVES OF VIROLOGY, v. 166, n. 3, p. 905-913, MAR 2021. (17/00021-9, 15/12944-9, 16/01735-2, 19/21706-5)

LUCHS, ADRIANA; LEAL, ELCIO; TARDY, KAELAN; DE PADUA MILAGRES, FLAVIO AUGUSTO; KOMNINAKIS, SHIRLEY VASCONCELOS; BRUSTULIN, RAFAEL; RODRIGUES TELES, MARIA DA APARECIDA; BRITO SAYAO LOBATO, MARCIA CRISTINA ALVES; DAS CHAGAS, ROGERIO TOGISAKI; NEVES DOS SANTOS ABRAO, MARIA DE FATIMA; et al. The rare enterovirus c99 and echovirus 29 strains in Brazil: potential risks associated to silent circulation. Memórias do Instituto Oswaldo Cruz, v. 114, 2019. (17/00021-9, 15/12944-9, 16/01735-2)

AUDREY CILLI; ADRIANA LUCHS; ELCIO LEAL; DANIELLE GILL; FLAVIO AUGUSTO DE PÁDUA MILAGRES; SHIRLEY VASCONCELOS KOMNINAKIS; RAFAEL BRUSTULIN; MARIA DA APARECIDA RODRIGUES TELES; MÁRCIA CRISTINA ALVES BRITO SAYÃO LOBATO; ROGÉRIO TOGISAKI DAS CHAGAS; et al. Human sapovirus GI.2 and GI.3 from children with acute gastroenteritis in northern Brazil. Memórias do Instituto Oswaldo Cruz, v. 114, 2019-04-04. (17/00021-9, 15/12944-9, 16/01735-2)

MEDEIROS, ROBERTA SALZONE; FRANCA, YASMIN; VIANA, ELLEN; DE AZEVEDO, LAIS SAMPAIO; GUIDUCCI, RAQUEL; DE LIMA NETO, DANIEL FERREIRA; DA COSTA, ANTONIO CHARLYS; LUCHS, ADRIANA. Genomic Constellation of Human Rotavirus G8 Strains in Brazil over a 13-Year Period: Detection of the Novel Bovine-like G8P[8] Strains with the DS-1-like Backbone. Viruses-Basel, v. 15, n. 3, p. 34-pg., 2023-03-01. (20/02469-0, 15/12944-9, 20/14786-0, 20/11182-6)