Investigação de Biomarcadores Genômicos para Aplicação Clínica no Câncer de Próstata

• Processo: 15/09111-5
• Linha de fomento: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Vigência: 01 de fevereiro de 2016 - 31 de janeiro de 2018
• Área do conhecimento: Ciências da Saúde - Medicina - Cirurgia
• Pesquisador responsável: Jeremy Andrew Squire
• Beneficiário: Jeremy Andrew Squire
• Instituição-sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Pesq. associados: Alfredo Ribeiro da Silva ; Fabiano Pinto Saggioro ; Rodolfo Borges dos Reis ; Silvana Giuliatti
• Assunto(s): Urologia Biomarcadores Genômica Neoplasias da próstata

Resumo

O câncer de próstata é caracterizado por alta incidência, grande variabilidade no período de latência e prognóstico incerto. Além disto, o screening sanguíneo por PSA resulta em excesso de diagnóstico, sendo que muitos pacientes não apresentam doença clinicamente significativa. Atualmente, o tratamento inicial baseia- se em nomogramas preditivos que relacionam achados histopatológicos detalhados com dados clínicos, definindo um escore de risco global. Até a presente data, não existem biomarcadores que permitam determinar com confiança, a partir de biópsias prostáticas, quais tumores de risco intermediário permanecerão indolentes e quais serão mais agressivos. Dados recentes de nosso grupo de pesquisa sugerem que tumores com pior prognóstico apresentam tanto deleção do gene PTEN quanto presença do gene de fusão TMPRSS2-ERG, além de CNVs recorrentes que afetam outras regiões do genoma. O objetivo do projeto, utilizando uma amostra de 150 casos de câncer de próstata com seguimento clínico conhecido, é identificar novos biomarcadores genéticos que permitam melhor avaliação prognóstica individual. A primeira etapa inclui seleção de casos que apresentam os biomarcadores PTEN e TMPRSS2-ERG combinando as técnicas de FISH, imunohistoquímica e análise de mutação. A seguir, a técnica de array-CGH será aplicada para comparar o perfil global de CNVs em tumores que apresentam os biomarcadores PTEN e TMPRSS2-ERG com os tumores sem qualquer dessas alterações. Análise bioinformática permitirá a seleção de genes candidatos diretamente relacionados com as regiões de CNV em comum neste subgrupo de tumores associados à câncer avançado e com progressão da doença. Esses genes formarão um painel de sondas de FISH altamente informativo para avaliação prognóstica do tumor. (AU)

Publicações científicas

(5)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

JAMASPISHVILI, TAMARA; PATEL, PALAK G.; NIU, YI; VIDOTTO, THIAGO; CAVEN, ISABELLE; LIVERGANT, RACHEL; FU, WINNIE; KAWASHIMA, ATSUNARI; HOW, NATHAN; OKELLO, JOHN B.; GUEDES, LIANA B.; OUELLET, VERONIQUE; PICANCO, CLARISSA; KOTI, MADHURI; REIS, RODOLFO B.; SAAD, FRED; MES-MASSON, ANNE-MARIE; LOTAN, TAMARA L.; SQUIRE, JEREMY A.; PENG, YINGWEI P.; SIEMENS, D. ROBERT; BERMAN, DAVID M. Risk Stratification of Prostate Cancer Through Quantitative Assessment of PTEN Loss (qPTEN). JNCI-JOURNAL OF THE NATIONAL CANCER INSTITUTE, v. 112, n. 11, p. 1098-1104, NOV 2020. Citações Web of Science: 4.

HARMON, STEPHANIE A.; PATEL, PALAK G.; SANFORD, THOMAS H.; CAVEN, ISABELLE; ISEMAN, RACHAEL; VIDOTTO, THIAGO; PICANCO, CLARISSA; SQUIRE, JEREMY A.; MASOUDI, SAMIRA; MEHRALIVAND, SHERIF; CHOYKE, PETER L.; BERMAN, DAVID M.; TURKBEY, BARIS; JAMASPISHVILI, TAMARA. High throughput assessment of biomarkers in tissue microarrays using artificial intelligence: PTEN loss as a proof-of-principle in multi-center prostate cancer cohorts. MODERN PATHOLOGY, v. 34, n. 2 SEP 2020. Citações Web of Science: 1.

VIDOTTO, THIAGO; MELO, CAMILA MORAIS; CASTELLI, ERICK; KOTI, MADHURI; DOS REIS, RODOLFO BORGES; SQUIRE, JEREMY A. Emerging role of PTEN loss in evasion of the immune response to tumours. BRITISH JOURNAL OF CANCER, v. 122, n. 12 APR 2020. Citações Web of Science: 1.

YOSHIMOTO, MAISA; LUDKOVSKI, OLGA; GOOD, JENNIFER; PEREIRA, CIRO; GOODING, ROBERT J.; MCGOWAN-JORDAN, JEAN; BOAG, ALEXANDER; EVANS, ANDREW; TSAO, MING-SOUND; NUIN, PAULO; SQUIRE, JEREMY A. Use of multicolor fluorescence in situ hybridization to detect deletions in clinical tissue sections. LABORATORY INVESTIGATION, v. 98, n. 4, p. 403-413, APR 2018. Citações Web of Science: 4.

VIDOTTO, THIAGO; TIEZZI, DANIEL GUIMARAES; SQUIRE, JEREMY A. Distinct subtypes of genomic PTEN deletion size influence the landscape of aneuploidy and outcome in prostate cancer. MOLECULAR CYTOGENETICS, v. 11, JAN 3 2018. Citações Web of Science: 7.