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Investigação de Biomarcadores Genômicos para Aplicação Clínica no Câncer de Próstata

Processo: 15/09111-5
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Regular
Vigência: 01 de fevereiro de 2016 - 31 de janeiro de 2018
Área do conhecimento:Ciências da Saúde - Medicina - Cirurgia
Pesquisador responsável:Jeremy Andrew Squire
Beneficiário:Jeremy Andrew Squire
Instituição-sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
Pesq. associados:Alfredo Ribeiro da Silva ; Fabiano Pinto Saggioro ; Rodolfo Borges dos Reis ; Silvana Giuliatti
Assunto(s):Urologia  Biomarcadores  Genômica  Neoplasias da próstata 

Resumo

O câncer de próstata é caracterizado por alta incidência, grande variabilidade no período de latência e prognóstico incerto. Além disto, o screening sanguíneo por PSA resulta em excesso de diagnóstico, sendo que muitos pacientes não apresentam doença clinicamente significativa. Atualmente, o tratamento inicial baseia- se em nomogramas preditivos que relacionam achados histopatológicos detalhados com dados clínicos, definindo um escore de risco global. Até a presente data, não existem biomarcadores que permitam determinar com confiança, a partir de biópsias prostáticas, quais tumores de risco intermediário permanecerão indolentes e quais serão mais agressivos. Dados recentes de nosso grupo de pesquisa sugerem que tumores com pior prognóstico apresentam tanto deleção do gene PTEN quanto presença do gene de fusão TMPRSS2-ERG, além de CNVs recorrentes que afetam outras regiões do genoma. O objetivo do projeto, utilizando uma amostra de 150 casos de câncer de próstata com seguimento clínico conhecido, é identificar novos biomarcadores genéticos que permitam melhor avaliação prognóstica individual. A primeira etapa inclui seleção de casos que apresentam os biomarcadores PTEN e TMPRSS2-ERG combinando as técnicas de FISH, imunohistoquímica e análise de mutação. A seguir, a técnica de array-CGH será aplicada para comparar o perfil global de CNVs em tumores que apresentam os biomarcadores PTEN e TMPRSS2-ERG com os tumores sem qualquer dessas alterações. Análise bioinformática permitirá a seleção de genes candidatos diretamente relacionados com as regiões de CNV em comum neste subgrupo de tumores associados à câncer avançado e com progressão da doença. Esses genes formarão um painel de sondas de FISH altamente informativo para avaliação prognóstica do tumor. (AU)

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Publicações científicas (5)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
JAMASPISHVILI, TAMARA; PATEL, PALAK G.; NIU, YI; VIDOTTO, THIAGO; CAVEN, ISABELLE; LIVERGANT, RACHEL; FU, WINNIE; KAWASHIMA, ATSUNARI; HOW, NATHAN; OKELLO, JOHN B.; GUEDES, LIANA B.; OUELLET, VERONIQUE; PICANCO, CLARISSA; KOTI, MADHURI; REIS, RODOLFO B.; SAAD, FRED; MES-MASSON, ANNE-MARIE; LOTAN, TAMARA L.; SQUIRE, JEREMY A.; PENG, YINGWEI P.; SIEMENS, D. ROBERT; BERMAN, DAVID M. Risk Stratification of Prostate Cancer Through Quantitative Assessment of PTEN Loss (qPTEN). JNCI-JOURNAL OF THE NATIONAL CANCER INSTITUTE, v. 112, n. 11, p. 1098-1104, NOV 2020. Citações Web of Science: 4.
HARMON, STEPHANIE A.; PATEL, PALAK G.; SANFORD, THOMAS H.; CAVEN, ISABELLE; ISEMAN, RACHAEL; VIDOTTO, THIAGO; PICANCO, CLARISSA; SQUIRE, JEREMY A.; MASOUDI, SAMIRA; MEHRALIVAND, SHERIF; CHOYKE, PETER L.; BERMAN, DAVID M.; TURKBEY, BARIS; JAMASPISHVILI, TAMARA. High throughput assessment of biomarkers in tissue microarrays using artificial intelligence: PTEN loss as a proof-of-principle in multi-center prostate cancer cohorts. MODERN PATHOLOGY, v. 34, n. 2 SEP 2020. Citações Web of Science: 1.
VIDOTTO, THIAGO; MELO, CAMILA MORAIS; CASTELLI, ERICK; KOTI, MADHURI; DOS REIS, RODOLFO BORGES; SQUIRE, JEREMY A. Emerging role of PTEN loss in evasion of the immune response to tumours. BRITISH JOURNAL OF CANCER, v. 122, n. 12 APR 2020. Citações Web of Science: 1.
YOSHIMOTO, MAISA; LUDKOVSKI, OLGA; GOOD, JENNIFER; PEREIRA, CIRO; GOODING, ROBERT J.; MCGOWAN-JORDAN, JEAN; BOAG, ALEXANDER; EVANS, ANDREW; TSAO, MING-SOUND; NUIN, PAULO; SQUIRE, JEREMY A. Use of multicolor fluorescence in situ hybridization to detect deletions in clinical tissue sections. LABORATORY INVESTIGATION, v. 98, n. 4, p. 403-413, APR 2018. Citações Web of Science: 4.
VIDOTTO, THIAGO; TIEZZI, DANIEL GUIMARAES; SQUIRE, JEREMY A. Distinct subtypes of genomic PTEN deletion size influence the landscape of aneuploidy and outcome in prostate cancer. MOLECULAR CYTOGENETICS, v. 11, JAN 3 2018. Citações Web of Science: 7.

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