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Retrotransposons e enzimas de edição de ácidos nucléicos: ativação, eventos somáticos e associação com o câncer

Processo: 15/19324-6
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Regular
Vigência: 01 de março de 2016 - 28 de fevereiro de 2018
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Humana e Médica
Pesquisador responsável:Israel Tojal da Silva
Beneficiário:Israel Tojal da Silva
Instituição-sede: A C Camargo Cancer Center. Fundação Antonio Prudente (FAP). São Paulo , SP, Brasil
Pesq. associados:Diana Noronha Nunes ; Emmanuel Dias-Neto ; Rafael Andres Rosales Mitrowsky ; Rodrigo Drummond Couto Duarte
Assunto(s):Biologia computacional  Sequenciamento de nova geração  Genômica  Neoplasias 

Resumo

Os retrotransponíveis ou elementos móveis (MEs), representam uma constante ameaça à integridade do genoma hospedeiro pela sua capacidade mutagênica. Como mecanismo que busca assegurar esta integridade, um conjunto de enzimas de edição de ácidos nucléicos atua para inibir a atividade deletéria desses MEs. No entanto, este mesmo mecanismo de proteção à integridade do genoma, acaba sendo uma fonte crônica de danos pois é capaz de induzir mutações no DNA. A relação entre a ativação dos MEs e as mutações colaterais resultantes destas enzimas ainda não é totalmente esclarecida e precisa ser melhor explorada. Este projeto visa identificar e fornecer informações críticas para deduzir os agentes prejudiciais ao DNA, mecanismos moleculares casuais e, portanto, sugerir alvos terapêuticos adicionais para evitar eventos mutacionais desta natureza. Para alcançar esse objetivo, estruturaremos uma abordagem integrativa para interrogar o transcriptoma de 75 linhagens celulares, genoma e exoma total de 207 amostras (normal vs tumor) de pacientes com linfoma. No final, prentendemos expandir nosso conhecimento a respeito dos danos molelulares, apontando para novas alterações genômicas determinantes durante a formação e progressão nos tumores de células B. (AU)

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
ROSALES, RAFAEL A.; DRUMMOND, RODRIGO D.; VALIERIS, RENAN; DIAS-NETO, EMMANUEL; DA SILVA, ISRAEL T. signeR: an empirical Bayesian approach to mutational signature discovery. Bioinformatics, v. 33, n. 1, p. 8-16, JAN 1 2017. Citações Web of Science: 19.

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